Preparation of protein-functionalized planar glass-supported lipid bilayers, determination of protein mobility within and measurement of protein densities is shown here. A roadmap to building a noise-reduced Total Internal Reflection microscope is outlined, which allows visualizing single bilayer-resident fluorochromes with high spatiotemporal resolution.
In the course of a single decade single molecule microscopy has changed from being a secluded domain shared merely by physicists with a strong background in optics and laser physics to a discipline that is now enjoying vivid attention by life-scientists of all venues 1. This is because single molecule imaging has the unique potential to reveal protein behavior in situ in living cells and uncover cellular organization with unprecedented resolution below the diffraction limit of visible light 2. Glass-supported planar lipid bilayers (SLBs) are a powerful tool to bring cells otherwise growing in suspension in close enough proximity to the glass slide so that they can be readily imaged in noise-reduced Total Internal Reflection illumination mode 3,4. They are very useful to study the protein dynamics in plasma membrane-associated events as diverse as cell-cell contact formation, endocytosis, exocytosis and immune recognition. Simple procedures are presented how to generate highly mobile protein-functionalized SLBs in a reproducible manner, how to determine protein mobility within and how to measure protein densities with the use of single molecule detection. It is shown how to construct a cost-efficient single molecule microscopy system with TIRF illumination capabilities and how to operate it in the experiment.
理解通过该膜蛋白履行其细胞功能的机制常常可以是一个具有挑战性的任务,因为它们的作用方式通常是由低亲合力的相互作用,这是难以检测和评估通过常规的生化方法学确定。膜蛋白可进一步高度富集特定膜结构域5,6或形成动态更高级结构,这原则上可以改变其生物活性的7。
因此,非侵入性的激光辅助单分子荧光显微镜已成为首选来研究复杂的细胞环境中的蛋白质行为的方法。这特别适用于发生在质膜的生化过程,因为这些原则上可以在噪声减少的全内反射(TIRF)模式进行监测。这里样品照射被限制在一个高达200纳米的薄切片在靠近一个玻璃苏rface,这导致在蜂窝背景显著损失,并且由于瞬逝激发光的特性,同样在荧光信号强度8,9-大幅增加。目标是在单分子检测的高位置和时间分辨率时,这两个方面都是重要的。
