Methoden voor biopsie van vastus lateralis, de voorbereiding van gezuiverde mitochondria, en respirometrische profilering worden beschreven. Het gebruik van kleine spiermassa maakt deze techniek geschikt voor onderzoekstoepassingen.
Respirometrische profilering van geïsoleerde mitochondriën wordt vaak gebruikt om elektronen transportketen functie te onderzoeken. We beschrijven een methode voor het verkrijgen van monsters van menselijke Vastus lateralis, het isoleren van mitochondriën van minimale hoeveelheden van de skeletspier weefsel, en de plaat gebaseerd respirometrische profilering met behulp van een extracellulair flux (XF) analyser. Vergelijking van respirometrische profielen verkregen met 1,0, 2,5 en 5,0 ug mitochondria geven aan dat 1,0 ug voldoende is om ademhaling te meten en dat 5,0 ug levert gelijkmatig resultaat gebaseerd op vergelijking standaardfouten. Western blot analyse van geïsoleerde mitochondria voor mitochondriële marker COX IV en niet-mitochondriale weefselmarkeerder GAPDH geven dat er beperkte niet-mitochondriale verontreinigingen door dit protocol. De mogelijkheid om mitochondriale respirometry bestuderen in slechts 20 mg spierweefsel kunnen gebruikers individuele biopsieën voor meerdere eindpunten in klinische gebruikonderzoeksprojecten.
Mitochondriën zijn de primaire energieproductie sites in de cel een belangrijke rol bij veroudering en diverse leeftijd gerelateerde aandoeningen zoals cardiovasculaire aandoeningen, ziekte van Alzheimer, diabetes, kanker, en obesitas. Respirometrische profilering van geïsoleerde mitochondriën biedt een directe analyse van elektron transport keten (ETC) functie en heeft een belangrijke bijdrage geleverd aan ons begrip van mitochondriale biologie en haar rol in gezondheid en ziekte. Geïsoleerde mitochondria worden gebruikt om verschillende aspecten van bio-energetica zoals, substraattransport, ATP synthase activiteit, proton lek, etc. De in deze handschrift beschreven methode is geoptimaliseerd respirometrische analyse van mitochondria geïsoleerd uit skeletspier weefsel biopsieën verkregen bij proefpersonen toe te bestuderen. De biopsie protocol in dit manuscript beschreven werd gebruikt door onze medewerkers voor de afgelopen 12 jaar. Onze groep heeft uitgevoerd meer dan 700 procedures op volwassenen van verschillende leeftijden,tot 90 jaar oud, en verschillende chronische ziektetoestanden zonder nadelige veiligheid. Een belangrijk aspect van dit protocol is dat het specifiek is ontworpen om minimale hoeveelheden weefsel te gebruiken, waardoor het gebruik in klinische studies te vergemakkelijken.
Verschillende protocollen ontwikkeld voor het isoleren mitochondria. Fernandez-Vizarra et al. 1,2 beschreef een werkwijze voor het isoleren mitochondriën uit verschillende rattenweefsels en gekweekte cellen. Garcia-Cazarin et al. 3 heeft een werkwijze voor het isoleren mitochondria uit skeletspieren van ratten en muizen gerapporteerd. Werkwijze voor het isoleren mitochondria uit rattenhersenen werd ook gerapporteerd door Iglesias-Gonzales et al. 4 Gross, et al. Rapporteerde een 5 werkwijze voor het isoleren mitochondria met de barocycler en / of PCT shredder. Recentelijk Franko et al. 6 meldde een werkwijze voor het isoleren sterk verrijkt mitochondriën met anti-TOM22 Magnetische korrels.
Hoewel deze protocollen leveren uitstekende resultaten, weefsel grootte eisen zijn hoog in vergelijking met de in dit manuscript beschreven methode. Bijvoorbeeld, Gross et al. 5 gebruikt 1,5-1,8 g gastrocnemius en ongeveer 2 g van het nierweefsel. Evenzo Franco et al. 6 gebruikt 500 mg muis leverweefsel. Vanuit onze ervaring, typische opbrengsten die worden verwacht van percutane naaldbiopsie van de skeletspieren (vastus lateralis) range 100-200 mg. De mogelijkheid om mitochondriale functie getest 20-50 mg spierweefsel volgens de hieronder beschreven protocol laat gebruikers meerdere bepalingen uit te voeren per biopsie en opslaan monsters voor toekomstig gebruik in andere moleculaire biologische experimenten. Dit is een cruciale functie in klinisch onderzoek en andere studies die ijverig gebruik van samples nodig. Opgemerkt moet worden dat eerder bevroren mitochondria niet goed voor het bestuderen gekoppeld ademhaling door outer mitochondriale membraan schade en verlies van cytochroom C-activiteit. Onze werkwijze is aangepast en gewijzigd vanaf de methode gepubliceerd door Chappell en Perry 7.
