このプロジェクトの目標は、ほぼリアルタイムで脳深部刺激療法の影響をシミュレートし、脳の神経活動に影響を与えるこれらのデバイスに関して有意義なフィードバックを提供するインタラクティブな患者固有のモデリング パイプラインを開発することです。
ローカライズされた脳の領域に刺激を提供する電極の挿入を含む、脳深部刺激療法 (DBS) は、運動障害に対する確立された治療で障害の増加に適用されています。DBS; の臨床効果を予測する計算モデルを正常に使用されていますしかし、DBS 機器の複雑化に対応するための新規モデリング技法の必要性があります。これらのモデルはまた迅速かつ正確に予測を生成する必要があります。このプロジェクトの目標は、構造の磁気共鳴画像 (MRI) と拡散強調画像 (DWI) DBS の効果をシミュレートする対話型の患者の特定のモデルに組み込む画像処理パイプラインを開発することです。仮想 DBS 鉛アクティブな連絡先と共に、患者モデル内に配置し、リアルタイムに近い刺激の設定、リードの位置または向きの変更が新しい有限要素メッシュと生体電気フィールドの問題のソリューションを生成、約 10 秒の timespan。このシステムでは、さまざまなアノードとカソードの異なるリードによって現在のステアリングは、近くに複数のリードのシミュレーションもできます。本稿で紹介する手法は、生成し、研究者や臨床医に電極位置、電極設計、および刺激の構成の影響についての有意義なフィードバックを提供しながら計算モデルを使用の負担を軽減します。モデリングの専門家はないかもしれない。
脳深部刺激療法 (DBS) は、1本態性振戦やパーキンソン病2などの運動障害のための確立された療法です。この療法は、疾患が外傷性脳損傷3、トゥレット症候群4うつ病5などの数が増え、潜在的な処置として調査中です。DBS システムは、継続的な神経活動6を調節するローカライズされた脳の領域に刺激を提供する電極リードの外科的移植を必要です。電極と刺激パラメーターの両方の場所には、治療効果を提供する神経回路を調節することに効果があります。小さい場所の変化は治療効果が達成した7,8,9前に多分有害な副作用の可能性が高く、治療のウィンドウに影響を与えます。実際には、それはしばしば影響刺激が神経活動を予測することは困難その結果、治療効果のこのウィンドウは、刺激装置の臨床医8,9プログラムは患者様によって基礎で表されます。このプロセスはより複雑な新世代の DBS のデバイスが利用可能になるようになっています。詳細連絡先10、11,12、新しい鉛の設計が導入されているなど、複数のリードが13を互いに近接される注入されていくつかのケースで。したがって、探索し、大きく、成長パラメーター空間で DBS の効果を予測可能にする必要があります。
患者ごとに DBS の生理・臨床効果を予測する計算モデル、解析を使用できます。これらのモデルでは、有限要素モデリング (有限要素法) を使用して、脳組織の 3 つの次元の表現と注入電極の生物物理学的特性を構築します。有限要素法による生体電気フィールド モデルを正常に DBS14の効果の予測に使用されているが、今までこれらの時間がかかり、負荷を生成する高価なされています。DBS 機器の複雑化に対応するための新規モデリング技法の必要性があります。これらの患者固有のモデルのように鉛の場所として DBS の効果をリアルタイム視覚的フィードバックの近くまたは刺激パラメーターが変更されます。ユーザーは、鉛の場所についてのフィードバックを取得して刺激の設定を有効にするいくつかの秒数分にわたってリード配置の改良を続けています。患者特異性は、有限要素法を構築するとき、患者の解剖学、脳の形状とサイズを組み込む電気伝導度異方性組織など、彼らの脳の生物物理プロパティを適用することによって実現されます。異方性導電率では、電流の異なる脳の領域を介して拡散し、典型的な磁気共鳴画像 (MRI) に類似した全体の脳の非侵襲的測定することができますどのようにをについて説明します。
