Genotypisierung<em> Staphylococcus aureus</em> Durch ribosomalen Spacer PCR (RS-PCR)

Staphylococcus (S. aureus) als wichtigste Erreger weltweit verantwortlich für die intramammäre Infektion (IMI) bei Rindern ¹ bekannt. Die Studie wurde von Fournier et al. ² in Schweizer Kühe unter Beweis gestellt und die Studien von Cosandey et al. ³ und Boss et al. ⁴ bei Kühen von 12 europäischen Ländern , dass S. aureus isoliert aus Rinder IMI ist eine genetisch heterogene Gruppe. Durch PCR – Amplifikation des 16S-23S – rRNA intergenischen Spacer – Region (RS-PCR), insgesamt 17 Genotypen wurden zunächst in 101 epidemiologisch unabhängige Isolate ² detektiert. Genotype B und Genotyp C (AGB) wurden am häufigsten (80%), während die anderen 15 Genotypen (GTs) selten aufgetreten, jeder macht 1 bis 4% aller Isolate. Auf europäischer Ebene ^3, GTB, GTC, GTF, GTI und GTR waren die wichtigsten Genotypen 76% aller untersuchten Stämme, die (n = 456). GTB wurde in Mitteleuropa während die anderen Genotypen wurden weit verbreitet. Die restlichen 24% der Stämme enthalten 41 Genotypen, von denen viele, aber nur einmal beobachtet.

Die Studien von Fournier et al. ^2, Cosandey et al. ³ und Graber et al. ⁵ weiter gezeigt , dass die Genotypen stark mit ihrer Virulenz – Gen – Muster verbunden waren, sowie an der Schweizer wie auf europäischer Ebene. Die Untersuchungen ergaben , weitere massive Unterschiede in IMI – Prävalenz unter S. aureus GTB, GTC und die anderen Genotypen ^2,5: Berücksichtigung GTB, bis zu 87% der Kühe in einer Herde wurden von diesem Genotyp infiziert. Im Falle von GTC und der anderen Genotypen, jedoch wurde IMI nur in 1 bis 2 Kühen einer Herde gefunden.

IMI verursacht durch S. aureus, führt normalerweise zu einer Entzündung der entsprechenden Brustdrüsen und einem Anstieg von Entzündungszellen in der Milch. Als Folge co die somatische Zellunts in Milch (SCC), dem Schlüsselindikator für die Milchqualität in den meisten Ländern, erhöht wird, um eine verringerte Milchpreis oder sogar Lieferstopp führt.

Neben dem RS-PCR von Fournier et al. ^2, haben andere Typisierungsmethoden für Subtypisierung Rinder Stämme von S. beschrieben aureus ^11.08. Zwei häufigsten sind Spa – Typisierung ¹² und Multi – Locus – Sequenz Typing (MLST) ^13. Der erstere wird basierend auf DNA – Sequenzierung der variablen Spacer – Bereich des Staphylokokken – Spa Gen , das für Protein A, während die letztere die Sequenzierung von 7 Housekeeping – Genen erfordert. Dies bedeutet , dass eine ¹² bis sieben PCRs ¹³ jeweils durchgeführt werden müssen, gefolgt von Amplicon Reinigung Sequenzierungsreaktion und Analyse unter Verwendung spezifischer Ausrüstung. Im Vergleich zu RS-PCR, erfordern diese Verfahren einen erheblichen Mehraufwand in der resultierenden Labor in einem geringen Probendurchsatz und hohe Kosten. DasDurchsatz besonders niedrig ist die PFGE. Unter Berücksichtigung der Auflösung dieser Methoden für Rinder Stämme von S. aureus, RS-PCR ist mindestens so gut wie spa Eingabe ⁴ und besser als MLST ⁴ oder PFGE ^15.

Alle diese Methoden auch binäre Typisierung ¹³ gezeigt , um ihre Wirksamkeit bei der Beschaffung weitere Einblicke in die Pathogenese von Rinder-IMI verursacht durch S. aureus, aber wegen der genannten Einschränkungen sind sie weniger geeignet für große klinische Untersuchungen. Zusätzlich Genotypisierung von RS-PCR wie von Fournier et al. ² ermöglicht die zuverlässige Vorhersage der epidemiologischen und das pathogene Potential von S. aureus in Rinder-IMI, zwei Schlüsselwerte in der klinischen Veterinärmedizin beteiligt.