Nous présentons ici les protocoles pour la synthèse des nucléosides disaccharide par la régiosélective O– glycosylation de ribonucléosides via une protection temporaire de leur 2′, 3′-diol moitiés utilisant un ester boronique cyclique. Cette méthode s’applique à plusieurs nucléosides non protégés comme l’adénosine, guanosine, cytidine, uridine, 5-méthyluridine et 5-fluorouridine pour donner les nucléosides disaccharide correspondante.
Les nucléosides disaccharide, qui consistent en des portions disaccharide et nucléobase, ont été connus comme un groupe valable de produits naturels ayant des bioactivités multiformes. Bien que chimiques O– glycosylation est une stratégie couramment bénéfique pour synthétiser les nucléosides disaccharide, la préparation des substrats tels que glycosyl donneurs et accepteurs exige fastidieuses manipulations de groupe protecteur et une purification à chaque étape de synthèse. Pendant ce temps, plusieurs groupes de recherche ont rapporté que boronique et esters borinic servent un protecteurs ou activateurs groupe des dérivés de glucides pour atteindre l’acylation régio – et stéréosélectives, alkylation, silylation et glycosylation. Dans cet article, nous démontrons la procédure pour la régiosélective O– glycosylation de ribonucléosides non protégés utilisant l’acide boronique. L’estérification de 2′, 3′-diol de ribonucléosides avec acide boronique rend la protection temporaire de diol et, O– glycosylation suivant avec un donateur glycosyl en présence de p– toluenesulfenyl permis triflates, chlorure et argent la réaction de régiosélective du groupe 5′-hydroxyle se permettre les nucléosides disaccharide. Cette méthode pourrait être appliquée à des nucléosides divers, tels que la guanosine, adénosine, cytidine, uridine, 5-metyluridine et 5-fluorouridine. Cet article et la vidéo d’accompagnement représentent des informations (visuelles) utiles pour la O– glycosylation des nucléosides non protégés et leurs analogues pour la synthèse de non seulement les nucléosides disaccharide, mais aussi une variété de biologiquement pertinente produits dérivés.
Les nucléosides disaccharide, qui sont conjugués d’un nucléoside et une fraction glucidique liée par un O-glycosidique bond, constituent une précieuse classe naturelle glucides dérivés1,2 ,3,4,5,6,7. Par exemple, elles sont incorporées dans les macromolécules biologiques comme les ARNt (acide ribonucléique de transfert) et poly (ADP = adénosine diphosphate), ainsi que dans certains agents antibactériens et autres substances biologiquement actives (par exemple, adenophostins, amicetins, ezomycin)5,6,8,9,10,11,12,13, 14,15,16,17,18,19. Par conséquent, nucléosides disaccharide et leurs dérivés doivent être composés de plomb pour la recherche de découverte de médicaments. Les méthodes pour la synthèse des nucléosides disaccharide sont classées en trois catégories ; enzymatique O– glycosylation20,21, chimique N– glycosylation5,9,16,22,23, 24et chimiques O– glycosylation7,9,14,16,18,19,24, 25,26,27,28,29,30,31,32,33, 34,35,36,37. En particulier, O– glycosylation chimique serait une méthode efficace pour la synthèse stéréosélective et synthèse à grande échelle des nucléosides disaccharide. Recherches antérieures ont montré que la O– glycosylation de la 2′-désoxyribonucléosides 2 avec la thioglycosyl donneur 1, à l’aide de la combinaison du chlorure de p– toluenesulfenyl et argent triflate, offre la désiré disaccharide nucléoside 3 (Figure 1A; AR = aryl et PG = groupe protecteur)38.
