In deze studie bieden we een gedetailleerde techniek voor een eenvoudig maar robuust corticale organoïde kweeksysteem met behulp van standaard feedervrije hPSC-culturen. Dit is een snel, efficiënt en reproduceerbaar protocol voor het genereren van organoïden die aspecten van hersensenescentie in vitro modelleren.
Hersenorganoïden zijn driedimensionale modellen van het zich ontwikkelende menselijke brein en bieden een aantrekkelijk, geavanceerd platform voor ziektemodellering en grootschalige genomische en medicijnscreening. Vanwege de zelforganiserende aard van cellen in hersenorganoïden en het groeiende aantal beschikbare protocollen voor hun generatie, zijn problemen met heterogeniteit en variabiliteit tussen organoïden geïdentificeerd. In dit protocolartikel beschrijven we een robuust en repliceerbaar protocol dat deze problemen grotendeels overwint en binnen 1 maand corticale organoïden genereert uit neuro-ectodermale voorlopercellen, en dat langer dan 1 jaar kan worden gehandhaafd. Dit zeer reproduceerbare protocol kan gemakkelijk worden uitgevoerd in een standaard weefselkweekkamer en resulteert in organoïden met een rijke diversiteit aan celtypen die typisch worden aangetroffen in de zich ontwikkelende menselijke cortex. Ondanks hun vroege ontwikkelingssamenstelling, zullen neuronen en andere menselijke hersenceltypen de typische tekenen van senescentie in neuronale cellen beginnen te vertonen na langdurige in vitro cultuur, waardoor ze een waardevol en nuttig platform zijn voor het bestuderen van verouderingsgerelateerde neuronale processen. Dit protocol schetst ook een methode voor het detecteren van dergelijke senescente cellen in corticale hersenorganoïden met behulp van senescentie-geassocieerde bèta-galactosidase-kleuring.
Onze huidige kennis van het menselijk brein is grotendeels gebaseerd op diermodellen en post-mortem hersenspecimens. Stamcelbiologie is een snel voortschrijdend veld dat nieuwe inzichten biedt in de basisbiologie van de ontwikkeling van het menselijk brein en de pathologische oorzaken van menselijke hersenaandoeningen. Menselijke pluripotente stamcellen (hPSC’s) zijn een waardevol hulpmiddel voor het modelleren van het menselijk brein via de generatie van organoïden, orgaanachtig driedimensionaal (3D) weefsel dat meestal de ontwikkelingstrajecten, cellulaire samenstelling en architectuur van het zich ontwikkelende menselijke brein samenvat. Hersenorganoïden zijn zelfgeassembleerd en samengesteld uit neurale stamcellen, gespecificeerde neurale voorlopers, volwassen neuronen en gliaceltypen. Organoïden bieden daarom een unieke kans om het vroege menselijke brein te bestuderen, dat vaak ontoegankelijk is voor directe experimenten, maar ook intrinsieke beperkingen heeft, zoals de afwezigheid van vasculatuur en een immuunsysteem.
Methodologieën om hersenorganoïden te genereren zijn op twee verschillende manieren nagestreefd: ongeleide en geleide differentiatie. Ongeleide hersenorganoïde methoden vertrouwen op de spontane intrinsieke differentiatiecapaciteiten van de stamcellen die weefselmorfogenese 1,2 aandrijven en zorgen voor de opkomst van een verscheidenheid aan cellijnidentiteiten, variërend van voorhersenen, middenhersenen en achterhersenen, tot choroïde plexus, netvlies en mesoderm. Daarentegen vereisen geleide hersenorganoïde methoden substantieel gebruik van externe factoren om hPSC’s te sturen naar de gewenste patroonvorming van neuronale afstammingslijnen die één hersengebiedtype vertegenwoordigen, zoals mediale ganglionaire eminentie3, voorhersenen4, middenhersenen5, hypothalamus6, cerebellum7 en choroïde plexus8. Dit vermogen om verschillende hersengebieden met verschillende cellijningen te genereren, en het potentieel om deze naar believen te fuseren, maakt hersenorganoïden een uitstekend model voor het onderzoeken van de ontwikkeling van de menselijke hersenen en het ontcijferen van de onderliggende mechanismen van hersengerelateerde ziekten. Hoewel deze methoden voor het genereren van hersenorganoïden een doorbraak bieden in het modelleren van menselijke hersengebieden, blijven de variabiliteit en heterogeniteit tussen organoïden een significante beperking voor systematische en kwantitatieve studies, zoals geneesmiddelenscreening.
