概要

高速遠心分離のない状態で U937 細胞のセル分別

Published: January 18, 2019
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概要

ここでは、細胞膜、細胞質、高速遠心分離を使用せず U937 細胞のミトコンドリアを分離するためのプロトコルを提案する.この手法は、蛋白質のローカリゼーションを介して免疫ブロットの後続受験内分を浄化するために使用できます。

Abstract

このプロトコル細胞遠心や無差別な洗剤を使用せず U937 細胞画分を取得する方法を詳しく説明します。このメソッドは、細胞質、ミトコンドリア、細胞膜を分離する差動遠心分離機械換散、ジギトニン低張性バッファーを利用します。プロセスは、研究者のニーズに対応することができます、安価で簡単です。このメソッドは、セル特殊な遠心分離機とどちらが極端に高くなることができる市販のキットの使用なしで蛋白質のローカリゼーションを決定する研究者になります。このゾル性細胞質の分離方法、細胞膜、ミトコンドリア蛋白質は、正常にひと単球細胞 u937 で利用させていただきました。

Introduction

蛋白質のローカリゼーションの確実な同定は、真核細胞の分子経路を調べてみる必要があります。内分を取得する方法は、興味の細胞成分を調べる研究者によって活用されます。

既存のセル分別方法の大半は一般に洗剤ベース1,2および遠心ベース3,45、することができます 2 つの広範なカテゴリに分類します。スピード ・精度・ コストによって区別されます。洗剤ベース プロトコルはセルの異なるコンポーネントを可溶化する洗剤の高強度化をバッファーの使用に頼る。これはサンプルを処理するための迅速かつ便利な方法で、数とサンプルのサイズが小さい場合は費用対効果にすることができます。細胞質膜/オルガネラ (混合割合)、細胞から核分画を分離するため洗剤ベース キットを購入できます。しかし、これらのキットに関連付けられているいくつかの欠点は、研究者への有用性を制限します。彼らは、簡単にセルの 1 つまたは 2 つのコンポーネントを分離するために設計されていますが、同時にサンプルからすべての画分を分離することができません。洗剤の使用を意味する血しょう膜、膜で囲まれた細胞内小器官が均等に溶こと、したがって、お互いから分離することができません。その他の合併症は、これらのキットは研究者が特定のアプリケーションのための条件を変更するを防止する独自のコンポーネントから発生します。最後に、彼らは、使用回数に制限が、非常に大きい実大施工実験高価かもしれません。非洗剤ベース キットは、ミトコンドリアの分離、膜を分離する設計されていませんし、サンプルの利回りは大幅密度遠心分離からのそれより小さいベース分離のプロトコル6,7.

分画遠心を利用する方法はより時間がかかるが、しばしば洗剤ベース キットよりも純粋な分数の結果。最初可 (膜小器官による汚染の結果) それらのない細胞から膜を分離するには、必要があります細胞コンポーネントを介して差動の分離に続いて非洗剤法による分離遠心分離、膜分離を達成する 100,000 × gの速度を必要とします。多くの場合、差動遠心分離細胞一部分または汚染物質の除去のさらに分離のための密度密度勾配遠心による従わなければなりません。これらのメソッドは、徹底的に、変更可能なコスト、時間消費、および分数とさらに浄化経由で密度勾配遠心分離用超遠心機の必要性の欠点が含まれます。ほとんど高速遠心分離機は、個々 の調査官とはしばしば共有、教育機関の機器のコアは、法外なコストです。したがって、超遠心機可用性はこのような状況で禁止になります。

この分別のプロトコルでは、内分可洗剤を使用せず、高速遠心分離なしの分離を示しています。このメソッドは、細胞膜、ミトコンドリアと分数の間の雑菌と真核細胞の細胞質成分を隔離して研究者になります。

Protocol

1. バッファーおよび試薬 注: は、テーブル 1を参照してください。 バッファー A、B の換散バッファー、サンプル バッファーおよびジギトニンのソリューションを準備します。 バッファー A を準備するには、NaCl の 8.77 g と 900 mL の脱イオン水 50 mL HEPES (1 M、pH 7.4) の調整を脱イオン水 1 L に最終巻を追加します。注: 最終濃度は、150 mM の NaCl と…

Representative Results

未分化 U937 細胞懸濁液で栽培の成功の分別は、上記の詳細し、図 1に示したプロトコルを使用して達成されました。この方法で得られた試料は、ポリフッ化ビニリデン (PVDF) 膜に濡れた転送法を用いた西部しみが付く9に服従しました。膜はその後に対する抗体をプローブ細胞質、ミトコンドリア膜局在蛋白質?…

Discussion

このプロトコルの開発は、ミトコンドリアを分離することができないと膜サンプル、市販キットを用いたネクロトーシス14中タンパク質の局在の解析から生まれた。既成のキットの主な制限は、サンプルとサンプルを処理することの限られた数、単価、各研究者のニーズに適応する無力です。ここで紹介した方法は、高価な試薬を使用せず、高価な機器の必要性なしに実行?…

開示

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

仕事に NIH-1R15HL135675-01 ティモシー j. ラロッカに支えられ

Materials

Digitonin TCI Chemicals D0540 For Cytoplasm Extraction
D-Mannitol Sigma-Aldrich M4125 For Lysis buffer B
Dounce homogenizer VWR 22877-282 For Homogenization
end-over-end rotator Barnstead N/A For Cytoplasm Extraction
ethylene glycol-bis(β-aminoethyl ether)-N,N,N',N'-tetraacetic acid (EGTA) Alfa Aesar J61721 For Lysis buffer B
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) Sigma-Aldrich E7889 For Lysis buffer B
GAPDH (14C10) Cell Signalling Technologies 2118 For detection of cytoplasmic fractions on western blot, dilution: 1:10000
HEPES VWR J848 For Lysis buffers A and B
KCl Sigma-Aldrich P9541 For Lysis buffer B
MgCl2 Alfa Aesar 12315 For Lysis buffer B
Na, K-ATPase a1 (D4Y7E) Cell Signalling Technologies 23565 For detection of plasma membrane fractions on western blot, dilution: 1:1000
NaCl Sigma-Aldrich 793566 For Lysis buffer A
phenylmethanesulfonyl fluoride (PMSF) VWR M145 For Cytoplasm Extraction and Homogenization Buffer
probe sonicator Qsonica Q125-110 For Final Samples
Protease Inhibitor Cocktail, General Use VWR M221-1ML For Cytoplasm Extraction
refrigerated centrifuge Beckman-Coulter N/A
Sodium dodecyl sulfate (SDS) VWR 227 For Sample buffer
sodium orthovanadate (SOV) Sigma-Aldrich 450243 For Lysis buffers A and B
Sucrose Sigma-Aldrich S0389 For Lysis buffer B
Tris-buffered Saline (TBS) VWR 788 For Sample buffer
VDAC (D73D12) Cell Signalling Technologies 4661 For detection of mitochondrial fractions on western blot, dilution: 1:1000

参考文献

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記事を引用
McCaig, W. D., Deragon, M. A., Haluska Jr,, R. J., Hodges, A. L., Patel, P. S., LaRocca, T. J. Cell Fractionation of U937 Cells in the Absence of High-speed Centrifugation. J. Vis. Exp. (143), e59022, doi:10.3791/59022 (2019).

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