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Quantification de l’organisation du collagène fibrillar avec des outils curvelet à base de transformation
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Quantifying Fibrillar Collagen Organization with Curvelet Transform-Based Tools
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Quantification de l’organisation du collagène fibrillar avec des outils curvelet à base de transformation

DOI:
10.3791/61931-v

•

07:58 min

•

November 11, 2020

•

,
1Laboratory for Optical and Computational Instrumentation, Center for Quantitative Cell Imaging,University of Wisconsin-Madison, 2Departments of Medical Physics and Biomedical Engineering,University of Wisconsin-Madison, 3Morgridge Institute for Research, Madison, Wisconsin, 4test,test

Capitoli

  • 00:04Introduction
  • 00:43CT-FIRE Fiber Extraction and Region of Interest (ROI) Analysis
  • 02:34Advanced CT-FIRE Post-Processing
  • 04:09CurveAlign Fiber Analysis: CT Mode Without Boundary
  • 05:03CurveAlign Fiber Analysis: CT-FIRE Mode with Boundary
  • 06:14CurveAlign Region of Interest (ROI) Analysis
  • 06:56Results: Representative Tumor-Associated Human Breast Cancer Tissue Microarray (TMA) Collagen Signatures
  • 07:26Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Ici, nous présentons un protocole pour utiliser un outil logiciel MATLAB à base de transformation de courbes et open-source pour quantifier l’organisation du collagène fibrillar dans la matrice extracellulaire des tissus normaux et maladie. Cet outil peut être appliqué sur des images avec des fibres de collagène ou d’autres types de structures en ligne.

Tags

Keywords: Fibrillar CollagenCollagen OrganizationExtracellular MatrixCurvelet TransformCT-FIREImage AnalysisFiber ExtractionRegion Of InterestPost-processing

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