La microscopia ottica a super-risoluzione basata su chip è un nuovo approccio alla microscopia a fluorescenza e offre vantaggi in termini di efficacia in termini di costi e produttività. Qui vengono mostrati i protocolli per la preparazione e l’imaging dei chip per la microscopia TIRF e la microscopia a super-risoluzione basata sulla localizzazione.
La fluorescenza totale della riflessione interna (TIRF) è comunemente utilizzata nella microscopia a super-risoluzione basata sulla localizzazione a singola molecola in quanto fornisce un contrasto maggiore a causa del sezionamento ottico. L’approccio convenzionale consiste nell’utilizzare obiettivi TIRF al microscopio ad alta apertura numerica sia per l’eccitazione che per la raccolta, limitando gravemente il campo visivo e la velocità effettiva. Vi presentiamo un nuovo approccio per generare eccitazione TIRF per l’imaging con guide d’onda ottiche, chiamato nanoscopia basata su chip. Lo scopo di questo protocollo è dimostrare come l’imaging basato su chip viene eseguita in una configurazione già costruita. Il vantaggio principale della nanoscopia basata su chip è che i percorsi di eccitazione e raccolta sono disaccoppiati. L’imaging può quindi essere fatto con un obiettivo a basso ingrandimento, con conseguente ampio campo visivo immagini TIRF, al prezzo di una piccola riduzione della risoluzione. Le cellule endoteliali sinusoidali del fegato (LSEC) sono state immagini utilizzando una microscopia ottica diretta stocastica (dSTORM), mostrando una risoluzione paragonabile ai tradizionali microscopi a super-risoluzione. Inoltre, dimostriamo le capacità ad alto velocità effettiva esaminando una regione di 500 m x 500 m con un obiettivo a basso ingrandimento, fornendo una risoluzione di 76 nm. Attraverso il suo carattere compatto, l’imaging basato su chip può essere adattato ai microscopi più comuni e può essere combinato con altre tecniche ottiche su chip, come il rilevamento su chip, la spettroscopia, l’intrappolamento ottico, ecc. La tecnica è quindi ideale per l’imaging ad alta velocità di continuità con super-risoluzione 2D, ma offre anche grandi opportunità per l’analisi multimodale.
Dalla dimostrazione iniziale della microscopia di localizzazione a singola molecola, molte variazioni sono state sviluppate per risolvere diverse sfide1,2,3. Una sfida che è rimasta, tuttavia, è l’imaging dSTORM di ampio campo visivo. Molte configurazioni dSTORM utilizzano la stessa lente obiettivo sia per eccitare il campione che per immaginarlo. Per aumentare il campo visivo, è necessaria una lente di ingrandimento bassa. Le lenti obiettive a bassa ingrandimento e bassa apertura numerica (NA) hanno in genere una grande profondità di campo, con un conseguente aumento del segnale fuori dal piano che ridurrà la precisione di localizzazione. Gli obiettivi TIRF sono comunemente utilizzati per aumentare il contrasto dell’immagine riducendo la fluorescenza fuori dal piano. Attraverso TIRF, l’eccitazione è limitata a uno spessore ottico di circa 150 nm dalla superficie per mezzo di un campo evanescente4. Le lenti obiettivo TIRF richiedono una grande NA che si traduca in un piccolo campo visivo (FOV) (ad esempio, 50 x 50 m2), che limita significativamente la velocità effettiva. Esistono, tuttavia, modi alternativi per generare un campo evanescente.
Una guida d’onda ottica è una struttura che confina e guida la luce se viene accoppiata nella struttura. Più comunemente, guide d’onda sono utilizzati in telecomunicazioni a base di fibra. Grande sforzo è stato fatto al fine di sviluppare guide d’onda integrate 2D come componente principale dei circuiti integrati fotonici. La tecnologia è avanzata a un punto in cui la fabbricazione di guide d’onda ottiche nanostrutturate a bassa perdita può essere regolarmente eseguita5. Oggi, diverse fonderie in tutto il mondo possono essere utilizzate per sviluppare circuiti integrati fotonici. Le guide antionde guidano la luce attraverso la riflettanza interna totale che mostra anche un campo evanescente in superficie. Con un’attenta progettazione della struttura della guida d’onda, si può ottenere un’alta intensità nel campo evanescente. Un campione posizionato direttamente sopra la superficie della guida d’onda può quindi essere illuminato anche dal campo evanescente per applicazioni di imaging. Il campo evanescente sarà generato lungo l’intera lunghezza e larghezza della guida d’onda, e quindi può essere reso arbitrariamente grande6.
