Qui introduciamo il principio, la struttura e le istruzioni del sistema intelligente di test di sensibilità antimicrobica/screening fagico ad alto rendimento. La sua applicazione è illustrata utilizzando come esempio la Salmonella isolata dal pollame nello Shandong, in Cina. Viene calcolato l’indice di Lar e viene discusso in modo esaustivo la sua importanza nella valutazione della resistenza antimicrobica.
Per migliorare l’efficienza dei test di sensibilità antimicrobica (AST) e dello screening fagico ad alto rendimento per i batteri resistenti e per ridurre i costi di rilevamento, è stato sviluppato un sistema intelligente di screening AST/fagico ad alto rendimento, che include un inoculatore a matrice di 96 punti, un convertitore di acquisizione immagini e un software corrispondente, secondo i criteri AST e i punti di rottura della resistenza (R) formulati dal Clinical & Laboratory Standards Institute (CLSI). L’AST e le statistiche delle distribuzioni della concentrazione minima inibitoria (MIC) (da R/8 a 8R) di 1.500 ceppi di Salmonella isolati dal pollame nello Shandong, in Cina, rispetto a 10 agenti antimicrobici sono state effettuate dal sistema intelligente di screening AST/fago ad alto rendimento. L’indice di Lar, che significa “meno antibiosi, meno resistenza e residuo fino a poco antibiosi”, è stato ottenuto calcolando la media ponderata di ogni MIC e dividendo per R. Questo approccio migliora l’accuratezza rispetto all’utilizzo della prevalenza della resistenza per caratterizzare il grado di resistenza antimicrobica (AMR) di ceppi altamente resistenti. Per i ceppi di Salmonella con AMR elevato, i fagi litici sono stati schermati in modo efficiente dalla libreria dei fagi da questo sistema e lo spettro di lisi è stato calcolato e analizzato. I risultati hanno mostrato che il sistema intelligente di screening AST/fago ad alto rendimento era operativo, accurato, altamente efficiente, economico e di facile manutenzione. In combinazione con il sistema di monitoraggio della resistenza antimicrobica veterinaria dello Shandong, il sistema è risultato adatto per la ricerca scientifica e il rilevamento clinico relativo alla resistenza antimicrobica.
Poiché gli agenti antimicrobici sono stati ampiamente utilizzati per prevenire le malattie infettive batteriche, la resistenza antimicrobica (AMR) è diventata un problema di salute pubblica globale1. La lotta alla resistenza antimicrobica è attualmente la missione principale del monitoraggio della resistenza antimicrobica dei patogeni epidemiologici e della terapia sinergica di agenti antimicrobici sensibili e batteriofagi litici2.
I test di sensibilità antimicrobica (AST) in vitro sono il cardine per il monitoraggio della terapia e la rilevazione del livello di resistenza antimicrobica. È una parte importante della farmacologia antimicrobica e la base critica per la medicina clinica. Il Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) degli Stati Uniti e l’European Committee on Antimicrobial Suscceptibility Testing (EUCAST) hanno formulato e rivisto i criteri internazionali dell’AST e i metodi AST continuamente modificati e integrati e i breakpoint per determinare la MIC di una determinata combinazione “organismo-agente antimicrobico” come sensibile (S), resistente (R) o intermedia (I)3, 4. Introduzione
Dagli anni ’80 agli anni ’90, gli strumenti automatici per la diluizione del microbrodo sono stati rapidamente sviluppati e applicati alla pratica clinica, con esempi tra cui Alfred 60AST, VITEK System, PHOENIXTM e Cobasbact 5,6,7. Tuttavia, questi strumenti erano costosi, richiedevano materiali di consumo ad alto costo e i loro intervalli di rilevamento erano progettati per i farmaci clinici dei pazienti 5,6,7. Per questi motivi, non sono adatti per l’esame clinico veterinario e la rilevazione di grandi quantità di ceppi altamente resistenti. In questo studio, è stato sviluppato un sistema intelligente di screening AST/fagico ad alto rendimento, che include un inoculatore a matrice di 96 punti (Figura 1), un convertitore di acquisizione di immagini (Figura 2) e il software corrispondente8, per condurre l’AST per un lotto di ceppi batterici contro più agenti antimicrobici contemporaneamente mediante il metodo di diluizione dell’agar. Inoltre, il sistema è stato utilizzato anche per rilevare e analizzare i modelli di lisi dei fagi contro batteri resistenti agli antimicrobici9 e i fagi litici sono stati selezionati in modo efficiente dalla libreria dei fagi. Questo sistema si è rivelato efficiente, conveniente e facile da usare.
