Apresenta-se aqui um conjunto de protocolos para a geração e criopreservação de esferoides cardíacos (CSs) de cardiomiócitos derivados de células-tronco pluripotentes induzidos por humanos cultivados em um formato multidimensional de alto rendimento. Esse modelo tridimensional funciona como uma plataforma robusta para modelagem de doenças, rastreios de alto rendimento e mantém sua funcionalidade após a criopreservação.
Os cardiomiócitos derivados de células-tronco pluripotentes induzidos por humanos (hiPSC-CMs) são de suma importância para a modelagem e terapêutica de doenças cardíacas humanas. Publicamos recentemente uma estratégia econômica para a expansão maciça de CM-hiPSC em duas dimensões (2D). Duas grandes limitações são a imaturidade celular e a falta de arranjo tridimensional (3D) e escalabilidade em plataformas de triagem de alto rendimento (HTS). Para superar essas limitações, os cardiomiócitos expandidos formam uma fonte celular ideal para a geração de cultura de células cardíacas 3D e técnicas de engenharia de tecidos. Este último possui grande potencial no campo cardiovascular, proporcionando HTS mais avançada e fisiologicamente relevante. Aqui, descrevemos um fluxo de trabalho compatível com HTS com fácil escalabilidade para a geração, manutenção e análise óptica de esferoides cardíacos (CSs) em um formato de 96 poços. Esses pequenos CSs são essenciais para preencher a lacuna presente nos atuais modelos de doenças in vitro e/ou geração para plataformas de engenharia de tecidos 3D. Os CSs apresentam morfologia, tamanho e composição celular altamente estruturados. Além disso, os CMs hiPSC cultivados como CSs apresentam maturação aumentada e várias características funcionais do coração humano, como manuseio espontâneo de cálcio e atividade contrátil. Ao automatizar o fluxo de trabalho completo, desde a geração de CSs até a análise funcional, aumentamos a reprodutibilidade intra e interlotes, conforme demonstrado pela imagem de alto rendimento (HT) e pela análise de manuseio de cálcio. O protocolo descrito permite a modelagem de doenças cardíacas e a avaliação de efeitos medicamentosos/terapêuticos no nível de uma única célula dentro de um ambiente complexo de células 3D em um fluxo de trabalho HTS totalmente automatizado. Além disso, o estudo descreve um procedimento simples para preservação a longo prazo e biobanco de esferoides inteiros, proporcionando aos pesquisadores a oportunidade de criar armazenamento de tecidos funcionais de próxima geração. O HTS combinado com o armazenamento de longo prazo contribuirá substancialmente para a pesquisa translacional em uma ampla gama de áreas, incluindo descoberta e teste de medicamentos, medicina regenerativa e desenvolvimento de terapias personalizadas.
A descoberta de células-tronco pluripotentes induzidas por humanos (hiPSCs) ofereceu oportunidades sem precedentes para estudar o desenvolvimento humano e a doença no nível celular. Ao longo da última década, utilizando lições de desenvolvimento, vários protocolos têm sido estabelecidos para garantir a diferenciação eficiente de hiPSCs em cardiomiócitos (MCs)1,2,3,4. Os cardiomiócitos derivados de hiPSC (hiPSC-CMs) podem servir como um recurso para modelar doenças cardiovasculares geneticamente hereditárias (DCV), testar a segurança cardíaca para novos medicamentos e estratégias regenerativas cardíacas 5,6,7,8. Apesar da diferenciação cardíaca direcionada das hiPSCs, os números indefinidos de MC continuam sendo um desafio no campo cardíaco, uma vez que os CM-HCs hiPSC amadurecidos geralmente não são proliferativos e as células humanas primárias não estão disponíveis em grandes quantidades.
Recentemente, descrevemos que a ativação concomitante da sinalização Wnt com cultura de baixa densidade celular resultou em uma resposta proliferativa maciça (até 250 vezes) de hiPSC-CMs 9,10. Essa estratégia econômica para a expansão maciça de hiPSC-CMs via passagem serial em formato de frasco de cultura facilita a padronização e o controle de qualidade de um grande número de hiPSC-CMs funcionais. Além disso, para acompanhar a demanda por grandes lotes de hiPSC-CMs de vários doadores, o biobanco de hiPSC-CMs tem sido descrito10. No entanto, as monocamadas de cardiomiócitos semeadas nessas placas de cultura padrão não são representativas da complexa estrutura 3D presente no coração. Além disso, a imaturidade dos CME-hiPSC tem permanecido um obstáculo, ficando aquém de imitar o fenótipo biológico e fisiológico do ambiente cardiovascular di vivo.
