Summary

Simulazione della temperatura in un esperimento di incubazione del suolo

Published: October 28, 2022
doi:

Summary

Gli esperimenti di riscaldamento del suolo di laboratorio di solito impiegano due o più temperature costanti in più camere. Presentando una sofisticata camera ambientale, forniamo un metodo di controllo della temperatura accurato per imitare l’entità e l’ampiezza della temperatura del suolo in situ e migliorare la progettazione sperimentale degli studi di incubazione del suolo.

Abstract

Lo studio dell’impatto del riscaldamento sui suoli richiede una rappresentazione realistica e accurata della temperatura. Negli studi di incubazione di laboratorio, un metodo ampiamente adottato è stato quello di rendere le temperature costanti in più camere e, attraverso il confronto delle risposte del suolo tra camere a bassa e alta temperatura, per derivare l’impatto del riscaldamento sui cambiamenti del suolo. Tuttavia, questo metodo comunemente usato non è riuscito a imitare sia l’entità che l’ampiezza delle temperature effettive osservate in condizioni di campo, minando così potenzialmente la validità di tali studi. Con la crescente disponibilità di camere ambientali sofisticate, è imperativo esaminare metodi alternativi di controllo della temperatura per la ricerca sull’incubazione del suolo. Questo protocollo introdurrà una camera ambientale all’avanguardia e dimostrerà metodi convenzionali e nuovi di controllo della temperatura per migliorare la progettazione sperimentale dell’incubazione del suolo. Il protocollo comprende principalmente quattro fasi: monitoraggio e programmazione della temperatura, raccolta del suolo, incubazione di laboratorio e confronto degli effetti di riscaldamento. Un esempio sarà presentato per dimostrare diversi metodi di controllo della temperatura e i conseguenti scenari di riscaldamento contrastanti; cioè, un progetto a temperatura costante denominato riscaldamento graduale (SW) e simulato in situ come riscaldamento graduale (GW), nonché i loro effetti sulla respirazione del suolo, sulla biomassa microbica e sulle attività enzimatiche extracellulari. Inoltre, presentiamo una strategia per diversificare gli scenari di cambiamento della temperatura per soddisfare specifiche esigenze di ricerca sui cambiamenti climatici (ad esempio, calore estremo). Il protocollo di controllo della temperatura e gli scenari di cambiamento di temperatura raccomandati ben adattati e diversificati aiuteranno i ricercatori a stabilire esperimenti di incubazione del suolo affidabili e realistici in laboratorio.

Introduction

Si prevede che la temperatura superficiale globale aumenterà in questo secolo di 1,8-6,4 °C 1,2. Il riscaldamento globale può aumentare il flusso di CO2 dal suolo all’atmosfera, con conseguente feedback positivo con riscaldamento 3,4,5,6. Poiché le comunità microbiche svolgono un ruolo fondamentale nella regolazione delle risposte respiratorie del suolo al riscaldamento7,8, i cambiamenti nella respirazione microbica e i meccanismi microbici sottostanti con il riscaldamento sono stati al centro della ricerca. Sebbene gli esperimenti di riscaldamento del suolo impiegati in condizioni di campo, tramite un cavo riscaldante9 e una camera superiore aperta10, siano stati vantaggiosi nel catturare caratteristiche naturali del suolo come la temperatura11, i loro elevati costi per l’installazione e la manutenzione ne hanno limitato l’applicazione. In alternativa, gli esperimenti di incubazione del suolo soggetti a temperature diverse sono una scelta favorevole. Il vantaggio principale dell’incubazione del suolo in laboratorio è che le condizioni ambientali ben controllate (ad esempio, la temperatura) sono in grado di districare l’effetto di un fattore da altri fattori confondenti in un ambiente sperimentale sul campo12,13. Nonostante le differenze tra camera di crescita ed esperimenti sul campo (ad esempio, crescita delle piante), la traduzione dai risultati di laboratorio al campo è prontamente disponibile14. L’incubazione di campioni di suolo in un ambiente di laboratorio potrebbe aiutare a migliorare la nostra comprensione meccanicistica della risposta del suolo al riscaldamento15.

La nostra revisione della letteratura ha identificato diversi metodi di controllo della temperatura e, di conseguenza, distinte modalità di variazione della temperatura in precedenti studi di incubazione del suolo (Tabella 1). In primo luogo, gli strumenti utilizzati per controllare la temperatura sono per lo più attraverso un incubatore, una camera di crescita, un bagno d’acqua e, in un raro caso, un cavo riscaldante. Dati questi strumenti, sono stati generati tre modelli tipici di variazione della temperatura (Figura 1). Questi includono la modalità più implementata, temperatura costante (CT), cambiamento lineare (LC) con un tasso di variazione della temperatura costante diverso da zero e cambiamento non lineare (NC) caratterizzato da un tipo diurno di temperatura. Per un caso di pattern CT, la temperatura può variare di grandezza nel tempo, anche se la temperatura costante rimane per un certo periodo di tempo durante l’incubazione (Figura 1B). Per LC, la velocità di variazione della temperatura potrebbe variare in diversi studi a più di due ordini di grandezza (ad esempio, 0,1 °C/giorno vs. 3,3 °C/h; Tabella 1); Per i casi NC, la maggior parte si basava sulla capacità intrinseca degli strumenti utilizzati, portando così a varie modalità. Nonostante ciò un tipo di variazione di temperatura diurna è stata rivendicata attraverso un cavo riscaldante o un’incubatrice16,17; Tuttavia, le temperature della camera in questi esperimenti non sono state convalidate. Altri importanti risultati della revisione nella Tabella 1 includono l’intervallo di temperatura di incubazione di 0-40 °C, con la maggior parte tra 5-25 °C; La durata degli esperimenti variava da poche ore (<1 giorno) a quasi 2 anni (~ 725 giorni). Inoltre, i terreni sottoposti a incubazione sono stati raccolti dagli ecosistemi di foreste, praterie e terreni coltivati, con orizzonte minerale dominante, orizzonte organico e persino suolo contaminato, situato principalmente negli Stati Uniti, in Cina e in Europa (Tabella 1).