Suite à ces résultats, nous avons décidé de développer la O– glycosylation de ribonucléosides appliquant le système p– toluenesulfenyl chlorure/argent promoteur triflate. Alors que plusieurs exemples de la O– glycosylation de ribonucléosides partiellement protégées ont été démontrées7,9,14,16,18,19 ,24,32,33,34,35,36,37, l’utilisation de protégé ou non protégé temporairement ribonucléosides comme un accepteur glycosyl pour O– glycosylation a été rapporté de façon négligeable. Par conséquent, le développement de régiosélective O– glycosylation de ribonucléosides protégés ou non protégé temporairement fournirait une méthode de synthèse plus avantageuse sans protéger les manipulations de groupe de ribonucléosides. Afin d’atteindre la régiosélective O– glycosylation de ribonucléosides, nous nous sommes concentrés sur les composés de bore, car plusieurs exemples d’acylation régio – et stéréosélectives, alkylation, silylation et la glycosylation d’hydrates de carbone dérivés, secondé par boronique ou acide borinic ont été déclarés39,40,41,42,43,44,45 ,46,47,48,49,50. Dans cet article, nous démontrons la procédure pour la synthèse des nucléosides disaccharide utilisant régiosélective O– glycosylation dans le groupe 5′-hydroxyl de ribonucléosides via un ester boronique intermédiaire. Dans la stratégie présentée ici, ester boronique intermédiaire 6 pourrait être offerte par l’estérification des ribonucléosides 4 avec le boronique acide 5, qui permet la régiosélective O– glycosylation à la Groupe de 5′-hydroxyle avec thioglycosyl donneur 7 pour donner le disaccharide nucléosides 8 (Figure 1B)51. Aussi, nous avons étudié l’interaction d’un ribonucléosides et un acide boronique par spectroscopie de résonance magnétique nucléaire (RMN), d’observer la formation d’un ester boronique. Estérification de faire un ester boronique et une réaction de glycosylation exigent des conditions anhydres pour éviter l’hydrolyse de l’ester boronique et le donateur glycosyl. Dans cet article, nous démontrons la procédure typique pour obtenir les conditions anhydres pour des réactions de glycosylation réussie pour les chercheurs et les étudiants non seulement en chimie, mais aussi dans d’autres domaines de recherche.
Le but de ce manuscrit est de montrer une méthode de synthèse pratique pour préparer les nucléosides disaccharide utilisant les ribonucléosides non protégés sans manipulations fastidieuses à groupe protecteur. Nous présentons ci-après la régiosélective O– glycosylations de nucléosides via le temporaire 2′, 3′-diol protection par un ester boronique cyclique (Figure 1B)51.
La préparation de l?…
The authors have nothing to disclose.
Cette recherche a été financée par des subventions du ministère de l’éducation, Culture, Sports, Science et technologie (MEXT) du Japon (nos 15K 00408, 24659011, 24640156, 245900425 et 22390005 pour Shin Aoki), grâce à une subvention de la recherche biochimique de Tokyo Fondation, Tokyo, Japon et par le fonds TUS (Tokyo University of Science) pour les domaines de recherche stratégiques. Nous tenons à remercier Noriko Sawabe (Faculté des Sciences pharmaceutiques, Université des sciences de Tokyo) pour les mesures des spectres RMN, Fukiko Hasegawa (Faculté des Sciences pharmaceutiques, Université des sciences de Tokyo) pour les mesures de la masse les spectres et Tomoko Matsuo (Institut de recherche pour la Science et de technologie, Université des sciences de Tokyo) pour les mesures de l’analyse élémentaire.
