генотипирование<em> Стафилококк</em> рибосомальным Spacer ПЦР (RS-PCR)

Стафилококк (S. стафилококк) известен как самый важный патоген во всем мире , ответственного за интрамаммарной инфекции (IMI) у крупного рогатого скота ^1. Исследование , проведенное Fournier и соавт. ² продемонстрировано в швейцарских коров и исследованиях Cosandey и др. ³ и Boss и др. ⁴ у коров 12 европейских стран , что С. стафилококк , выделенной из бычьих ИМИ представляет собой генетически гетерогенную группу. С помощью ПЦР – амплификации межгенном спейсерной области 16S-23S рРНК (RS-PCR), в общей сложности 17 генотипами были первоначально обнаружены в 101 эпидемиологически независимых изолятов ^2. Генотип В и генотипа С (КТЗ) были наиболее распространенным (80%), в то время как остальные 15 генотипов (ГСТ) происходили редко, каждый из которых вносит 1 до 4% от всех изолятов. На европейском уровне ^3, GTB, GTC, ГТФ, GTI и GTR были самыми важными генотипы , содержащие 76% всех анализируемых штаммов (n = 456). GTB был расположен в центральной части Европы, шhereas другие генотипы были широко распространены. Остальные 24% штаммов включали 41 генотипов, многие из них, однако, наблюдались только один раз.

В работах Fournier и соавт. ^2, Cosandey и др. , ^3, и Грабером и др. ⁵ дополнительно показано , что генотипы были высоко связаны с их рисунком генов вирулентности, а также на швейцарцев , как на европейском уровне. Исследования дополнительно выявил массовые различия в распространенности среди IMI S. стафилококк GTB, GTC и другие генотипы ^2,5: учитывая GTB, до 87% коров в стаде были заражены этим генотипом. В случае GTC и других генотипов, однако, IMI был только найден в 1 до 2 коров стада.

IMI , вызванные S. стафилококк, как правило , приводит к воспалению соответствующих молочных желез и увеличение воспалительных клеток в молоке. Как следствие, соматической клетки совместноунц в молоке (SCC), основным показателем качества молока в большинстве стран, увеличивается, приводящий к снижению цен на молоко или даже доставки остановки.

Кроме того, RS-PCR из Fournier и др. ^2, другие методы типирования были описаны для подтипов бычьим штаммам S. из стафилококк ^8-11. Два наиболее часто встречающиеся из них включают спа набрав ¹² и мульти Locus последовательность ввода (MLST) ^13. Первый из них основан на секвенирование ДНК переменной спейсерной области стафилококкового гена Spa кодирующего белок А, тогда как последний из них требует секвенирование 7 генов домашнего хозяйства. Это означает , что один ¹² и семь ДЗП ^13, соответственно, должны быть выполнены, с последующей очисткой ампликона, реакции секвенирования и анализа с использованием специального оборудования. По сравнению с RS-PCR, эти методы требуют значительных дополнительных усилий в лабораторных условиях, что приводит к низкой пропускной способности образца и высокой стоимостью.пропускная способность особенно низка для PFGE. Принимая во внимание решение этих методов для бычьих штаммов S. стафилококк, RS-PCR, по крайней мере так же хорошо , как спа , набрав ⁴ и лучше , чем MLST ⁴ или PFGE ^15.

Все эти методы , включая бинарного ввода ¹³ продемонстрировали свою эффективность в получении дальнейшее понимание патогенеза крупного рогатого скота IMI , вызванного S. стафилококк, но из – за указанных ограничений они менее подходят для крупных клинических исследований. Кроме того, с помощью генотипирования RS-PCR , как описано Fournier и др. ² позволяет надежно предсказывать эпидемиологические и патогенного потенциала S. стафилококк участвует в коровьем IMI, два ключевых значения в клинической ветеринарной медицины.