Bu rapor, kan-beyin bariyeri modellerinin oluşturulması için μSiM platformunda montaj, hücre kültürü ve tahliller için protokoller sağlar.
MikroSiM (μSiM), kan-beyin bariyerini (BBB) modellemek için membran bazlı bir kültür platformudur. Geleneksel membran tabanlı platformlardan farklı olarak μSiM , deneycilere canlı hücre görüntüleme, ‘kan’ ve ‘beyin’ odaları arasında engelsiz parakrin sinyalleme ve membranların çıkarılmasına/yeniden birleştirilmesine gerek kalmadan immünofloresanı doğrudan görüntüleme yeteneği dahil olmak üzere yeni yetenekler sağlar. Burada, ultra ince nano gözenekli silikon-nitrür membranlar kullanarak BBB’nin monokültür (endotel hücreleri) ve ko-kültür (endotel hücreleri ve perisitler) modellerini oluşturmak için platformun temel kullanımını gösteriyoruz. Hem primer hücre kültürleri hem de insan kaynaklı pluripotent kök hücre (hiPSC) kültürleri ile uyumluluk gösteriyoruz. İmmünofloresan boyama yoluyla BBB modellerinin kalitatif analizi için yöntemler sağlıyoruz ve küçük moleküllü geçirgenlik testinde bariyer fonksiyonunun kantitatif değerlendirmesi için μSiM’nin kullanımını gösteriyoruz. Sağlanan yöntemler, kullanıcıların platform üzerinde bariyer modellerini oluşturmalarını sağlamalı ve insan dokularını incelemek için doku çipi teknolojisinin kullanımını ilerletmelidir.
Canlı dokular, bariyerler oluşturan ve koruyan ve hangi hücrelerin ve moleküllerin bir bölmeden diğerine taşınacağını düzenleyen özel hücreler tarafından bölümlere ayrılır. Bariyer fonksiyonlarının yanlış düzenlenmesi hem akut hastalıkların hem de kronik hastalıkların kaynağı olabilir. Kan-beyin bariyeri (BBB), insan vücudundaki en kısıtlayıcı doku bariyeridir1. BBB’nin işlev bozukluğu, Alzheimer hastalığı 2, Parkinson hastalığı3,4 ve multipl skleroz 5,6 dahil olmak üzere çok çeşitli merkezi sinir sistemi (CNS) hastalıklarının temelini oluşturur. BBB’nin yaralanması, sepsis7, COVID-198 ve postoperatif deliryum9 gibi akut bozuklukların bir sonucu olarak uzun vadeli bilişsel bozuklukla da bağlantılıdır. Beyin bozukluklarını tedavi etme potansiyeline sahip ilaçların geliştirilmesi, beyindeki hedeflere biyoaktif moleküller iletmek için BBB’yi kasıtlı olarak ihlal etme zorluğu nedeniyle sinir bozucu derecede zor olmuştur10. Bu nedenlerden dolayı, BBB fonksiyonunu in vitro olarak inceleme yöntemleri, CNS hastalıklarının anlaşılması ve tedavisi için büyük önem taşımaktadır.
Bariyer fonksiyonunu in vitro ölçmek için temel yöntemler, yarı geçirgen bir membran üzerinde tek tabaka veya ko-kültürün oluşturulmasını ve hücrelerin küçük molekül difüzyonuna veya küçük elektrik akımlarına verdiği direncin ölçülmesini içerir11,12,13,14. Mikrofizyolojik sistemlerin (MPS) ortaya çıkışı, BBB’yi 3D olarak modellemek için çok sayıda seçenek üretmiş olsa da,15,16, sistem geometrilerinin çeşitliliği, MPS veya yerleşik literatür değerleri arasındaki geçirgenlik ölçümlerini karşılaştırmayı zorlaştırmaktadır. Güvenilir temel değerlerin oluşturulması, beyin vasküler endotel hücreleri tarafından kapsamlı bariyer regülasyonu nedeniyle, in vitro geçirgenlik değerlerinin yüksek oranda incelendiği BBB araştırmalarında özellikle önemlidir12,17,18. Bu nedenlerden dolayı, 2D membranlar üzerine kurulan tek tabakalar arasındaki geçirgenlik ölçümleri, önümüzdeki yıllarda BBB çalışmalarında temel bir unsur olmaya devam edecektir. Bu, in vitro modelleri doğrulamak ve karşılaştırmak için temel geçirgenliğin mutlak değerlerinin kullanıldığı epitel bariyerleri de dahil olmak üzere diğer doku bariyerleri için geçerlidir 19,20,21.