Figura 1: Schema strutturale dell’inoculatore a matrice di 96 punti. 1: Piastra del perno di inoculazione; 2: Operatore di telefonia mobile; 3: Blocco del seme; 4: Piastra incubata; 5: Base; 6: Maniglia di comando; 7: Perno limite. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 2: Schema strutturale del convertitore di acquisizione delle immagini. 1: Conchiglia; 2: Schermo di visualizzazione; 3: Sala acquisizione immagini; 4: Base della scheda di rilevamento; 5: Scheda di rilevamento dentro e fuori dal magazzino; 6: Scheda di controllo; 7: Dispositivo di conversione dell’acquisizione delle immagini; 8: Sorgente luminosa; 9: Scanner di immagini. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Il metodo di diluizione dell’agar è stato ben consolidato e ampiamente utilizzato. Il principio del sistema AST ad alto rendimento era quello del metodo di diluizione dell’agar. Uno dei passaggi critici all’interno del protocollo è stato il trasferimento accurato ad alto rendimento di 96 inoculi contemporaneamente, che è stato eseguito più volte di seguito. Per completare questo passaggio critico, i perni dell’inoculatore a matrice di 96 punti erano uniformi e molto lisci. La deposizione naturale di ciascun perno era…
The authors have nothing to disclose.
Questo lavoro è stato sostenuto dal National Key Research and Development Project (2019YFA0904003); Moderno sistema industriale agricolo nella provincia di Shandong (SDAIT-011-09); Progetto di Ottimizzazione della Piattaforma di Cooperazione Internazionale (CXGC2023G15); Principali compiti di innovazione del progetto di innovazione tecnologica e scientifica agricola dell’Accademia delle scienze agrarie dello Shandong, Cina (CXGC2023G03).
96 well culture plate | Beijing lanjieke Technology Co., Ltd | 11510 | |
96-dot matrix AST image acquisition system | Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences | In-house software copyright | |
96-dot matrix inoculator | Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences | N/A | Patented product |
Agar | Qingdao hi tech Industrial Park Haibo Biotechnology Co., Ltd | HB8274-1 | |
Amikacin | Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd | A857053 | |
Amoxicillin | Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd | A822839 | |
Ampicillin | Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd | A830931 | |
Analytical balance | Sartorius | BSA224S | |
Automated calculation software for Lar index of AMR | Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences | In-house software copyright | |
Bacteria Salmonella strains | Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences | N/A | Animal origin |
Bacterial resistance Lar index certification management system V1.0 | Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences | In-house software copyright | |
Ceftiofur | Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd | C873619 | |
Ciprofloxacin | Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd | C824343 | |
Clavulanic acid | Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd | C824181 | |
Clean worktable | Suzhou purification equipment Co., Ltd | SW-CJ-2D | |
Colistin sulfate | Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd | C805491 | |
Culture plate | Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences | N/A | Patented product |
Doxycycline | Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd | D832390 | |
Enrofloxacin | Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd | E809130 | |
Filter 0.22 μm | Millipore | SLGP033RB | |
Florfenicol | Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd | F809685 | |
Gentamicin | Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd | G810322 | |
Glass bottle 50 mL | Xuzhou Qianxing Glass Technology Co., Ltd | QX-7 | |
High-throughput resistance detection system V1.0 | Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences | In-house software copyright | |
Image acquisition converter | Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences | N/A | Patented product |
Meropenem | Shanghai McLean Biochemical Technology Co., Ltd | M861173 | |
Mueller-Hinton agar | Qingdao hi tech Industrial Park Haibo Biotechnology Co., Ltd | HB6232 | |
Petri dish 60 mm x 15 mm | Qingdao Jindian biochemical equipment Co., Ltd | 16021-1 | |
Petri dish 90 mm x 15 mm | Qingdao Jindian biochemical equipment Co., Ltd | 16001-1 | |
Salmonella phages | Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences | N/A | |
Shaker incubator | Shanghai Minquan Instrument Co., Ltd | MQD-S2R | |
Turbidimeter | Shanghai XingBai Biotechnology Co., Ltd | F-TC2015 | |
Varms base type library system V1.0 | Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences | In-house software copyright | |
Vertical high-pressure steam sterilizer | Shanghai Shen'an medical instrument factory | LDZX-75L | |
Veterinary pathogen resistance testing management system | Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences | In-house software copyright | |
Veterinary resistance cloud monitoring and phage control platform V1.0 | Institute of Animal Science and Veterinary Medicine, Shandong Academy of Agricultural Sciences | In-house software copyright |