Novos modelos 3D in vitro foram desenvolvidos onde os CM-hiPSC mostram um comportamento fisiológico mais próximo, como auto-organização 11,12, remodelamento da matriz extracelular (ECM) 13, maturação aumentada 14,15,16 e contração sincronizada17,18,19 . Modelos 3D têm sido utilizados para descoberta de medicamentos, testes de cardiotoxicidade de medicamentos, modelagem de doenças, terapias regenerativas e até mesmo os primeiros ensaios clínicos 20,21,22,23,24. Um dos modelos mais utilizados é o tecido cardíaco modificado à base de fibrina (EHT), que apresenta arranjo tecidual e contratilidade cardíaca13,17,25. Anteriormente, mostramos que os EHTs gerados a partir de hiPSC-CMs expandidos exibiam contratilidade comparável aos de hiPSC-CMs não expandidos, demonstrando funcionalidade celular não comprometida após a expansão9. No entanto, embora a geração de EHTs a partir de CM-hiPSC tenha sido bem estabelecida, esperam-se novos desenvolvimentos em relação ao estabelecimento de uma plataforma de avaliação de HT. Aqui, a rápida geração de um grande número de esferoides cardíacos auto-agregadores (CSs) no formato de 96 poços permite uma melhoria nas condições 3D para fins de triagem de alto rendimento (HTS).
No geral, a vantagem dos CSs como cultura de células 3D é sua alta reprodutibilidade e escalabilidade. Em particular, os CSs combinados com o manuseio robótico de amostras podem padronizar e automatizar a cultura de CS, o tratamento medicamentoso e a análise de alto conteúdo20. Aqui, descrevemos protocolos otimizados para gerar CSs de alta pureza e alta qualidade, que podem ser eficientemente criopreservados e rastreados para a função cardíaca, realizando medições transitórias de Ca2+ usando um sistema óptico de aquisição e análise de cálcio. Este modelo fornece uma ferramenta simples, mas poderosa, para executar telas de alto rendimento em centenas a milhares de esferoides17,18.
A descoberta de medicamentos cardíacos é dificultada por uma dependência de modelos celulares e animais não humanos com rendimento inadequado e fidelidade fisiológica para realizar leituras com precisão. A biologia hiPSC-CM, juntamente com a instrumentação HT e sondas fisiológicas, tem o potencial de reintroduzir modelos humanos nos estágios iniciais da modelagem de doenças cardíacas e da descoberta de medicamentos. Desenvolvemos um método de geração de tecido cardíaco 3D que produz CSs funcionais e de alta qualidade para uma plataforma ideal de modelagem de doenças cardíacas e triagem de medicamentos. Além disso, a combinação da tecnologia esferoide em sistemas de biorreatores 3D para a produção industrial de EV permite um passo necessário em direção à tradução clínica da terapia baseada em EV. O método aqui descrito baseia-se em vários fatores cruciais e é uma variante dos protocolos existentes 9,10,28,29. Esses métodos incluem: 1) a geração de construções de tecido 3D, 2) o número ideal de células e o tempo antes da triagem, 3) melhorar a sensibilidade e a capacidade de alto rendimento dos instrumentos e 4) ser capaz de congelar os esferoides antes de qualquer análise funcional. Ao contrário dos protocolos descritos anteriormente, o protocolo proposto descreve a geração de até 1.500 esferoides por dia e a adequação para HTS. A análise convencional de uma centena de compostos com mais de 6 x 0,5 log doses para 10 replicações usando sistemas de imagem de cálcio de 96 poços existentes ou tecidos cardíacos modificados multiplexados de 24 poços requer aproximadamente 500 milhões a 3 bilhões de CMs hiPSC-31,32. A aplicação proposta torna os rastreios cardíacos menos dispendiosos e eficazes em termos de tempo em comparação com os sistemas convencionais, uma vez que as placas de 96 poços exigiram apenas 10% da densidade de semeadura em comparação com o método descrito. Além disso, em comparação com protocolos anteriores, como o método hanging-drop, a geração de esferoides por autoagregação em placas de fixação ultrabaixa permite imagens automatizadas de alta qualidade de microtecidos únicos33.
