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Bio3D-web을 이용한 단백질 염기 서열 구조 역학 관계 조사

JoVE Journal
Biochimica

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Investigating Protein Sequence-structure-dynamics Relationships with Bio3D-web

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Bio3D-web을 이용한 단백질 염기 서열 구조 역학 관계 조사

DOI:

10.3791/55640-v

•

09:51 min

•

July 16, 2017

•

Shashank Jariwala*¹, Lars Skjærven*², Xin-Qiu Yao, Barry J. Grant

¹Department of Computational Medicine and Bioinformatics,University of Michigan Medical School, ²Department of Biomedicine,University of Bergen

Capitoli

00:05Titolo
00:40Structure Search and Selection (SEARCH)
01:46Multiple Sequence Alignment Analysis (ALIGN)
02:51Structure Fitting and Analysis (FIT)
03:52Principle Component Analysis (PCA)
05:24Ensemble Normal Mode Analysis (eNMA)
06:52Results: Bio3D-web Analysis of Adenylate Kinase
08:01Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Bio3D-web을 이용한 단백질 서열 - 구조 - 역학 관계에 대한 온라인 조사 프로토콜을 제시한다.

Tags

Protein Sequence-structure-dynamics Bio3D-web Protein Analysis Interactive Analysis Sequence Alignment Structure Superimposition Residue Conservation

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