İki jetli bir CIJ ve dört jetli çok girişli girdap karıştırıcı (μMIVM) dahil olmak üzere sınırlı çarpma jeti (CIJ) karıştırıcı teknolojileri kullanılarak lipid nanopartiküllerinin (LNP’ler) sentezlenmesi için ayrıntılı bir protokol gösterilmiştir. CIJ mikserleri, tekrarlanabilir, türbülanslı mikro karıştırma ortamları oluşturur ve bu da monodispers LNP’lerin üretilmesiyle sonuçlanır.
Lipid nanopartikülleri (LNP’ler), iki COVID-19 haberci RNA (mRNA) aşısının onaylanması ve küresel kullanımıyla kanıtlandığı gibi, terapötik dağıtım araçları olarak muazzam potansiyellerini göstermiştir. Küçük ölçekte, LNP’ler genellikle mikroakışkanlar kullanılarak yapılır; Bununla birlikte, bu cihazların sınırlamaları, büyük ölçekte kullanımlarını engellemektedir. COVID-19 aşıları, kapalı çarpma jeti (CIJ) türbülanslı karıştırıcılar kullanılarak büyük miktarlarda üretilmektedir. CIJ teknolojisi, üretim hacimlerine göre ölçeklendirilebileceğinden emin olarak laboratuvar ölçeğinde üretim yapılmasını sağlar. CIJ karıştırmadaki temel kavramlar, karıştırma uzunluğu ve zaman ölçeğinin karıştırma boşluğundaki türbülans yoğunluğu tarafından belirlenmesi ve nanopartikül oluşumunun duvarlardan uzakta meydana gelmesi, yüzeylerde birikme ve kirlenme sorununu ortadan kaldırmasıdır. Bu çalışma, iki geometrili sınırlı çarpma jet karıştırıcı teknolojisini kullanarak LNP’ler yapma sürecini göstermektedir: iki jetli CIJ ve dört jetli çok girişli girdap karıştırıcı (MIVM). Her bir karıştırma geometrisinin avantajları ve dezavantajları tartışılmaktadır. Bu geometrilerde, LNP’ler, bir organik çözücü akışının (genellikle iyonlaşabilir lipitleri, ko-lipitleri ve stabilize edici PEG lipidlerini içeren etanol) sulu bir anti-çözücü akışı (RNA veya DNA içeren sulu tampon) ile hızlı bir şekilde karıştırılmasıyla oluşturulur. CIJ ve MIVM karıştırıcılar için çalışma parametreleri, kontrollü boyut, zeta potansiyeli, stabilite ve transfeksiyon etkinliği ile tekrarlanabilir LNP’ler hazırlamak için sunulmuştur. CIJ karıştırmaya kıyasla zayıf karıştırma (pipetleme çözeltileri) ile yapılan LNP’ler arasındaki farklar da sunulmaktadır.
mRNA bazlı terapötikler, bulaşıcı hastalıklar, genetik bozukluklar ve kanserler dahil olmak üzere çok çeşitli hastalıkların tedavisi ve önlenmesi için büyük potansiyele sahiptir1. Hücre zarı boyunca pasif olarak yayılabilen küçük moleküllü terapötiklerin aksine, hücre içi iletim için nükleik asitlerin kapsüllenmesi gerekir2. Kapsülleme, mRNA’ya hem yapı hem de stabilite sağlar, endositik yollar yoluyla hücre içi iletimlerini kolaylaştırır ve ayrıca nükleazlar3 gibi hücre içi ve hücre dışı bileşenlerden bozulmayı önler. mRNA’nın kapsüllenmesi ve verilmesi için inorganik nanopartiküller, polimerler, lipitler ve lipit benzeri malzemeler dahil olmak üzere bir dizi malzeme ve nanotaşıyıcı geliştirilmiştir1. Bunlar arasında, LNP’ler mRNA bazlı terapötikler için en belirgin dağıtım platformu olarak ortaya çıkmıştır4.