患者固有の情報を使用してアプローチをモデリング DBS 刺激効果、一般化されたジオメトリと脳組織の導電率値のための高速、しかしより少なく正確な予測を提供できます。この方法では単一の有限要素法、すべての患者に使用され、予測の神経活動を事前に計算できます。患者固有のモデルを一般化し、計算済みの新しい有限要素法は個々 に組み込まれていることはできません。これらのモデルを構築するより多くの努力を必要とするより正確にすることができます。いくつかの要因がこれらのモデルの構築し、使用する速度を制限: 1) 以降の手順のすべてを更新する手動の努力が必要です電極位置など、モデル建築パイプラインの先頭にパラメーターを変更します。・ 2) モデリング パイプラインの手順簡単と統合されていない、別のソフトウェア パッケージを複数のデータを渡すことを必要とします。多くの場合、我々 は電極の位置、刺激パラメーター、または電極設計などさまざまな状況を評価したいです。これらの変更は、患者が受け取る治療効果に与える影響について意味のあるフィードバックを提供する、これらの結果必要があります正確で生成されたすぐに。
私たちの目標は一般化されたモデルで得られた速度の利点を取る患者固有のモデル構築と実時間視覚のそばを提供するインタラクティブなモデリング環境を作成するパイプラインの手順の多くを自動化するための新しい技術を提示するにはDBS の効果についてのフィードバック。対話式シミュレーション予測をテストし、モデル構築の詳細に焦点を当てすることがなく迅速に結果を取得できます。これは、大きなパラメーター空間を探索する、シミュレーションに影響を与えるこれらのパラメーターがあるない場合に有益です。磁気共鳴画像 (MRI) の買収から対話型、患者固有の有限要素モデルを生成する処理のパイプラインでの手順を説明します。ツールや、本稿に記載されているテクニックは有限要素法による生体電気フィールド モデルを作成するための時間コストを削減し、研究者や専門家をモデリングできない医師にこれらのモデルを活用するために方法を提供します。
このプロトコルでは、買収した MRI ボリュームから患者固有の有限要素モデルの構築し、DBS 電極による電場をシミュレートする方法について説明します。これらのモデルの作成の主な手順は、: 1) 患者の脳と注入電極を表す有限要素モデル (FEM) を構築、2)、有限要素法に DBS 機器の脳と刺激パラメーターの生物物理プロパティを追加し、3) の解決モデルの電極によって生成される電圧。2 つのイメージ投射様相は、DBS のシミュレーションのため患者の特定のモデルを構築する必要です。T1 MRI は、脳の表面、脳室と特定の核の区切りを構築する使用されます。拡散強調画像 (DWI), 水分拡散係数の測定を使用して、脳組織15中拡散のテンソルを推定します。拡散のテンソルは、ボクセルごと16ボクセルに組織の不均質、異方性の生物物理特性を定量化した電気伝導度テンソルに変換されます。有限要素法の適用による方程式の線形システムを簡素化するポアソン方程式を解くことによって電極による脳全体の電圧分布を計算Ax = bここAは剛性行列を電気伝導度を表し、メッシュのジオメトリは、 xは、メッシュ内の各ノードの電圧ソリューションと境界条件と現在のソースに基づくbが変更されました。
このプロトコルは、時間の負担を軽減する技術を示しているし、モデルを構築患者特定 DBS の程度の計算コストがシミュレーション結果のリアルタイムのフィードバックのそばができます。迅速なフィードバックにより、パラメーターの変更が、モデルの結果にどのように影響するかを理解するための大きなパラメーター空間の探査です。これらのパラメーターには、鉛の場所、アクティブな連絡先の選択と振幅、パルス幅、およびそれらの連絡先を刺激波形の周波数が含まれます。提案ツールの主要な機能: 1) シンプルなユーザー インターフェイス リアルタイム可視化シミュレーション、および 2) 入力の小さなセットからモデル作成の自動化のこれらのパラメーターの影響の近くでモデルのパラメーターを調整する: 脳の表面脳組織電気伝導度テンソルと電極形状の表面表現します。この自動化は、既存モデルの異なる電極設計の挿入の効果の評価し同様に、異なる脳のジオメトリおよび組織導電率を持っている多くの個人の患者固有のモデルの作成を迅速化します。このプロトコルのイメージ前処理手順は完全に自動化されたされていないと処理時間の日をすることが。しかし、完了すると次の手順から生成されたデータと、静的、このデータはシミュレーション中に変更されませんを意味見なされます。モデルの作成の自動化は、手動の努力もせず患者固有の FEM にこのデータを適用するシステムの能力から発生します。モデルの生成、シミュレーション、可視化の手順すべてを実行する SCIRun ネットワークのみ一度ビルドする必要があります。したがって、画像の前処理手順だけは受信患者の患者固有のモデルを生成するもう一度実行する必要があります。
