网状电子探针无缝集成, 并提供稳定, 长期, 单神经元水平记录在大脑内。本协议采用网状电子技术进行体内实验, 涉及网格电子学的制作、针的装入、立体定向注射、输入/输出接口、记录实验和含有网状组织的组织学。探针。
植入性脑电生理探针是神经科学的宝贵工具, 因为它们能够记录来自浅和深脑区的高时空分辨率的神经活动。然而, 由于探针和脑组织之间的机械和结构不匹配, 它们的使用受到阻碍, 通常导致微动和胶质, 导致慢性记录实验中的信号不稳定。相比之下, ultraflexible 网格电子通过注射器注射植入后, 网状探针就形成了一个无缝的、无胶质的界面, 与周围的脑组织, 使单个神经元的稳定跟踪至少一年时间表。本协议详细介绍了在典型的鼠标神经记录实验中使用注射器注射网格电子学的关键步骤, 包括在许多大学可能在标准的基于光刻的过程中制造网状电子学, 加载网状电子成标准毛细管针, 立体定向注射在体内, 连接的网输入/输出到标准仪器接口, 克制或自由移动记录会话, 和组织学切片的大脑含有网状电子的组织。提出了具有代表性的神经记录和组织学数据。熟悉此协议的调查人员将有必要将网格电子学纳入自己的实验, 利用长期稳定的神经接口所提供的独特机会, 如衰老研究过程, 大脑发育和脑部疾病的发病机制。
对大脑进行单神经元分辨率定位的工具的开发对于神经科学和神经学是至关重要的。无创技术的神经研究, 如脑电图 (EEG), 脑 (梅格) 和功能磁共振成像 (fMRI) 已证明有价值的关联大脑活动与行为在人类1, 2, 但它们缺乏研究神经网络在其基本千分尺和毫秒尺度上的结构和动力学所必需的时空分辨率, 分别为3、4。某些皮层脑电图 (ECoG) 探针和光学成像方法使用电压敏感染料成功地记录了在体内5,6的单单位扣球活动, 但它们通常是有效的, 只有接近脑表面, 限制对浅部脑区研究的适用性。相比之下, 植入式电探针可以测量从几乎任何大脑区域自由移动动物的单神经元电生理学, 而不需要荧光标记, 这使得它们对系统级神经科学必不可少, 尤其是从半导体行业的微细加工技术已经把渠道数量推入成百上千的3、7、8、9。凭借这些能力, 植入式电探针对神经科学和神经学作出了许多重要贡献, 包括在视觉系统10中信息处理的基础研究, 神经系统的治疗疾病, 如帕金森氏病11, 和示范脑机接口 (体重指数) 为先进的假肢12,13。
然而, 长期不稳定表现为减少穗振幅和不稳定信号的时间刻度为14,15限制了植入探针的适用性研究相对短期现象, 留下的问题, 如大脑老化和发展基本上没有答案。长期不稳定的局限性是传统探针与脑组织在大小、力学和拓扑14、15、16、17、18之间不匹配的结果。就大小而言, 神经元突触和胞体的直径约为19微米, 而在硅微电极阵列 > 4 倍的情况下, 传统探针通常会显著增大。单个神经元细胞体的大小7,8。这些探针的尺寸相对较大, 可能会扰乱致密神经组织的自然结构和连通性, 从而导致慢性免疫应答, 扰动神经回路的研究。就机械性能而言, 传统探针比植入的极软神经组织要剧烈得多;即使是由10–20µm 厚片的聚酰亚胺制成的 “柔性” 探头, 也比脑组织20、21的硬度至少10万倍。这种不匹配的弯曲刚度导致探针和脑组织之间的相对剪切运动, 导致不可靠的单单位跟踪在延长记录和诱导慢性胶质在植入部位。最后, 常规脑探针的拓扑结构必然排除组织的固体体积。这种拓扑不匹配扰乱了神经回路的连通性, 排除了三维 (3D) 神经元、胶质细胞和脑组织内血管的自然互穿分布, 阻碍了3D 的运输信号分子23。这些传统探针的缺点使它们无法与临床应用和单神经元水平的纵向神经科学研究的长期相容性相结合。