LNP’ler dört lipid bileşeninden oluşur: iyonlaşabilir lipid, kolesterol, zwitteriyonik lipid ve PEG-lipid stabilizatörü5. mRNA iletimi için uygun iyonlaşabilir lipitler, lipid hidrofobikliği ile üçlü bir amin grubu6’nın ayrışma sabiti (pKa) arasında dikkatli bir denge sergiler. İyonlaşabilir lipid pKa tipik olarak KC-2 (DLin-KC2-DMA), MC-3 (DLin-MC3-DMA) ve ALC-03157 gibi 6.0 ile 6.7 arasında bir pH’a sahiptir. İyonize olabilen lipid üzerindeki bu pKa kısıtlaması, hem nükleik asit polimerlerinin hidrofobik lipid tuzları olarak kapsüllenmesini hem de bir “endozom kaçış” işlemi yoluyla hücre içi iletimi sağlar. LNP’ler, tümü endozomun pH 7.4’ten pH ~ 58’e asitlenmesini içeren (çeşitli) endositoz yolları yoluyla bir hedef hücreye girer. İyonlaşabilir lipid pKa, LNP’lerin fizyolojik koşullar altında neredeyse nötr yüzeylere sahip olmasını, ancak asitleştirici bir endozomdakatyonik hale gelmesini sağlar 9. Bu pH yanıtı, Lipofektamin gibi transfeksiyon sistemlerinde kullanılan kalıcı katyonik lipidlerin aksine, yalnızca endozomal zarın seçici olarak bozulmasını, kapsüllenmiş nükleik asit polimerinin salınmasını sağlar ve hücre canlılığını korur. Kolesterol, LNP yapısında lipid akışkanlığını artıran hidrofobik, interstisyel bir moleküldür. Zwitteriyonik lipid yapısal bir rol oynar ve LNP yüzeyinde bir çift tabaka oluşturur. Poli (etilen glikol) -lipid (PEG-lipid), LNP’lerin toplanmasına direnen LNP yüzeyine bir polimerik sterik stabilizatör vererek LNP stabilitesini artıran bir kolloidal stabilizatördür. Bu, özellikle hidrofobik bir yağ gibi davranan iyonlaşabilir lipidin serbest baz formunu yeniden oluşturan pH’daki değişiklikler sırasında LNP’yi stabilize eder. Onpattro (patisiran) tarifi (bundan böyle LNP formülasyonu olarak anılacaktır) genellikle iyonize edilebilir lipid MC3, kolesterol, distearoilfosfatidilkolin (DSPC) ve sulu bir RNA10 çözeltisine karşı karıştırılmış etanol içinde çözülmüş PEG2000-DMG ile LNP formülasyonu için bir başlangıç noktası olarak kullanılır.
Nükleik asit polimerlerini kapsülleyen LNP’leri üretmek için çeşitli teknikler kullanılabilir ve bunların çoğu, lipitler içeren bir etanol akışının, ilgilenilen nükleik asidi (siRNA, mRNA veya DNA) içeren sulu bir akışla hızlı bir şekilde karıştırılması ortak temasına dayanır9,11,12,13,14. Bu bağlamda, pipet karıştırma ve vorteks karıştırma gibi yığın karıştırma işlemleri, karmaşık aletlerin kullanılması ihtiyacını ortadan kaldıran LNP’ler oluşturmak için basit bir strateji sunar12. Bununla birlikte, yığın karıştırma, bileşenlerin homojen bir dağılımını sağlamaz, bu da partiden partiye önemli değişkenlik ile birlikte optimal olmayan bir LNP boyut dağılımına yol açar15.
Laboratuvarlar, karıştırma koşulları üzerinde daha hassas kontrol sağlayarak tekrarlanabilir LNP’ler elde etmek için rutin olarak mikroakışkan karıştırma tekniklerini kullanır 12,13,16. Yine de, bir mikroakışkan odasındaki küçük uzunluk ölçekleri ve düşük hızlar nedeniyle doğal olan mikroakışkan cihazlardaki laminer akış koşulları, nispeten yavaş çözücü/çözücü karışımıile sonuçlanır 17. Küçük hazne boyutları, LNP’lerin GMP üretimi için gereken verimi ve ölçeklenebilirliği ciddi şekilde sınırlamaktadır, ancak araştırmacılar, üretim hacimlerini ölçeklendirmeye çalışmak için mikroakışkan odaları paralelleştirmiştir15. Paralelleştirilmiş bir mikroakışkan geometrisi, büyük hacimli işleme sırasında yüzeylere lipid adsorpsiyonu problemini ortadan kaldırmaz, bu problem genellikle karıştırma cihazının “kirlenmesi” olarak adlandırılır ve mikroakışkanların ölçek büyütmesini endüstriyel ölçekli üretim için zorlaştıran akışların tekdüzeliği ve stabilitesi ile ilgili problemler vardır18,19. İlaç şirketlerinin COVID-19 aşısı mRNA-LNP’leri20 üretmek için türbülanslı çarpma jet karıştırıcıları kullanması şaşırtıcı değildir.
