We present a protocol for capturing the dynamics of zebrafish larval tail fin regeneration on a whole-tissue scale using brightfield-based stereomicroscopy. This technique enables capturing the regeneration dynamics with single cell resolution. This methodology can be adapted to any stereomicroscope equipped with a CCD camera and time-lapse software.
The zebrafish larval tail fin is ideal for studying tissue regeneration due to the simple architecture of the larval fin-fold, which comprises of two layers of skin that enclose undifferentiated mesenchyme, and because the larval tail fin regenerates rapidly within 2-3 days. Using this system, we demonstrate a method for capturing the repair dynamics of the amputated tail fin with time-lapse video brightfield stereomicroscopy. We demonstrate that fin amputation triggers a contraction of the amputation wound and extrusion of cells around the wound margin, leading to their subsequent clearance. Fin regeneration proceeds from proximal to distal direction after a short delay. In addition, developmental growth of the larva can be observed during all stages. The presented method provides an opportunity for observing and analyzing whole tissue-scale behaviors such as fin development and growth in a simple microscope setting, which is easily adaptable to any stereomicroscope with time-lapse capabilities.
The ability of an organism to orchestrate tissue repair processes after injury is crucial for its survival 1. While all animals have the capacity to heal their wounds, the extent to which tissues regenerate differs greatly among species. Vertebrate species such as zebrafish, salamanders and frog tadpoles have the remarkable ability to regenerate lost tissues, including their appendages, portions of their eyes, heart, and central nervous system 2-4. Mammalian species, such as the African spiny mouse and rabbits, are capable of regenerating holes in their pinnae 5-7, and humans and mice regenerate portions of their liver as well as their digit tips during fetal and juvenile stages 8-12. Although it is not well understood yet why and how certain species regenerate tissues more effectively than others, the presence of similar genetic pathways suggests that these mechanisms may lie dormant in species without great regeneration potential 13,14. Thus elucidating tissue repair and regeneration mechanisms in species with satisfactory regeneration outcomes will benefit regeneration in humans.
We have chosen the larval zebrafish tail fin as a paradigm to demonstrate its regeneration with time-lapse brightfield stereomicroscopy. The zebrafish larval tail fin is anatomically simple as compared to the more complex adult structures, consisting of a two-layered, infolded epithelium with somatosensory axons innervating the skin that surrounds medially located mesenchymal cells 15. Despite the anatomical differences, larval tail fin regeneration is somewhat comparable to adult fin regeneration in terms of the molecular signatures and the outgrowth responses 16,17. As compared to the adult fin, imaging larval tail fin regeneration has however several advantages: 1) larval fin regeneration is completed within just 2-3 days 16, 2) larvae can be mounted in low-melt agarose, and 3) larvae do not require feeding until ~ 5 days post fertilization (dpf) due to the presence of the yolk sac. This makes zebrafish larvae ideal for observing tissue repair dynamics in vivo.
The presented method enables the capture of detailed dynamics underlying the early processes of fin regeneration. Many studies have utilized fluorescence-based confocal microscopy to study cellular and subcellular biological processes in embryonic and larval zebrafish. Sophisticated confocal imaging setups are however often not accessible to everyone and highly expensive as compared to other imaging techniques. In contrast, the presented methodology utilizes a Discovery V12 stereomicroscope equipped with Axiovision software and a time-lapse module, thus providing a more affordable alternative to expensive imaging equipment to examine tissue behaviors. We demonstrate that this method can be utilized for imaging tissue regeneration with high temporal resolution at a minimal cost. The implications for this method could extend beyond basic biology to advance mammalian regeneration studies using organ cultures, for therapeutic development through pharmacological and genetic screens, and it can serve as a teaching tool in a classroom setting.
Представленный метод позволяет наблюдать заживление ран и регенерацию тканей живых данио личинок в естественных условиях покадровой съемки на светлое стереомикроскопом, используя сравнительно простую настройку. Эта процедура требует определенных важных аспектов, которые мы протестировали, которые будут оптимизировать результат: 1) Низкие агарозные концентрации (~ 0,5%) позволит свести к минимуму роста препятствий на постоянно растущий личинок рыбок данио, 2) Удаление агарозы вокруг плавника важно не чтобы скрыть процесс заживления, 3) Захват агарозы в пластиковой сетки сохраняет агарозы и животных, в стабильном положении на протяжении всей процедуры, и 4) правильное контролируемой температурой окружающей среды, что очень важно для личинок жизнеспособности. Мы адаптировали с подогревом инкубационной камере 23,24, который использует пузырчатую пленку, что выявляется на картон, и проводной купол нагреватель для контроля температуры и правильной циркуляции воздуха с минимальными колебаниями вопроцедура визуализации. Этот простой и экономичный камера может быть подготовлен, чтобы соответствовать любому микроскопа. Похоже подогревом инкубационной камере была также использована для мышей изображений и развитие цыплят 24,29.
