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Sitio de Integración Retroviral Bidireccional Metodología de PCR y Flujo de Trabajo de Análisis de Datos Cuantitativos
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Bidirectional Retroviral Integration Site PCR Methodology and Quantitative Data Analysis Workflow
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Sitio de Integración Retroviral Bidireccional Metodología de PCR y Flujo de Trabajo de Análisis de Datos Cuantitativos

10,588 Views

•

12:53 min

•

June 14, 2017

DOI:

10.3791/55812-v

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10.3791/55812-v

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12:53 min
June 14, 2017

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1UCLA AIDS Institute,University of California at Los Angeles (UCLA), 2Department of Microbiology, Immunology, & Molecular Genetics,University of California at Los Angeles (UCLA), 3Departments of Biomathematics and Mathematics,University of California at Los Angeles (UCLA), 4Personalized Genomic Medicine Research Center, Division of Strategic Research Groups,Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, 5Department of Medicine,University of California at Los Angeles (UCLA), 6Department of Veterinary Biosciences, College of Veterinary Medicine,The Ohio State University (OSU)

Summary

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Este manuscrito describe el procedimiento experimental y el análisis de software para un ensayo de sitio de integración bidireccional que puede analizar simultáneamente el ADN de unión vector-huésped aguas arriba y aguas abajo. Los productos de PCR bidireccionales pueden utilizarse para cualquier plataforma de secuenciación aguas abajo. Los datos resultantes son útiles para una comparación cuantitativa de alto rendimiento de dianas de ADN integradas.

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Bidirectional Retroviral Integration Site PCRQuantitative Data Analysis WorkflowRetroviral Vector Integration SitesGene TherapyVector Host DNA JunctionsGenomic DNAPCR ReactionDNA PolymeraseDNA PurificationDNA DigestionRSAI EnzymeCviQI Enzyme

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Suryawanshi, G. W., Xu, S., Xie, Y., Chou, T., Kim, N., Chen, I. S. Y., Kim, S. Bidirectional Retroviral Integration Site PCR Methodology and Quantitative Data Analysis Workflow. J. Vis. Exp. (124), e55812, doi:10.3791/55812 (2017).

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