Un ensemble de protocoles pour la génération et la cryoconservation de sphéroïdes cardiaques (CS) à partir de cardiomyocytes dérivés de cellules souches pluripotentes induites par l’homme cultivés dans un format multidimensionnel à haut débit est présenté. Ce modèle tridimensionnel fonctionne comme une plate-forme robuste pour la modélisation des maladies, les criblages à haut débit et conserve sa fonctionnalité après cryoconservation.
Les cardiomyocytes dérivés de cellules souches pluripotentes induites par l’homme (hiPSC-CM) sont d’une importance primordiale pour la modélisation et la thérapeutique des maladies cardiaques humaines. Nous avons récemment publié une stratégie rentable pour l’expansion massive des CM-HISP en deux dimensions (2D). Deux limitations majeures sont l’immaturité cellulaire et le manque d’arrangement tridimensionnel (3D) et d’évolutivité dans les plates-formes de criblage à haut débit (HTS). Pour surmonter ces limitations, les cardiomyocytes expansés forment une source cellulaire idéale pour la génération de cultures cellulaires cardiaques 3D et de techniques d’ingénierie tissulaire. Ce dernier présente un grand potentiel dans le domaine cardiovasculaire, fournissant un HTS plus avancé et physiologiquement pertinent. Ici, nous décrivons un flux de travail compatible HTS avec une évolutivité facile pour la génération, la maintenance et l’analyse optique des sphéroïdes cardiaques (CS) dans un format de 96 puits. Ces petits CS sont essentiels pour combler les lacunes présentes dans les modèles actuels de maladies in vitro et/ou la génération de plateformes d’ingénierie tissulaire 3D. Les CS présentent une morphologie, une taille et une composition cellulaire très structurées. De plus, les hiPSC-CM cultivés en tant que CS présentent une maturation accrue et plusieurs caractéristiques fonctionnelles du cœur humain, telles que la manipulation spontanée du calcium et l’activité contractile. En automatisant l’ensemble du flux de travail, de la génération de CS à l’analyse fonctionnelle, nous augmentons la reproductibilité intra et inter-lots, comme le démontrent l’imagerie à haut débit (HT) et l’analyse de la manipulation du calcium. Le protocole décrit permet de modéliser les maladies cardiaques et d’évaluer les effets médicamenteux / thérapeutiques au niveau de la cellule unique dans un environnement cellulaire 3D complexe dans un flux de travail HTS entièrement automatisé. En outre, l’étude décrit une procédure simple pour la préservation à long terme et la biobanque de sphéroïdes entiers, offrant ainsi aux chercheurs la possibilité de créer un stockage de tissus fonctionnels de nouvelle génération. Le HTS, combiné au stockage à long terme, contribuera de manière substantielle à la recherche translationnelle dans un large éventail de domaines, notamment la découverte et les essais de médicaments, la médecine régénérative et le développement de thérapies personnalisées.
La découverte de cellules souches pluripotentes induites par l’homme (CSPhi) a offert des possibilités sans précédent d’étudier le développement humain et la maladie au niveau cellulaire. Au cours de la dernière décennie, à l’aide de leçons de développement, divers protocoles ont été établis pour assurer la différenciation efficace des CSPhi en cardiomyocytes (CM)1,2,3,4. Les cardiomyocytes dérivés des hiPSC (hiPSC-CM) peuvent servir de ressource pour modéliser les maladies cardiovasculaires génétiquement héréditaires (MCV), tester la sécurité cardiaque pour de nouveaux médicaments et les stratégies de régénération cardiaque 5,6,7,8. Malgré la différenciation cardiaque dirigée des CSPhi, le nombre indéfini de CM reste un défi dans le domaine cardiaque, car les HIPSC-CM matures ne sont généralement pas prolifératifs et les cellules humaines primaires ne sont pas disponibles en grande quantité.
Récemment, nous avons décrit que l’activation concomitante de la signalisation Wnt avec une culture à faible densité cellulaire entraînait une réponse proliférative massive (jusqu’à 250 fois) des hiPSC-CMs 9,10. Cette stratégie rentable pour l’expansion massive des CM-CSPh via le passage en série dans le format flacon de culture facilite la normalisation et le contrôle de la qualité d’un grand nombre de CM-CSP fonctionnels. De plus, pour répondre à la demande de grands lots de CM-CSPhi de divers donateurs, la biobanque de CM-HIPSC a été décrite10. Cependant, les monocouches de cardiomyocytes ensemencées dans ces boîtes de culture standard ne sont pas représentatives de la structure 3D complexe présente dans le cœur. De plus, l’immaturité des hiPSC-CM est restée un obstacle, ne permettant donc pas d’imiter le phénotype biologique et physiologique de l’environnement cardiovasculaire in vivo.