Мы полагаем, что до ампутировали личинки монтируются на заранее ампутации изображения, демонтированных для ампутации, и перемонтирована для покадровой обработки изображений. Хотя это возможно, чтобы выполнить следующие действия в одну стадию в конечном камере формирования изображения, в нашем опыте мы обнаружили, что ампутации хвостовой плавник на покровным стеклом не является оптимальным, так как он разрывает ткань и не привести к чистый срез. Агарозном Метод, основанный на ампутации, используя иглу шприца первоначально был описан Каваками и его коллеги (2004) 16, а также, по нашему опыту, идеально подходит для выполнения ампутации. Таким образом, довольно сложный ряд шагов, которые мы представили вполне оправдано и обеспечивает оптимальный результат регенерации.
Мы показали, что larvаль данио в 2 денье могут быть отображены до 1,5 дней в агарозы и решения Tricaine. Мы использовали Tricaine (рН 7) рН раствора, оптимизированные подготовленный с помощью функции мгновенного океана соли, которая не мешает здоровья особи за представленный период формирования изображений. Мы ранее, однако, также показали, что с помощью Tricaine в Danieau среды позволяет покадровой визуализации 2,5 DPF личинок рыбок данио на конфокальной микроскопии, по крайней мере, 2 дней 30. Таким образом, оптимальные условия буфер может продлить личинок здоровье и продолжительность визуализации. С другой стороны, более низкие концентрации Tricaine могут быть использованы для анестезии или 2-феноксиэтанол, который мы обнаружили хорошо переносится во личинок и взрослых стадий при 28 ° С в течение по меньшей мере 60 ч.
Чтобы избежать дефектов в ребра регенерации, мы удалили агарозы из хвостового плавника до визуализации. Наши данные показывают, что в течение 1,5 дней плавник регенерируют до примерно 60%. Это скорость восстановления согласуется с предыдущим исследованием, определяющего 3 дней вš среднее время для регенерации хвостового плавника у рыбок данио личинок до 6 DPF 16. Альтернативные методы агарозы, однако, может быть использован для установки рыбы для визуализации. Например, тонкий плазменный сгустков 31 или фторированный этилен-пропилен (FEP) трубки, покрытые метилцеллюлозы и наполненные очень низких концентрациях агарозы (0,1%) были рекомендованы для легкой листовой микроскопии 32 и могут быть пригодны для нашего, представленном способе. Тем не менее, мы не рекомендуем метилцеллюлозы и 0,1% агарозы, как они требуют, чтобы образец установлены в нижней части камеры из-за отсутствия кристаллизации из этих сред. Очень высокие концентрации метилцеллюлозы будет того генерировать воздушные карманы, основанные на нашем опыте, и они могут влиять на процедуры визуализации. Если эти средства являются предпочтительными с использованием нижнюю камеру, важно, чтобы соответствующее рабочее расстояние между объективом и образцом присутствует. Следует отметить, что тэтилцеллюлоза в качестве монтажной среды рекомендуется только до 1 дня, так как это может помешать личинок здоровья 32.
Монтаж образца в крышке может привести к медленной гравитационной вниз дрейфа. Поэтому рекомендуется, чтобы изображения нескольких секций в каждый момент времени, который может быть либо прогнозируемых в одной плоскости или только изображений, которые находятся в фокальной плоскости могут быть извлечены для сборки окончательного фильма. Визуализация образец на дно камеры может быть альтернативной методологии, чтобы избежать возможных вниз дрейф. Плазменные сгустки может быть полезным, чтобы избежать дрейф, а плазма будет прилипать к внешней огибающей слоя (EVL, перидермы) 31 и, следовательно, может стабилизировать образца. Это, однако, должна быть проверена, а также, как долго личинок данио могут быть сохранены в плазменных сгустков, не мешая личинок здоровья или ребра регенерации.