Vi presentiamo un nuovo approccio a TIRF dSTORM che offre un campo visivo arbitrariamente ampio. Invece di usare una lente TIRF sia per l’eccitazione che per la raccolta, entusiasmiamo usando il campo evanescente delle guide d’onda ottiche. Questo disaccoppia il percorso di luce di eccitazione e raccolta, consentendo la totale libertà lungo il percorso di luce di raccolta senza compromettere la sezionamento ottico per una determinata lunghezza d’onda fornita dall’illuminazione del chip guida d’onda. Le lenti a basso ingrandimento possono quindi essere utilizzate per l’immagine di regioni molto grandi in modalità TIRF, anche se una NA più piccola ridurrà la risoluzione laterale. Inoltre, l’imaging multicolore è anche notevolmente semplificato utilizzando guide d’onda7, in quanto diverse lunghezze d’onda possono essere guidate e rilevate senza riadattare il sistema. Questo è vantaggioso per dSTORM, in quanto le basse lunghezze d’onda possono essere utilizzate per migliorare il fluoroforo lampeggiante e per l’imaging multicolore. Vale la pena notare che la profondità di penetrazione del campo evanescente cambierà in funzione della lunghezza d’onda, anche se non influisce sulle modalità di esecuzione della procedura di imaging. Il chip è compatibile con l’imaging a celle vive8 ed è ideale per applicazioni come l’integrazione della microfluidica. Ogni chip può contenere decine di guide d’onda, che possono consentire all’utente di immagine in condizioni diverse o applicare trapping ottico9 e spettroscopia Raman10.
Il sistema basato su chip funziona altrettanto bene sia per l’imaging con limitazione diffrazione che per l’imaging a super-risoluzione. Un approccio simile è stato introdotto nel 2005 utilizzando un prisma per generare eccitazione sul campo evanescente4 . Il chip fotonico eccita anche attraverso il campo evanescente, ma con le moderne tecniche di fabbricazione della guida d’onda, si possono generare modelli di luce esotici con guide d’onda. L’attuale implementazione della nanoscopia basata su chip è limitata solo all’imaging 2D, poiché il campo di eccitazione è bloccato all’interno della superficie della guida d’onda. Lo sviluppo futuro sarà destinato alle applicazioni 3D. Inoltre, altre tecniche di super-risoluzione come la microscopia ad illuminazione strutturata sono in fase di sviluppo utilizzando lo stesso microscopio basato su chip11.
L’imaging basato su chip è simile all’imaging dSTORM convenzionale. La qualità dell’immagine può quindi essere misurata utilizzando gli stessi approcci dell’imaging dSTORM tradizionale. La differenza principale per l’utente è che la diapositiva di vetro trasparente viene scambiato con un Si-wafer opaco. Anche se appaiono molto diversi, la manipolazione del campione è praticamente analoga a uno scivolo di vetro. I chip sono abbastanza robusti e possono essere facilmente maneggiati utilizzando una pinzetta di wafer. La procedura di imaging e la ricostruzione dell’immagine sono le stesse di un normale esperimento dSTORM. La configurazione di un microscopio funzionale basato su chip non richiede componenti speciali, ad eccezione dei chip fotonici. Ulteriori dettagli del set-up possono essere trovati nel lavoro precedente6,7. I chip utilizzati in questo lavoro sono stati fabbricati utilizzando la fotolitografia standard8.
La preparazione del campione comprende la preparazione della camera campione. Quando si collega il telaio PDMS al chip, è fondamentale evitare piccole pieghe o strappi in cui potrebbe entrare l’aria. Se il PDMS si piega quando lo si attacca, è sufficiente rimuoverlo con attenzione con una pinzetta e riattaccarlo. Quando il campione è pronto all’interno della camera PDMS, la copertura deve essere premuta contro di esso, sigillando la regione. È importante evitare eventuali bolle d’aria che potrebbero formarsi quando si attacca la copertura. Se si forma una bolla d’aria, rimuovere delicatamente la copertura e aggiungere PBS alla camera campione per assicurarsi che il campione sia coperto. La preparazione e l’attaccamento dello slittamento di copertura possono quindi essere semplicemente rifatti.