モデリング パイプラインから結果を生成するときにパフォーマンスの向上は、メッシュ生成、生体電気フィールド計算、および単一ソフトウェア環境にソリューションの可視化の統合によるものです。既存のモデリング技術など、アダプティブ メッシュの生成は、高く作成に使われたメッシュ電極密度と低密度を構築して有限要素法を解決する時間を短縮する電極から遠ざかるソフトウェア、SCIRun、メッシュの生成と生体電気フィールド計算の自動化ができます。インタラクティブなウィジェットを使用して電極の動きをユーザー定義トリガー更新された電極の位置に新しいメッシュの構築。境界条件と新しい電極位置の導電率値の変更が含まれます。
有限要素法にその位置を統合する前に、電極形状が頭脳の容積内自由移動オブジェクトとして扱われるメッシュ構造のこのアプローチのキーの意味は複数の電極は、モデルに簡単に挿入することができます。たとえば、電極形状の 2 番目のコピーは数ミリ離れて配置することができ、有限要素法の両方が表示されます。最近の研究では、多発性硬化症・振戦・13を治療し、効果的な刺激のターゲット21を探索する非ひと霊長類実験で使用されている近くに 2 つの電極を埋め込まれています。複数の電極を使用しての利点は、組織に大きな領域を発生させる電界のよりよい制御を提供することです。両電極にアクティブな連絡先と刺激的な操縦と、対象地域の方と否定的な副作用につながる地域から現在。広い領域の刺激のより細かく制御も DBS の新興治療アプリケーションの多くの場合と同様、意図されていたターゲットの正確な位置が不明、異なる刺激の場所を探索に便利です。しかし、治療の刺激を達成するためにパラメーターを決定する既に大きいパラメーター空間の増加のための単一電極よりも困難です。
我々 は、このインタラクティブなモデリング ツールは、DBS の移植の術前計画時にメリットを提供できることを想像します。脳組織の刺激の範囲についてのフィードバックは、対象地域に治療の刺激を提供する手術計画において電極貼付位置を変更するのには外科医を許可できます。脳深部刺激療法では、このツールを開発するための主動機を与える要因でしたが、本稿で紹介する手法は異なる刺激または記録パラダイムと任意の有限要素法による生体電気フィールド モデルに適用できます。うつ病22または23てんかんの治療のため深さ電極の使用のための経頭蓋直流電流刺激などの刺激療法は達成するために刺激の最適な位置を決定する際に DB と同じ課題を共有します。治療の結果。下角、発作発症地域を識別するために脳の表面に電極の配列を記録技術脳24のターゲット地域から記録するために電極を配置する場所を決定するのに挑戦しています。これらすべてのアプリケーションがどのように電流が流れる脳組織の不確実性に対処しながら電極の位置によって異なります。本稿で紹介する手法は、生成し、研究者や臨床家がこれらのデバイスを使用してモデリングの専門家ではない人に意味のあるフィードバックを提供しながら計算モデルを使用の負担を軽減します。
The authors have nothing to disclose.
このプロジェクトによって、国立研究所の健康補助金 UH3、NS095554 を受けました。テクニカル サポートは、科学技術計算やイメージング研究所で統合的な生体コンピューティングの中心によって提供されたおよび統合生体コンピューティングのセンター NIH P41-GM103545 から開発されたソフトウェアによって部分的に可能作られました。
感謝の気持ちは、原稿についてレキシー床、科学技術計算やイメージング研究所生産と送信、ビデオの編集でネイサン ・ ガッリ、テレサ リンスが拡張されます。
FreeSurfer | Athinoula A. Martinos Center for Biomedical Imaging | https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/ | |
3D Slicer | BWH, Harvard University | https://www.slicer.org/ | |
SCIRun | University of Utah Center for Integrative Biomedical Computing | http://www.sci.utah.edu/cibc-software/scirun.html |