De nouveaux modèles in vitro 3D ont été développés où les hiPSC-CM montrent un comportement physiologique plus étroit tel que l’auto-organisation 11,12, le remodelage de la matrice extracellulaire (ECM) 13, la maturation améliorée 14,15,16 et la contraction synchronisée17,18,19 . Les modèles 3D ont été utilisés pour la découverte de médicaments, les tests de cardiotoxicité des médicaments, la modélisation de maladies, les thérapies régénératives et même les premiers essais cliniques 20,21,22,23,24. L’un des modèles les plus utilisés est le tissu cardiaque modifié à base de fibrine (EHT), qui présente un arrangement tissulaire et une contractilité cardiaque13,17,25. Auparavant, nous avons montré que les EHT générés à partir de hiPSC-CM étendus présentaient une contractilité comparable à celles des hiPSC-CM non développés, démontrant une fonctionnalité cellulaire sans compromis après l’expansion9. Néanmoins, même si la génération d’EHT à partir de CM-CSP a été bien établie, d’autres développements sont attendus concernant la mise en place d’une plate-forme d’évaluation de l’HT. Ici, la génération rapide d’un grand nombre de sphéroïdes cardiaques (CS) auto-agrégés au format 96 puits permet une amélioration des conditions 3D à des fins de criblage à haut débit (HTS).
Dans l’ensemble, l’avantage des CS en tant que culture cellulaire 3D est leur reproductibilité et leur évolutivité élevées. En particulier, les CS combinés à la manipulation robotisée des échantillons peuvent normaliser et automatiser la culture CS, le traitement de la toxicomanie et l’analyse à haut contenu20. Ici, nous décrivons des protocoles optimisés pour générer des CS de haute pureté et de haute qualité, qui peuvent être efficacement cryoconservés et criblés pour la fonction cardiaque en effectuant des mesures transitoires Ca2+ à l’aide d’un système optique d’acquisition et d’analyse du calcium. Ce modèle fournit un outil simple mais puissant pour effectuer des criblages à haut débit sur des centaines à des milliers de sphéroïdes17,18.
La découverte de médicaments cardiaques est entravée par le recours à des modèles animaux et cellulaires non humains avec un débit et une fidélité physiologique insuffisants pour effectuer des lectures avec précision. La biologie hiPSC-CM couplée à l’instrumentation HT et aux sondes physiologiques a le potentiel de réintroduire des modèles humains dans les premières étapes de la modélisation des maladies cardiaques et de la découverte de médicaments. Nous avons développé une méthode de génération de tissu cardiaque 3D qui produit des CS fonctionnels et de haute qualité pour une plateforme optimale de modélisation des maladies cardiaques et de dépistage de médicaments. De plus, la combinaison de la technologie sphéroïde dans des systèmes de bioréacteurs 3D pour la production industrielle de véhicules électriques permet une étape nécessaire vers la traduction clinique de la thérapie à base de véhicules électriques. La méthode décrite ici repose sur plusieurs facteurs cruciaux et est une variante des protocoles existants 9,10,28,29. Ces méthodes comprennent: 1) la génération de constructions tissulaires 3D, 2) le nombre optimal de cellules et le moment avant le criblage, 3) l’amélioration de la sensibilité et de la capacité à haut débit des instruments, et 4) la possibilité de congeler les sphéroïdes avant toute analyse fonctionnelle. Contrairement aux protocoles décrits précédemment, le protocole proposé décrit la génération de jusqu’à 1 500 sphéroïdes par jour et la pertinence du HTS. L’analyse conventionnelle d’une centaine de composés sur 6 x 0,5 log doses pour 10 répétitions à l’aide de systèmes d’imagerie calcique existants à 96 puits ou de tissus cardiaques modifiés multiplexés à 24 puits nécessite environ 500 millions à 3 milliards de hiPSC-CM31,32. L’application proposée rend les dépistages cardiaques moins coûteux et moins rapides que les systèmes conventionnels puisque les plaques à 96 puits ne nécessitaient que 10 % de la densité d’ensemencement par rapport à la méthode décrite. De plus, par rapport aux protocoles précédents, tels que la méthode de la goutte suspendue, la génération de sphéroïdes par auto-agrégation dans des plaques de fixation ultra-basses permet une imagerie automatisée de haute qualité de microtissus uniques33.