Date le tre principali modalità di variazione della temperatura, diversi scenari di riscaldamento distinti raggiunti negli studi precedenti sono stati riassunti nella Tabella 2. Includono il riscaldamento graduale (SW), SW con entità variabile (SWv), il riscaldamento graduale linearmente (GWl), il riscaldamento graduale non lineare (GWn) e il riscaldamento graduale diurno (GWd).

In sintesi, le incubazioni del suolo passate di solito catturavano la temperatura media dell’aria o del suolo in un sito. In molti casi, come mostrato nella tabella 1, gli incubatori o le camere sono stati programmati manualmente ad una temperatura fissa ma non sono stati in grado di regolare automaticamente la temperatura come desiderato, mancando la capacità di controllare il modo e la velocità di variazione della temperatura nel tempo (Eq. 1), e quindi portando a difficoltà di imitare la temperatura diurna del suolo locale. D’altra parte, sebbene tentato in due esperimenti16,17, non abbiamo identificato studi che imitassero esplicitamente il riscaldamento graduale diurno (GWd) nei loro esperimenti di incubazione (Tabella 1). Sulla base della revisione della letteratura, l’ostacolo principale risiede nella scarsa progettazione sperimentale, in particolare nella mancanza di uno strumento sofisticato che consenta l’implementazione e la convalida di scenari diurni o di altri scenari di riscaldamento graduale.

Equation 1(Eq. 1)

Dove ΔT è la quantità di variazione di temperatura, m è il modo di variazione della temperatura, r è la velocità di variazione della temperatura e t è la durata della modifica.

Per migliorare il rigore sperimentale nell’incubazione del suolo, in questo studio viene presentato un metodo di controllo della temperatura accurato e sofisticato. Adottando una camera ambientale all’avanguardia, sempre più disponibile ed economicamente sostenibile, il nuovo progetto non solo consentirà la simulazione accurata della temperatura del suolo in situ (ad esempio, modello diurno) ma anche, tenendo conto di possibili variazioni di temperatura estreme, fornirà un modo affidabile per ridurre al minimo gli artefatti di bias strumentale. L’attuale progettazione dell’incubazione del suolo dovrebbe aiutare i ricercatori a identificare strategie ottimali che soddisfino le loro esigenze di incubazione e ricerca. L’obiettivo generale di questo metodo è quello di presentare ai biogeochimici del suolo un approccio altamente operativo per riformare la progettazione dell’incubazione del suolo.