BBB araştırma topluluğu için değerli yeni bir araç oluşturmak amacıyla, son 5 yılda bariyer doku modellemesinde kullanılmak üzere silicon membran (μSiM) platformuna sahip mikro cihazı22 vegelişmiş 23,24,25,26’yı tanıttık. Platformun etkinleştirici özelliği, yüz milyonlarca nano gözenek27,28 veya nano gözenek ve mikro gözeneklerin 29 bir karışımı olan ultra ince (<100 nm kalınlığında) bir zardır. Serbest duran membran çipleri, ultra ince yapıları 30 stabilize eden ve cihaz montajı için cımbızla tutulmalarına izin veren300 μm’lik bir silikon ‘çip’ üzerinde üretilir. Ultra ince yapıları nedeniyle, membranlar, ticari membran kültürü cihazlarında kullanılan geleneksel rayla oyulmuş membranlardan iki kat daha yüksek bir geçirgenliğe sahiptir31,32. Pratikte bu, zarın nanogözeneklerden (<60 nm) daha küçük moleküllerin difüzyonuna engelinin ihmal edilebilir olduğu anlamına gelir33. Bu nedenle, hücresel bariyerler için, sadece hücreler ve biriktirdikleri matrisler, zar34 tarafından ayrılan apikalden bazal bölmelere küçük molekül taşıma hızını belirleyecektir. Cihaz tasarımı ve membranların ultra ince yapısı da optik mikroskopi için birçok avantaj sağlar. Bunlar arasında 1) faz kontrastı veya parlak alan görüntüleme kullanarak canlı kültürleri takip etme yeteneği, 2) membranı çıkarmaya ve bir kapak camına aktarmaya gerek kalmadan floresan olarak boyama ve yerinde görüntüleme yeteneği ve 3) membranların konfokal ‘dilimlerden’ daha ince olması, böylece doğrudan ko-kültürlerin hücre tipleri arasında 6-10 μm kalınlığında iz kazınmış membranlarla elde edilebilenden daha doğal bir boşluğa sahip olması.
Son zamanlarda, hızlı montajı 34 ve özelleştirmeyi 35,36 kolaylaştırmak için platformu modüler bir formata yükselttik. Cihaz bileşenlerini biyomühendislik ve işbirliği yapan beyin bariyeri laboratuvarlarımız arasında dağıtmak için modüler formattan yararlandık. Daha sonra cihaz montajı, monokültür ve ko-kültür, immünofloresan boyama ve küçük molekül geçirgenliği için ortaklaşa protokoller geliştirdik ve bu yöntemlerin laboratuvarlar arasında tekrarlanabilir olduğunu gösterdik. Bu protokolleri kullanarak, modüler platformun, insan kaynaklı pluripotent kök hücrelerden (hiPSC’ler) beyin mikrovasküler benzeri endotel hücreleri (BMEC) oluşturmak için genişletilmiş endotel kültürü yöntemi (EECM) kullanılarak geliştirilen doğrulanmış bir BBB’yi desteklediğini de gösterdik37. Mevcut raporun amacı, bu yöntemleri daha ayrıntılı olarak gözden geçirmek ve beraberindeki videonun yardımıyla, platformun BBB topluluğunda daha geniş çapta benimsenmesini kolaylaştırmaktır.