RNA yüklü LNP’lerin üretim süreci, RNA yükünü içeren sulu bir tampon akışının, dört farklı lipid bileşenini içeren bir etanol akışı ile harmanlanmasını gerektirir. Bu formülasyonlar, sulu ve etanolik akışlar karıştıkça iyonlaşabilir lipidi yükleyen pH’ı 4.0 veya daha düşük olan asidik bir tampon kullanır. Pozitif yüklü iyonlaşabilir lipitler, negatif yüklü RNA’larla elektrostatik olarak etkileşime girerek hidrofobik bir RNA-lipid tuzu oluşturur. RNA-lipid tuzu da dahil olmak üzere hidrofobik lipid türleri, karışık çözücülerde çökelir ve hidrofobik çekirdekler oluşturur. Bu çekirdekler, zwitteriyonik lipid ve kolesterolün çökeltilmesi yoluyla, LNP’lerin yüzeyinde yeterli pegile lipidin adsorbe olduğu kritik bir noktaya ulaşana kadar büyür ve daha fazla büyüme-çekirdeklenme ve büyüme mekanizmasını durdurur 21,22,23. Lipitlerin çökeldiği ve LNP’lerin oluştuğu ölçüde, lipit çözeltisine sulu tampon eklenmesi, iki farklı zaman ölçeğine bağlıdır: çözücü-anti-çözücü karıştırma periyodu, τkarışımı ve çekirdek büyüme periyodu, τagg. Da = τkarışımı/τagg olarak tanımlanan boyutsuz Damköhler sayısı, bu zaman ölçekleri24 arasındaki etkileşimi yakalar. Yavaş karıştırma durumlarında (Da > 1), LNP’lerin nihai boyutu taşıma kontrollüdür ve karıştırma süresine göre değişir. Tersine, hızlı karıştırma sırasında (Da < 1), sıvı Kolmogrov uzunluğunda çizgilere veya katmanlara ayrılır, bu sayede LNP oluşumu yalnızca her bir bileşenin moleküler difüzyonu tarafından yönetilir ve LNP oluşumunun homojen kinetiği ile sonuçlanır. İkinci senaryoya ulaşmak, lipit konsantrasyonunun kritik bir eşiği aşmasını ve tek tip homojen çekirdeklenmeye elverişli bir aşırı doygunluk durumu oluşturmasını gerektirir.
τagg’nin birkaç on ila birkaç yüz milisaniye arasında değiştiği tahmin edilmektedir25. En temel konfigürasyonunda, biri lipitli etanol içeren ve diğeri RNA kargolu sulu bir tampon içeren iki akış, “kapalı çarpma jeti” (CIJ) karıştırıcı olarak bilinen bir odaya enjekte edilir. Türbülanslı girdaplar, uygun hızlarda çalıştırıldığında 1,5 ms içinde 1 μm’lik çözücü/antisolvent çizgileme uzunluğu ölçekleri üretir. Akış hızları ve karıştırma geometrisi, doğrusal momentumun akışları karıştıran türbülanslı girdaplara dönüşümünü belirler. Bu, akış hızlarıyla doğrusal orantılı olan boyutsuz sayı olan Reynolds sayısı (Re) ile parametreleştirilir. Re, Re = Σ (ViDi/vi) değerinden hesaplanır, burada Vi her buhardaki akış hızıdır, vi her akışın kinematik viskozitesidir ve Di , 2 jetli CIJ cihazlarında akış giriş çapıdır26 veya 4 jetli MIVM’lerdeoda çapı 27. Not: CIJ için yapılan bazı referanslar, Re28’i tanımlamak için yalnızca tek bir jet çapı ve hızı kullanır. Re, bir mikroakışkan cihazında 1-100 aralığındayken, CIJ cihazlarında 125.000’lik Re elde edilebilir. Bir CIJ karıştırıcıda, eşit momentumlu akışlar çarpışır ve çarpma üzerine momentumlarını türbülanslı karışım olarak dağıtır, bu da küçük Kolmogorov mikro ölçekleri ve küçük Damköhler sayısı nedeniyle verimli mikro karıştırmaya yol açar. Başka bir karıştırıcı türü, dört akışın merkezi bir odaya yönlendirildiği “çoklu girişli girdap karıştırıcı” dır (MIVM). Bu kurulumda, kapalı karıştırma haznesine sürekli akışlar, iyi tanımlanmış bir karıştırma süresi ölçeği sağlar. Tüm akışkan elemanlar, her iki mikser tipinde de yüksek enerjili karıştırma bölgesinden geçer. Buna karşılık, T-bağlantıları gibi basit karıştırma cihazları, bir karıştırma bölgesi sağlayan bir oda içermez, bu da gelen akış momentumunun türbülanslı girdap oluşumundan ziyade büyük ölçüde çıkış yönüne saptırılması nedeniyle iki akışın daha az karışmasına neden olur. Hem CIJ hem de MIVM mikserler, toplu veya sürekli modlarda çalıştırılabilir ve çeşitli ölçeklerde LNP üretimi için esneklik sunar.