Protocol

1. Monitoraggio e programmazione della temperatura Identificare una zona di campionamento all’interno di un appezzamento di ricerca. Installare una o più sonde di temperatura automatiche in terreni a 10 cm di profondità. Collegare la stazione meteo a un computer tramite il cavo di trasmissione dati e aprire il software sul computer. Fare clic sul pulsante della barra degli strumenti Avvia/Proprietà per configurare il logger per i sensori esterni utilizzati. Nella schermata Proprietà , impostare il nome del logger/stazione (ad esempio, Soil incubation exp.) e l’intervallo di raccolta dei dati (ad esempio, 60 min). Quindi, nella schermata Proprietà , fare clic su Abilitato sulle porte del sensore esterno utilizzate e selezionare il sensore/unità dal pulsante a discesa per ciascuna porta del sensore (ad esempio, Porta A; “Abilitato”: Temperatura °C). Infine, fai clic su OK per salvare le impostazioni. Monitorare la lettura delle sonde settimanalmente per evitare malfunzionamenti e scaricare il set di dati una volta al mese. Ottenere un record completo per diversi mesi che coprono la stagione di crescita (cioè da aprile a settembre). Condurre l’analisi dei dati dei record di temperatura. Ottenere la temperatura oraria media della stagione di crescita facendo la media di tutte le osservazioni.Ottenere la temperatura media di ogni ora su base giornaliera facendo la media delle temperature della stessa ora in tutti i giorni durante la stagione di crescita. Nella sofisticata camera, avviare il software e fare clic sul pulsante Profilo nella schermata del menu principale per creare un nuovo file. Nella riga di immissione del nome del file, immettere “SW low”. Cliccando sull’opzione Instant Change (Cambio istantaneo ), immettere 15,9 °C come temperatura iniziale ottenuta al punto 1.5, quindi immettere 2 nella riga Minuti per mantenere la temperatura per 2 minuti e fare clic sul pulsante Fine . Quindi, sotto l’opzione Tempo rampa , immettere 15,9 °C come set point di destinazione e nella riga Ore immettere 850 h per sostenere la temperatura. Infine, fai clic sul pulsante Fine .Ripetere il passaggio precedente nella seconda camera aggiungendo 5 °C a ciascun nodo di temperatura e creare un nuovo nome file “SW high”. Ripetere il punto 1.4 nella terza camera aggiungendo 23 ulteriori passi corrispondenti alle 23 temperature orarie del suolo osservate come ottenuto al punto 1.5.1. All’ultimo passaggio, chiamato JUMP, impostare 42 cicli ripetuti (Jump Count 42). Ciò porta allo scenario di riscaldamento graduale o GW basso. Ripetere il passaggio precedente nella quarta camera con 5 °C aggiunti a ciascun nodo di temperatura. Ciò consentirà una simulazione di temperature variabili per 42 giorni a un livello di temperatura più elevato (cioè GW alto). Condurre una corsa preliminare per 24 ore e produrre le temperature registrate dalle quattro camere. Tracciare le temperature registrate dalle camere rispetto a quelle programmate (Figura 2A-D).Se le temperature raggiunte nella camera corrispondono alle temperature programmate da una differenza di temperatura <0,1 °C durante le 24 ore (Figura 2A,B,E,F), le camere sono adatte per l'esperimento di incubazione del suolo. Se i criteri non sono stati soddisfatti in nessuna di queste camere, ripetere un altro test di 24 ore o cercare una nuova camera. 2. Raccolta del suolo e omogeneizzazione Vicino all’area della sonda di temperatura, raccogliere cinque campioni di terreno a 0-20 cm di profondità e metterli in un sacchetto di plastica dopo aver rimosso lo strato superficiale di lettiera. Mescolare accuratamente il campione torcendo, premendo e mescolando i materiali nel sacchetto fino a quando non è visibile alcun singolo campione di terreno. Conservare i campioni in un refrigeratore pieno di impacchi di ghiaccio e trasportarli immediatamente in laboratorio. Rimuovere le radici in ciascun nucleo, setacciarlo attraverso un setaccio di terreno di 2 mm e mescolare e omogeneizzare accuratamente il campione prima della seguente analisi. 3. Incubazione in laboratorio Prima dell’incubazione, pesare 10,0 g di terriccio fresco, asciugarlo in forno per 24 ore a 105 °C e pesare il terreno asciutto. Ricava la differenza tra campioni di terreno fresco e secco e calcola il rapporto tra differenza e peso del suolo asciutto per determinare il contenuto di umidità del suolo in un foglio di calcolo. Utilizzare il contenuto di umidità derivato per calcolare il carbonio della biomassa microbica del suolo (MBC), l’attività enzimatica extracellulare (EEA) e la respirazione eterotrofica del suolo come descritto nei passaggi seguenti. Questi dati aiuteranno a comprendere gli effetti del trattamento sulla respirazione del suolo e i meccanismi microbici sottostanti. Prima dell’incubazione, pesare il sottocampione di terreno umido di campo (10 g) e quantificare il terreno MBC mediante fumigazione del cloroformio-K2SO4 estrazione e metodi di digestione del persolfato di potassio18. Prima dell’incubazione, pesare il sottocampione di terreno umido di campo (1,0 g) e misurare il suolo idrolitico e ossidativo EEA19. Pesare 16 sottocampioni di terreno umido (15,0 g equivalenti di peso secco) in 16 nuclei di cloruro di polivinile (PVC) (diametro 5 cm, altezza 7,5 cm) sigillati con carta in fibra di vetro sul fondo. Posizionare le anime in PVC in barattoli Mason (~ 1 L) rivestiti con un letto di perle di vetro per garantire che i nuclei non assorbano umidità. Posizionare quattro barattoli in ciascuna delle quattro camere come descritto al punto 1.4. Accendere le camere e avviare il programma contemporaneamente in quattro camere. Durante l’incubazione, a 2 ore, giorni 1, 2, 7, 14, 21, 28, 35 e 42, prendere tutti i barattoli in ciascuna delle quattro camere e utilizzare un analizzatore di gas CO2 portatile per misurare la velocità di respirazione del suolo (Rs) mettendo il collare dell’analizzatore sulla parte superiore di ciascun barattolo. Raccogliere distruttivamente tutti i vasi alla fine dell’incubazione (cioè il giorno 42) e quantificare il terreno MBC come descritto nella fase 3.3. Raccogliere distruttivamente tutti i vasi alla fine dell’incubazione (cioè il giorno 42) e quantificare l’attività enzimatica del suolo come descritto nella fase 3.4. 4. Confronto dell’effetto riscaldante Assumendo una frequenza respiratoria costante (Rs) tra due raccolte consecutive, utilizzare la frequenza respiratoria moltiplicata per la durata per ricavare la respirazione cumulativa (Rc). Condurre un’analisi a tre vie delle misure ripetute della varianza (ANOVA) per testare gli effetti principali e interattivi di tempo, temperatura (riscaldamento) e modalità di temperatura (scenario di riscaldamento) su Rs e Rc. Inoltre, condurre un ANOVA bidirezionale per testare gli effetti del riscaldamento e dello scenario di riscaldamento su MBC e EEA.

