L’élongation de la transcription est un processus dynamique qui change en fonction de l’hétérogénéité de la séquence de l’ADN en cours de transcription. Par conséquent, il n’est pas surprenant que la composition du complexe d’élongation varie également au cours de la transcription d’un gène.
L’élongation de la transcription est régulée via la pause de l’ARN polymérase à plusieurs reprises au cours de la transcription. Chez les bactéries, ces arrêts sont nécessaires car la transcription de l’ADN en ARNm est couplée à la traduction de cet ARNm en protéine. Cependant, chez les eucaryotes, la transcription est couplée au traitement de l’ARNm. Par conséquent, la pause de l’ARN polymérase autour des jonctions exon-intron est nécessaire pour augmenter l’efficacité de l’épissage de l’ARNm.
Ces arrêts de l’activité de l’ARN polymérase peuvent être réversibles ou irréversibles. En cas de pause réversible, des protéines telles que TFIIF, élongines, ELL, assurent que l’ARN polymérase reprenne son élongation après une brève pause. Cependant, si l’arrêt de l’activité de l’ARN polymérase est irréversible, cela devient un arrêt transcriptionnel. Si la transcription est arrêtée, alors l’enzyme ne peut pas reprendre l’élongation par elle-même. Dans une telle situation, les facteurs d’élongation tels que TFIIS et pTEFb permet à l’ARN polymérase II de lire la matrice d’ADN au niveau des sites d’arrêt de la transcription.
De plus, les facteurs de remodelage de la chromatine dépendant de l’ATP et les chaperons d’histones sont également impliqués dans la régulation de l’élongation de la transcription. Ensemble, ils peuvent modifier les positions des nucléosomes le long de l’ADN, le rendant accessible ou inaccessible à la machinerie de transcription.
Par conséquent, l’ARN polymérase a besoin de l’aide de plusieurs facteurs pour traverser la chromatine et des séquences spécifiques qui interfèrent avec la transcription.