Este pequeno modelo 3D imita o fenótipo biológico e fisiológico do ambiente cardiovascular di vivo. Como demonstrado anteriormente, os transientes de cálcio aumentam drasticamente nos construtos de tecido cardíaco 3D em comparação com as culturas de células monocamada 2D34.
Em seguida, descobrimos que a densidade de semeadura e o tempo de cultivo adequado também são fatores críticos para uma triagem de CS bem-sucedida. As densidades de 10K-20K hiPSC-CMs por esferoide e triagem entre as semanas 2-3 após a geração foram ótimas, enquanto esferoides muito pequenos ou muito velhos mostram manuseio de cálcio perturbado (Figura 2 e Figura 3). Portanto, é importante manter as densidades de semeadura o mais consistentes possível, uma vez que o tamanho influencia os parâmetros funcionais. Além disso, embora este método óptico forneça bons resultados para culturas 3D vivas como um todo o tecido, a obtenção de dados dentro de esferoides maiores a nível (sub)celular é um desafio sem depender de métodos histológicos demorados. Recentemente, várias abordagens foram publicadas que usaram “limpeza óptica”, que permite a aquisição de esferoides 3D inteiros com a oportunidade de quantificação de marcadores de célula única. Aqui, adaptamos um protocolo de 3 dias da coleta de CS para a análise de imagens, que é otimizado para imagens 3D usando microscopia confocal29 (Figura 1C e Figura 4D).
Por fim, com o aumento das aplicações de tecido cardíaco 3D e aplicações comerciais, a demanda por armazenamento a longo prazo e biobanco específico do paciente de vários doadores está aumentando. A criopreservação é uma estratégia eficaz para gerar placas HTS a partir de vários lotes ao longo do tempo. O congelamento de CME-hiPSC já foi descrito anteriormente e não é diferente em comparação com outros tipos de células cultivadas 10,35,36. Recentemente, abordagens para congelamento de placas com células 2D têm sido descritas37. Aqui, descobrimos que o kit de criopreservação PSC é a condição mais ideal em comparação com três outros (dados não mostrados) e usamos esse meio para o congelamento eficiente de esferoides. Após a criopreservação, a viabilidade permanece elevada (Figura 4B,C), mas as propriedades eletrofisiológicas dos CSs são afetadas e é necessário um período de incubação após o descongelamento. De fato, 1 semana após o descongelamento, os CSs apresentaram atividade espontânea de batimento e manuseio de cálcio. No entanto, tem sido descrito que os CM-hiPSC frescos e recuperados nem sempre apresentam propriedades moleculares e fisiológicas idênticas38. Essa limitação precisa ser considerada quando os CM-hiPSC criopreservados são usados para avaliar leituras cardíacas induzidas por medicamentos. Além disso, embora efetivamente modulemos o número de células por esferoide e o momento ideal da imagem transitória de cálcio, os esferoides cardíacos poderiam ser melhorados pela mistura de células cardiomiócitos derivadas de hiPSC com células endoteliais, fibroblastos, junções célula-célula e matrizes extracelulares, como quitosana, colágeno IV, fibronectina, matrigel ou laminina, imitando o ambiente cardíaco in vivo 39, 40. No geral, propomos um protocolo passo-a-passo para gerar eficientemente CSs que são adequados para aplicações a jusante, como modelagem de doenças e triagem de medicamentos HT.
The authors have nothing to disclose.