Membran yongaları stabilite için tasarlanmış olsa da, montaj sırasında yanlış kullanılırsa çatlayabilir veya kırılabilir. Bu nedenle, çipi çip cımbız çentiklerinde kavramak ve yavaşça fikstüre yerleştirmek çok önemlidir. Cihazları genel olarak tutarken, cihazlara çarpmamak veya düşürmemek için ekstra önlem alınmalıdır. Membran çipinin A1 fikstürüne bağlanması sırasında, bileşen 1’e bağlanma sırasında membran çatlamasını önlemek için çip düz bir şekilde yerleştirilmeli ve fikstür A1’in direğine ortalanmalıdır. Ayrıca, koruyucu maskeler çıkarıldıktan sonra açıkta kalan PSA katmanlarıyla herhangi bir temastan kaçınılmalıdır. Koruyucu maskelerin çıkarılmasının ardından bileşen 2’yi tutarken, bileşenin kenarı boyunca tutmanız ve PSA içermeyen üçgen köşeyi tutmak için cımbız kullanmanız önerilir.
Olası BBB modelleri için hücre kültürü protokolleri tanımlanmış olsa da, burada açıklanan BBB’nin BMEC/perisit ko-kültür modeli, fizyolojik bağlama ve ilgilenilen sorulara bağlı olarak yeterli veya yetersiz olabilir. Örneğin, bağışıklık hücresi kaçakçılığı büyük ölçüde beynin postkapiller venüllerinde meydana gelir41,42. Bu bölgelerde, bir perivasküler boşluk, BMEC / perisit bariyerini astrositler tarafından oluşturulan glial limitanslardan ayırır. Bu nedenle, postkapiller venüllerde, nörovasküler ünite (NVU) seri olarak fiziksel olarak ayrılmış iki bariyer içerir ve astrositik uç ayaklar, mevcut model tarafından iyi temsil edilen BMEC / perisit kan bariyerine doğrudan temas etmez. Amaç, astrosit tarafından salgılanan faktörlerin kan bariyeri üzerindeki etkisini açıklayan bir NVU modeli ise, cihaza perivasküler boşluktan çözünür faktör değişimine izin veren bir astrosit bölmesi eklenebilir. Bu örnek daha önce 34 gösterilmişti ve bir3D ‘beyin’ bölmesindeki mikroglia ve nöronlar gibi diğer hücreleri içerecek şekilde genişletilebilir. Platformun modüler mimarisi, bu yeniden yapılandırmaları gerçekleştirmek için basit montaj stratejilerinin kullanılmasını sağlar, böylece platform eldeki hipotezleri ele almak için gerektiği kadar basit veya karmaşık olur. Her hücre kültürü kurulumu; ancak, yeni hücre hatları ve çoklu kültürler için optimize edilmelidir. Örneğin, silikon-nitrür membranların özellikleri nedeniyle, doku kültürü plakalarına kıyasla kaplama çözeltilerinin ayarlanması gerekebilir. Fibronektinin dahil edilmesi tipik olarak hücre bağlanmasına ve hayatta kalmasına yardımcı olur. Ayrıca, kullanıcılar endotel hücrelerini ve perisitleri zıt yönlerde kültürleyebilirler. Bu durumda, örneğin geçirgenlik ölçümlerinin yapılma ve yorumlanma şeklini değiştirmek gerekebilir. Bununla birlikte, bu tür bir kültür için adımlar sağlamak bu makalenin kapsamı dışındadır.
