الاستخدام الناجح للخلية تتبع الأصباغ لمراقبة وظيفة خلايا المناعة وانتشار يشمل عدة خطوات حاسمة. وصفنا طرق: 1) الحصول على وموحدة مشرق، استنساخه التسمية جي مع الأصباغ الغشاء؛ 2) اختيار fluorochromes وشروط الحصول على البيانات، و3) اختيار نموذج لقياس انتشار الخلايا يعتمد على التخفيف صباغة.
الفلورسنت الأصباغ تتبع الخلية، إلى جانب تدفق الخلوي والصورة، هي أدوات قوية لدراسة التفاعلات ومصائر أنواع مختلفة من الخلايا في المختبر والمجراة. 1-5 على الرغم من أن هناك حرفيا الآلاف من المنشورات باستخدام هذه الأصباغ، وبعض تتبع الخلية الأكثر شيوعا التي تواجهها التطبيقات تشمل رصد:
المتاحة تجاريا خلية تتبع الأصباغ تختلف على نطاق واسع في كيمياء وممتلكاتهم مضان ولكن سقوط الغالبية العظمى في واحدة من فئتين استنادا إلى آلية لوضع العلامات على الخلية. "الأصباغ غشاء" الذي تمثله PKH26، هي دهون بدرجة عالية الأصباغ رقسم قبعة ثابت ولكن غير تساهمي في أغشية الخلايا، 1،2،11. "الأصباغ البروتين" الذي تمثله CFSE، هي الأمينية التفاعل الأصباغ التي تشكل روابط تساهمية ثابتة مع البروتينات الخلوية 4،16،18. كل فئة لها مزايا وقيود من صنعها. المفتاح لنجاح استخدامها، وخاصة في الدراسات متعددة الألوان والأصباغ التي تستخدم فيها عدة لتتبع أنواع مختلفة من الخلايا، وبالتالي لفهم القضايا الحاسمة تمكن من الاستخدام الأمثل لكل فئة 2-4،16،18،24.
وشملت البروتوكولات هنا تبرز ثلاثة أسباب مشتركة من النتائج السيئة أو متغير عند استخدام خلية تتبع الأصباغ. وهذه هي:
الأمثلة الواردة هنا توضيح كيف يمكن أن تؤثر هذه المتغيرات النتائج عند استخدام الغشاء و / أو الأصباغ البروتين لرصد تكاثر الخلايا.
الأساليب المذكورة هنا هي تلك التي وجدت في مختبراتنا المشتركة لمعظم موثوق تعطي أفضل النتائج لوضع العلامات باستخدام الأصباغ hPBMC غشاء 13،16،18 وphenotyping فرعية تتبع انتشار الخلايا اللمفاوية والغشاء أو باستخدام الأصباغ البروتين 2،11،13،16، 18. كما هو موضح في الشكلين 1 و 2، هو الأكثر بسهولة تحقيق وضع العلامات موحد مشرق عن طريق الحد من وجود الأملاح والفسيولوجية باستخدام تقنية الخلط الذي يؤدي إلى التعرض، متجانسة السريع لجميع الخلايا لنفس التركيز من الصبغة. لأن تلطيخ مع الأصباغ الغشاء يحدث من قبل في تقسيم طبقة ثنائية المادة الدهنية، يمكن أن المتغيرات الأخرى التي تغير تركيز صبغة مجانا يؤثر أيضا وضع العلامات كفاءة. على سبيل المثال، ووضع العلامات في أسفل الجولة البوليسترين أنابيب النتائج في تبييض أقل كفاءة من الأملاح قبل إعادة تعليق في C مخفف وأيضا في خفض تركيز صبغة مجانا نظرا لصبغ الامتزاز على جدران الأنبوب، ولا سيمابتركيزات أقل صباغة. كل العوامل تميل إلى إعطاء توزيعات أوسع من تلطيخ عندما يتم وضع العلامات باستخدام أنابيب البولي بروبلين أسفل المخروطية (أرقام 3 و 4 و غير منشورة النتائج). يمكن العمر ونوع العينة تؤثر أيضا عرض الذروة حتى عندما يتم استخدام إجراءات تلطيخ الأمثل. على سبيل المثال، السير الذاتية لنقاط البيع PKH26 الخلايا الليمفاوية المعزولة من الدم المسحوبة مجموعة طازجة من 14-20٪ (الشكل 3، المرجع 13 و نتائج غير منشورة) في حين السير الذاتية لمفاوية معزولة عن 24 عينة الدم ساعة قديمة أو مجموعة الفلاتر TRIMA فصادة 25-30 ٪ (الشكل 4 والمرجع 18).