平面的SLBs不仅与TIRF显微镜兼容。当与适当的配体功能化,他们还提供了直接访问,因为它们发生在免疫细胞和其他细胞研究细胞 – 细胞识别的分子动力学。它们也可以简单地利用到位置足够接近载玻片能动否则非粘附细胞,使这些细胞可以在TIRF照明,这是很理想被成像时,涉及单分子跟踪或单分子基超分辨率传导实验。为此蛋白必须被装载到高移动SLB。所用李的先天优势 PID是有蛋白质没有非特异性结合的。此外,SLBs中可视为二维液体的愈合本身固有的能力;在玻璃支撑件内的凹凸被补偿到一定的程度。一个一步一步的协议是为了产生被控蛋白质的利益高度流动双层。平面的SLBs的形成进行说明,其中包含1-棕榈酰-2-油酰-sn-甘油-3-磷酸胆碱(POPC)作为主要成分(90-99%)和合成的和官能化的脂质1,2- dioleoyl- SN -glycero -3 – {〔N-(5-氨基-1-羧基戊基)亚氨基二乙酸]琥珀酰基}镍盐(DGS NTA-Ni)的低丰度(1-10%)。 POPC携带一个饱和脂肪酸和一种单不饱和脂肪酸,并形成高流动性的脂质双层,即使在室温。 DGS NTA镍结合而其头部基团对聚组氨酸尾巴并且用作锚所选择的多组氨酸标签的蛋白( 图1)。
“>重要的是,显微硬件必须包括一些下面所述外围设备。所提供的信息,并在光学和激光物理的一些基本知识,任何生物学家应该能够建立一个单分子成像设置,样品激发应该理想地在全内反射(TIRF)模式的倒置显微镜进行作为该方案减少了杂散光并过度背景所得从蜂窝自发荧光9除外。对于这一点,一个特殊的TIRF能力的目标(见下文),并且需要激光照射。某些实验中,需要照明倍毫秒范围内,并且在快速连续操作。为了节省照明时间或避免因重复照明常常是有帮助的发射的光分成两个或更多个光谱通道不必要的漂白。这允许同时读出的两个或更多个发射分布,这可以成为当conduc一个显著因子婷实验涉及荧光共振能量转移(FRET)。在这里,从单一的激发光脉冲所产生的排放量既可以从FRET供体进行记录和FRET受体(如致敏发射)。该相机应该获得足够的光子具有足够低的背景在光照时间,以可视化的单荧光团。计算机软件将必须最多同步激发关停和图像采集的任务。全面概述了下方, 如图 2所示:TIRF能力的目标:对于目标为基础的TIRF照明物镜的数值孔径(NA)必须等于或使用标准载玻片大于1.4(N = 1.515)9。放大倍率范围60X之间可以以150倍。目标应该是色校正成像不同的荧光团时,允许共焦。
激光:可用化酶数- [R选项已经显著增加,在过去几年。现代电子调制的连续波二极管激光器是具有成本效益的,并且可以与前所未有频率和速度进行操作。更昂贵的气体离子激光器擅长在激光光束质量,但需要外部关停(见下文),并经常广泛(水)冷却。
激励百叶窗:声光调制器(AOM)允许快速关停快速连续10。用于紧密关闭与机械快门的AOM的组合建议。 AOM的因连续曝光这种方式广泛加热避免光从在关闭位置AOM的泄漏被抵消。
透镜被用于扩大激光束,并且将它们聚焦在物镜的后焦平面。这种方式,激发光离开目标作为一个平行光束(图3),这是需要的TIRF照明样品。移动后焦平面内的焦点从中心到物镜的周边将改变光束离开目标处的角度,但不是在检体中的激光点的位置(图3),这是一个功能整体光束形状。 TIRF照明接着发生在一个关键的角,其可以使用一组反射镜用作潜望镜翻译物镜的焦平面内的激光的聚焦点的调整。透镜应当色校正,并且可以在一组两个或三个透镜中使用。的三透镜系统包括两个透镜充当望远镜扩大激光束(并因此在试样照射点)和第三透镜到加宽光束聚焦到物镜(图4)的后焦面。这两种功能(望远镜和聚焦)也可以通过仅两个透镜的组合来实现( 见图 4)。
<p class=“jove_content”>镜子至少应为95%的反射,以避免激光光的损失。对于每个波束调整一组两个反射镜,通常为这样的布置施加足以精确地调节激光束的任何角度和位置。分色叠加反射和透射光不同的特定波长的和被用于重叠或分开的两个激光器的光束。
Polychroic过滤器比二向色滤光片更加复杂,并且需要反映传入激发光传输离开发射光从标本。它们被置入物镜和显微镜镜筒透镜之间的滤波器立方体。
清理过滤器 :根据激光雇工三维激光的类型清理过滤器具有窄传输带宽应放置在激光束离开激光之后。
陷波滤波器旨在有效地吸收激光具有窄带宽和传输所有其它光。它们被放置在排放路径中,以过滤掉任何杂散激光激发光。然而,陷波滤波器在0°入射角只工作。如果带宽的陷波滤波器的非常尖锐,在不同的角度进入的可能不会反映任何更多。阻挡的准直的激光的激光光没有受到影响,但背散射光可能不被有效地从到达照相机阻碍。
配备有适当的过滤器轮机动滤光轮可以容易地放置在激发和发射通路,并允许不同的光强度(当装有ND滤镜)或荧光通道(间简单的切换时,放置在一个氙或汞弧灯的比率的前钙成像或在摄像机前选择用于发射的荧光团)。