Representative Results

Le camere all’avanguardia selezionate hanno replicato la temperatura target con elevata precisione (Figura 2A,B,E,F) e hanno soddisfatto i requisiti tecnici dell’esperimento di incubazione. Data la facilità d’uso e funzionamento, questo ha significato la tecnica per migliorare la simulazione della temperatura negli studi sul riscaldamento del suolo e in altre applicazioni come gli studi sulle piante. La procedura è stata impiegata nel nostro recente caso di studio basato su un terreno coltivato di panico verga nel Medio Tennessee. I risultati della ricerca hanno mostrato che rispetto al trattamento di controllo, il riscaldamento ha portato a perdite respiratorie significativamente maggiori (Rs e R c) in entrambi gli scenari di riscaldamento (SW e GW), e GW ha raddoppiato la perdita respiratoria indotta dal riscaldamento (Rc) rispetto a SW, 81% vs 40% (Figura 3). Il giorno 42, MBC e EEA erano anche significativamente diversi tra SW e GW, in modo tale che MBC era più alto in SW che in GW (69% vs 38%; Figura 4) e le glicosidasi e la perossidasi (ad esempio, AG, BG, BX, CBH, NAG, AP, LAP) erano significativamente più alte in GW rispetto agli scenari SW (Figura 5). Figura 1: L’illustrazione della modalità di variazione della temperatura in un esperimento di riscaldamento del suolo come concettualizzato dalla Tabella 1. (A) Temperatura costante (CT) adottata dalla maggior parte degli studi. (B) Temperatura costante con grandezza variabile (CTv). (C,D) Variazione lineare (LC) con tassi positivi e negativi. (E,F) Cambiamento non lineare (NC) con pattern irregolare e pattern diurno. Fare clic qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura. Figura 2: Obiettivo della temperatura tramite programmazione e temperatura della camera durante un periodo di prova di 24 ore. (A,B) Valori di temperatura target (linea grigia) e record di temperatura della camera (linea tratteggiata) sotto controllo e trattamenti di riscaldamento del riscaldamento graduale (SW); (C,D) Target di temperatura (linea grigia) e record di temperatura della camera (linea tratteggiata) sotto controllo e trattamenti di riscaldamento graduale (GW); (E, F) La differenza di temperatura derivata per i record nei pannelli C e D. Fare clic qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura. Figura 3: Tasso cumulativo medio (± SE) di respirazione del suolo (Rc, μg CO2-C·g suolo-1) sotto controllo (cavo) e trattamenti di riscaldamento (scuro) in SW e GW in un esperimento di incubazione delsuolo di 42 giorni. Gli inserti mostrano i tassi di respirazione del suolo (R s, μg CO2-C·h-1·g suolo-1) applicati per stimare la respirazione cumulativa, supponendoche R s fosse costante fino alla successiva misurazione. (A) Riscaldamento graduale (SW) e (B) riscaldamento graduale (GW). N = 4 in ogni collezione. Fare clic qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura. Figura 4: MBC medio (± SE) sotto controllo e trattamenti di riscaldamento in SW e GW in un esperimento di incubazione del suolo di 42 giorni. MBC = carbonio da biomassa microbica; N = 4 in ogni collezione. S denota un effetto significativo dello scenario di riscaldamento (SW vs. GW), a p < 0,05, basato su misure ripetute a tre vie ANOVA. Fare clic qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura. Figura 5: Glicosidasi medie (± SE) e perossidasi (attività μmol h-1·gsoil-1) sotto controllo e trattamenti di riscaldamento in SW e GW in un esperimento di incubazione di 42 giorni. BX =β1,4-xilosidasi; AP = fosfatasi acida; LAP = Leucina aminopeptidasi; NAG =β-1,4-N-acetil-glucosaminidasi; OX = Enzimi ossidativi; PHO = Fenolo ossidasi; PER = Perossidasi. N = 4 in ogni collezione. S denota un effetto significativo dello scenario di riscaldamento (SW vs. GW), a p < 0,05, basato su una triplice misura ripetuta ANOVA. Fare clic qui per visualizzare una versione ingrandita di questa figura. Tabella 1: Revisione della letteratura sui metodi di controllo della temperatura e sulle modalità di variazione della temperatura negli studi di incubazione del suolo 12,13,16,17,20,21,22,23,24,25,2 6,27,28,29, 30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50, 51, 52,53,54,55,56,57,58,59,60,61,62.In totale, 46 studi sono stati inclusi nella revisione. Clicca qui per scaricare questa tabella. Tabella 2: Principali modalità di variazione della temperatura e corrispondenti scenari di riscaldamento basati su una revisione della letteratura (Tabella 1). Sono state stabilite cinque modalità e scenari per rappresentare una vasta gamma di possibili cambiamenti di temperatura e condizioni di riscaldamento. Clicca qui per scaricare questa tabella.

Discussion

Il metodo di controllo della temperatura costante è stato ampiamente applicato (tabella 1). Tuttavia, l’entità e il modello temporale della temperatura implementati in queste procedure simulano male la temperatura del suolo osservata nelle condizioni del campo. Nonostante gli sforzi emergenti che imitavano il modello diurno in passato, tali studi erano scarsi e non riuscivano a chiarire l’attrezzatura e la procedura; né hanno convalidato la simulazione della temperatura per quanto riguarda l’accuratezza e l’affidabilità16,17. Mentre la comunità si sforzava di migliorare la sua comprensione delle risposte al riscaldamento del suolo, è fondamentale ottimizzare la procedura di incubazione del suolo con una temperatura realistica e un controllo fattibile. Tuttavia, tali nuovi metodi non sono stati sviluppati e, pertanto, un metodo standard per i futuri esperimenti di incubazione è ancora fuori portata. Di fronte alla crescente complessità del cambiamento della temperatura globale in termini di ampiezza, ampiezza, stagionalità, durata ed estremità, una procedura completa è molto richiesta.