Наша фильм был собран с использованием отдельных секций (26 мкм)записанного Z-стек, который охватывает всю толщину плавника (~ 10 мкм) и на долю которых приходится потенциального Z-дрейфа плавника во время процедуры визуализации. Для того, чтобы сохранить 3-D информации, это также можно Z-стеки в одиночных изображений проекта. Потому что это может привести к размытости изображения, светлое деконволюции может быть желательным. Программное обеспечение, такое как деконволюции или Autoquant X3 могут быть использованы для этой цели. Кроме того, математические алгоритмы (описанные в Tadrous 33) могут быть использованы для получения ФРТ функцию высоким соотношением сигнал-шум (SNR). Получение высокой SNR является одним из основных препятствий в светлое деконволюции. Хотя этот метод требует высокую контрастность и малую толщину образца, было бы целесообразно для визуализации хвостовой плавник из-за его уменьшенной ширины.
Явным преимуществом предложенного метода формирования изображения является то, что он быстро адаптируется к любому стереомикроскопа, снабженного ПЗС камерой ANd программного обеспечения покадровой и предлагает недорогую альтернативу для более дорогих систем конфокальной микроскопии. Хотя этот метод не использует флуоресценции для обнаружения клеток, он может быть продлен для таких приложений, путем использования автоматизированной системы управления жалюзи и пост-обработки изображений деконволюции программного обеспечения 34. Это позволит пользователям для дальнейшего наблюдения заживления раны и процессы регенерации с одной клетки или субклеточных разрешением в течение длительных периодов времени.
Оптическая прозрачность и легкость, с которой в зачаточном состоянии и личинок рыбок данио может быть обработан, и адаптивность этого метода к любому стереомикроскопом делает его пригодным для обучения основной позвоночных биологии в классной комнате. Этот метод может дать студентам лучше понять основные биологические процессы, лежащие в основе восстановления тканей и регенерации. Другие биологические процессы, которые были захвачены с аналогичным методом, данио эмбриональное развитие 23,34 и сердцафункция (не опубликовано). Этот метод также дает возможность для ремонта мониторинга раны и регенерации у личинок, которые были генетически и фармакологически манипулировать.
The authors have nothing to disclose.
We thank the MDI Biological Laboratory animal core service facility for zebrafish maintenance. Research reported in this publication was supported by Institutional Development Awards (IDeA) from the National Institute of General Medical Sciences of the National Institutes of Health under grant numbers P20GM104318 (for COBRE) and P20GM103423 (INBRE) and Department of Defense – USAMRAA (W81XWH-BAA-1) grant.
Reagents | |||
Bullseye Agarose (MidSci, Cat. No. BE-GCA500) | |||
Low-melt agarose (Fisher BioReagents, Cat No. BP1360-100) | |||
1-phenyl-2-thiourea [Alfa Aesar, Cat No. L06690] | |||
Instant Ocean Aquarium Salt (Pet store) | |||
Methylene Blue (0.1% solution) (Sigma, Cat. No. M9140) | |||
Tricaine (Ethyl 3-aminobenzoate methanesulfonate, Sigma-Aldrich, Cat. No. E10505) | |||
2-Phenoxyethanol (Sigma-Aldrich, Cat. No. 77699) | |||
Petri Dish 35 x 15 mm (BD Falcon, Cat. No 351008) | |||
Petri Dish 60 x 15 mm (BD Falcon, Cat. No 351007) | |||
Petri Dish 100 x 25 mm (BD Falcon, Cat. No 351013) | |||
5.75 inch boroschillate glass pipets (Fisher) | |||
35 mm Glass Top Glass Bottom Dish (MatTek Corporation, Cat No. D35-20-0-TOP) Glass: 0.085-0.115mm | |||
Superfrost/Plus microscope slides (Fisherbrand, Cat No. 12-550-15) | |||
Glass coverslips (Electron Microscopy Services, Cat No. 72191-75) | |||
Glass coverslips (Warner Instruments, Cat. No. CS-18R15) | |||
Phifer Phiferglass Insect Screen Charcoal – 48" (Home Depot) | |||
DOW CORNING® HIGH VACUUM GREASE | |||
Microloader pipette tips 20 µl (Eppendorf, Cat. No. 930001007) | |||
Fine Scissors – Sharply Angled Up (Fine Science Tools, Cat. No. 14037-10) | |||
3 mL Luer-Lok™ disposable syringe (BD, Cat. No. 309657) | |||
60 mL Luer-Lok™ disposable syringe (BD, Cat. No. 309653) | |||
23-gauge syringe needles (BD, Cat. No. 305145) | |||
Dumont #5 Forceps (Fine Science Tools, Cat. No. 11295-00) | |||
Equipment | |||
LabDoctor Mini Dry Bath (MidSci) | |||
Zeiss Discovery.V12 compound microscope | |||
Zeiss Plan Apo S 3.5X objective | |||
Zeiss AxioCam MRm | |||
Zeiss Axiovision software, Release 4.8.2SP1 (12-2011) |