Частица ядра нуклеосомы состоит из октамера, который содержит четыре вида гистонов, и окружен левосторонней катушкой ДНК. Частицы ядра нуклеосомы играют важную роль в функции ДНК путем контроля уплотнения структуры ДНК и хроматина. Эта роль настолько важна, что гистоны являются одними из самых высокоплотных белков в эукариотах, от гороха, до коров и других организмов.Например, есть только две различные аминокислоты из 102 для гистонов H4 растений гороха, и коровы. У этих четырёх видов гистонов, которые образуют частицу ядра нуклеосомы H2A, H2B, H3, и H4, некоторые характеристики совпадают. Во-первых, они все малы, и содержат не более 135-ти аминокислот.Во-вторых, они имеют общий структурный мотив, гистонную складку. Гистонная складка состоит из трех альфа-спиралей, соединенных двумя петлями. Когда частицы ядра нуклеосомы собираются вместе, гистоные складки связываются друг с другом сначала во взаимодействии, которое описывается как рукопожатие, формируя два димера H2A, H2B и два димера H3, H4.После этого димеры H3, H4 образуют тетрамер, который далее формирует октамер частицы ядра нуклеосомы с помощью димеров H2A, H2B.Структура этотого гистонного октамера порождает обширные взаимодействия между гистонами, и намотанной вокруг них ДНК. Имеется более 100 водородных связей между гистонами и ДНК нуклеосомного ядра. И многие из них находятся между ними аминокислотные основами гистонов и сахаро-фосфатным остовом ДНК.Наконец, многие из аминокислот в каждом гистоне ядра это лизин или аргинин, которые имеют положительные заряды, эффективно нейтрализующие отрицательно заряженную основу ДНК.