50:50立方体分束器Ç一个用于激光束分裂成两个单独的激发束的路径,并也将它们组合在潜望镜的前面。
光束分离器(发射路径):对于无需任何物理过滤的变化快速图像获取,发射光束被分成一个蓝移和红移通道。原则上,分束器可以通过采用分色楔形或一组反射镜和二向色镜来分离发射光束中的波长依赖性方式来建立。需要两个发射滤光片清理发射频道。
空间滤波器:激发光束的空间滤波,有时需要除去从低质量的激光束发射的非平行光线。空间滤波器由双透镜望远镜的小针孔两个镜头的焦点准确地放置。从激光束的非平行部分所得这样的杂散光变得有效阻止。苏建立TIRF为基础的显微镜时,通道必须满足的条件。空间滤波随较小的针孔,这更难以定位到焦点,并与第一透镜的较小的焦距。以减少所造成的透镜像差的影响是有利的使用,而不是简单的镜片高质量和无限远校正显微镜物镜与低倍率(10倍或20倍)。
潜望镜:甲潜望镜的设置是必要的,以平移的目标,对于TIRF成像的先决条件的后焦平面内的聚焦激光束。它可以由两个两英寸镜,用于调整所述第一反射镜和后用于定位第二反射镜,以反映加宽和聚焦激发束到显微镜(图5)的平移阶段容易地建造。
摄像头:背照式电子倍增电荷耦合器件(EMCCD)常规用于的单分子信号的记录。这是因为它们的高量子效率(高达95%),高采集速度(高达30MHz)和相对低的噪声。在冷却至-80℃降低热噪声,并支撑由若干现有EMCCD相机。所述EMCCD技术的一个限制是,相机噪声增大线性地在相机增益和信号被捕获。这是不符合科学的CMOS(SCMOS)相机,它们是显著更便宜,操作因SCMOS芯片的特殊结构比EMCCD相机也快得多的情况。然而,随着CMOS技术相关联的问题是,图像采集仍然缺少一定程度上的单分子水平的定量读数的,因为每个象素设有不同检测灵敏度。在主要这可以通过像素正常化来补偿,但该过程是决不琐碎11。这就是为什么我们还是义无反顾地重新赞扬SCMOS相机为单分子显微镜,但鉴于这项技术的飞速发展,SCMOS相机可能很快成为首选的摄像头。慢扫描CCD相机摄像机避免放大相关的噪音和像素方差在一起,支持他们是否可以在一个所谓的“运动”模式下运行最快的采集速率。在这种模式下,除了感兴趣区域(ROI)的区域中的整个摄像机芯片被屏蔽,这使得它能够在芯片本身采用作为存储设备。后的ROI被暴露首次,所得电荷移入芯片像素线通过像素线,其中该图像被从进一步曝光保护的掩蔽区域。一旦变速ROI的所有行的进掩模区完成时(在亚毫秒范围内),将ROI本身是准备进行下一次的曝光。该循环被重复,直到CCD芯片的所有像素线被充电。该芯片然后读出缓慢显着热度CED读出噪声。例如1000×1300像素的芯片上,20 ROI的50×50像素可以被记录在快速连续。因为图像残留的芯片为一相当长的时间上之前被读出的,重要的是,以确保高质量的掩蔽和冷却相机(例如用液氮),为减少过多的热噪声的装置。一些EMCCD相机还支持动态模式。
软件:激光器,百叶窗,声光调制器和相机曝光时间以及合适的图像存储是不可或缺的任何成功的成像实验。在主营许多定义的操作可以与可用的软件包,来与摄像机进行编程。商业软件包支持的硬件外围设备,它可以与小技术知识来实现大量。
脉冲发生器,数据采集(DAQ)板(带模拟和数字输出通道)和示波器:脉冲发生器是很好的选择,以触发脉冲转换成规定的时间和电压脉冲。这样的激光器可以被精确地控制输出功率,并定时在毫秒到亚毫秒范围。数据采集板带模拟输出达到相同的,而且很容易通过PCI插槽,集成到计算机主板。脉冲持续时间,幅度和频率用示波器验证。
整个激发光束路径的外壳:为了避免由于空气对流整个激发光束路径应该从它的实验室环境括波动激发轮廓。导电TIRF显微镜当这一措施是特别重要的。光学组件也防止灰尘和激光照射人眼。外壳可以从黑卡板,它可以在艺术用品商店购买方便地构建。
要确定SLB荧光恢复Photobleac后的流动性兴(FRAP)测量12被执行。为FRAP两个激发光束路径的存在是可取的( 见图 3)。第一光束路径被设计成图像的双层的荧光。这可以在TIRF配置和低的光强度来实现。第二束路径应允许一个短但强烈漂白脉冲,并应在非TIRF模式来配置,使得它离开物镜沿着光轴。圆形孔可以放入激发光束路径( 见图 8)为将具有限定边缘的完美的圆形漂白轮廓。为了这个图象孔径到物体面,其最佳位置将是在透镜3的焦平面( 见图 3)。然而,由于该透镜的长焦距,也可以产生足够的质量孔径图像,当光圈置于略微偏移的位置。
其执行T中之后他成像实验的原始数据必须进行适当的分析。几个步骤一步协议提供,覆盖的主要设置(例如照明的功率和时间,TIRF角)的调整,获取和分析数据。
单分子显微镜,为研究它们的天然细胞环境中的蛋白质的活动的独特机会。分子影像变得越来越多,因此向广大科学界有吸引力,但许多生命科学家仍然回避的技术和专业知识的初始投资。从组装自己的成像系统产生的主要好处是,它可以容易地调整到任何人的特定需要。