Het huidige protocol is gebaseerd op een methode die is ontwikkeld in ons recente artikel9 en omvat de selectieve differentiatie van hPSC-kolonies naar neuro-ectoderm (NEct) identiteit met dubbele SMAD-remmers (SB-431542 en LDN 193189), die vervolgens het vermogen hebben om zichzelf binnen 4 dagen te organiseren in 3D neuro-epitheelsferoïden onder invloed van FGF2-signalering. Deze neuro-epitheelsferoïden genereren op betrouwbare wijze homogene corticale organoïden met een in vivo-achtige cellulaire samenstelling binnen 4 weken na differentiatie. Het hier beschreven protocol is gebaseerd op onze eerdere bevindingen waaruit blijkt dat remming van dubbele SMAD (Suppressor of Mothers Against Decapentaplegic) signalering de differentiatie van hPSC’s bevordert in de richting van rostrale neurale stamcellen afgeleid van neuro-ctodermale voorlopers10 door, onder andere, endodermale, mesodermale en trophectodermcel lotkeuze11 te remmen . Bovendien veroorzaakt de inbedding van de neuro-epitheliumsferoïden in de hESC-gekwalificeerde keldermembraanmatrix een aanzienlijke ontluiking van de neuro-epithelia, waardoor ventrikels met apicobasale polariteit worden gevormd. Grootschalige cultuur toonde reproduceerbaarheid en homogeniteit van corticale organoïden onafhankelijk van cellijnen, klonen of batches, en vertegenwoordigt dus een betrouwbaar en stabiel stamcelsysteem om de vroege menselijke corticale ontwikkeling in gezondheid en ziekte in vitro na te bootsen. We schetsen verder een protocol voor het detecteren van senescente neuronale celmarkers in hPSC’s-afgeleide corticale hersenorganoïden die gedurende langere tijd zijn gekweekt.
Na het platen van hPSC’s met een zaaidichtheid van 20% -30%, worden de cellen gedurende 3 dagen behandeld met dubbele SMAD-remmers om hPSC-kolonies te differentiëren in de richting van neuro-ectodermale kolonies. Deze kolonies worden vervolgens voorzichtig opgetild met dispase en gezaaid in ultra-lage bevestiging 6-well platen aangevuld met FGF2. De drijvende 2D-kolonies organiseren zichzelf ‘s nachts in 3D neuro-elektro-intestinale sferoïden en worden gedurende 4 dagen in N2-medium gehouden, dagelijks aangevuld met FGF2. Zodra de sferoïden de neuro-epitheliale laag hebben vastgesteld, kunnen ze worden ingebed in de keldermembraanmatrix. Door routinematig een nieuw terminaal differentiatiemedium toe te voegen, zullen de onderzoekers progressieve expansie en ontluiking van neuro-epithelia in corticale organoïden waarnemen. Onderzoekers kunnen deze organoïden dissociëren om transcriptionele en proteomische profilering uit te voeren. Bovendien wordt brightfield imaging aanbevolen voor het bewaken van de kwaliteit van de corticale organoïden. Analyse kan worden uitgevoerd door fixatie, cryosectie en immunostaining. Beschrijvingen en methoden voor deze technieken zijn eerder beschreven12. Uiteindelijk stelt dit protocol onderzoekers in staat om snel en robuust homogene corticale hersenorganoïden te genereren voor het modelleren van het zich ontwikkelende menselijke corticale brein, met lage kosten en beperkte apparatuur, en voor het bestuderen van aspecten van cellulaire neuronale senescentie, zoals uiteengezet in dit artikel.