Gostaríamos de agradecer às ciências da VALA pelo pacote de software Cyteseer e pela otimização da análise automatizada de cálcio 3D. Queremos agradecer o apoio da Fundação PLN (RM). P.A.D. e F.S. são suportados pelo CUREPLaN Leducq. A J.P.G.S. é apoiada pelo H2020-EVICARE (#725229) do Conselho Europeu de Investigação (ERC). A J.W.B. é apoiada pela UMC Utrecht Clinical Fellowship, Netherlands Heart Institute Fellowship e pela bolsa de jovens talentos CVON-Dosis; Fundação do Coração dos Países Baixos (CVON-Dosis 2014-40). N.C. é apoiada pelo Programa de Gravitação “Regeneração Impulsionada por Materiais” da Organização Holandesa de Pesquisa Científica (RegmedXB #024.003.013) e pelas Ações Marie Skłodowska-Curie (Contrato de Subvenção RESCUE #801540). V.S.-P. é apoiado pelo Fundo de Aliança (UMCU, UU, TU/e). A A.V.M. é apoiada pelo projeto BRAVE, financiado pela UE (H2020, ID:874827)
24 wells suspenion plate | Corning | 3738 | |
96 wells Ultra-Low Attachment Multiple Well Plate | Corning | CLS3474-24EA | |
Albumax | Thermo Fisher Scientific | 11020021 | |
Anti-α-Actinin (Sarcomeric) antibody | Sigma-Aldrich | A7811 | Dilution: 1:200 |
Anti-Cardiac Troponin T antibody (ab45932) | Abcam | ab45932 | Dilution: 1:200 |
Ascorbic acid | Sigma-Aldrich | A8960 | |
B-27 supplement | Thermo Fisher Scientific | 17504-044 | |
Biotin | Sigma-Aldrich | B4639 | |
Bovine serum albumin fraction V (BSA) | Roche | 10735086001 | |
Cal-520, AM | Abcam | ab171868 | |
Confocal microscope | Leica | DMi8 | |
Confocal microscope software | Leica | Las X | |
Conical tubes 15 mL | Greiner Bio-One | 5618-8271 | |
Creatine monohydrate | Sigma-Aldrich | C3630 | |
DAPI | Thermo Fisher Scientific | D3571 | Concentration: 1 µg/mL |
DMEM no glucose | Thermo Fisher Scientific | 11966025 | |
EDTA | Thermo Fisher Scientific | 15575020 | |
Fructose | Sigma-Aldrich | 76050771.05 | |
Glucose | Sigma-Aldrich | G7021 | |
Glycerol | Boom | 76050771.05 | |
Goat anti-mouse Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A11029 | Dilution: 1:500 |
Goat anti-rabbit Alexa Fluor 568 | Invitrogen | A11011 | Dilution: 1:500 |
Horizontal shaker | IKA | 4003000 | |
Human induced pluripotent stem cell lines | (Stanford Cardiovascular Institute (S-CVI) Biobank) | CVI-273 (control 1) | |
Human induced pluripotent stem cell lines | Germany | 141 (control 2) 144 (control 3) | |
Hydrochloric acid (HCl) | Ajax Firechem | 265.2.5L-PL | 10 M stock solution, corrosive |
Isotype control, FITC mouse IgM κ isotype | BD | 556652 | |
KnockOut Serum Replacement | Thermo Fisher Scientific | 10828 | Protect from light |
L-carnitine | Sigma-Aldrich | C0283 | |
Myocyte calcium and contractility system | Leica | Thunder, DMi8 | |
Non essential amino acids (NEAA) | Thermo Fisher Scientific | 11140 | |
Paraformaldehyde solution 4% in 1x PBS, pH 7.0–7.6 | Santa Cruz | SC281692 | Hazardous |
PBS, pH 7.4 | Thermo Fisher Scientific | 10010023 | |
Penicillin/streptomycin | Thermo Fisher Scientific | 15140 | |
PES Membrane Vacuum Filter system | Corning | 431097 | |
PI/RNase Staining Solution | Invitrogen | F10797 | Dilution: 1:1000 |
Pluronic F-127 | Sigma-Aldrich | P2443 | |
PSC Cryopreservation Kit | Thermo Fisher Scientific | A2644601 | |
RevitaCell | Thermo Fisher Scientific | A2644501 | |
RPMI 1640 medium | Thermo Fisher Scientific | 11875 | |
Silicone Elastomer Kit | SYLGARD | 184 | |
Sodium dodecyl sulfate solution (10%) | Sigma-Aldrich | 71736 | |
Sodium L-Lactate | Sigma-Aldrich | 71718 | |
Taurine | Sigma-Aldrich | T0625 | |
Tris Fisher | Scientific | 11486631 | |
Triton X-100 | Merck | X100-1L | Hazardous |
Trypan blue solution, 0.4% | Thermo Fisher Scientific | 15250061 | |
TrypLE Select Enzyme (10x) | Thermo Fisher Scientific | A1217701 | |
Tween-20 | Sigma-Aldrich | P1379 | |
Urea | Sigma-Aldrich | 51456 | |
Vitamin B12 | Sigma-Aldrich | V6629 | |
Y-27632 dihydrochloride (Rho-kinase inhibitor) | Tocris | 1254 | Protect from light |