Bu protokol, iki sınırlı çarpma jet teknolojisi kullanılarak en uygun LNP formülasyonlarının nasıl yapıldığını açıklar: 2 jetli CIJ ve 4 jetli MIVM karıştırıcılar. CIJ ve MIVM karıştırıcıların çalışması daha önce hidrofobik çekirdek malzemeleri29 ile NP’lerin hazırlanması için gösterilmiştir. Bu mikserlerle NP’lerin oluşumu hakkında ek bir kaynak olarak bu makale ve videoya başvurulmalıdır. Bu güncelleme, lipid bazlı NP oluşumuna odaklanmaktadır. Mikro karıştırma koşullarını değiştirerek LNP’lerin boyutunu ayarlama yeteneği gösterilmiştir. Ek olarak, CIJ teknolojilerinin, zayıf pipet karışımı kullanılarak yapılan LNP’lerle karşılaştırıldığında, HeLa hücrelerinde gelişmiş in vitro transfeksiyon verimliliklerine sahip kararlı, monodispers LNP’lerin oluşturulmasındaki faydası gösterilmiştir. Ayrıca, her bir CIJ karıştırma geometrisinin avantajları ve dezavantajları, bu karıştırıcıların ölçeklendirilmesi için gereken uygun koşullarla birlikte tartışılmaktadır.
Nükleik asit polimerleri içeren LNP’lerin iki kapalı çarpma jet türbülanslı karıştırıcı kullanılarak sentezi sunulmuştur. Uygun hızlarda yürütüldüğünde, CIJ türbülanslı karıştırıcılar, karıştırma zaman ölçeğinin LNP montaj süresinden daha kısa olmasını sağlayarak, dar boyut dağılımlarına sahip küçük LNP’ler oluşturmak için homojen aşırı doygunluk koşulları üretir21. Sonuç olarak, farklı türbülanslı karıştırıcı geometrileri (2-jet CIJ ve 4-jet MIVM karıştırıcı) kullanılarak aynı kimya ile yapılan LNP’ler, benzer fizikokimyasal özellikler sergiler ve iyi transfeksiyon verimlilikleri gösterir (Şekil 5 ve Şekil 6). Buna karşılık, daha zayıf karıştırma üreten pipetleme kullanılarak yapılan LNP’ler, daha düşük transfeksiyon verimliliğine sahip daha büyük ve daha fazla polidispers LNP’ler (Şekil 5A) ile sonuçlanır. Karıştırma ve birleştirme kinetiğinin LNP işlemede önemli bir rol oynadığı uzun zamandır anlaşılmıştır; Cullis ve ark. etanol ve tamponun hızlı konvektif-difüzyonlu karışımının dar bir boyut dağılımına sahip küçük parçacıkların oluşumuna yol açtığını, yavaş difüzyonlu karışımın ise geniş boyut dağılımlarına sahip daha büyük parçacıklara yol açtığını belirtmiştir9. CIJ türbülanslı karıştırıcılarda karıştırma zaman ölçeği, akışların karıştırıcıya27 giriş akış hızlarıyla orantılı olarak azalır. Bu, eylemsizlik ve viskoz kuvvetler arasındaki oranı ölçen boyutsuz Reynolds sayısı (Re) ile ölçülür. CIJ ve MIVM’nin karıştırma odalarının içindeki türbülans, yeterince yüksek Re’de meydana gelir, öyle ki türbülanslı girdap gerilmesi, difüzyon yoluyla hızlı çözücü/çözücü önleyici karışımı üreten küçük uzunluk ölçekleri ile sonuçlanır. Türbülanslı uzunluk ölçeği, karıştırma cihazının spesifik geometrisine değil, Re’ye bağlıdır. Bu nedenle CIJ veya MIVM aynı LNP parçacıklarını üretir ve bu nedenle çeşitli boyutlardaki MIVM karıştırıcıları aynı NP boyutlarını27 yapar. Yüksek giriş hızlarına karşılık gelen yüksek Re’de, LNP’ler partiden partiye varyasyonlar olmadan tekrarlanabilir şekilde yapılabilir (Şekil 3B).