تلطيخ التوحيد وإلى أي مدى يمكن استبعاد غير قابلة للحياة الخلايا من كلا تحليل ما إذا كانت تؤثر على قمم ابنة مميزة واضحة في تخفيف الصبغة الشخصي، وهذا بدوره يؤثر على اختيار نموذج الانتشار لاحتواء البيانات المرصودة (أرقام 5 و 6 </strong>). على الرغم من أن يستخدم ModFit (فيرتي برمجيات البيت، Topsham، ME) هنا كمثال على البرمجيات المستخدمة لتوليد المقاييس مثل مؤشر الانتشار والتردد السلائف (أرقام 3 و 5 و 6؛ الجدول 3)، وحزم البرمجيات الأخرى تحتوي أيضا على وحدات لتحليل بيانات الانتشار. وتشمل هذه FCSExpress (دي نوفو البرمجيات، لوس أنجلوس، CA) وFlowJo (شجرة نجوم، وشركة، آشلاند، OR). كل هذه البرامج استخدام غير الخطية تحليل المربعات الصغرى للعثور على تكراري الأنسب للبيانات الخام عن طريق تغيير الموقف، وارتفاع SD (أو العرض) من قمم جاوس تمثل أجيال متتابعة ابنة. مؤشر التكاثري (PI) والتردد السلائف (PF) هي التدابير الأكثر استخداما من مدى الانتشار. PI، على النحو المحدد من قبل ModFit، هو مقياس للزيادة في عدد الخلايا على مدى الفحص، قياسا إلى "مؤشر التحفيز" لفحص امتصاص ثيميدين. PF إرجاع جزء من الخلايا الأولية في populatأيون التي ردت على التحفيز المتكاثرة. وينصح الحذر، ومع ذلك، عند قراءة الأدب منذ المصطلحات تختلف إلى حد ما بين حزم البرامج (على سبيل المثال، وFlowJo ModFit استخدام تعاريف مختلفة وحسابات ما هو المقصود ب "مؤشر انتشار") 22.
واجهت أيضا القضايا الحرجة التي تمت مناقشتها هنا لوضع العلامات وتحليل انتشار الأصباغ مع الغشاء عند استخدام الأصباغ البروتين. على سبيل المثال، يجب أيضا الاهتمام الدقيق لتقنية خلط يتعين مراعاتها، جنبا إلى جنب مع استبعاد الخلايا الميتة / الموت، من أجل الحصول على توزيعات موحد وقمم ابنة مميزة عند استخدام CFSE (الشكل 6) 2-4،13،18،24. الاختيار المناسب للfluorochromes لphenotyping وتقييم الجدوى المهم أيضا تجنب التداخل الطيفي المفرط وعدم القدرة على الاعتراف خلايا الجسم المضاد إيجابية، لا سيما فيما مرئية الأصباغ البروتين ينبعث منها مثل CFSE 2-4،11،13،16،18 </sup>. الحد من تركيز صبغة تتبع يقلل المشاكل التعويض في قنوات الطيفية المجاورة ولكن يحد أيضا من عدد من الانقسامات الخلوية التي يمكن رصدها قبل خلية ابنة شدة تبدأ تتداخل مع تألق ذاتي. بدلا من ذلك، استخدام الأصباغ أحدث خلية تتبع مثل كلاريت ينبعث منها CellVue الحمراء بعيدة (سيغما الدريخ، سانت لويس، MO) أو البنفسجي ينبعث منها CellTrace البنفسج (الحياة تكنولوجيز، وغراند ايلاند، نيويورك) قد يقلل المشاكل التعويض (الشكل 6). وأخيرا، على الرغم من الأصباغ الغشاء تميل عموما أقل سمية لعرض 11،26، فمن الممكن أن الإفراط في تسمية الخلايا مع صبغة إما فئة من. ولذلك فمن الضروري دائما للتحقق من أن تركيز صبغة المستخدمة تتبع لم يغير وظائف الخلايا لتعقبها (الشكل 6) 3،13،16،18.
The authors have nothing to disclose.
The authors would particularly like to thank the following individuals for their technical and intellectual contributions to the development of these methods through the years: Bruce Bagwell (Verity Software House), Nadège Bercovici (IDM), Lizanne Breslin (Zynaxis Cell Science and PTI Research), Brian Gray (PTI Research), Jan Fisher (Dartmouth Medical School), Alice Givan (Dartmouth Medical School), Betsy Ohlsson-Wilhelm (SciGro, Inc.), and Mary Waugh (Dartmouth Medical School). They would also like to thank the Bowdoin class of 2006 from the Annual Courses in Research Methods and Applications of Flow Cytometry, which generated the data shown in Figure 2.