Hücre kültürü sırasında karşılaşılabilecek bir diğer zorluk, ortamın hızlı buharlaşmasıdır, çünkü cihazlar standart doku kültürü plakalarına ve şişelerine kıyasla ortamdaki değişikliklere karşı daha hassas olabilir. Aşırı buharlaşma görülürse veya hücre büyümesi yavaşlarsa, doğru ayarları sağlamak için tüm kritik inkübatör parametreleri ölçülmelidir. Hücre kültürü odasının içine yerleştirilen doku kapağına veya küçük Petri kabına daha fazla su eklenebilir veya ortam daha sık değiştirilmelidir. Ayrıca, kabarcıklar alt kanala girebilir ve hendek açma cihazları için hendekte sıkışabilir. Çıkarılabilseler de, ilk etapta baloncuk eklemekten kaçınmak en kolay yoldur. Bunu yapmak için, medyayı alt hazneye pipetlemeden önce pipet ucunda kabarcık veya pipet ucunun ucunda hava olup olmadığını kontrol etmek önemlidir. Ayrıca, kanaldaki ortam buharlaşması, ortam yüzeyi ile bağlantı noktası üst kısmı arasında bir boşluğa yol açabilir. Ortam karşı bağlantı noktasının yüzeyine ulaşana kadar küçük bir hacimde ortam bir bağlantı noktasına pipetlenebilir, ardından ortam bu karşı bağlantı noktasında değiştirilebilir. hECSR ve E6 + %10 FBS ortamı su banyosunda ısıtılmamalıdır, ancak kabarcık oluşumunu azaltmak için diğer ortamlar önceden ısıtılabilir. Alt hazneye bir kabarcık girerse, kanaldan 100 μL’yi hızlı bir şekilde pipetleyerek çıkarılabilir. Ancak bu yöntem, cihazın yüzeyine dökülen odalar veya ortamlar arasında kontaminasyona yol açabilir. Ayrıca hücre katmanlarını da bozabilir. Alternatif olarak, ortam önce kanaldan çıkarılabilir ve ardından 50 μL’lik bir hacimle yeniden verilebilir. Bununla birlikte, önce medyayı çıkarmak, kanalda daha fazla kabarcık oluşumuna neden olabilir. Bir kabarcık doğrudan zar alanının altında değilse, hücre kültürü üzerinde hiçbir etkisi olmadan kanalda bırakılabilir.
Şekil 2’de gösterildiği gibi perisit bağlanması ve büyümesi zor olabilir. Optimize edilmiş bir tohumlama yoğunluğunun kullanılması, fizyolojik olarak ilgili perisit-endotel hücre oranına sahip bir tabakanın oluşumu için gereklidir. Ayrıca, perisitler kaymaya duyarlı olduğundan, hücreleri korumak için kanaldaki tüm medya alışverişleri çok yavaş yapılmalıdır. BPLC kültürü için, alt hazne 800 μg/mL kollajen tip IV veya 100 μg/mL fibronektin ile kaplanarak daha iyi bağlantı sağlanabilir.
Burada açıklanan cihazlardaki immünositokimya, hücre sağlığı ve fonksiyonunun kalitatif analizini sağlar. Doku kültürü plakalarında veya diğer platformlarda boyama yöntemleri doğrudan platforma çevrilebilir olmalıdır. Sadece üst odadaki hücre kültürü için, fiksasyonu takiben, PBS alt bölmeye eklenebilir ve kalan adımlar için bırakılabilir, blokaj ve boyama sadece üst bölmede yapılır. Bu, membranların kırılması veya alt hazneye kabarcık girmesi risklerini en aza indirir. Ko-kültür boyama için, her iki odayı da tüm adımlarda kullanmanızı öneririz. Fiksatif ve PBS’nin viskozitesinin ortamınkinden farklı olduğuna dikkat etmek önemlidir. Bu nedenle, alt hazneye kabarcık eklemek daha kolay olabilir ve alt hazneye pipetlemeden önce pipet uçlarında ucun ucunda hava olup olmadığını kontrol etmek için ekstra özen gösterilmelidir.