Om het gebruik van hPSC-afgeleide hersenorganoïden bij medicijnscreening en ziektemodellering mogelijk te maken, is het cruciaal om organoïden te maken volgens een repliceerbaar en betrouwbaar protocol15. Hersenorganoïden worden vaak gegenereerd uit embryoïde lichamen afgeleid van hPSC’s, die vervolgens worden ingebed in een extracellulaire matrix die weefselexpansie en neurale differentiatie bevordert. In vergelijking met protocollen zoals Lancaster’s1,16,17 en Velasco18, die beginnen bij embryoïde lichamen en het mogelijk maken dat een standaard differentiatieroute wordt gevolgd door de zich ontwikkelende organoïden, hebben we ontdekt dat het beginnen met corticale hersenorganoïde creatie met menselijke NEct-cellen in plaats van met embryoïde lichamen de consistentie van corticale hersenorganoïde vorming verbetert. Dit maakt dus ook de schaalvergroting mogelijk die nodig is voor geneesmiddelen- en fenotypische screening. Omdat menselijke NEct-cellen niet alleen in aanzienlijke hoeveelheden kunnen worden uitgebreid, maar ook gemakkelijk kunnen worden gecryopreserveerd, verbetert deze aanpak ook de repliceerbaarheid tussen experimenten. Er moet ook worden opgemerkt dat, in vergelijking met andere protocollen die het gebruik van bioreactoren en soortgelijke technologieën hebben aangenomen, er geen gespecialiseerde apparatuur nodig is voor dit protocol, waardoor het geschikt is voor elk laboratorium6. Ten slotte wordt de tijd die nodig is om volwassen organoïden te genereren die positief zijn voor corticale laagmarkers zoals SATB2 verminderd in vergelijking met zowel Lancaster1 als bioreactorprotocollen 6,19, waardoor het meer geschikt is voor het bestuderen van het ontwikkelingstraject van menselijke corticale ontwikkeling in gezondheid en ziekten 1,6,16.
Bovendien, gezien de voortdurend groeiende wereldwijde gezondheidszorgimpact van verouderingsgerelateerde ziekten zoals dementie, die geassocieerd zijn met een toename van senescente celtypen in de hersenen die bijdragen aan pathogenese, is het vermogen om verbindingen te identificeren en te testen die hersenveroudering kunnen verbeteren van enorm belang. Ondanks dat bekend is dat hPSC’s epigenetisch verjongd zijn tijdens het herprogrammeringsproces20, vinden we robuuste toenames van senescente cellen in corticale hersenorganoïden die gedurende langere tijd worden gekweekt. Dit is een veelbelovende ontwikkeling die nu de screening mogelijk maakt van geneesmiddelen die dergelijke senescente cellen uit de hersenen elimineren (senolytica) of die dit proces vertragen (senostatica)21. Aangezien menselijke NEct-afgeleide corticale hersenorganoïden van menselijke oorsprong zijn, zal deze benadering waarschijnlijk het traditionele pad verkorten om dergelijke nieuwe therapieën op de markt te brengen.
Er zijn twee kritieke stappen in dit protocol. De eerste is het juiste niveau van samenvloeiing van de hPSC-kolonies op het moment van differentiatie. hPSC-kolonies moeten maximaal 30% samenvloeiend zijn om ervoor te zorgen dat gegenereerde NEct-kolonies niet fuseren met naburige kolonies en dat individuele organoïden clonaal worden aangedreven. De tweede kritieke stap omvat het juiste gebruik van dispase om de NEct-kolonies op te tillen en de neurale sferoïden te produceren. De timing van incubatie met dispase is van cruciaal belang voor de uiteindelijke kwaliteit van de gegenereerde neurale sferoïden. Dit komt omdat overmatige blootstelling van kolonies met dispase giftig is voor de cellen22 en uiteindelijk de kwaliteit van gegenereerde organoïden beïnvloedt. De beperking van dit protocol is dat het moeilijk is om de grootte van de neurale sferoïden te controleren, omdat het afhankelijk is van de grootte van de initiële kolonies die met dispase worden opgeheven. Dit probleem kan echter worden opgelost door neurale sferoïden te selecteren die van vergelijkbare grootte zijn wanneer u doorgaat naar de insluitfase.
Ten slotte kunnen toekomstige toepassingen zich uitstrekken tot het gebruik van deze reproduceerbare corticale organoïden in robotanalyse en biofarmaceutische screeningbenaderingen die doorgaans in die industrie worden gebruikt. Dit wordt ondersteund door voorlopige gegevens van ons laboratorium die aangeven dat de generatie van corticale hersenorganoïden uit menselijke NEct-cellen gemakkelijk kan worden geautomatiseerd, waardoor het compatibel is met deze benaderingen.
The authors have nothing to disclose.