Bu protokol, türbülanslı CIJ karıştırıcılar kullanılarak farklı fizikokimyasal özelliklere sahip çeşitli mRNA, DNA veya siRNA LNP’lerin formülasyonunu sağlar. Bileşim ve konsantrasyonlarda çok yönlülüğe izin vermenin yanı sıra, bu teknik, formülasyonları tezgah satışında (birkaç miligram) hızlı bir şekilde taramak ve kurşun formülasyonlarını 5 L / dak36 üretim hızlarında daha büyük endüstriyel parti boyutlarına ölçeklendirmek için açık bir yol sağlar. Bu, toplu karıştırma ve mikroakışkanlar dahil olmak üzere diğer birçok teknik için büyük bir engel olmuştur. Örneğin, toplu işleme teknikleri, LNP’leri birkaç mililitrelik ölçeklerde bile tekrarlanabilir bir şekilde tutarlı bir şekilde üretemez. Mikroakışkan teknikler, tek tip ve tekrarlanabilir LNP’lerin üretimini sağlamak için toplu karıştırma tekniklerine göre önemli bir gelişme sağlar; Ancak, sadecemiligram 29 aralığındadırlar. Giriş bölümünde ayrıntılı olarak açıklandığı gibi, mikroakışkan cihazların paralelleştirilmesi, üretim ölçeklerine ölçeklendirme girişimi sağlar, ancak kirlenme sorununu ortadan kaldırmaz ve sınırlı çarpma jet teknolojisine dayalı karıştırıcılar kadar başarılı bir şekilde ölçeklendirilemez.
Bu avantajların yanı sıra, CIJ karıştırıcılar, hedefleme yetenekleri sergileyen veya gen düzenlemesi yapan yeni nesil LNP’lerin üretiminde etkili olacaktır. Mevcut LNP formülasyonları, benzer difüzyonlara sahip lipitlere ve nükleik asitlere sahiptir ve bu nedenle, tezgah ölçeğinde biraz zayıf karıştırma ile bile yapılabilirler. Bununla birlikte, gen düzenleme yaklaşımları, bir CAS9 proteinini kodlamak için küçük kılavuz RNA molekülleri ve büyük mRNA transkriptleri gibi çok farklı moleküler ağırlıklara sahip nükleik asit türlerinin kapsüllenmesini gerektirebilir37. Bu farklı türlerin çok farklı difüzyon zaman ölçekleri, stokiyometrik oranlarda tek tip kapsüllemeyi zorlaştırır. Bu homojen kapsülleme sorunu, karıştırma verimliliği zayıfladıkça daha belirgin hale gelir. Benzer şekilde, hepatik olmayan hücrelerin hedeflenmesi, güçlü bir şekilde bağlanmış yavaş yayılan stabilizatörlerin (hedefleme ligandlarına sahip büyük moleküler ağırlıklı blok kopolimerler gibi) dahil edilmesini gerektirebilir. 14 kDa’ya kadar olan hedefleme ligandları, nanopartikül montajından önce kopolimerleri bloke etmek için konjuge edilebilir, bu da CIJ karıştırma38 kullanılarak NP’lere homojen bir şekilde dahil edilmelerini sağlar. CIJ türbülanslı karıştırıcılar, farklı yayılımlara sahip bileşenlerle yapılan LNP’leri üretmek için kullanışlı araçlardır.