为了克服这些缺点, 我们试图通过开发一种新的 “组织式” 神经探针 (称为网状电子学16、21、24) 来模糊神经和电子系统之间的界线。网格电子解决上述大小, 力学和拓扑的匹配问题, 通过纳入 (1) 结构特征的相同纳米到微米大小的神经组织, (2) 机械性质类似的脑组织, (3) 3D大孔拓扑, 是 > 90% 开放空间, 从而容纳渗透的神经元和扩散分子通过细胞外环境。网状电子探针可以通过注射器和针精确地传送到特定的脑区, 造成最小的急性损伤, 即使在深部脑区21,25。神经元体细胞和轴突已经显示相互渗透开放的3D 网格电子探针结构在几周后注入, 从而创造一个无缝, 无胶质的接口记录电子和周围的脑组织21,26,27. 这些独特的特性使网状电子探针能够稳定地跟踪来自同一单个神经元的峰值活动, 至少一年时间刻度27。此外, 基于光刻技术 (PL) 的网格电子学的制作提供了可合并的电极数量的高可伸缩性, 通过简单接触掩模光刻, 每探头显示的通道计数高达128个电极。28和一个即插即用输入/输出 (i/o) 设计, 允许快速电气连接到外围电子学没有专门设备29。
广泛的研究可能会受益于将网格电子学纳入测量协议。大多数 intracortical 记录实验可以从网状电子学的微创植入过程中受益, 通过注射器注射, 大大降低了植入后的免疫反应, 并有能力离开网格电子在组织在随后的组织学和染色, 以精确分析周围的生物环境的每个记录网站。特别是慢性记录实验将从网状电子的独特能力中获得价值, 以追踪大量的单个神经元数月到数年。这种能力为那些以前不切实际的单神经元分辨率的研究创造了机会, 例如神经回路的纵向老化研究, 发育中的大脑的调查, 以及对性脑病16。
在本协议中, 我们描述了典型的小鼠神经记录实验中使用注射器注射网格电子学的所有关键步骤 (见图 1)。所述步骤包括在许多大学可能在标准的基于 PL 的过程中制造网状电子学, 将网格电子装入标准毛细管针,在体内对网状电子进行立体定向注射, 连接对标准仪器接口进行网格 i/o, 限制或自由移动记录会话, 以及包含网状电子的脑组织的组织学切片。一些研究人员使用网格电子学仅用于组织学研究, 可能不需要电子接口和录音, 在这种情况下, 他们可能跳过这些步骤。在熟悉了这个协议之后, 调查人员应该具备在自己的实验中使用网格电子学所需的所有知识。
所有的步骤在制造和使用网格电子是重要的, 但一些是特别重要的。在从晶片中释放网格电子之前, 必须氧化表面, 使网格在水溶液中容易悬浮 (步 1.6.1)。如果跳过这一步, 网格通常漂浮在水面上, 使它们难以加载到针头中, 如果它们可以加载, 它们经常粘在玻璃针的两侧, 需要大量的 (> 100 µL) 注入。因此, 在释放前不能氧化表面, 通常意味着不能使用网格, 必须从头开始重新进行制造。另一个关键步骤是弯曲网格电子 “茎” 到 ~ 90°在 i/o 接口 (步骤 4.3)。如果角度小于 90°, 则所有 32 i/o 垫片将不适合 ZIF 连接器;有些将不得不切断结束, 以允许插入, 减少连接电极的数量。这个过程也必须轻轻地做, 以防止茎断裂。
网格电子学的设计可以通过修改光掩膜和使用图 2中概述的相同的制造过程来为各种应用定制。例如, 当用于记录图 9中数据的网格电子探头设计为有32个记录电极横跨老鼠海马和原体感皮层时, ultraflexible 网格中的电极放置可以选择的目标几乎任何大脑区域, 或更大的刺激电极可以被纳入27。保留了相同的基本网格结构和制作工艺, 但对电极的布置和设计进行了调整, 以满足研究的需要。然而, 调查人员应该谨慎使用, 并且总是测试修改过的设计可以通过预定的针头轻易地注入。对网格电子学弯曲力学的小改动对可注射性有很大的影响。一个这样的例子是, 在横向和纵向 SU-8 丝带之间的45°角产生一个网状电子探针, 可以弃注入, 但90°的角度导致一个揉和堵塞针21。
