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Une plate-forme de machine virtuelle pour les professionnels non informatiques pour l’utilisation de l’apprentissage profond pour classer les séquences biologiques de données métagénomiques
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JoVE Journal Genetica
A Virtual Machine Platform for Non-Computer Professionals for Using Deep Learning to Classify Biological Sequences of Metagenomic Data
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Une plate-forme de machine virtuelle pour les professionnels non informatiques pour l’utilisation de l’apprentissage profond pour classer les séquences biologiques de données métagénomiques

DOI:
10.3791/62250-v

•

09:34 min

•

September 25, 2021

•

,
1Microbiome Medicine Center, Department of Laboratory Medicine, Zhujiang Hospital,Southern Medical University, 2Center for Quantitative Biology,Peking University, 3State Key Laboratory of Organ Failure Research,Southern Medical University

Capitoli

  • 00:07Introduction
  • 01:35The Installation of the Virtual Machine
  • 04:11Create Shared Folders and Prepare the Files for the Training Set and Test Set
  • 06:55Digitize the Biological Sequences Using “One‐Shot” Encoding Form
  • 07:27Train and Test the Artificial Neural Network
  • 08:12Result
  • 08:52Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Ce didacticiel décrit une méthode simple pour construire un algorithme d’apprentissage profond pour effectuer une classification de séquence à 2 classes de données métagénomiques.

Tags

Virtual MachineDeep LearningBiological Sequence ClassificationMetagenomic DataSpecies ClassificationGene Function ClassificationHost ClassificationDeep Learning FrameworkSequence ClassificationVirtualBoxUbuntu

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