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Un pipeline complet pour isoler et séquencer les microARN et les analyser à l'aide d'outils Open Source
JoVE Journal
Genetica
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JoVE Journal Genetica
A Complete Pipeline for Isolating and Sequencing MicroRNAs, and Analyzing Them Using Open Source Tools

Un pipeline complet pour isoler et séquencer les microARN et les analyser à l'aide d'outils Open Source

DOI:

00:09 min

August 21, 2019

, ,

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 00:513’ Adaptor Ligation
  • 04:465’ Linker Ligation
  • 05:44Reverse Transcription (RT)
  • 06:33PCR Amplification and Agarose Gel Purification
  • 08:10Results: Representative MicroRNA Analyses
  • 08:49Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Ici, nous décrivons une stratégie étape par étape pour isoler les petits ARN, enrichir les microARN et préparer des échantillons pour le séquençage à haut débit. Nous décrivons ensuite comment traiter les lectures de séquences et les aligner sur les microARN, à l'aide d'outils open source.

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