Qui, è stato presentato un metodo per manipolare una procedura di cambiamento di temperatura diurna, basandosi sulla sofisticata camera, per offrire la capacità di stabilire un cambiamento di temperatura costante, lineare e non lineare e successivamente vari scenari di riscaldamento per soddisfare le future esigenze di ricerca. Ci sono quattro passaggi critici all’interno del protocollo. Il primo è determinare la temperatura del suolo nelle condizioni del campo. Poiché il tipo di suolo e la profondità di interesse, nonché il tipo di uso del suolo possono variare da uno studio all’altro, il numero di sonde di temperatura necessarie per il sito di ricerca specifico dovrebbe essere modificato per adattarsi al meglio alle condizioni reali. In generale, la profondità del suolo per le sonde di temperatura deve soddisfare la maggior parte delle esigenze di ricerca a 0-20 cm e il numero di sonde per rappresentare la temperatura del suolo dovrebbe essere limitato a uno o tre. La chiave è ottenere un record di temperatura continuo e consecutivo a lungo termine in almeno una posizione tipica del suolo.

Il secondo passo critico è impostare il programma per raggiungere la grandezza e il modello di temperatura target nella camera. A causa dell’elevata sensibilità e precisione della camera (Figura 4), è possibile programmare una rappresentazione accurata della temperatura osservata nella condizione di campo. Sebbene il protocollo attuale presentasse solo la temperatura oraria osservata come target nella camera, un monitoraggio più frequente della temperatura del suolo, come 30 min, 15 min, o anche più breve, può essere ottenuto attraverso questa procedura. Tuttavia, una prova delle temperature target e della camera deve essere condotta nell’arco di 24 ore e, prima dell’esperimento, i risultati della prova devono soddisfare i criteri di temperatura inferiore a 0,1 °C tra la temperatura target e la temperatura della camera in tutti i punti temporali. Più frequentemente viene selezionata l’osservazione della temperatura per simulare, più passaggi sono necessari per impostare il programma nella camera prima dell’esperimento.

Il terzo passo critico è condurre l’incubazione stessa. Per ridurre l’influenza delle eterogeneità del suolo63, l’omogeneizzazione dei campioni di suolo è fondamentale e si raccomandano almeno tre repliche per ciascun trattamento. Prima dell’incubazione, è necessario un trattamento di pre-incubazione e la procedura attuale può facilitare il pre-trattamento programmando la temperatura e la durata prima dell’inizio ufficiale dell’esperimento. Questo è vantaggioso per ridurre il disturbo sperimentale e orchestrare l’intera incubazione senza soluzione di continuità. L’ultimo passo critico è quello di includere sia trattamenti a temperatura costante che trattamenti a temperatura variabile in modo da poter fare un confronto con le risposte di riscaldamento del suolo.

Questo protocollo può essere facilmente modificato per consentire di manipolare l’entità, l’ampiezza e la durata del cambiamento di temperatura. Ad esempio, le temperature estreme durante un’ondata di calore in estate e il gelo improvviso all’inizio della primavera a causa dei cambiamenti climatici, possono essere rappresentati utilizzando questa procedura, oltre alla sua capacità di tenere conto della loro durata e intensità variabili. La simulazione delle temperature regolari e irregolari in combinazione consente anche di simulare effetti di variazione di temperatura complessi a lungo termine come previsto in futuro. Come riassunto nella Tabella 2, quegli scenari di riscaldamento che sono stati studiati in molti studi distinti possono essere realizzati collettivamente in uno studio. Questo protocollo dovrebbe fornire un metodo sofisticato per simulare la temperatura negli studi di incubazione del suolo. Con la speranza di un’ampia applicazione, l’adozione di questo protocollo aiuterà a identificare o convalidare un metodo più accurato per futuri studi sul riscaldamento del suolo basati sull’incubazione di laboratorio.

Un’importante limitazione della procedura è che la camera utilizzata nel protocollo attuale ha un volume relativamente piccolo, quindi è in grado di ospitare solo nove vasi di incubazione in ogni camera. Sebbene un barattolo più piccolo aumenti la capacità della camera, si consiglia un grande volume di camera. Un nuovo modello (ad esempio, TestEquity 1007) offrirà una capacità otto volte maggiore ed è quindi raccomandato per esperimenti su larga scala. Nonostante il miglioramento della procedura di controllo della temperatura nelle incubazioni del suolo, le potenziali complicazioni con l’umidità e l’omogeneizzazione del suolo non saranno alleviate adottando l’attuale protocollo.