Silver trifluoromethanesulfonate | Nacalai Tesque | 34945-61 | |
Phenylboronic acid (contains varying amounts of anhydride) | Tokyo Chemical Industry | B0857 | |
p-Methoxyphenylboronic acid | Wako Pure Chemical Industries | 321-69201 | |
4-(Trifluoromethyl)phenylboronic acid (contains varying amounts of anhydride) | Tokyo Chemical Industry | T1788 | |
2,4-Difluorophenylboronic acid (contains varying amounts of anhydride) | Tokyo Chemical Industry | D3391 | |
Cyclopentylboronic acid (contains varying amounts of Anhydride) | Tokyo Chemical Industry | C2442 | |
4-Nitrophenylboronic acid (contains varying amounts of anhydride) | Tokyo Chemical Industry | N0812 | |
4-Hexylphenylboronic acid (contains varying amounts of anhydride) | Tokyo Chemical Industry | H1489 | |
Adenosine | Merck KGaA | 862. | |
Guanosine | Acros Organics | 411130050 | |
Cytidine | Tokyo Chemical Industry | C0522 | |
Uridine | Tokyo Chemical Industry | U0020 | |
5-Fluorouridine | Tokyo Chemical Industry | F0636 | |
5-Methyluridine | Sigma | M-9885 | |
Methylamine (40% in Methanol, ca. 9.8mol/L) | Tokyo Chemical Industry | M1016 | |
N,N-dimethyl-4-aminopyridine | Wako Pure Chemical Industries | 044-19211 | |
Acetic anhydride | Nacalai Tesque | 00226-15 | |
Pyridine, Dehydrated | Wako Pure Chemical Industries | 161-18453 | |
Acetonitrile | Kanto Chemical | 01031-96 | |
1,4-Dioxane | Nacalai Tesque | 13622-73 | |
Dichloromethane | Wako Pure Chemical Industries | 130-02457 | |
Propionitrile | Wako Pure Chemical Industries | 164-04756 | |
Molecular sieves 4A powder | Nacalai Tesque | 04168-65 | |
Molecular sieves 3A powder | Nacalai Tesque | 04176-55 | |
Celite 545RVS | Nacalai Tesque | 08034-85 | |
Acetonitrile-D3 (D,99.8%) | Cambridge Isotope Laboratories | DLM-21-10 | |
Trifluoroacetic acid | Nacalai Tesque | 34831-25 | |
TLC Silica gel 60 F254 | Merck KGaA | 1.05715.0001 | |
Chromatorex | Fuji Silysia Chemical | FL100D | |
Sodium hydrogen carbonate | Wako Pure Chemical Industries | 191-01305 | |
Hydrochloric acid | Wako Pure Chemical Industries | 080-01061 | |
Sodium sulfate | Nacalai Tesque | 31915-96 | |
Chloroform | Kanto Chemical | 07278-81 | |
Sodium chloride | Wako Pure Chemical Industries | 194-01677 | |
Methanol | Nacalai Tesque | 21914-74 | |
JEOL Always 300 | JEOL | Measurement of NMR | |
Lamda 400 | JEOL | Measurement of NMR | |
PerkinElmer Spectrum 100 FT-IR Spectrometer | Perkin Elmer | Measurement of IR | |
JEOL JMS-700 | JEOL | Measurement of MS | |
PerkinElmer CHN 2400 analyzer | Perkin Elmer | Measurement of elemental analysis | |
JASCO P-1030 digital polarimeter | JASCO | Measurement of optical rotation | |
JASCO PU-2089 Plus intelligent HPLC pump | JASCO | For HPLC | |
Jasco UV-2075 Plus Intelligent UV/Vis Detector | JASCO | For HPLC | |
Rheodyne Model 7125 Injector | Sigma-Aldrich | 58826 | For HPLC |
Chromatopac C-R8A | Shimadzu | For HPLC | |
Senshu Pak Pegasil ODS | Senshu Scientific | For HPLC | |
p-Toluenesulfenyl chloride | Prepared Ref. 38 | ||
Phenyl 6-O-acetyl-2,3,4-tri-O-benzyl-1-thio-a-D-mannopyranoside (a-9) | Prepared Ref. 52 | ||
4-Metylphenyl 2,3,4,6-tetra-O-benzoyl-1-thio-b-D-galactopyranoside (b-21) | Prepared Ref. 53 | ||
4-Metylphenyl 2,3,4,6-tetra-O-benzoyl-1-thio-b-D-glucopyranoside (b-31) | Prepared Ref. 57 | ||
4-Metylphenyl 2,3,4,6-tetra-O-benzoyl-1-thio-a-D-Mannopyranoside (a-32) | Prepared Ref. 67 | ||
6-N-Benzoyladenosine (14) | Prepared Ref. 54 | ||
2-N-Isobutyrylguanosine (16) | Prepared Ref. 55 | ||
4-N-Benzoylcytidine (20) | Prepared Ref. 56 |