Здесь мы представляем протокол для обширной территории сканирования зонд кантилеверных включена путем итеративного выравнивание зонд массивов, а также использования литографических моделей для исследования взаимодействия клетк поверхности.
Сканирующая зондовая микроскопия позволяет создание различных методов для конструктивного изготовления (присадки) сверху вниз нанометровом масштабе функций. Исторически, основным недостатком сканирующего зонда литографии неразрывно низкую пропускную способность систем одного датчика. Это может быть решена путем использования массивов несколько зондов для включения кантилеверных увеличение пропускной способности. Для реализации такого параллельного нанолитографию, точное выравнивание зонд массивов с поверхности субстрата является жизненно важным, таким образом, чтобы сделать все датчики контакта с поверхностью одновременно, когда начинается литографических кучность. Этот протокол описывает использование полимерных перо литографии производить нанометровом масштабе функции над сантиметр размера районов, облегчается использование алгоритма для быстрого, точного и автоматизированных выравнивание зонд массивы. Здесь нанолитографию тиолы на золото субстратов демонстрирует поколения функций с высокой однородности. Эти шаблоны затем функционализированных с фибронектин для использования в контексте исследований по морфологии ориентированные на поверхности клеток.
Прогресс в области нанотехнологий зависит от разработки методов, способных эффективно и надежно изготовления наноразмерных компонентов на поверхностях. 1 , 2 однако, создавая такие особенности на больших площадях (несколько см2) надежно и на относительно низкая стоимость нетривиальных усилий. Большинство существующих методов, производный от полупроводниковой промышленности, полагаются на абляционного фотолитографии для изготовления «твердый» материалов. Совсем недавно литографический методы, производные от сканирующей зондовой микроскопии (СЗМ) появились как удобный и универсальный подход для быстрого прототипирования наноразмерных конструкций. 3 методы, основанные на РП возможность удобно и быстро «писать» любой шаблон, определяемые пользователем. Наиболее известным из них является dip Пен нанолитографию (ДПН), впервые Миркин et al.,4 где сканирующего зонда используется как «перо» для передачи молекулярной «чернила» на поверхности особенности в моде, аналогичные письма. При температуре окружающей среды, как зонд проверяется по всей поверхности молекулы «чернила» передаются поверхности через воды мениска, который формирует между зондом и поверхностью (рис. 1). DPN таким образом позволяет nanolithographic осаждения широкий спектр материалов, в том числе «мягкие» таких полимеров и биомолекул. 5 Родственные методы, с помощью зондов, инженерии с каналами для доставки жидкости, различно называется «nanopipettes» и «nano-авторучки», также поступало. 6 , 7 , 8
Главным препятствием для более широкого применения СПР производные литографии является пропускная способность, как это требует слишком много времени в шаблон сантиметр масштаба районы с единичного пробоотборника. Ранние усилия для решения этой проблемы сосредоточены на распараллеливания основанных на консольные ДПН, с «одно-мерного» и «двумерные» (2D) зонд массивы, сообщанными для литографии сантиметр размера областей. 5 , 9 однако эти массивы консольные производятся через сравнительно сложный многоэтапный изготовление методы и относительно слабы. Изобретение полимера перо литография (PPL) рассматривала этот вопрос путем замены стандартных кантилеверов СЗМ с массивом 2D мягкой силоксановых эластомер зондов, приклеенная к слайду стекла. 10 этот простой датчик установки значительно снижает стоимость и сложность структурирования больших площадей, открытие кантилеверных для более широкого круга приложений. Эта консольно бесплатные архитектура также была расширена жесткий отзыв пружину литографии,11 , которая обеспечивает гибрид мягких эластичных минусовки с жесткий кремния советы, давая более резолюции по сравнению с шаблонов производится с помощью мягкой эластомер советы.