Dimostriamo vantaggi significativi della sofisticata procedura di controllo della temperatura. Fornisce una strategia di controllo della temperatura affidabile e conveniente per ottenere una simulazione accurata della temperatura e offre un modo fattibile per migliorare l’esperimento di incubazione del suolo necessario per una migliore comprensione delle risposte di riscaldamento del suolo. Sebbene il controllo costante della temperatura sia ampiamente accettato e logisticamente facile da usare, gli artefatti della temperatura costante a lungo termine sulle comunità microbiche del suolo possono deviare gli sforzi per catturare le vere risposte del suolo. Gli altri metodi di riscaldamento di laboratorio riportati sono in gran parte meno controllabili e replicabili. Il protocollo attuale è superiore grazie alla sua facilità d’uso, all’elevata precisione e replicabilità della simulazione della temperatura, alla programmazione esplicita e alla capacità di combinare vari scenari di variazione della temperatura in un singolo esperimento. La fattibilità del controllo della temperatura con elevata precisione consentirà ai ricercatori di esplorare vari scenari di cambiamento di temperatura.

Divulgazioni

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Le fonti di finanziamento utilizzate per sostenere la ricerca includono un US National Science Foundation (NSF) HBCU-EiR (n. 1900885), un US Department of Agriculture (USDA) Agricultural Research Service (ARS) 1890s Faculty Research Sabbatical Program (No. 58-3098-9-005), un USDA NIFA grant (No. 2021-67020-34933) e un USDA Evans-Allen Grant (No. 1017802). Ringraziamo l’assistenza ricevuta dai membri dello staff del Main Campus Agriculture Research and Extension Center (AREC) della TSU a Nashville, Tennessee.

Materials

10 mL-Syringe Fisher Scientific 14-826-13 for soil respiration measurement
Composer Software TestEquity Model #107 for incubation temperature setup
Environmental chamber TestEquity Model #107 for soil incubation
Environmental gas analyzer PP Systems EGM5 for soil respiration measurement
Filter paper Fisher Scientific 1005-125 for soil incubation
Mason jar Ball 15381-3 for soil incubation
Oven Fisher Scientific 15-103-0520 for soil moisture measurement
Plastic Zipper Seal Storage Bag Fisher Scientific 09-800-16 for soil collection
Plate reader Molecular devices FilterMax F5 for soil extracellular enzyme analysis
R Software The R Foundation R version 4.1.3 (2022-03-10) For statistical computing
Refrigerator/Freezer Fisher Scientific 13-991-898 for soil storation
Screwdriver Fisher Scientific 19-313-447 for soil collection
Sharpie Fisher Scientific 50-111-3135 for soil collection
Sieve Fisher Scientific 04-881G  for sieving soil sample
Silicone Septa Duran Wheaton kimble 224100-070 for mason jars used for soil incubation
Soil auger AMS 350.05 for soil collection
SpecWare Software Spectrum Technologies WatchDog E2700 (3340WD2) for temperature collection interval setup
Temperature probe Spectrum Technologies WatchDog E2700 (3340WD2) for soil temperature measurements
TOC/TN analyzer Shimadzu TOC-L series for soil microbial biomass analysis