CIJ türbülanslı karıştırıcılar, LNP’leri formüle etmek için diğer karıştırıcılara göre çeşitli avantajlar gösterse de, her bir geometri ile ilişkili sınırlamalara dikkat etmek önemlidir. 2 jetli CIJ karıştırıcı, haznede homojen türbülanslı mikro karıştırma elde etmek için her iki giriş akışının da (etanol ve su) eşit momentuma (%10-30 dahilinde) sahip olmasını gerektirir. Çıkış akışının 50:50 çözücü/antiçözücü içermesi, çökelmenin meydana geldiği karıştırma boşluğundaki aşırı doygunluk seviyesini sınırlar29. Bu dezavantaj, karıştırma odasında yüksek aşırı doygunluk koşullarını elde etmek için eşit olmayan momente sahip dört jet kullanabildiği için 4 jetli MIVM karıştırıcı tarafından ele alınır. Ek olarak, her iki karıştırıcının da toplam kütlenin miligram mertebesinde olması gerekir, bu da onları birçok farklı LNP formülasyonunun yüksek verimli taraması için ideal olmayan bir seçim haline getirir. Basit LNP formülasyonları için, tarama en iyi şekilde mikrogram ölçeklerinde mikroakışkanlar veya pipetleme stratejileri ile yapılabilir ve daha sonra birkaç kurşun formülasyonu tanımlandığında sınırlı çarpma jet teknolojisine aktarılabilir. Mikserlerdeki ölü hacimleri de dikkate almak çok önemlidir. İki jet mikser olan CIJ’de tutma hacimleri 50-100 mikrolitredir. Bu malzeme miktarı, prosesten geri kazanım hesaplanırken söndürme banyosunda yakalanan miktardan çıkarılmalıdır. Bu kayıplar, büyük ölçeklerde çalışırken önemsizdir, ancak burada gösterildiği gibi toplam 5 mL’lik hacimler üretildiğinde %10’luk kayıplara neden olur. Çarpan jet türbülanslı karıştırıcılar, FDA onaylı iki COVID-19 aşısının kanıtladığı gibi, GMP ölçeğinde LNP’ler üretmek için değerli bir araçtır.
The authors have nothing to disclose.
BKW’ye NSF Bursu (DGA1148900), Tessera Therapeutics Inc., Bill ve Melinda Gates Vakfı (BMGF, sözleşme numaraları OPP1150755 ve INV-041182) ve FDA’dan 75F40122C00186 ödülü altında destek.
18:0 PC (DSPC) | Avanti Polar Lipids | 850365P | Helper lipid |
21 G x 1-1/2 in. BD PrecisionGlide Needle | BD | 305167 | |
96 Well Black Wall Black Bottom Plate | Fisher Scientific | 07-000-135 | |
96 Well White/Clear Bottom Plate, TC Surface | Thermo Fisher Scientific | 165306 | |
Acetic Acid, Glacial | Fisher Scientific | A38-212 | |
ALC-0315 | Avanti Polar Lipids | 890900 | Ionizable lipid |
Amicon Ultra Centrifugal Filter, 100 kDa MWCO, 15 mL | Millipore Sigma | UFC910024 | |
Amicon Ultra Centrifugal Filter, 100 kDa MWCO, 4 mL | Millipore Sigma | UFC810096 | |
Bright-Glo Luciferase Assay System | Promega | E2620 | |
Cholesterol | Millipore Sigma | C8667 | |
CleanCap FLuc mRNA (5 moU) | Trilink Biotechnologies | L-7202 | |
Confined Impinging Jets Mixer | Holland Applied Technologies, Helix Biotech, Diamond Tool and Die (DTD) | N/A | Contact Holland or DTD for custom orders and the Helix Biotech system is Nova BT. Review text for new mixer validation |
D-Lin-MC3-DMA | MedChemExpress | HY-112251 | Ionizable lipid |
DMEM, high glucose, pyruvate | Thermo Fisher Scientific | 11995065 | |
DMG-PEG 2000 | Avanti Polar Lipids | 880151P | PEG-lipid |
DODMA | Avanti Polar Lipids | 890899P | Ionizable lipid |
Ethanol 200 Proof | Decon Labs, Inc. | 2701 | |
Falcon 15 mL Conical Centrifuge Tubes | Fisher Scientific | 14-959-70C | |