Решающим фактором в реализации этих технологий двумерный массив является, что зонд массив должен быть точно параллельна поверхности субстрата так, что когда литографии используется, все датчики соприкасаться с поверхностью одновременно. Даже небольшой перекос может привести к большой разницы в размере функция с одной стороны массива на другой, так как некоторые датчики будут контактировать поверхность ранее во время спуска массива, в то время как другие вступит в контакт позже или не на всех. 12 точное выравнивание особенно важна с PPL благодаря деформируемость мягкая эластичная зондов, где будут сжаты зонды, связавшись с поверхности ранее, оставляя больше след на поверхности.
Ранние работы на PPL работают чисто визуальный осмотр направлять процесс выравнивания, с помощью камеры, установленной выше массив наблюдать деформации пирамидальной зондов, как они были принесены контакт с поверхностью. 10 выравнивание судил наблюдения, какой стороне зондов соприкоснулся с поверхности сначала, то Регулировка угла и повторяя процедуру на постоянной основе до тех пор, пока разница в контакт на каждой стороне зонда неразличимы глазом. Поскольку эта процедура выравнивания зависит от субъективных визуальный осмотр оператором, воспроизводимость является низким.
Впоследствии был разработан более объективный подход, состоящий из сил Датчик монтируется под субстрат для измерения силы, применяется при контакте зондов на поверхности. 12 выравнивание таким образом было достигнуто путем регулировки углов наклона максимизировать сила, которые сообщили, что все датчики одновременно в контакте. Этот метод показал, что выравнивание для 0,004 ° параллельно поверхности возможно. Это «сила обратной связи выравнивание» теперь реализована в полностью автоматизированных систем в двух независимых докладах. 13 , 14 как использовать триады датчиков силы монтируется под субстрат или выше массив и измерить количество силы оказываемого на контакт между массивами зонда и поверхностью. Эти системы дают высокой точности, отчетности некоаксиальности ≤0.001 ° на 1 см Длина шкалы,14 или ≤ 0,0003 ° над 1.4 см.13 эти автоматизированные выравнивание системы также обеспечивают крупные сбережения в времени оператора и общее время, требуемое для завершения литография процесса.
Один из основных применение высок объём поверхности этой технологии изготовления это поколение субстратов культуры клеток. Сейчас хорошо известно, что фенотип ячейки можно манипулировать, контролируя первоначального взаимодействия между клетками и особенности поверхности, и что это может быть повышена на наноуровне. 15 специально, зонд литографии методы как доказано быть поверхностным методом для производства различных поверхностей nanofabricated для таких экспериментов культуры клеток. 16 например, поверхности, представляя наноразмерных структур собственн-собранные монослои и внеклеточного матрикса, белки шаблонного PPL и DPN были использованы для изучения потенциала нано модифицированных материалов в материале индуцированной дифференциация Стволовые клетки. 17
Этот протокол описывает использование модифицированных атомно-силового микроскопа (AFM) системы, которая позволяет большой площади PPL. Мы подробно определение силы, используя множественные датчики силы в качестве средства определения зонд поверхности контакта, используя алгоритм, который автоматизирует процесс последовательной выравнивания. Последующие функционализации этих шаблонов с фибронектин белков внеклеточного матрикса и культуры мезенхимальных стволовых клеток (МСК) описаны, как проявление PPL-готовых поверхностей, применяется для клеточной культуры.
Этот протокол служит для предоставления пользователям с удобным методологии быстро осуществлять nanolithographic, кучность с высокая однородность и размер управляемой функции над большой (см2) областях. Субстраты, принимая эти большие площади nanopatterns может быть далее разработан для различных приложений. Один из основных применение этой технологии в поколения nanofabricated поверхностей для исследования взаимодействия клетк поверхности. Этот отчет показывает некоторые наглядные примеры клеточной культуры на эти материалы, демонстрируя контроля МСК морфологии, nanofabricated субстратов.