Dit werk wordt ondersteund door het Medical Research Future Fund-Accelerated Research, Leukodystrophy vlaggenschip Massimo’s Mission (EPCD000034), Medical Research Future Fund-Stem Cell Mission (APP2007653). Auteurs willen Dr. Ju-Hyun Lee (Korea University) bedanken voor het genereren van gegevens in Aanvullende Video 1.
16% Formaldehyde (W/V) Methanol-free | Thermo Fisher Scientific | 28908 | 4% of PFA are diluted in 1x PBS |
2-Mercaptoethanol 50 mL(1000x) | Life Technologies Australia (TFS) | 21985023 | Used in NM and DM media |
B 27 Supplement 10 mL | Life Technologies Australia (TFS) | 17504044 | Used in NM and DM media |
CKX53 microscope with SC50 camera | Olympus | ||
Corning Costar 6 well cell culture plates | Sigma Aldrich Pty Ltd | CLS3516-50EA | |
Dispase II powder | Thermo Fisher Scientific | 17105041 | Powder is dissolve in HBSS, filtered through 0.22 µm filter, aliquote at 10 mL and store at -20 °C |
DMEM Nutrient Mix F12 10x 500 mL (DMEM/F-12) | Thermofisher | 11320082 | Used in NM and DM media |
DMSO Dimethyl Sulfoxide | Sigma Aldrich Pty Ltd | D2650-100ML | |
Dulbecco's Phosphate Buffered Saline | Sigma Aldrich Pty Ltd | D1408-500ML | |
Falcon Matrigel hESC-qualified Matrix | In Vitro Technologies Pty Ltd | FAL354277 | Make aliquotes of 100 µL and stored at -20 °C |
GlutaMAX Supplement 100x | Thermo Fisher Scientific | 35050061 | Used in NM and DM media |
Hanks Balanced Salt Solution | Sigma Aldrich Pty Ltd | H8264 | |
Human induced pluripotent stem cells (EU79) | In-house reporogrammed from skin fibroblast | ||
Human induced pluripotent stem cells (G22) | Genea Biocells | Obtained from Genea Biocells (San Diego, United States) | |
Human induced pluripotent stem cells (WTC) | Gift from Professor Bruce Conklin | ||
InSolution TGF-Β RI Kinase Inhibitor VI, SB431542 | Merck | US1616464-5MG | |
Insulin Solution Human Recombinant | Sigma Aldrich Pty Ltd | I9278 | Used in NM and DM media |
LDN193189 Dihydrochloride | Sigma Aldrich Pty Ltd | SML0559-5MG | Used during differentiation |
MEM Non-Essential Amino Acids Solution (100x) | Thermo Fisher Scientific | 11140050 | Used in NM and DM media |
mTeSR Plus | STEMCELL TECHNOLOGIES | 100-0276 | Used to maintain hiPSC colonies prior to differentiation with NM media |
N2 Supplement 5 mL (100x) | Life Technologies Australia Pty Ltd | 17502048 | Used in NM and DM media |
Neurobasal Medium | Thermo Fisher Scientific | 21103049 | Used in DM media |
OCT Embedding Compound Sakura Clear (118 mL/Bottle) | Tissue Tek | 4583 | |
Parafilm M Roll Size 4 in. x 125 Ft | Sigma Aldrich Pty Ltd | P7793 | |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | Used in NM and DM media |
Potassium Hexacyanoferrate (II) Trihydrate | Sigma Aldrich Pty Ltd | CP1087 | |
Potassium hexacyanoferrate(III) | Sigma Aldrich Pty Ltd | 455946 | |
Prolong Glass Antifade Mountant | Life Technologies Australia (TFS) | P36980 | |
Recombinant Human FGF basic | R&D Systems | 233-FB-01M | Aliquotes are made at 20 µg/mL and stored at -20 °C |
SB431542 | Tocris | 1614 | Used during differentiation |
Sucrose | Sigma Aldrich Pty Ltd | PHR1001-1G | 30% of sucrose are diluted in 1x PBS |
Ultra-Low attachment multiwell plates , 24 well plate, polystyrene | Sigma Aldrich Pty Ltd | CLS3473-24EA | |
X-GAL EA | Life Technologies Australia (TFS) | R0404 | Make aliquotes of 20 mg/mL and storde at -80 °C |