Nous avons mis au point une technique de traitement tissulaire utilisant un vibratome et du tissu pulmonaire enrobé d’agarose pour générer des coupes pulmonaires, permettant ainsi l’acquisition d’images à haute résolution de l’architecture pulmonaire. Nous avons utilisé la coloration par immunofluorescence pour observer l’expression spatiale des protéines à l’aide de marqueurs structurels pulmonaires spécifiques.
En raison de sa fragilité structurelle inhérente, le poumon est considéré comme l’un des tissus les plus difficiles à traiter pour les lectures microscopiques. Pour ajouter un soutien structurel à la section, des morceaux de tissu pulmonaire sont généralement incorporés dans de la paraffine ou un composé OCT et coupés avec un microtome ou un cryostat, respectivement. Une technique plus récente, connue sous le nom de tranches de poumon coupées avec précision, ajoute un soutien structurel au tissu pulmonaire frais par infiltration d’agarose et fournit une plate-forme pour maintenir le tissu pulmonaire primaire en culture. Cependant, en raison du masquage des épitopes et de la distorsion des tissus, aucune de ces techniques ne se prête adéquatement au développement de lectures d’imagerie par la lumière avancées reproductibles qui seraient compatibles entre plusieurs anticorps et espèces.
À cette fin, nous avons développé un pipeline de traitement des tissus, qui utilise l’enrobage d’agarose du tissu pulmonaire fixe, couplé à une section automatisée du vibratome. Cela a facilité la génération de coupes pulmonaires de 200 μm à 70 μm d’épaisseur, dans les poumons de souris, de porc et d’humains, qui ne nécessitent pas de récupération d’antigène et représentent la version la moins « traitée » du tissu isolé natif. À l’aide de ces coupes, nous révélons une lecture d’imagerie multiplex capable de générer des images à haute résolution dont l’expression spatiale des protéines peut être utilisée pour quantifier et mieux comprendre les mécanismes sous-jacents aux lésions pulmonaires et à la régénération.
Les coupes de tissu pulmonaire ex vivo sont largement utilisées dans l’étude des maladies pulmonaires1. Les étalon-or actuels, en particulier dans les études cliniques et translationnelles sur les grands animaux, utilisent la coloration à l’hématoxyline et à l’éosine couplée à la microscopie à fond clair et à la notation basée sur l’observateur pour évaluer et classer le dysfonctionnement pulmonaire 2,3. Bien qu’il s’agisse toujours d’une technique précieuse, elle présente des limites en termes de résolution spatiale et de nombre de marqueurs pouvant être imagés simultanément. De plus, le tissu pulmonaire doit subir de nombreux lavages à base de solvant, ce qui entraîne une déshydratation, un rétrécissement et une réhydratation du tissu avant son imagerie finale4. Ce processus est non seulement long, mais il est également peu respectueux de l’environnement, masque les épitopes protéiques et peut invoquer des changements structurels tissulaires 5,6,7,8. Cependant, pour le tissu pulmonaire, l’enrobage dans la paraffine avant la coupe a été une nécessité en raison de la fragilité structurelle du poumon. En revanche, les organes solides tels que le cerveau peuvent être coupés à l’aide d’un microtome vibrant (vibratome), à la fois dans les tissus fixes et frais 9,10,11,12.
Pour permettre la coupe du vibratome dans le tissu pulmonaire, une méthode appelée tranches de poumon coupées avec précision (PCLS) a été mise au point où l’agarose à bas point de fusion est injectée dans le tissu pulmonaire frais via les voies respiratoires ou les vaisseaux sanguins et laissée se solidifier13,14. L’agarose dans les voies respiratoires fournit un support structurel suffisant pour permettre ensuite la section du vibratome 9,14. Chez les rongeurs, c’est simple à réaliser car l’agarose peut être injectée par la trachée ; Cependant, dans les tissus porcins et humains, il peut être difficile de localiser une voie respiratoire ou un vaisseau approprié dans une biopsie donnée15,16. De plus, même si une telle voie respiratoire ou un tel vaisseau est localisé, une force importante est généralement nécessaire pour injecter l’agarose, ce qui peut influencer la morphologie pulmonaire ultérieure17.