Küçük molekül geçirgenlik deneyi için açıklanan protokol, μSiM cihazında kültürlenen endotel hücrelerinin bariyer fonksiyonunun fonksiyonel ve kantitatif değerlendirmesine izin verir. Bu test sırasında karşılaşılabilecek bir sorun, protokol adımı 4.1.7.4’teki alt kanaldan numune toplama sırasında pipete hava kabarcıkları çekilmesidir. Bu sorunu önlemek için, numune toplamaya başlamadan önce ucun porta kapatıldığından emin olmak önemlidir ve numune çok hızlı çekilmemelidir. Bu sorunu çözmezse, kullanılan uçların boyutu bağlantı noktalarına sığamayacak kadar küçük veya çok büyük olabilir; Malzeme Tablosunda listelenen ipuçlarını kullanın. Sağlıklı görünen birleşik bir tek tabakaya rağmen beklenmedik şekilde yüksek geçirgenlik değerleri ölçülürse, numune toplama sırasında tek tabakanın bütünlüğünde bozulma olup olmadığı kontrol edilmelidir. Numune alındıktan hemen sonra tek tabakayı her zaman mikroskop altında kontrol etmenizi öneririz. Tek tabaka hala sağlam ve sağlıklı görünüyorsa, numune sabitlenebilir ve bariyer fonksiyonunun biyolojik belirteçleri, örneğin bağlantı proteinlerinin immün boyanması yoluyla değerlendirilebilir. Tersine, beklenmedik şekilde düşük geçirgenlik değerleri ölçülürse, alt kanaldan herhangi bir hava kabarcığı olmadan 50 μL ortam numunesi alındığından emin olmak önemlidir. Rezervuar ucu yerleştirilir yerleştirilmez ortam numune alma portundan çıkarsa, floresan küçük molekülün çoğu alt kanaldan örneklenen ilk 10 μL hacimde bulunacağından, pipeti numune alma portuna takmadan önce bu ortam toplanmalıdır. Hidrofobik bir kalem kullanarak bağlantı noktalarının etrafına daireler çizmek veya bağlantı noktasının etrafına delikli bir hidrofobik bant yerleştirmek, pasif olarak pompalanan ortamların yayılmasını önler. Numune alma sırasında kabarcıklar geri çekilirse veya 50 μL’lik numunenin tamamı çıkarılmazsa, numune kullanılmamalıdır. Alternatif olarak, tam hacim belirlenebilir ve geçirgenlik hesaplamasında kullanılabilir; ancak bu, yalnızca çıkarılan hacim ~%98-99 boya geri kazanımına karşılık gelen ≥40 μL ise yapılmalıdır34.
The authors have nothing to disclose.
J.L.M., B.E., T.R.G., M.C.M., P.K., M.T., K.C. ve L.W., NIH hibesi R33 HL154249 tarafından finanse edildi. J.L.M. R44 GM137651 tarafından finanse edildi. M.M., Rochester Üniversitesi, Schmidt Program Ödülü Del Monte Sinirbilim Enstitüsü tarafından finanse edildi. M.T., RF1 AG079138 tarafından finanse edildi. K.C., Uluslararası Etik Araştırmalar Vakfı tarafından finanse edilmiştir.
Antibodies | |||
CD31 Polyclonal antibody | Thermo Fisher Scientific | PA5-32321 | |
Claudin-5 mouse IgG antibody, 4C3C2 | Thermo Fisher Scientific | 35-2500 | |
Goat α-Mouse IgG Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A11001 | |
Goat α-Rabbit IgG Alexa Fluor 568 | Thermo Fisher Scientific | A11011 | |
Hoechst 33342 | Life Technologies | H3570 | |
NG2, mouse IgG2a, 9.2.27 | Millipore | MAB2029 | |
Occludin mouse IgG antibody, OC-3F10 | Thermo Fisher Scientific | 33-1500 | |
PDGFRβ, rabbit IgG antibody, 28E1 | Cell Signaling Technology | 3169 | |
VE-cadherin mouse IgG2B Clone # 123413 | R&D Systems | MAB9381 | |
ZO-1 rabbit IgG antibody, polyclonal | Thermo Fisher Scientific | 40-2200 | |
Chemicals, peptides, and recombinant proteins | |||
100% Methanol | VWR | 101443-718 | Can be substituted with similar products |
16% Paraformaldehyde | Thermo Fisher Scientific | 28908 | Can be substituted with similar products |
Accutase | Thermo Fisher Scientific | A1110501 | |
Acetic acid | Sigma-Aldrich | 695092 | |
B27 supplement | Thermo Fischer Scientific | 17504044 | |
bFGF | R&D Systems | 233-FB-025 | |
Collagen IV from human placenta | Sigma-Aldrich | C5533 | |
Collagen, Type I solution from rat tail | Sigma-Aldrich | C3867-1VL | Can be substituted with similar products |