测量记录电极的阻抗有助于故障排除。20-µm 直径圆 Pt 电极应具有 1 MΩ的阻抗级, 当测量频率为1赫体内或 1x PBS29。阻抗明显大于这意味着电极没有暴露, 如可能发生, 如果它是受光刻胶残留, 或没有电连接。例如, 如果在 PL 中的照片掩码上有灰尘导致在 Au 互连中断开连接, 或者在 i/o 接口期间 ZIF 连接器针脚没有联系到其中一个网格 i/o 垫片, 则可能发生后者。阻抗的幅度大约是预期值的一半, 这表明信道可能会短路到相邻的一个, 从而产生两个电极阻抗并联的电路。测量阻抗值在故障排除过程中充当指导;结合网格电子探针的光学显微术, 在下一次制造运行或 i/o 接口尝试时, 通常可以对问题的来源进行相应的识别和修正。
用于急性研究的注射器注射用网状电子学有限, 因为单单位的扣球活动通常没有观察到1周后注射27, 虽然最近的工作 (未发表) 表明, 这个问题是容易克服。观察峰值活动所需时间的关键决定因素是网格设计、随网格电子注入大脑的流体体积以及注射针头的直径, 因为这些影响了组织损伤的程度。注射和愈合率。如果在镍蚀刻释放之前不使用氧等离子体处理网状电子, 则可能需要大量的注入量;即, 如果网格不是亲水性的, 它可以坚持玻璃针。有时, 网格有缺陷, 导致弯曲力学, 使他们难以注入。在网格电子的加载过程中, 重要的是检查网格在针内的移动是否容易且平滑 (如辅助视频 1所示)。如果没有, 则应使用不同的网格电子探针。最好的结果, 无缝的神经接口将实现与理想的注入量10–50µL 每4毫米注入网格长度。最近的结果与更细的网状电子探针注入和/或更小直径毛细管针 (小至150µm 内径, 250 µm 外径) 表明, 单单位扣球可以观察后不久注射 (急性测量)通过更长的时间。这些较细的网格结构的掩码设计文件可通过请求或资源网站 meshelectronics.org 提供。我们估计, 使用400µm 内径 (650 µm 外径) 针, 我们的体内网注射程序的总收益率约为 70%, 虽然产量更接近80–90% 为我们最近的工作与150µm 内径 (250 µm 外径针.最常见的失败原因是 (1) 网格不顺利注入, 导致脑水肿, 从意外的大注射量到大脑, (2) 网损在手动操作时需要在 i/o 接口程序, 和 (3)在注射过程中损害血管的流血。在注射过程中损害血管是罕见的 (原因不到10% 的失败), 并可以进一步减少使用图像引导手术。我们还注意到, 血管损伤是所有涉及脑组织渗透的程序的常见限制, 包括注射病毒微粒进行转染, 植入刚性脑探头, 以及注入网状电子学。
网格电子探头能够稳定地记录和跟踪相同的单个神经元在至少几个月到一年的时间刻度, 并唤起几乎没有慢性免疫应答, 如图 9和图 10所示。与常规深度电极相比, 这是一个显著的优势, 在长期记录实验14中, 通常会减少穗振幅、不稳定信号和慢性炎症,15. 此外, 网格电子学的优点是, 在组织学切片、染色和成像过程中, 它们可以留在组织中, 与传统的探针形成对比, 因为它们过于僵硬, 因此必须在组织学前移除。分析。因此, 网状电子学允许使用免疫组化分析的独特能力, 精确地研究每个记录站点周围的细胞环境。
这里提出的协议开启了令人振奋的新的神经科学机会。微创分娩法和网状电子与脑组织的无缝集成最大限度地减少了神经回路的中断, 避免了慢性免疫应答, 这将有益于大多数类型的慢性神经记录实验。网格电子在长时间内记录和跟踪同一单个神经元的能力将特别感兴趣的是研究人员试图将毫秒级的峰值活动与月-长的过程 (如衰老) 关联起来,脑部疾病的发病机制, 或大脑发育16,18。此外, 还存在扩展和自定义此协议的大量机会, 例如在 PCB 头阶段添加活动电子, 以实现诸如数字复用8、35、无线等功能。通信35,36,37, 信号处理35, 共注入干细胞或聚合物与网状电子, 以帮助组织再生18,38, 39、将纳米线场效应晶体管 (NW FETs) 并入网格电子学中, 用于高度本地化和多功能的脑探头24、29、40、41 ,42。
The authors have nothing to disclose.
