Rivista
/
Genetica
/
Инструмент исследования ассоциаций путей для анализа GWAS информации о метаболических путях
JoVE Journal
Genetica
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetica
A Pathway Association Study Tool for GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Инструмент исследования ассоциаций путей для анализа GWAS информации о метаболических путях

DOI:
10.3791/61268-v

•

05:01 min

•

July 01, 2020

•

,
1Institute for Genomics, Biocomputing & Biotechnology,Mississippi State University, 2Corn Host Plant Resistance Research Unit,USDA-ARS

Capitoli

  • 00:05Introduction
  • 00:32Genome-Wide Association Study (GWAS) Data Loading
  • 00:57Load Linkage Disequilibrium (LD) Data Loading
  • 01:26Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Assignment
  • 01:56Significant Pathway Discovery
  • 02:35Rugplot Visualization
  • 03:21Results: Representative GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
  • 04:21Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Запустив Pathway Association Study Tool (PAST), либо через приложение Shiny, либо через консоль R, исследователи могут получить более глубокое понимание биологического значения результатов своего общегеномного ассоциативного исследования (GWAS), исследуя вовлеченные метаболические пути.

Tags

GWASGenome-wide Association AnalysisMetabolic PathwayPASTPathway Association Study ToolSNPsLinkage DisequilibriumGene AnnotationPathway AnalysisRug PlotsR ConsoleShiny

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

Измерение ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНО метилированных<em> INS</em> ДНК видов в образцах сыворотки человека как клетка смерти биомаркером Островок & beta;

Количественная оценка информации, кодируемых ген выражение уровня во время жизни модуляции под широкий диапазон диетическое ограничение в C. elegans

Метаболические маркировки и профилирование передачи РНК с помощью Macroarrays

Сверхнизкое ввода геном последовательность подготовки библиотеки от Tardigrade единичная

Методология для точного обнаружения метилирования митохондриальной ДНК

Высок объём идентификации генов регулирования последовательностей с использованием следующего поколения последовательности круговой хромосома конформации захвата (4C-seq)

Хромогенные На ситу Гибридизация SS инструмент для ВПЧ связанных головы и шеи диагностики рака

Навигация MARRVEL, веб-инструмент, который интегрирует геномику человека и модель генетики организма информации

Масса на основе спектрометрии протеомики анализа с использованием базы данных OpenProt откроет новые белки перевод с неканоническим открытом чтения фреймов

Метод изучения де Ново Формирование хрометинов доменов

Read Article