DMEM/Ham’s F12 | Thermo Fisher Scientific | 11320033 | |
EGM-2 Endothelial Cell Growth Medium-2 BulletKit | Lonza | CC-3162 | |
Essential 6 medium | Thermo Fisher Scientific | A1516401 | |
Fetal bovine serum (FBS) | Peak Serum | PS-FB1 | |
Fibronectin from bovine plasma | Sigma-Aldrich | F1141 | |
Fibronectin human protein, plasma | ThermoFisher Scientific | 33016015 | Can be substituted with similar products |
hESFM | Thermo Fisher Scientific | 11111044 | |
Lucifer Yellow CH dilithium salt | Sigma-Aldrich | 861502 | |
Normal goat serum | Thermo Fisher Scientific | 500627 | Can be substituted with similar products |
PBS without calcium, magnesium | Cytiva | SH30256.01 | Can be substituted with similar products |
Pericyte Medium | ScienCell | 1201 | Use complete kit (includes supplements) |
Poly-L-Lysine, 10 mg/mL | ScienCell | 0413 | |
Triton X-100 | JT Baker | X198-05 | Can be substituted with similar products |
UltraPure DNase/RNase-Free Distilled Water | Invitrogen™ | 10977015 | Can be substituted with similar products |
Experimental models: Cell lines | |||
Blood-brain barrier hCMEC/D3 cell line | Sigma-Aldrich | SCC066 | |
Human brain vascular pericytes | ScienCell | 1200 | |
iPS(IMR90)-4 human induced pluripotent stem cells | WiCell | RRID:CVCL_C437 | |
Glassware and Plasticware | |||
150 mm TC-treated Cell Culture Dish with 20 mm Grid | Falcon | 353025 | |
Clamps | VWR | MFLX06832-10 | |
Corning tissue culture plates (6-well) | Corning | 3506 | |
Flat 96-well non-binding microplates | Greiner Bio-One | 655900 | |
Microscope Slide Device Holder | SiMPore | USIM-SB | Dimensions compatible with micropscope slide holders |
Nunc 15 mL Conical Sterile Polypropylene Centrifuge Tubes | Thermo Fischer Scientific | 339651 | |
Nunc 50 mL Conical Sterile Polypropylene Centrifuge Tubes | Thermo Fischer Scientific | 339653 | Tube caps can be filled with water for cell culture |
P20-200 pipette tips | VWR | 76322-516 | Alternate brands may not seal as effectively into ports |
Transwell filters (12 well, 12 mm, 0.4 μm pore size, PC) | CoStar | 3401 | |
Instruments | |||
10X Objective (For Andor) | Nikon Instruments Inc. | MRD00105 | Air; WD: 4 mm; NA 0.45 |
10X Objective (For Nikon) | Nikon Instruments Inc. | MRP40102 | Air; WD: 6.2 mm; NA 0.25 |
40X Objective (LWD) (For Andor) | Nikon Instruments Inc. | MRD77410 | Water immersion; WD: 590-610 mm; NA 1.15 |
Andor Spinning Disc Confocal microscope | Oxford Instruments, Andor | ||
Nikon Eclipse Ts2 Phase Contrast Microscope | Nikon Instruments Inc. | Can be substituted with similar products | |
TECAN Infinite M200 | TECAN | Can be substituted with similar products | |
Altro | |||
Advanced PAP Pen | Millipore Sigma | Z672548 | 2 mm tip is recommended |
Assembly kit with fixtures | SiMPore | USIM-JIGSET | Including fixure A1, A2, B1, and B2 |
Camera Adapter for Microscopes | AmScope | CA-CAN-SLR Canon SLR / D-SLR | Φ23.2 – Φ30 adapter fits Nikon Eclipse Ts2 |
Canon EOS Rebel SL3 DSLR Camera | Canon | EOS 250D, BH #CAEDRSL3B, MFR #3453C001 | Can be substituted with similar products |
Cell strainer, 40 µm | Millipore Sigma (Corning) | CLS431750 | |
Component 1 | SiMPore | USIM-C1 | |
Component 2 | SiMPore | USIM-C2 | |
Membrane chips | SiMPore | NPSN100-1L | Other chips formats are available |
SMD handling tweezer double angle | Techni-Tool | 758TW003 | "Chip Tweezers" |
Stainless steel precision type GG tweezer | Techni-Tool | 758TW534 | "Straight Tweezers" |
Software | |||
Fiji | ImageJ | For image processing | |
Fusion | Oxford Instruments, Andor | Instructions for version 2.3.0.44 | |
i-control | TECAN | Instructions for version 2.0 | |
Imaris | Oxford Instruments | For image processing. Instructions for version 9.9.0 |