Riferimenti

  1. Chatterjee, D., Saha, S., Bal, S., Mukherjee, J., Choudhury, B., Dhawan, A. Response of Soil Properties and Soil Microbial Communities to the Projected Climate Change. Advances in Crop Environment Interaction. , 87-136 (2018).
  2. Feral, J., Pachauri, R. K., Meyer, L. A. . Climate Change 2014: Synthesis Report. Contribution of Working Groups I, II and III to the Fifth Assessment Report of the Intergovernmental Panel on Climate. , 151 (2014).
  3. Davidson, E. A. Carbon dioxide loss from tropical soils increases on warming. Nature. 584 (7820), 198-199 (2020).
  4. Davidson, E. A., Janssens, I. A. Temperature sensitivity of soil carbon decomposition and feedbacks to climate change. Nature. 440 (7081), 165-173 (2006).
  5. Van Gestel, N., et al. Predicting soil carbon loss with warming. Nature. 554 (7693), 4-5 (2018).
  6. Tarnocai, C., et al. Soil organic carbon pools in the northern circumpolar permafrost region. Global Biogeochemical Cycles. 23 (2), 2023 (2009).
  7. Allison, S. D., Treseder, K. K. Warming and drying suppress microbial activity and carbon cycling in boreal forest soils. Global Change Biology. 14 (12), 2898-2909 (2008).
  8. Allison, S. D., Wallenstein, M. D., Bradford, M. A. Soil-carbon response to warming dependent on microbial physiology. Nature Geoscience. 3 (5), 336-340 (2010).
  9. Melillo, J. M., et al. Soil warming, carbon-nitrogen interactions, and forest carbon budgets. Proceedings of the National Academy of Sciences. 108 (23), 9508-9512 (2011).
  10. Pelini, S. L., et al. Heating up the forest: open-top chamber warming manipulation of arthropod communities at Harvard and Duke Forests. Methods in Ecology and Evolution. 2 (5), 534-540 (2011).
  11. Hamdi, S., Moyano, F., Sall, S., Bernoux, M., Chevallier, T. Synthesis analysis of the temperature sensitivity of soil respiration from laboratory studies in relation to incubation methods and soil conditions. Soil Biology and Biochemistry. 58, 115-126 (2013).
  12. Benton, T. G., Solan, M., Travis, J. M., Sait, S. M. Microcosm experiments can inform global ecological problems. Trends in Ecology & Evolution. 22 (10), 516-521 (2007).
  13. Schädel, C., et al. Decomposability of soil organic matter over time: the Soil Incubation Database (SIDb, version 1.0) and guidance for incubation procedures. Earth System Science Data. 12 (3), 1511-1524 (2020).
  14. Poorter, H., et al. Pampered inside, pestered outside? Differences and similarities between plants growing in controlled conditions and in the field. New Phytologist. 212 (4), 838-855 (2016).
  15. Jian, S., et al. Multi-year incubation experiments boost confidence in model projections of long-term soil carbon dynamics. Nature Communications. 11 (1), 5864 (2020).
  16. Zhu, B., Cheng, W. Constant and diurnally-varying temperature regimes lead to different temperature sensitivities of soil organic carbon decomposition. Soil Biology and Biochemistry. 43 (4), 866-869 (2011).
  17. Whitby, T. G., Madritch, M. D. Native temperature regime influences soil response to simulated warming. Soil Biology and Biochemistry. 60, 202-209 (2013).
  18. Brookes, P. C., Landman, A., Pruden, G., Jenkinson, D. S. Chloroform fumigation and the release of soil nitrogen: A rapid direct extraction method to measure microbial biomass nitrogen in soil. Soil Biology and Biochemistry. 17 (6), 837-842 (1985).
  19. Saiya-Cork, K., Sinsabaugh, R., Zak, D. The effects of long term nitrogen deposition on extracellular enzyme activity in an Acer saccharum forest soil. Soil Biology and Biochemistry. 34 (9), 1309-1315 (2002).
  20. Adekanmbi, A. A., Shu, X., Zhou, Y., Shaw, L. J., Sizmur, T. Legacy effect of constant and diurnally oscillating temperatures on soil respiration and microbial community structure. bioRxiv. , (2021).
  21. Akbari, A., Ghoshal, S. Effects of diurnal temperature variation on microbial community and petroleum hydrocarbon biodegradation in contaminated soils from a sub-Arctic site. Environmental Microbiology. 17 (12), 4916-4928 (2015).
  22. Bai, Z., et al. Shifts in microbial trophic strategy explain different temperature sensitivity of CO2 flux under constant and diurnally varying temperature regimes. FEMS Microbiology Ecology. 93 (5), (2017).
  23. Bao, X., et al. Effects of soil temperature and moisture on soil respiration on the Tibetan plateau. PLoS One. 11 (10), 0165212 (2016).
  24. Chang, X., et al. Temperature and moisture effects on soil respiration in alpine grasslands. Soil science. 177 (9), 554-560 (2012).
  25. Chen, X., et al. Evaluating the impacts of incubation procedures on estimated Q10 values of soil respiration. Soil Biology and Biochemistry. 42 (12), 2282-2288 (2010).
  26. Conant, R. T., Dalla-Betta, P., Klopatek, C. C., Klopatek, J. M. Controls on soil respiration in semiarid soils. Soil Biology and Biochemistry. 36 (6), 945-951 (2004).
  27. Conant, R. T., et al. Sensitivity of organic matter decomposition to warming varies with its quality. Global Change Biology. 14 (4), 868-877 (2008).
  28. Ding, J., et al. Linking temperature sensitivity of soil CO2 release to substrate, environmental, and microbial properties across alpine ecosystems. Global Biogeochemical Cycles. 30 (9), 1310-1323 (2016).
  29. En, C., Al-Kaisi, M. M., Liange, W., Changhuan, D., Deti, X. Soil organic carbon mineralization as affected by cyclical temperature fluctuations in a karst region of southwestern China. Pedosphere. 25 (4), 512-523 (2015).
  30. Fang, C., Moncrieff, J. The dependence of soil CO2 efflux on temperature. Soil Biology and Biochemistry. 33 (2), 155-165 (2001).
  31. Fierer, N., Colman, B. P., Schimel, J. P., Jackson, R. B. Predicting the temperature dependence of microbial respiration in soil: A continental-scale analysis. Global Biogeochemical Cycles. 20 (3), 3026 (2006).
  32. Guntinas, M., Gil-Sotres, F., Leiros, M., Trasar-Cepeda, C. Sensitivity of soil respiration to moisture and temperature. Journal of Soil Science and Plant Nutrition. 13 (2), 445-461 (2013).
