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Bio3D-webとのタンパク質配列構造ダイナミクスの関係の研究

JoVE Journal
Biochimica

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Investigating Protein Sequence-structure-dynamics Relationships with Bio3D-web

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Bio3D-webとのタンパク質配列構造ダイナミクスの関係の研究

DOI:

10.3791/55640-v

•

09:51 min

•

July 16, 2017

•

Shashank Jariwala*¹, Lars Skjærven*², Xin-Qiu Yao, Barry J. Grant

¹Department of Computational Medicine and Bioinformatics,University of Michigan Medical School, ²Department of Biomedicine,University of Bergen

Capitoli

00:05Titolo
00:40Structure Search and Selection (SEARCH)
01:46Multiple Sequence Alignment Analysis (ALIGN)
02:51Structure Fitting and Analysis (FIT)
03:52Principle Component Analysis (PCA)
05:24Ensemble Normal Mode Analysis (eNMA)
06:52Results: Bio3D-web Analysis of Adenylate Kinase
08:01Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Bio3D-webを用いたタンパク質配列 - 構造 - 動態関係のオンライン調査のためのプロトコールを提示する。

Tags

Protein Sequence-structure-dynamics Bio3D-web Protein Analysis Interactive Analysis Sequence Alignment Structure Superimposition Residue Conservation

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