Ce petit modèle 3D imite le phénotype biologique et physiologique de l’environnement cardiovasculaire in vivo . Comme démontré précédemment, les transitoires de calcium augmentent considérablement dans les constructions de tissus cardiaques 3D par rapport aux cultures cellulaires monocouches2D 34.
Ensuite, nous avons constaté que la densité de semis et le temps de culture approprié sont également des facteurs critiques pour un dépistage CS réussi. Les densités de 10K-20K hiPSC-CM par sphéroïde et le dépistage entre les semaines 2 et 3 après la génération étaient optimales, tandis que les sphéroïdes trop petits ou trop âgés présentent une manipulation perturbée du calcium (Figure 2 et Figure 3). Par conséquent, il est important de maintenir des densités de semis aussi cohérentes que possible, car la taille influence les paramètres fonctionnels. De plus, bien que cette méthode optique fournisse de bons résultats pour les cultures 3D vivantes en tant que tissu entier, il est difficile d’obtenir des données au sein de sphéroïdes plus grands au niveau (sous-)cellulaire sans recourir à des méthodes histologiques fastidieuses. Récemment, plusieurs approches ont été publiées qui utilisaient le « nettoyage optique », qui permet l’acquisition de sphéroïdes 3D entiers avec la possibilité de quantifier des marqueurs à cellule unique. Ici, nous avons adapté un protocole de 3 jours allant de la récolte CS à l’analyse d’images, optimisée pour l’imagerie 3D par microscopie confocale29 (Figure 1C et Figure 4D).
Enfin, avec l’augmentation des applications de tissus cardiaques 3D et des applications commerciales, la demande de stockage à long terme et de biobanque spécifique au patient de la part de divers donneurs augmente. La cryoconservation est une stratégie efficace pour générer des plaques HTS à partir de plusieurs lots au fil du temps. La congélation des hiPSC-CM a été décrite précédemment et n’est pas différente de celle des autres types de cellules cultivées 10,35,36. Récemment, des approches pour congeler des plaques avec des cellules 2D ont été décrites37. Ici, nous avons constaté que le kit de cryoconservation PSC est la condition la plus optimale par rapport à trois autres (données non présentées) et utilisé ce milieu pour la congélation efficace des sphéroïdes. Après cryoconservation, la viabilité reste élevée (Figure 4B,C), mais les propriétés électrophysiologiques des CS sont affectées et une période d’incubation après décongélation est nécessaire. En effet, 1 semaine après la décongélation, les CS ont montré une activité de battement spontanée et une manipulation du calcium. Cependant, il a été décrit que les hiPSC-CM fraîches et récupérées ne présentent pas toujours des propriétés moléculaires et physiologiques identiques38. Cette limitation doit être prise en compte lorsque des CM-HiPSC cryoconservés sont utilisés pour évaluer les lectures cardiaques induites par le médicament. De plus, bien que nous modulions efficacement le nombre de cellules par sphéroïde et le moment optimal de l’imagerie transitoire du calcium, les sphéroïdes cardiaques pourraient être améliorés en mélangeant des cellules cardiomyocytaires dérivées de l’hiPSC avec des cellules endothéliales, des fibroblastes, des jonctions cellule-cellule et des matrices extracellulaires, telles que le chitosane, le collagène IV, la fibronectine, la matrigel ou la laminine, imitant l’environnement cardiaque in vivo 39, 40. Dans l’ensemble, nous proposons un protocole étape par étape pour générer efficacement des CS adaptés aux applications en aval telles que la modélisation des maladies et le dépistage de médicaments HT.
The authors have nothing to disclose.