Pour surmonter les défis rencontrés dans l’enrobage/sectionnement/coloration de la paraffine et le flux de travail PCLS, nous avons établi un nouveau pipeline de traitement pour les tissus pulmonaires fixes. Ce flux de travail permet l’utilisation d’un vibratome pour la section, peut produire des tranches plus fines que dans le PCLS et produit des tranches qui ne nécessitent pas de récupération d’antigène pour l’imagerie par fluorescence multiplex. Cette méthode offre un moyen de « moindre traitement » pour générer des coupes pulmonaires qui peuvent être utilisées en microscopie optique avancée. De plus, les lectures d’imagerie peuvent être utilisées pour démontrer les relations spatiales des cellules et des structures anatomiques dans le tissu pulmonaire en capturant l’architecture volumétrique du tissu 18,19,20,21. Cet article décrit le protocole permettant de générer ces coupes pulmonaires et démontre les colorations multiplex appliquées à chacun de ces tissus et comment ces données d’imagerie avancées peuvent être utilisées pour la quantification.
Dans ce protocole, nous présentons une méthode améliorée basée sur le vibratome pour générer des coupes pulmonaires. Par rapport aux techniques de traitement à base de paraffine, cette méthode est plus rentable, plus rapide et meilleure pour l’environnement22. De plus, cette méthode aide à maintenir l’intégrité structurelle des coupes de tissu pulmonaire et permet une imagerie avancée par immunofluorescence sans avoir besoin de récupérer l’antigène. Cependant, au cours de nos expériences, nous avons également trouvé certaines limites à ce flux de travail. Les poumons malades peuvent interférer avec le processus de coupe en raison de la destruction des tissus causée par des changements pathologiques. Lors de l’utilisation du vibratome pour la section, les obstructions des voies respiratoires et le tissu pulmonaire fibreux sévère peuvent entraver la lame, ce qui rend le processus de découpage de ces tissus plus difficile. Cependant, cela peut être surmonté en réduisant la vitesse de la lame et en soutenant le tissu avec un pinceau fin. L’épaississement de la plèvre, qui est un résultat courant dans la pleurésie, la bronchopneumopathie chronique obstructive (MPOC) et la fibrose pulmonaire idiopathique (FPI)23,24,25, pose des défis similaires. Si la plèvre n’est pas intéressante pour une expérience, nous recommandons de l’enlever avant la section ou en isolant un volume pulmonaire éloigné de la plèvre. Si la plèvre est nécessaire, elle peut être tranchée en utilisant une manipulation similaire à celle ci-dessus, impliquant des vitesses de lame plus lentes et un support de tranche à partir d’une brosse fine.
Bien que les tranches de poumon découpées avec précision puissent préserver l’architecture tridimensionnelle et l’environnement natif du poumon26, il est important de noter que la génération de PCLS est un processus complexe et chronophage. Le succès de la génération de coupes de tissu pulmonaire dépend en grande partie de l’efficacité de l’obturation à l’agarose, qui, à son tour, est influencée par la présence d’une plèvre intacte et de sites d’injection viables dans le tissu obtenu. Ceci est facile à réaliser chez les rongeurs car l’agarose peut facilement être introduite par la trachée dans les poumons intacts27,28,29. Cependant, dans la recherche sur les grands animaux, les biopsies prélevées au cours d’une expérience proviennent généralement de segments pulmonaires distaux, qui n’ont pas de voies respiratoires suffisamment grandes pour canuler30,31. Ainsi, au lieu d’injecter de l’agarose dans les bronches ou les vaisseaux sanguins, nous adoptons cette méthode où le tissu pulmonaire, quelle que soit l’espèce d’origine ou le volume de l’échantillon, est incorporé dans de l’agarose à bas point de fusion pour générer des tranches de tissu pulmonaire. Cette approche est techniquement plus simple et vise à minimiser autant que possible les dommages tissulaires. Sur la base de notre expérience, cette méthode a démontré une plus grande efficacité et une plus grande facilité dans la génération de coupes de tissu pulmonaire. Il préserve efficacement la morphologie des alvéoles et est particulièrement adapté à la coupe du tissu pulmonaire, permettant la génération d’une imagerie par fluorescence multiplex haute résolution reproductible.
Dans cette étude, nous démontrons en outre deux quantifications basées sur des échantillons pour les données d’imagerie générées. Le premier a utilisé le traçage d’images pour évaluer les différences de taille alvéolaire entre les échantillons d’espèces. Sans surprise, les alvéoles de souris étaient les plus petites, tandis que les alvéoles de porc et humaines étaient de taille similaire, ce qui met en évidence les porcs comme un modèle translationnel intéressant pour la recherche pulmonaire.