如本文中所提出的非TIRF激发束可以除了现有的TIRF光路径容易地实现,若荧光团和配体的快速和限定光致漂白(或-activation)是期望的,例如,在执行时FRAP或配体解笼锁实验14 。发射光束分离器的引入允许同时记录的至少两个且在一些情况下,多达四个荧光通道。扩展的列表是在本质上仅由自己的想象。
例如,实现在发射路径的机动发射滤光轮允许多达10种不同的荧光通道之间快速切换。当组合两个机动发射滤光片轮(各装有10过滤槽)串联,多达18个荧光通道能够被读出。全内反射荧光为基础的成像可以补充钙动员测量和一体化氙气或汞激发灯路径后,干扰反射显微镜(IRM)。 IRM是选择的方法来可视化,以使细胞附着在玻璃表面或一个SLB和解释的TIRF基于成像数据时可以容易地提供重要的信息的程度。建立的加宽激发光束与使用简单的分色镜和405的附加的激光波长可以进行光活化定位显微镜(PALM)或随机光学重构显微术(STORM),即2 superresolut离子的方法用下面的可见光15,16衍射极限的位置精度。
然而,实验的成功不仅是适当的硬件的问题。为了充分利用的噪声减少的TIRF基于成像,细胞应该接触到表面在不强加限制在细胞表面上或与它们的质膜的生理学干扰一种时尚。的SLBs官能适当的蛋白质为细胞粘附都超过适合于这个目的,因为所有的SLB包埋配位体是横向移动,并调整它们在双层内横向位置响应于受体结合和偏析动力学。
要在再现的方式制造SLBs中,最好是一开始就使用高纯度的越野车。如本文所述,它是由此临界去除多层囊泡,这些超声处理过程中也产生,两个超速离心步骤,因为这些我nterfere与邻接的SLBs具有高流动性的形成。只有在清洁玻璃表面的高质量形式的SLBs。一旦清洗玻片应立即使用或储存于真空。重要的是,必须的SLBs从未暴露于空气,因为这将导致其破坏。 SLB洗涤涉及,如所示,缓冲漂洗与使用血清吸管的,因为这不仅是一个节省,而且节省时间的过程。
在收获SLB驻留蛋白的纯化和应避免使用洗涤剂。这是因为,洗涤剂会显著减少即使当痕量存在的蛋白质的移动性。规避需要洗涤剂一起,分泌多组氨酸标签配备配体的可溶性表达,建议在哺乳动物或昆虫细胞。如果从大肠杆菌包涵体复性是必需的,必须谨慎施加有效地从包涵体之前,他们的非折叠和除去洗涤剂。
用从他们的模块化和reconstitutive性质,它允许专供解剖细胞活化和细胞粘附的给定受体 – 配体相互作用的作用的SLBs结果的一个主要优点。在这方面,要提到,DGS NTA镍应该存在于SLB在10%以内,以防止蛋白质竞争NTA-NI的结合位点是很重要的。当使用的SLBs窝藏仅1%或2%的DGS NTA镍,在一个给定的多组氨酸标记的蛋白质种类的关联的降低可以注意到,尤其是当共孵育增加的第二多组氨酸标记的蛋白质种类的量(未公开观察)。与SLBs的具有10%DGS NTA镍工作时,这种现象没有得到遵守。
虽然我们已经从未观察到的非特异性进行测试,以含DGS NTA-Ni表面的SLBs任何聚组氨酸标签的蛋白的结合,这种可能性应当首次引入蛋白质时进行测试,为此,我们建议使用SLBs的缺乏DGS NTA镍(蛋白质不应该结合)的。其次,使用含DGS NTA镍的SLB时,蛋白质应彻底清洗SLB含300毫米咪唑的PBS后脱落。
用人的SLBs的另一个显著优点是短暂的相互作用和信号转导事件可以具有增强的时空分辨率17-19进行监测。这至少部分是因为三维装订处理基本上减少到两个成像尺寸,在噪声衰减的TIRF模式尤其录制时。使用的SLBs的是用单分子检测信号,为光激活定位显微镜(PALM)或随机光学重构显微术(STORM)的先决条件,即超分辨率显微镜用低于衍射极限15,16的分辨率兼容。这些特殊成像方式使单分子福斯特共振能量茶nsfer实验设计成可视化在突触环境20个别蛋白质-蛋白质相互作用。这种方法相当详细说明在一个朱庇特的出版物被称为“测量TCR转的pMHC使用基于FRET的显微镜测定法的结合”21。
当解释SLB-基于实验的每个人都应该记住,活细胞的质膜不是所有的属性由SLBs中的特点,而一些缺少的素质可能影响被调查的生理。毕竟,SLB-嵌入式蛋白自由扩散,而不是组织膜微,因为大多数的细胞同行的是5,6,22。从贴壁细胞,其保存活细胞在一定程度的质膜架构来自固定质膜片,已经被成功地用于研究从膜包埋抗原由B淋巴细胞23的摄取。然而,即使这样的膜不与高度动态细胞骨架相互作用,设有没有灵活性,因为它们是由硬质玻璃表面支撑。鉴于这些差异的存在显然需要工程SLBs中,通过可调节的灵活性表面或通过改变它们的刚性应对局部应用光脉冲面都支持它提供手段来划分的蛋白质以定义的方式,哪些。
The authors have nothing to disclose.
