Rivista
/
Biochimica
/
Label-fri Immunoprecipitation massespektrometri workflow for storstilet nuklear Interactome profilering
JoVE Journal
Biochimica
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochimica
Label-Free Immunoprecipitation Mass Spectrometry Workflow for Large-scale Nuclear Interactome Profiling

Label-fri Immunoprecipitation massespektrometri workflow for storstilet nuklear Interactome profilering

DOI:
10.3791/60432-v

•

11:19 min

•

November 17, 2019

•

, ,
1Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado, 2Linda Crnic Institute for Down Syndrome,University of Colorado School of Medicine

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 01:07Preparation of Nuclear Extract
  • 03:45Immunoprecipitation of Endogenous Nuclear Bait Protein
  • 07:01Sample Preparation and LC/MS System Suitability
  • 09:09Results: A Single-bait Single-antibody IP-MS Experiment
  • 10:25Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Beskrevet er en proteomics workflow for at identificere protein interaktion partnere fra en nuklear subcellulære fraktion ved hjælp af immun affinitet berigelse af et givet protein af interesse og label-fri massespektrometri. Arbejdsprocessen omfatter subcellulære fraktionering, immunopræcipitation, filter Aided prøveforberedelse, offline oprydning, massespektrometri, og en downstream Bioinformatik pipeline.

Tags

Label-freeImmunoprecipitationMass SpectrometryNuclear InteractomeProtein-protein InteractionsSubcellular FractionationAffinity PurificationProteomics WorkflowCell LysisNuclear LysateDounce Homogenization

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

Sheathless kapillarelektroforese-massespektrometri for Metabolic profilering biologiske prøver

Time-løst elektrosprayioniserings Brint-deuterium Exchange-massespektrometri til at studere proteiners struktur og Dynamics

Løsning affinitetsrensede proteinkomplekser ved Blå Native PAGE og protein Korrelation Profilering

Lipid Droplet Isolation for Kvantitativ massespektrometri Analyse

Dyb proteomet profilering af Isobar mærkning, omfattende væskekromatografi, massespektrometri og Software-assisteret kvantificering

Optimal forberedelse af Formalin fast prøver for peptid baseret Matrix Assisted Laser Desorption/Ionisation massespektrometri Imaging arbejdsprocesser

Nitropeptid profilering og identifikation illustreret af angiotensin II

Prøve forberedelse til Sonde Elektrospray Ionization Mass Spektrometri

Kvantitativ analyse af cellulære lipidom af Saccharomyces Cerevisiae Ved hjælp af flydende kromatografi kombineret med tandem massespektrometri

Trinvis doseringprotokol for øget overførselstid i label-free impedansbaserede GPCR-analyser

Read Article