L’accoppiamento della luce nella guida d’onda viene semplificato utilizzando il protocollo proposto in questo documento. Ci sono, tuttavia, alcune sfide comuni che possono limitare l’accoppiamento. In primo luogo, se il chip non è stato pulito correttamente e qualsiasi PBX residuo rimosso completamente, ci potrebbe essere sporcizia o PBS cristallizzato sulla guida d’onda. Questo può introdurre perdite importanti, con conseguente scarsa potenza nella regione di imaging. L’utilizzo di un tampone umido per pulire la regione al di fuori del vetro di copertura può migliorare significativamente la potenza. In secondo luogo, se l’aspetto di accoppiamento della guida d’onda è danneggiato (ad esempio, da una manipolazione impropria), la perdita di accoppiamento può aumentare drasticamente. L’ispezione ottica del bordo di solito rivela facilmente eventuali danni. L’intera sfaccettatura di accoppiamento del chip può essere lucidata con attenzione, proprio come una fibra ottica, e darà una sfaccettatura di accoppiamento liscia, che poi aumenta la potenza accoppiata.
Dopo che la luce è stata accoppiata, la procedura di imaging è la stessa di qualsiasi configurazione dSTORM convenzionale. Se l’immagine ha un’eccitazione omogenea, come illustrato nella Figura 2A, molto probabilmente la modalità media non ha funzionato bene. Le due ragioni più comuni per questo sono: 1) troppo poche immagini catturate per creare una pila media e 2) troppo breve di una distanza oscillazione / troppo grande di una dimensione di passo. Raccogliere troppo poche immagini può tralasciare alcuni modelli di eccitazione e la media sarà quindi inomogenea. Questo può essere facilmente risolto aumentando il numero di immagini nella pila media. Una distanza di oscillazione troppo breve può anche causare un’immagine inomogenea, in quanto non abbastanza modelli di modalità sono eccitati. Questo può anche essere facilmente risolto aumentando la distanza di oscillazione e / o diminuendo la dimensione del passo. In questo lavoro abbiamo usato uno stadio piezo per scansionare il raggio laser di ingresso oltre 20 m e acquisire almeno 300 immagini. Un altro approccio potrebbe essere quello di utilizzare galvo-mirror ad alta velocità per eseguire la scansione della luce attraverso la sfaccettatura della guida d’onda di ingresso entro un singolo tempo di acquisizione, ad esempio 10-30 ms. Questa opzione è adatta per l’imaging TIRF a cellule vive, dove gli organelli subcellulari sono in costante movimento.
DSTORM, basato su chip, offre un’eccitazione TIRF ad ampia area senza precedenti, che la rende ideale per l’imaging ad alta velocità effettiva. Il carattere compatto consente l’ammodernamento ai sistemi commerciali, in cui il chip può essere posizionato a testa in giù per configurazioni invertite o substrati trasparenti. I trucioli sono fabbricati in massa e possono essere modificati per soddisfare molte esigenze. Attualmente, la restrizione principale è che è limitato a 2D. Il campo evanescente è disponibile solo a circa 200 nm dalla superficie della guida d’onda, quindi solo i fluorofori all’interno di questa regione saranno entusiasti. Complessivamente, il campo dell’ottica integrata offre molte opportunità per la microscopia basata su chip nel prossimo futuro, affrontando nuove domande di imaging e fornendo nuove possibilità a quelle esistenti.
The authors have nothing to disclose.
Gli autori desiderano riconoscere il Consiglio europeo della ricerca (concedere il numero 336716 a B.S.A.). Gli autori desiderano anche ringraziare Irati Lagfragua per la sua preziosa assistenza nella registrazione e nell’editing del video.
1-axis sample stage | Standa | 7T173-20 | |
2-axis sample translation stage | Mad City Labs | Custom order | |
3-axis NanoMax stage | Thorlabs | MAX311D | |
BXFM microscope body | Olympus | OLY-LSM-037018 | |
CellMask Deep Red, Life technologies | ThermoFisher | C10046 | |
Cleanroom grade swabs | MRC Technology | MFS-758 | |
Fiber-coupled laser | Cobolt | Flamenco | |
Filter Holder | Homemade | ||
Hellmanex III, Hellma Gmbh | Sigma-Aldrich | Z805939 | Cleaning detergent concentrate |
Isopropanol | Sigma-Aldrich | 563935-1L | |
KL 1600 LED | Olympus | OLY-LSM-E0433314 | |
Olympus Coupling lens | Olympus | LMPLFLN 50x/0.5 | |
Orca Flash 4.0 V2 | Hamamatsu | ||
PBS tablets | Sigma-Aldrich | P4417-50TAB | Mix according to descriptions |
SYLGARD 184 Silicone Elastomer 1.1 kg kit | Dow | 1673921 | |
Tip-tilt stage | Thorlabs | APR001 | |
Vacuum holder | Thorlabs | HWV001 | |
Wafer Tweezers Type 2W | Agar scientific | AGT5051 |