MA是由奥地利科学基金会(FWF,J3086-B11)和感谢的薛定谔奖学金马克斯 – 普朗克协会的财政和行政支持的支持。 GS是由维也纳科技基金(WWTF,LS13-030)的支持。 JH是由维也纳科技基金(WWTF,LS14-031)的支持。
#1.5 glass slides | VWR | 631-0853 | |
250ml round bottom flask | VWR | 201-1357 | |
50:50 beam splitter cubes | Thorlabs | BS013 | |
Acousto-opitcal modulator C1205-2 | Isomet | – | only necessary if CW lasers, which cannot be modulated, are used |
Alexa Fluor 488-NHS | Life technologies | A-20000 | |
Alexa Fluor 555-NHS | Life technologies | A-20009 | |
Alexa Fluor 647-NHS | Life technologies | A-20006 | |
autoclave tape | VWR | 489-1312 | or any other heat-stable sticky tabe |
Avanti Mini-Extruder | Avanti Lipids | 610000 | alternative to the bath sonicator |
bath sonicator QSONICA Q700 | QSONICA | Q700 | |
beam splitter | Cairn | P280/210/MLS | |
Büchi rotary evaporator | VWR | 531-0837 | |
camera | Andor | iXon Ultra 897 | see manuscript text for alternatives |
concentarted hydrogenperoxide | Roth | 9683.1 | |
concentrated sulfuric acid | Roth | X944.2 | |
epoxy glue | Uhu | 45705 | Uhu plus sofortfest 2min |
filter wheel | Sutter instruments | Lambda 10-2 | |
LabTek chambers | VWR | 734-2062 | |
laser | Toptica | – | different variants (wavelengths 375 – 785 nm) are available |
lens | Thorlabs, Newport | – | |
DGS NTA-Ni (lipid) | Avanti Lipids | 790404C | already in Choroform-solved delivered version of the nicekl salt variant is recommended |
POPC (lipid) | Avanti Lipids | 850457C | already in Choroform-solved delivered version is recommended |
microscope Zeiss Axiovert 200 | Zeiss | – | |
mirrors | Thorlabs | BB1-E02 | |
optical filters | AHF, Chroma, Semrock | – | filter sets are available for many different combinations of dyes |
oscilloscope | BK Precision | 2120C | |
phosphate buffered saline (PBS) | Life technologies | 14190-136 | degas before usage |
periscope | Thorlabs | RS99/M | |
picodent twinsil 22 | Picodent | 13001000 | alternative to the epoxy glue |
power meter Lasermate-Q | Coherent | – | any powermeter sensitive in the used spectral range will do |
pulse generator | Stanford Research Systems | SRS DG535 | |
spatial filter | Thorlabs | KT310/M | |
syringe filter 0.2µm | Millipore | GVWP04700 | |
TIRF-capable apochromat objective 100x, NA 1.46 | Zeiss | 440782-9800-000 | |
trichloromethane/chloroform | Roth | 3313.1 | |
tubes forultracentrifugation polycarbonate 1.00 mm, 11 mm x 32 mm | Thermo Fisher | 45237 | |
Sorvall ultracentrifuge | Thermo Fisher | RC M150GX | |
ultracentrifuge rotor | Thermo Fisher | S120-AT2 | |
UV spectrophotometer Nanodrop 2000c | Thermo Fisher | – | |
vacuum pump | VWR | 181-0248 |