Ключевым фактором настоящего Протокола является автоматизация процедуры выравнивания (шаг 4) который позволяет единообразного и высок объём производства функций на поверхностях, вплоть до наноразмерных резолюции, которая позволяет быстрый оборот культуры клеток экспериментов. Литография пером полимера, осуществляется с помощью этого алгоритма выравнивания способен генерировать наноразмерных компонентов в течение примерно 30 мин. Воспроизводимость и точность автоматического выравнивания и таким образом единообразия узорной функций, — однако критически зависит качество зонд массивов, которые производятся (шаг 1 и 2). Любые недостатки в их подготовке, которые приводят к тупым, сломаны или отсутствуют датчики; таких захваченных воздушных пузырьков (шаг 1.5) или неправильное разделение зондов от хозяина (шаг 1.8) может привести к неточной выравнивание и низкого качества литографии.
Это сообщили, что метод разделяет ограничение общего другие методы выравнивания, которые полагаются на силовой обратной связи. Точное определение когда зонды находятся в контакте с поверхностью ограничивается необходимостью учитывать фон вибрации, вызванные окружающей среды и движение на стадии образца. В общем датчики имеют чувствительность силы в µN режиме (2 µN в данном случае), но выравнивание алгоритм предназначен только зарегистрировать силой по крайней мере 490 µN как окончательный контакт между штырями и поверхностью, для того чтобы избежать любых resul «ложных срабатываний» Тин от фонового шума. 13 таким образом, этот метод имеет тенденцию производить большие возможности (1-2 мкм) поскольку датчики должны продлен большое расстояние на z-оси (с последующим высшие силы) для того чтобы зарегистрировать контакта. Для того, чтобы компенсировать, меньше функций могут быть получены путем сокращения z-оси пробег на этапе литография (например, введя параметр «Черный» на шаге 5.2.3.2 как 3 мкм вместо 5 мкм).
Тем не менее, даже при этом ограничение, Автоматизация алгоритмов способна решить важнейший аспект в применении методов параллельного сканирования зонд литографии, как выравнивание было ранее наиболее требовательных и неточные шаг по времени в Реализация этих методов. Эта автоматизация теперь переносит ограничения скорости шаг процесса изготовления из выравнивание литографических писать сам. Хотя этот протокол демонстрирует применение этой процедуры выравнивания для PPL, рамки может применяться к ряду SPL методы, такие как липид DPN26 и при содействии матрицы литографии27 , а также потенциального будущего каталитического зонд систем. 28
The authors have nothing to disclose.
Авторы признают финансовой поддержки из различных источников, включая инженерные Великобритании и физическим научным исследованиям Совета (Грант РЭС. EP/K011685/1, EP/K024485/1) и выпускник студенчества для JH; Леверхульме доверия (РПГ-2014-292); Фонд институционального стратегической поддержки Уэллком траст (105610/Z/14/Z); Британский Совет (216196834); и в университете Манчестера в университете Манчестера научно-исследовательский институт (умри насос грунтование фонд) и президентской докторской стипендии для SW. технической помощи д-р Андреас Lieb (Nanosurf AG) также благодарностью.