C.M.L. 承认空军科学研究办公室 (FA9550-14-1-0136)、哈佛大学物理科学和工程加速器奖以及全国卫生主任先驱奖 (1DP1EB025835-01). T.G.S. 承认国防部 (DoD) 通过国防科学 & 工程研究生奖学金 (NDSEG) 计划提供的支持。伦理承认美国心脏协会 (16POST27250219) 的奖学金支持, 以及来自国立卫生研究院老龄研究所的独立奖 (父母 K99/R00) 的途径。这项工作是在哈佛大学纳米系统中心 (CNS) 的一部分进行的, 这是国家纳米技术协调基础设施网络 (NNCI) 的成员, 由国家科学基金会根据 NSF ECCS 奖编号支持。1541959。
Motorized stereotaxic frame | World Precision Instruments | MTM-3 | For mouse stereotaxic surgery |
512-channel recording controller | Intan Technologies | C3004 | A component of the neural recording system |
RHD2132 amplifier board | Intan Technologies | C3314 | A component of the neural recording system |
RHD2000 3-ft ultra thin SPI interface cable | Intan Technologies | C3213 | A component of the neural recording system |
Mouse restrainer | Braintree Scientific | TV-150 STD | Standard 1.25 inch inner diameter; used to restrain the mouse during restrained recording sessions. |
Si wafers | Nova Electronic Materials | 3" P <100> .001-.005 ohm-cm 356-406μm Thick Prime Grade SSP Si wafers w/2 Semi-Std. Flats & 6,000 A°±5% Wet Thermal Oxide on both sides. |
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Photomasks (chrome on soda lime glass) | Advance Reproductions | Advance Reproductions and other vendors manufacture photomasks from provided design files. Our photomask design files are available by request or from the resource website, meshelectronics.org. Alternatively, some university clean rooms have mask writers for making photomasks on site. | |
AutoCAD software | Autodesk Inc. | Design software for drawing photomasks. A free alternative is LayoutEditor. Our photomask design files are available by request or from the resource website, meshelectronics.org. | |
Thermal evaporator | Sharon Vacuum | Used to evaporate Ni, Cr, and Au onto mesh electronics during fabrication. Many university clean rooms have this or a similar tool. | |
SU-8 2000.5 negative photoresist | MicroChem Corp. | Negative photoresist used to define the bottom and top passivating layers of mesh electronics. | |
MA6 mask aligner | Karl Suss Microtec AG | Used to align each photomask to the pattern on the wafer and expose the wafer to UV light. Most university clean rooms have this or a similar tool. | |
SU-8 developer | MicroChem Corp. | Used to develop SU-8 negative photoresist following exposure to UV light. | |
LOR3A lift-off resist | MicroChem Corp. | Used with Shipley 1805 photoresist to promote undercutting during metal lift-off processes | |
Shipley 1805 positive photoresist | Microposit, The Dow Chemical Company | Positive photoresist used to define metal interconnects and Pt electrodes in mesh electronics | |
MF-CD-26 positive photoresist developer | Microposit, The Dow Chemical Company | To develop S1805 positive photoresist after exposure in a mask aligner. Many university clean rooms stock this chemical. | |
Spin coater | Reynolds Tech | For coating wafers with positive and negative resists. Most university clean rooms have spin coaters. | |
PJ plasma surface treatment system | AST Products, Inc. | Used to oxidize the surface of mesh electronics prior to release into aqueous solution. Most university clean rooms have this or a similar tool. | |
Electron beam evaporator | Denton Vacuum | For evaporating Cr and Pt during fabrication of mesh electronics. Many university clean rooms have this or a similar tool. | |