Falcon 50 mL High Clarity Conical Centrifuge Tubes | Fisher Scientific | 14-959-49A | |
Fetal Bovine Serum, certified, United States | Thermo Fisher Scientific | 16000044 | |
HeLa | ATCC | CCL-2 | |
HEPES, free acid | IBI Scientific | IB01130 | |
HSW HENKE-JECT two-part 1 mL Luer | Henke Sass Wolf | 4010.200V0 | |
HSW HENKE-JECT two-part 5 mL (6 mL) Luer Lock | Henke Sass Wolf | 4050.X00V0 | |
Idex 1648 ETFE tubing ” OD 0.093” ID | Idex Health & Science | 1648 | |
Idex P-678 ¼”-28 to Luer fitting | Idex Health & Science | P-678 | |
Idex P-940 ferrule for ETFE tubing | Idex Health & Science | P-940 | |
Lipofectamine 3000 Transfection Reagent | Thermo Fisher Scientific | L3000001 | |
Luer fitting | Idex Health & Science | P-604 | Assemble on CIJ or MIVM mixer inlet with corresponding threads. Idex parts are also available through VWR and many other suppliers |
Mixer stand | Holland Applied Technologies | N/A | See Markwalter & Prud'homme for design.26 Contact Holland for Purchase |
Multi-Inlet Vortex Mixer | Holland Applied Technologies and Diamond Tool and Die (DTD) | N/A | Contact Holland or DTD for custom orders. Review text for new mixer validation |
O-ring (MIVM) | C.E. Conover | MM1.5 35.50 V75 | Order bulk – consumable part. Ensure solvent compatibility if using an alternative source. |
Outlet ferrule – CIJ | Idex Health & Science | P-200 | Assemble with outlet fitting (large end flush with tubing) |
Outlet fitting – CIJ | Idex Health & Science | P-205 | Assemble with ferrule and tubing on CIJ chamber outlet |
Outlet fitting – MIVM | Idex Health & Science | P-942 | Combination with ferrule |
Outlet tubing – CIJ | Idex Health & Science | 1517 | Use a tubing cutter for clean ends. Ensure extra tubing doesn't protrude into mixing chamber |
Outlet tubing – MIVM | N/A | N/A | Fit to ferrule ID. |
PBS – Phosphate-Buffered Saline (10x) pH 7.4, RNase-free | Thermo Fisher Scientific | AM9624 | |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
PHD 2000 Programmable Syringe Pump | Harvard Apparatus | N/A | |
Plastic two-piece syringe 1 mL | Thermo Fisher Scientific | S7510-1 | |
Plug fitting | Idex Health & Science | P-309 | Assemble on CIJ mixer sides (seal access point from drilling) |
Quant-it RiboGreen RNA Assay Kit and RiboGreen RNA Reagent, RediPlate 96 RiboGreen RNA Quantitation Kit | Invitrogen by Thermo Fisher Scientific | R11491 | |
Resazurin, Sodium Salt | Thermo Fisher Scientific | R12204 | |
RNase AWAY Surface Decontaminant | Thermo Fisher Scientific | 7000TS1 | |
Scintillation vial | DWK Lifesciences | 74504-20 | |
SGE Gas Tight Syringes, Luer Lock, 100 mL | SGE | 100MR-LL-GT | |
SGE Gas Tight Syringes, Luer Lock, 50 mL | SGE | 50MR-LL-GT | |
Slide-A-Lyzer Dialysis Cassettes, 20 K MWCO | Thermo Fisher Scientific | 66012 | |
Sodium Acetate | Millipore Sigma | 32319-500G-R | |
Sodium Hydroxide | Fisher Scientific | S320-500 | |
Sucrose | Millipore Sigma | S7903-1KG | |
Syringe Filters, Sterile | Genesse Scientific | 25-243 | |
Triton X-100 | Millipore Sigma | 9036-19-5 | |
Trypsin-EDTA (0.25%), phenol red | Thermo Fisher Scientific | 25200056 | |
Water, Endotoxin Free | Quality Biological | 118-325-131 | RNAse and DNAse free |
Yeast RNA (10 mg/mL) | Thermo Fisher Scientific | AM7118 |