Pour la deuxième quantification, nous avons comparé la distribution de l’HTII entre un échantillon de poumons d’adultes et de nourrissons. Les pneumocytes de type 2 jouent un rôle essentiel dans la structure de l’épithélium pulmonaire distal. Cette capacité unique des TIIs contribue à la réparation et à la régénération de l’épithélium alvéolaire32. Dans le poumon humain adulte sain, les TII représentent environ 15 % de la population cellulaire totale, tandis que leur couverture de la surface alvéolaire est estimée à environ 5 %33. HTII-280 est un marqueur pulmonaire spécifique largement reconnu pour l’étude du développement et de la réponse des cellules épithéliales alvéolaires aux lésions, et il est spécifiquement localisé dans les membranes plasmiques apicales des TII. Dans l’expérience, des tissus adultes ont été prélevés sur un patient donneur décédé des suites d’une hémorragie intracérébrale et d’une lésion pulmonaire concomitante, tandis que l’échantillon du nourrisson provenait d’une mortalité liée à l’asphyxie. Nos résultats indiquent que l’expression de HTII-280 était significativement plus faible dans l’échantillon de poumons adultes que dans l’échantillon de nourrissons. Il est intéressant de noter que, bien que le HTII-280 soit exprimé dans la majorité des HTII, son expression peut également être influencée par la qualité des tissus, et il est considérablement réduit dans les tissus pulmonaires humains lésés34. Les tissus pulmonaires âgés présentent une diminution significative du nombre et de l’activité sécrétoire des AIT par rapport aux tissus jeunes, et les personnes âgées présentent une prolifération, une sécrétion et une activité anti-apoptotique considérablement plus faibles des ITS par rapport à ces tissus jeunes35. Dans le même ordre d’idées, l’identification et la détection d’une protéine de surface cellulaire spécifique aux ICI humains pourraient aider à évaluer la gravité des lésions pulmonaires et à évaluer les approches thérapeutiques visant à améliorer la réparation pulmonaire36,37. Ainsi, en utilisant ce pipeline, il serait d’un grand intérêt de mener des études sur l’IIT alvéolaire dans de plus grandes cohortes humaines de santé et de maladie.
En conclusion, ce protocole présente une approche plus rapide et plus facile pour couper le tissu pulmonaire. Cette méthode fournit des instructions détaillées pour la préparation, la coupe et la coloration du tissu pulmonaire, assurant la préservation de la structure intacte du tissu pulmonaire. Il optimise le modèle pour l’étude de l’architecture pulmonaire saine et malade, ce qui permet d’améliorer l’efficacité expérimentale. Dans l’ensemble, cette étude présente une approche prometteuse pour étudier la biologie spatiale complexe dans la physiopathologie des tissus pulmonaires à travers les espèces, ce qui peut aider à mieux comprendre les mécanismes moléculaires en jeu dans la maladie et la réparation.
The authors have nothing to disclose.
Les auteurs remercient chaleureusement la Wallenberg Molecular Medicine Foundation et le Stem Cell Center de l’Université de Lund, ainsi que le Lund University Bioimaging Centre (LBIC) pour l’accès au Nikon A1RHD.
24 well tissue culture inserts | SARSTEDT | 83.3932.300 | |
4% paraformaldehyde | SOLVECO | 6095714 | |
4’, 6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) | Thermo Fisher scientific | D1306 | |
50 mL Falcon tube | SARSTEDT | 2045221 | |
Cluster of differentiation 31 (CD31) | Abcam | ab28364 | |
Confocal microscope | Nikon | A1R HD25 | |
Elastin | Abcam | ab23747 | |
Epredia X1000 Coverslip | Thermo Fisher scientific | 10318963 | |
Epredia SuperFrost Plus Adhesion slides | Thermo Fisher scientific | 10149870 | |
Forceps | AESCULAP | FB395R | |
Goat anti-mouse 647 | Invitrogen | A21235 | |
Goat anti-rabbit 568 | Invitrogen | A11011 | |
Human type II cells | Terrace Biotech | TB-27AHT2-280 | |
Invitrogen Fluoromount-G Mounting Medium | Thermo Fisher scientific | E41473 | |
Low gelling temperature Agarose | Sigma-Aldrich | 1003467046 | |
Lycopersicon Esculentum lectin | Thermo Fisher scientific | 2531965 | |
Phosphate-buffered saline (PBS) | Thermo Fisher scientific | 50-100-8798 | |
Plastic cup | kontorsgiganten | 885221 | |
Scissors | STILLE | 101-8380-18 | |
Smooth muscle actin | Abcam | ab5694 | |
Sodium azide | Sigma-Aldrich | K54329188239 | |
Super glue | LOCTITE | 2721643 | |
Vibrating microtome | Leica | VT1200S |