Flow cytometry was performed at Roswell Park Cancer Institute’s Flow Cytometry Laboratory, which was established in part by equipment grants from the NIH Shared Instrument Program, and receives support from the Core Grant (5 P30 CA016056-29) from the National Cancer Institute to the Roswell Park Cancer Institute, and at the Abramson Cancer Center Flow Cytometry and Cell Sorting Resource Laboratory of the University of Pennsylvania, which was established in part by equipment grants from the NIH Shared Instrument Program, and receives support from NIH #2P30 CA016520 from the National Cancer Institute. The work shown in Figures 3 and 5 was also supported in part by SBIR grant EB00228 from the National Institutes of Biomedical Imaging and Bioengineering (NIBIB) awarded to PTI Research, Inc.
Reagent or equipment | Company | Catalogue number | コメント |
Commercially Purchased | |||
7-Aminoactinomycin D | Sigma-Aldrich | A9400 | |
Bovine serum albumin (BSA) | Sigma-Aldrich | A4503 | |
Fetal bovine serum (FBS) | Atlanta Biologicals | S11150 | |
Hanks balanced salt solution (HBSS) | Life Technologies | 14175-079 | Calcium and magnesium free, without phenol red |
Human IgG Cohn fraction II and III globulins | Sigma-Aldrich | G-4386 | |
Mouse anti-human CD3-FITC | BD Biosciences | 349201 | Saturating concentration as determined by laboratory titration |
Mouse anti-human CD4-APC | BD Biosciences | 340672 | Saturating concentration as determined by laboratory titration |
Mouse anti-human CD4-PECy7 | BD Biosciences | 348799 | Saturating concentration as determined by laboratory titration |
Mouse anti-human CD8-FITC | BD Biosciences | 347313 | Saturating concentration as determined by laboratory titration |
Mouse anti-human CD8-APC | Caltag (Life Technologies) | MHCD0805 | Saturating concentration as determined by laboratory titration |
Mouse anti-human CD19-APC | Caltag (Life Technologies) | MHCD1905 | Saturating concentration as determined by laboratory titration |
Mouse anti-human CD25-APC | BD Biosciences | 340938 | Saturating concentration as determined by laboratory titration |
Mouse anti-human CD127-PE | BD Biosciences | 557938 | Saturating concentration as determined by laboratory titration |
Mouse anti-human CD3 | eBiosciences | 16-0037-85 | 1.0 mg/ml; azide free |
Mouse anti-human CD28 | eBiosciences | 16-0289-85 | 1.0 mg/ml; azide free |
PBS | Gibco | 21300-058 | |
PKH26 red fluorescent cell linker kit containing 10-3M PKH26 in EtOH and Diluent C | Sigma-Aldrich | PKH26GL-1KT or MINI26-1KT |
Procedures in Step 1 also apply to kits containing PKH67 or other CellVue dyes |
CellVue Claret far red fluorescent cell linker kit containing 10-3M CellVue Claret in EtOH and Diluent C | Sigma-Aldrich | MINCLARET-1KT or MIDCLARET-1KT | |
5-(and-6)-carboxyfluorescein diacetate, succinimidyl ester (CFDA-SE) | Invitrogen (Life Technologies) | C34554 | Non-fluorescent; cleaved by membrane esterases to form fluorescent amino-reactive carboxyfluorescein succinimidyl ester (CFSE) |
LIVE/DEAD Fixable Violet | Invitrogen (Life Technologies) | L34955 | |
Sterile 12 x 75 mm conical polypropylene tubes & caps |
VWR | 60818-102 | Gives better membrane dye staining efficiency (reduced dye adsorption; less cell loss during supernatant aspiration) |
12 x 75 mm round bottom polystyrene tubes |
Becton Dickinson | 21008-936 | |
Flow cytometer | BD Bioscience | FACSCalibur LSRFortessa |
Any cytometer able to detect FITC, PKH26, and 7-AAD (ex. 488 nm; em. 520 nm, 567 nm, and 655 nm, respectively) and APC ex. 633-640 nm; em. 660 nm) |
Flow cytometer | Beckman Coulter | LSRII CyAn | Any cytometer able to detect FITC, PKH26, and 7-AAD (ex. 488 nm; em. 520 nm, 567 nm, and 655 nm, respectively) and APC ex. 633-640 nm; em. 660 nm) |
Laboratory Prepared | |||
7-Aminoactinomycin D, concentrated stock |
NA | NA | 1 mg/ml in PBS. Freeze in aliquots and store at -20 °C. |
7-Aminoactinomycin D, working stock |
NA | NA | 100 μg/ml in PBS; prepare daily from 1 mg/ml frozen stock. |
IgG block | NA | NA | HBSS + 10 mg/ml Human IgG Cohn fraction II and III globulins + 10 mg/ml BSA. |