Rivista
/
Genetica
/
כלי מחקר של איגוד הנתיבים עבור ניתוחי GWAS של מידע על מסלול מטבולי
JoVE Journal
Genetica
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetica
A Pathway Association Study Tool for GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

כלי מחקר של איגוד הנתיבים עבור ניתוחי GWAS של מידע על מסלול מטבולי

DOI:
10.3791/61268-v

•

05:01 min

•

July 01, 2020

•

,
1Institute for Genomics, Biocomputing & Biotechnology,Mississippi State University, 2Corn Host Plant Resistance Research Unit,USDA-ARS

Capitoli

  • 00:05Introduction
  • 00:32Genome-Wide Association Study (GWAS) Data Loading
  • 00:57Load Linkage Disequilibrium (LD) Data Loading
  • 01:26Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Assignment
  • 01:56Significant Pathway Discovery
  • 02:35Rugplot Visualization
  • 03:21Results: Representative GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
  • 04:21Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

על ידי הפעלת כלי המחקר של איגוד הנתיבים (PAST), באמצעות היישום הנוצץ או באמצעות קונסולת R, החוקרים יכולים לקבל הבנה עמוקה יותר של המשמעות הביולוגית של תוצאות מחקר הקשר הגנום שלהם (GWAS) על ידי חקירת המסלולים המטבוליים המעורבים.

Tags

GWASGenome-wide Association AnalysisMetabolic PathwayPASTPathway Association Study ToolSNPsLinkage DisequilibriumGene AnnotationPathway AnalysisRug PlotsR ConsoleShiny

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

מדידת דיפרנציאלי Methylated<em> אח"י</em> DNA מינים בדגימות אדם סרום כמו מוות של תאים ביומרקר של איילט β

כימות של מידע מקודד על ידי גנים ביטוי רמות במהלך תוחלת החיים אפנון תחת הגבלת תזונה מגוון רחב C . elegans

תיוג מטבולית, יצירת פרופילים של RNAs העברה באמצעות Macroarrays

הגנום קלט ultralow רצף ספריית הכנה מ להצטננות Tardigrade

מתודולוגיה עבור איתור מדויק של מתילציה DNA מיטוכונדריאלי

זיהוי תפוקה גבוהה של ג'ין רצפים תקינה באמצעות רצף הדור הבא של כרומוזום מעגלי קונפורמציה ללכוד (4C-seq)

כרומוגניים היברידיזציה באתרו הכלי עבור אבחון הקשורות HPV וסרטן צוואר

ניווט MARRVEL, כלי מבוסס אינטרנט המשלבת גנומיקה האנושית ומודל האורגניזם גנטיקה מידע

ניתוחים פרוטאומיקס מבוססי ספקטרומטר מסה משימוש במסד הנתונים OpenProt לחשוף את הרומן חלבונים מתורגם ממסגרות קאנונית קריאה פתוחה

שיטה ללמוד דה נובו היווצרות של כרומטין דומיינים

Read Article