Remover PG | MicroChem Corp. | Used to dissolve LOR3A and Shipley S1805 resists during metal lift-off | |
Ferric chloride solution | MG Chemicals | 415-1L | A component of Ni etching solution |
36% hydrochloric acid solution | Kanto Corp. | A component of Ni etching solution | |
Glass capillary needles | Drummond Scientific Co. | Inner diameter 0.40 mm, outer diameter 0.65 mm. Other diameters are available. | |
Micropipette holder U-type | Molecular Devices, LLC | 1-HL-U | Used to hold the glass capillary needles during stereotaxic injection |
1-mL syringe | NORM-JECT®, Henke Sass Wolf | Used for manual loading of mesh electronics into capillary needles | |
Polyethylene intrademic catheter tubing | Becton Dickinson and Company | Inner diameter 1.19 mm, outer diameter 1.70 mm | |
5-mL syringe | Becton Dickinson and Company | Used in the syringe pump for injection of mesh electronics in vivo | |
Eyepiece camera | Thorlabs Inc. | DCC1240C | Used to view mesh electronics within capillary needles during injection |
ThorCam uc480 image acquisition software for USB cameras | Thorlabs Inc. | Used to view mesh electronics within capillary needles during injection | |
Syringe pump | Harvard Apparatus | PHD 2000 | Used to flow precise volumes of solution through capillary needles during injection of mesh electronics |
EXL-M40 dental drill | Osada | 3144-830 | For drilling the craniotomy |
0.9 mm drill burr | Fine Science Tools | 19007-09 | For drilling the craniotomy |
Hot bead sterilizer 14 cm | Fine Science Tools | 18000-50 | Used to sterlize surgical instruments |
CM1950 cryosectioning instrument | Leica Microsystems | Used to slice frozen tissue into sections. Many universities have this or a similar tool available in a shared facility. | |
0.3% Triton x-100 | Life Technologies | Used for histology | |
5% goat serum | Life Technologies | Used for histology | |
3% goat serum | Life Technologies | Used for histology | |
Rabbit anti-NeuN | Abcam | ab177487 | Used for histology |
Mouse anti-Neurofilament | Abcam | ab8135 | Used for histology |
Rat anti-GFAP | Thermo Fisher Scientific Inc. | PA516291 | Used for histology |
ProLong Gold Antifade Mountant | Thermo Fisher Scientific Inc. | P36930 | Used for histology |
Poly-D-lysine | Sigma-Aldrich Corp. | P6407-5MG | Molecular weight = 70-150 kDA |
Right-angle end clamp | Thorlabs Inc. | RA180/M | Used to attach the pipette holder to the stereotaxic frame |
Printed circuit board (PCB) | Advanced Circuits | Used to interface between mesh electronics and peripheral measurement electronics such as the Intan recording system. Advanced Circuits and other vendors manufacture and assemble PCBs based on provided design files. Our PCB design files are available by request or at the resource site meshelectronics.org | |
32-channel standard amplifier connector | Omnetics Connector Corp. | A79024-001 | Component assembled onto the PCB |
32-channel flat flexible cable (FFC) | Molex, LLC | 152660339 | Used as a clamping substrate when interfacing to mesh electronics I/O pads with the PCB-mounted ZIF connector |
32-ch zero insertion force (ZIF) connector | Hirose Electric Co., LTD | FH12A-32S-0.5SH(55) | Component assembled onto the PCB |