Equipment | |||
FlexAFM mounted on a motorised 5-axis (XYZΘΦ) translation and goniometer stage | NanoSurf | P40008 | |
AFM control software | NanoSurf | C3000 | |
Engraving pen | Sigma-Aldrich | Z225568 | |
Plasma Cleaner | Harrick plasma | PDC-32G-2 | |
PlasmaFlo | Harrick plasma | PDC-FMG-2 | |
Economy Dry Oxygen Service Pump | Harrick plasma | PDC-OPE-2 | |
Tube Rotator | Stuart | SB3 | |
Vacuum Desiccator | Thermo Fisher Scientific | 5311-0250 | |
Milli-Q Water Purification System | Merck Millipore | ZRXQ015WW | |
Modular Humidity Generator | proUmid | MHG32 | |
Proline Plus Pipette 100-1000 µL | Sartorius | 728070 | |
Silicon masters | NIL Technology | custom-made | |
Upright snapshot fluorescence microscope | Olympus | BX51 | |
Microscope objectives | Olympus | 10x and 60x UPlan FLN ∞/-/FN 26.5 | |
Upright bright field microscope | Leica | DM 2500M | |
Ultrasonicator | Ultrawave Ltd. | U95 | |
Spreadsheet for recording and intepreting automated alignment results | Microsoft | Excel | |
Reagent | |||
2-propanol | Sigma-Aldrich | 34863 | FLAMMABLE |
Microscope Sildes, Clear, Ground | Thermo Fisher Scientific | 451000 | |
(7–8% vinylmethylsiloxane)-dimethylsiloxane copolymer, trimethylsiloxy-terminated | Gelest | VDT-731 | |
1,3,5,7-tetramethyl-1,3,5,7-tetravinylcyclotetrasiloxane | Gelest | SIT7900.0 | |
Platinum(0)-1,3-divinyl-1,1,3,3-tetramethyldisiloxane complex solution | Sigma-Aldrich | 479527 | HARMFUL, TOXIC |
(25–35% methylhydrosiloxane)-dimethylsiloxane copolymer, trimethylsiloxane-terminated | Gelest | HMS-301 | |
Weigh Boat 100 mL | Scientific Laboratory Supplies | BALI828 | |
Pasteur pipette | Appleton Woods | KS230 | |
Petri dish | SARSTEDT | 82.1473 | |
Razor blade | Thermo Fisher Scientific | ST10-031T | |
Adhesive Carbon Tape | Agar scientific | AGG3939 | |
16-Mercaptohexadecanoic acid | Sigma-Aldrich | 448303-1G | HARMFUL, TOXIC |
Ethanol | Sigma-Aldrich | 34852 | FLAMMABLE |
Gold coated microscope slide | Sigma-Aldrich | 643203 | Once opened gold will remain reactive to thiols for at least 1 month |
Thiourea | Sigma-Aldrich | T8656 | HARMFUL, TOXIC |
Iron(III) nitrate nonahydrate | Sigma-Aldrich | 529303 | HARMFUL, TOXIC |
Hydrochloric acid | Sigma-Aldrich | 84415 | HARMFUL, TOXIC |
(11-Mercaptoundecyl)hexa(ethylene glycol) | Sigma-Aldrich | 675105 | HARMFUL, TOXIC |
Fibronectin from human plasma | Sigma-Aldrich | F0895 | |
Cobalt(II) nitrate hexahydrate | Sigma-Aldrich | 203106 | HARMFUL, TOXIC |
Dulbecco’s Phosphate Buffered Saline | Sigma-Aldrich | D8537 | |
MSCGM Mesenchymal Stem Cell Growth Medium | Lonza UK | PT-3001 | |
Human Mesenchymal Stem Cells | Lonza UK | PT-2501 | |
Trypsin-EDTA | Sigma-Aldrich | T4174 | |
Heraeus Multifuge X1 Centrifuge | Thermo Fisher Scientific | 75004210 | |
CELLSTAR Centrifuge Tubes | Greiner Bio-One | 188261 | |
Paraformaldehyde | Fisher Scientific | P/0840/53 | HARMFUL, TOXIC |
Alexa Fluor 488 Phalloidin | Thermo Fisher Scientific | A12379 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | "Detergent" in manuscript |
VECTASHIELD Antifade Mounting Medium with DAPI | Vector Laboratories | H-1200 | |
Rabbit anti-fibronectin antibody | Abcam | ab2413 | |
Goat anti-Rabbit IgG (H+L) Secondary Antibody, Alexa Fluor 594 | Thermo Fisher Scientific | R37117 | |
Bovine Serum Albumin | Sigma-Aldrich | A3912 | |
12-well plate | Thermo Fisher Scientific | 10253041 | |
T75 tissue culture flask | Thermo Fisher Scientific | 10790113 | |
cantilever | BudgetSensor | ContAl-G |