  33. Kittredge, H. A., Cannone, T., Funk, J., Chapman, S. K. Soil respiration and extracellular enzyme production respond differently across seasons to elevated temperatures. Plant and Soil. 425 (1), 351-361 (2018).
  34. Knorr, W., Prentice, I. C., House, J., Holland, E. Long-term sensitivity of soil carbon turnover to warming. Nature. 433 (7023), 298-301 (2005).
  35. Lefevre, R., et al. Higher temperature sensitivity for stable than for labile soil organic carbon-Evidence from incubations of long-term bare fallow soils. Global Change Biology. 20 (2), 633-640 (2014).
  36. Li, J., et al. Asymmetric responses of soil heterotrophic respiration to rising and decreasing temperatures. Soil Biology and Biochemistry. 106, 18-27 (2017).
  37. Li, J., et al. Biogeographic variation in temperature sensitivity of decomposition in forest soils. Global Change Biology. 26 (3), 1873-1885 (2020).
  38. Li, J., et al. Rising temperature may trigger deep soil carbon loss across forest ecosystems. Advanced Science. 7 (19), 2001242 (2020).
  39. Liang, J., et al. Methods for estimating temperature sensitivity of soil organic matter based on incubation data: A comparative evaluation. Soil Biology and Biochemistry. 80, 127-135 (2015).
  40. Lin, J., Zhu, B., Cheng, W. Decadally cycling soil carbon is more sensitive to warming than faster-cycling soil carbon. Global Change Biology. 21 (12), 4602-4612 (2015).
  41. Liu, H., et al. Differential response of soil respiration to nitrogen and phosphorus addition in a highly phosphorus-limited subtropical forest, China. Forest Ecology and Management. 448, 499-508 (2019).
  42. Liu, H. S., et al. Respiratory substrate availability plays a crucial role in the response of soil respiration to environmental factors. Applied Soil Ecology. 32 (3), 284-292 (2006).
  43. Liu, Y., et al. A new incubation and measurement approach to estimate the temperature response of soil organic matter decomposition. Soil Biology and Biochemistry. 138, 107596 (2019).
  44. Meyer, N., Welp, G., Amelung, W. The temperature sensitivity (Q10) of soil respiration: Controlling factors and spatial prediction at regional scale based on environmental soil classes. Global Biogeochemical Cycles. 32 (2), 306-323 (2018).
  45. Mikan, C. J., Schimel, J. P., Doyle, A. P. Temperature controls of microbial respiration in arctic tundra soils above and below freezing. Soil Biology and Biochemistry. 34 (11), 1785-1795 (2002).
  46. Podrebarac, F. A., Laganière, J., Billings, S. A., Edwards, K. A., Ziegler, S. E. Soils isolated during incubation underestimate temperature sensitivity of respiration and its response to climate history. Soil Biology and Biochemistry. 93, 60-68 (2016).
  47. Quan, Q., et al. type affects the coupled relationships of soil C and N mineralization in the temperate forests of northern China. Scientific Reports. 4 (1), 6584 (2014).
  48. Robinson, J., et al. Rapid laboratory measurement of the temperature dependence of soil respiration and application to changes in three diverse soils through the year. Biogeochemistry. 133 (1), 101-112 (2017).
  49. Sierra, C. A., Trumbore, S. E., Davidson, E. A., Vicca, S., Janssens, I. Sensitivity of decomposition rates of soil organic matter with respect to simultaneous changes in temperature and moisture. Journal of Advances in Modeling Earth Systems. 7 (1), 335-356 (2015).
  50. Sihi, D., Inglett, P. W., Gerber, S., Inglett, K. S. Rate of warming affects temperature sensitivity of anaerobic peat decomposition and greenhouse gas production. Global Change Biology. 24 (1), 259-274 (2018).
  51. Sihi, D., Inglett, P. W., Inglett, K. S. Warming rate drives microbial nutrient demand and enzyme expression during peat decomposition. Geoderma. 336, 12-21 (2019).
  52. Subke, J. -. A., Bahn, M. On the ‘temperature sensitivity’of soil respiration: can we use the immeasurable to predict the unknown. Soil Biology and Biochemistry. 42 (9), 1653-1656 (2010).
  53. Tucker, C. L., Bell, J., Pendall, E., Ogle, K. Does declining carbon-use efficiency explain thermal acclimation of soil respiration with warming. Global Change Biology. 19 (1), 252-263 (2013).
  54. Wang, J., et al. Temperature sensitivity of soil carbon decomposition due to shifts in soil extracellular enzymes after afforestation. Geoderma. 374, 114426 (2020).
  55. Wang, Q., et al. Important interaction of chemicals, microbial biomass and dissolved substrates in the diel hysteresis loop of soil heterotrophic respiration. Plant and Soil. 428 (1), 279-290 (2018).
  56. Wang, Q., et al. Differences in SOM decomposition and temperature sensitivity among soil aggregate size classes in a temperate grasslands. PLoS One. 10 (2), 0117033 (2015).
  57. Weedon, J. T., et al. Temperature sensitivity of peatland C and N cycling: does substrate supply play a role. Soil Biology and Biochemistry. 61, 109-120 (2013).
  58. Wei, L., et al. Labile carbon matters more than temperature for enzyme activity in paddy soil. Soil Biology and Biochemistry. 135, 134-143 (2019).
  59. Wetterstedt, J. M., Persson, T., Ågren, G. I. Temperature sensitivity and substrate quality in soil organic matter decomposition: results of an incubation study with three substrates. Global Change Biology. 16 (6), 1806-1819 (2010).
  60. Winkler, J. P., Cherry, R. S., Schlesinger, W. H. The Q10 relationship of microbial respiration in a temperate forest soil. Soil Biology and Biochemistry. 28 (8), 1067-1072 (1996).
  61. Yan, D., et al. The temperature sensitivity of soil organic carbon decomposition is greater in subsoil than in topsoil during laboratory incubation. Scientific Reports. 7, 5181 (2017).
  62. Yang, K., et al. Temperature response of soil carbon decomposition depends strongly on forest management practice and soil layer on the eastern Tibetan Plateau. Scientific Reports. 7, 4777 (2017).
  63. Li, J. W. Sampling soils in a heterogeneous research plot. Journal of Visualized Experiments. (143), e58519 (2019).

Play Video

Citazione di questo articolo
Li, J., Areeveso, P., Wang, X., Jian, S., Gamage, L. Simulating Temperature in a Soil Incubation Experiment. J. Vis. Exp. (188), e64081, doi:10.3791/64081 (2022).

View Video