Met behulp van de in dit manuscript beschreven methoden, hebben we onlangs gemeld dat de respirometrische profiel van mitochondriën geïsoleerd uit menselijke Vastus lateralis is direct gecorreleerd met fysieke vermogen, gemeten als loopsnelheid 8.
Geïsoleerde mitochondria worden vaak gebruikt in studies die de rol van ETC functie en andere mitochondriale activiteiten, waaronder substraattransport en TCA cyclusfunctie onderzoeken. Respirometrische testen met behulp van geïsoleerde organellen toestaan rechtstreeks onderzoek van de fundamentele processen van oxidatieve fosforylering en de intrinsieke eigenschappen van de ETC. Respirometrische profilering van geïsoleerde mitochondria in vergelijking met gehele cellen of permeabel spiervezels heeft de voordelen van relatief eenvoudige interpretatie van de gegevens en de afwezigheid van "storing" van niet-mitochondriale processen of veranderingen in mitochondriale massa / biogenese. Normalisatie van geeft de mitochondriale eiwitgehalte, waardoor eenvoudig onderling kunnen vergelijken mitochondriën tussen de monsters. Respirometrische profilering van geïsoleerde mitochondriën is een voorkeur aanpak bij het doel van het onderzoek is om te bepalen onderliggende mechanismen en de specifieke doelen, zoals ETC components / complexen, of mitochondriaal transport mechanismen.
Beschreven is een protocol voor spierbiopsie en isolatie van functionele mitochondriën van kleine weefselmonsters. Deze methode levert reproduceerbare resultaten tussen de gebruikers te wijten aan het gebruik van een geautomatiseerd homogenisator versus handbediende dounce homogeniseerapparaten. Isolatie van mitochondria kan worden uitgevoerd met slechts 20 mg van spierweefsel. Het bedrag van geïsoleerde mitochondriën die kunnen worden verkregen uit deze steekproef voldoende groot is om Seahorse-plaat gebaseerd respirometry draaien terwijl overschot mitochondriën voor andere experimenten en opslag voor verdere moleculaire analyses. Opgemerkt zij dat deze werkwijze kan worden vertaald naar de XF 96, waar nog kleinere hoeveelheden mitochondria worden gebruikt (1-2 ug per putje).
Verscheidene protocollen voor het isoleren mitochondria afhankelijk dounce homogenisatoren initiële weefselverstoring. Een nadeel van deze methode is de praktische aard van het initiële weefselhomogenisering. De kracht en de snelheid van de stamper in de homogenisator kan sterk variëren tussen de exploitanten 6. Dit kan resulteren in experiment tot experiment variatie en lab tot lab variatie, en leidt tot moeilijkheden bij het vergelijken van gegevens tussen experimenten. Dit is van bijzonder belang in de menselijke interventiestudies bij de gegevens van de deelnemers worden verzameld op verschillende tijdstippen, meestal vóór en na de behandeling, en mogelijk op meerdere plaatsen. We maken gebruik van een geautomatiseerde homogenisator voor een meer consistente aanpak die meer reproduceerbare resultaten met beperkte persoon tot persoon verschillen oplevert. De snelheid van bereiding maakt deze aanpak geschikt voor het hanteren van meerdere monsters tegelijk. Meestal kan tot drie experimenten worden uitgevoerd in een enkele dag.
Mogelijke beperkingen van de hier beschreven techniek ontstaan door het gebruik van geïsoleerde organellen en het gebruik van een plaat gebaseerd formaat. Bijvoorbeeld, Picard et al. hebben demontoond dat geïsoleerde mitochondriën bezitten functionele eigenschappen die fundamenteel verschillen van die van intacte mitochondriën in gepermeabiliseerde myovezels. Ze stelden mitochondriale isolatietechnieken resulteren in gewijzigde bioenergetica functie als aanzienlijk toegenomen RCR opzichte permeabel spiervezels gaan met een grotere productie van reactieve zuurstof 13. Vergeleken met gepermeabiliseerd spiervezels, isolatie van mitochondria vereist langere bereidingstijd. Ook verlies van cellulaire gehalte vermindert fysiologische relevantie, iets dat wordt vastgehouden in volledige cellen en zelfs gepermeabiliseerd vezels. Het gebruik van de plaat gebaseerd respirometry met de beschreven techniek het toelaat repliceren runs per monster. Echter, moet mitochondriën goed aan de bodem van elk. Deze configuratie verschilt van de normale omgeving en kunnen beïnvloeden functionele eigenschappen. Voorts zij opgemerkt dat het gebruik van dit protocol voor mitochondriële isolatie ther,e kunnen nog verontreiniging van het endoplasmatisch reticulum (ER) in het mitochondriale preparaat. Verschillen in ER verontreiniging kan de bepaling van de mitochondriale opbrengst en invloed resultaten beïnvloeden.