Nous tenons à remercier VALA sciences pour le progiciel Cyteseer et l’optimisation de l’analyse 3D automatisée du calcium. Nous tenons à remercier la fondation PLN (RM) pour le soutien de la subvention. P.A.D. et F.S. sont soutenus par CUREPLaN Leducq. J.P.G.S. est soutenu par H2020-EVICARE (#725229) du Conseil Européen de la Recherche (ERC). J.W.B. est soutenu par la bourse clinique UMC Utrecht, la bourse de l’Institut de cardiologie des Pays-Bas et la bourse de jeunes talents CVON-Dosis; Fondation néerlandaise du cœur (CVON-Dosis 2014-40). N.C. est soutenu par le programme de gravitation « Materials Driven Regeneration » de l’Organisation néerlandaise pour la recherche scientifique (RegmedXB #024.003.013), et les actions Marie Skłodowska-Curie (accord de subvention RESCUE #801540). V.S.-P. est soutenu par le Fonds Alliance (UMCU, UU, TU/e). A.v.M. est soutenu par le projet BRAVE (H2020, ID:874827) financé par l’UE
24 wells suspenion plate | Corning | 3738 | |
96 wells Ultra-Low Attachment Multiple Well Plate | Corning | CLS3474-24EA | |
Albumax | Thermo Fisher Scientific | 11020021 | |
Anti-α-Actinin (Sarcomeric) antibody | Sigma-Aldrich | A7811 | Dilution: 1:200 |
Anti-Cardiac Troponin T antibody (ab45932) | Abcam | ab45932 | Dilution: 1:200 |
Ascorbic acid | Sigma-Aldrich | A8960 | |
B-27 supplement | Thermo Fisher Scientific | 17504-044 | |
Biotin | Sigma-Aldrich | B4639 | |
Bovine serum albumin fraction V (BSA) | Roche | 10735086001 | |
Cal-520, AM | Abcam | ab171868 | |
Confocal microscope | Leica | DMi8 | |
Confocal microscope software | Leica | Las X | |
Conical tubes 15 mL | Greiner Bio-One | 5618-8271 | |
Creatine monohydrate | Sigma-Aldrich | C3630 | |
DAPI | Thermo Fisher Scientific | D3571 | Concentration: 1 µg/mL |
DMEM no glucose | Thermo Fisher Scientific | 11966025 | |
EDTA | Thermo Fisher Scientific | 15575020 | |
Fructose | Sigma-Aldrich | 76050771.05 | |
Glucose | Sigma-Aldrich | G7021 | |
Glycerol | Boom | 76050771.05 | |
Goat anti-mouse Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A11029 | Dilution: 1:500 |
Goat anti-rabbit Alexa Fluor 568 | Invitrogen | A11011 | Dilution: 1:500 |
Horizontal shaker | IKA | 4003000 | |
Human induced pluripotent stem cell lines | (Stanford Cardiovascular Institute (S-CVI) Biobank) | CVI-273 (control 1) | |
Human induced pluripotent stem cell lines | Germany | 141 (control 2) 144 (control 3) | |
Hydrochloric acid (HCl) | Ajax Firechem | 265.2.5L-PL | 10 M stock solution, corrosive |
Isotype control, FITC mouse IgM κ isotype | BD | 556652 | |
KnockOut Serum Replacement | Thermo Fisher Scientific | 10828 | Protect from light |
L-carnitine | Sigma-Aldrich | C0283 | |
Myocyte calcium and contractility system | Leica | Thunder, DMi8 | |
Non essential amino acids (NEAA) | Thermo Fisher Scientific | 11140 | |
Paraformaldehyde solution 4% in 1x PBS, pH 7.0–7.6 | Santa Cruz | SC281692 | Hazardous |
PBS, pH 7.4 | Thermo Fisher Scientific | 10010023 | |
Penicillin/streptomycin | Thermo Fisher Scientific | 15140 | |
PES Membrane Vacuum Filter system | Corning | 431097 | |
PI/RNase Staining Solution | Invitrogen | F10797 | Dilution: 1:1000 |
Pluronic F-127 | Sigma-Aldrich | P2443 | |
PSC Cryopreservation Kit | Thermo Fisher Scientific | A2644601 | |
RevitaCell | Thermo Fisher Scientific | A2644501 | |
RPMI 1640 medium | Thermo Fisher Scientific | 11875 | |
Silicone Elastomer Kit | SYLGARD | 184 | |
Sodium dodecyl sulfate solution (10%) | Sigma-Aldrich | 71736 | |
Sodium L-Lactate | Sigma-Aldrich | 71718 | |
Taurine | Sigma-Aldrich | T0625 | |
Tris Fisher | Scientific | 11486631 | |
Triton X-100 | Merck | X100-1L | Hazardous |
Trypan blue solution, 0.4% | Thermo Fisher Scientific | 15250061 | |
TrypLE Select Enzyme (10x) | Thermo Fisher Scientific | A1217701 | |
Tween-20 | Sigma-Aldrich | P1379 | |
Urea | Sigma-Aldrich | 51456 | |
Vitamin B12 | Sigma-Aldrich | V6629 | |
Y-27632 dihydrochloride (Rho-kinase inhibitor) | Tocris | 1254 | Protect from light |