Kortom, deze studie bevat gegevens die bevestigt dat mitochondriën geïsoleerd uit weefsels met behulp van deze procedure functioneel actief en kan worden gebruikt voor onderzoek / toepassingen die hoogwaardige geïsoleerde mitochondriën van minimale skeletspier monsters vereisen. Het voordeel van deze methode is dat: i) het is mogelijk om mitochondriën te isoleren van geringe hoeveelheden van skeletspieren, ii) de werkwijze is snel, iii) de plaat gebaseerde technologie, is het mogelijk om meerdere monsters draaien op hetzelfde moment, en iv) er genoeg van overtollig weefsel en geïsoleerde mitochondria na de bio-energetische test voor opslag van monsters en andere moleculaire biologische onderzoeken.
The authors have nothing to disclose.
We would like to thank Dr. Marc Liesa, Boston University School of Medicine, helpful discussions; Ms. Karin Murphy, Ms. Heather Gregory, and Mr. John Stone, all from Wake Forest School of Medicine, for helpful technical assistance in the development of this protocol.
Equipment | ||
Name of the Equipment | Company | |
Homogenizer Bio-Gen PRO200 | BioExpress | |
Eppendorf Centrifuge 5804 R | Fisher Scientific | |
Deepwell late Rotor | Fisher Scientific | |
6mm University College Hospital Needle | Cadence | |
60cc syringe | Fisher Scientific | |
96-well plate reader | Tecan (Genios-basic) | |
Seahorse XF 24-3 analyzer | Seahorse Biosciences, Inc. | |
Protein gel system | Life Technologies (Invitrogen) | |
Kodak Gel Logic 112 | Carestream Health, Inc | |
Kodak camera assembly | Carestream Health, Inc | |
Consumables | ||
Name | Company | Catalog Number |
XF24 V7 Cell Culture Microplate and XF24 sensor cartridge | Seahorse Bioscience | 100850-001 |
100867-100 | ||
Potassium hydroxide (KOH) | Sigma-Aldrich Co | 221473 |
Hydrochloric acid (HCl) | Acros | 12421-0010 |
Dulbecco's Phosphate buffered saline | Lonza | 17-512F |
Potassium chloride (KCl) | Fisher Scientific | P333 |
MOPS | Fisher Scientific | BP308 |
EDTA | Fisher Scientific | BP118 |
Magnesium sulfate (MgSO4) | Sigma-Aldrich Co | M7506 |
ATP | Sigma-Aldrich Co | A9187 |
Fatty acid-free BSA | Calbiochem | 126575 |
Sucrose | Sigma-Aldrich Co | S0389 |
Bacterial proteinase | Sigma-Aldrich Co | P-8038 |
D-Mannitol | Sigma-Aldrich Co | M9546 |
KH2PO4 | Fisher Scientific | P284 |
Magnesium chloride (MgCl2) | Sigma-Aldrich Co | M9272 |
HEPES | Sigma-Aldrich Co | H3784 |
EGTA | Sigma-Aldrich Co | E3889 |
BCA protein assay kit | Sigma-Aldrich Co | PI23227 |
Succinic Acid* | Sigma-Aldrich Co | S3674 |
Pyruvic acid* | Sigma-Aldrich Co | P5280 |
Malic acid* | Sigma-Aldrich Co | 2288 |
ADP(K+ salt)* | Sigma-Aldrich Co | A5285 |
XF Cell mito stress test kit | Seahorse Biosciences | 101706 |
Tween-20 | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | SC-29113 |
NuPAGE 12% Bis-Tris Gel | Life Technologies (Invitrogen) | NP0343BOX |
Immobilin Transfer Membranes (0.45um) | Millipore | IPVH20200 |
MOPS SDS Running Buffer (20X)-500 ml | Life Technologies (Invitrogen) | NP0001 |
NuPAGE Transfer Buffer (20X)-1 liter | Life Technologies (Invitrogen) | NP0006-1 |
Primary antibodies (mAB to VDAC1/Porin) | Abcam | ab14734 |
Primary antibodies (mAB to GAPDH) | Abcam | ab9484 |
Anti-Mouse IgG (Goat), HRP-labeled | PerkinElmer | NEF822E001EA |
Anti-Rabbit IgG (Goat), HRP-labeled | PerkinElmer | NEF812E001EA |
*ADP, succinic acid, pyruvic acid, and malic acid should be adjusted to pH 7.4 with KOH only |