Apresentamos um protocolo para o isolamento e fratura de congelamento de vesículas extracelulares (EVs) originárias de células cancerígenas uroteliais. A técnica de fratura congelante revelou o diâmetro e a forma dos EVs e como uma característica única- a organização interna das membranas EV. Estes são de imensa importância na compreensão de como os EVs interagem com as membranas receptoras.
Vesículas extracelulares (EVs) são estruturas limitadas à membrana liberadas das células para o espaço extracelular e estão implicadas na comunicação intercelular. Os EVs consistem em três populações de vesículas, ou seja, microvesículos (MVs), exosóis e corpos apoptóticos. A membrana limitante dos EVs está crucialmente envolvida nas interações com as células receptoras, o que poderia levar à transferência de moléculas biologicamente ativas para as células receptoras e, consequentemente, afetar seu comportamento. A técnica de microscopia eletrônica de fratura congelante é usada para estudar a organização interna de membranas biológicas. Aqui, apresentamos um protocolo para o isolamento mv de células cancerígenas cultivadas e a fratura congelante de MVs nas etapas de congelamento rápido, fratura, fabricação e limpeza das réplicas, e analisá-las com microscopia eletrônica de transmissão. Os resultados mostram que o protocolo de isolamento produz uma população homogênea de EVs, que correspondem à forma e tamanho dos MVs. Partículas intramembranas são encontradas principalmente na face protoplasmática da membrana limitante. Assim, a fratura congelante é a técnica escolhida para caracterizar o diâmetro, a forma e a distribuição das proteínas da membrana. O protocolo apresentado é aplicável a outras populações de EVs.
Vesículas extracelulares (EVs) são vesículas limitadas por membrana liberadas das células para o espaço extracelular. As três principais populações de EVs são exosóis, microvesículos (MVs) e corpos apoptóticos, que diferem em sua origem, tamanho e composição molecular 1,2,3. A composição dos EVs reflete o perfil molecular da célula doadora e seu estado fisiológico (ou seja, saudável ou doente)4,5. Isso dá aos EVs imenso potencial no diagnóstico, prognóstico e terapia de doenças humanas, e eles têm aplicações médicas promissoras para o uso em medicina personalizada 6,7,8.
EVs são mediadores de comunicação intercelular. Eles contêm proteínas biologicamente ativas, lipídios e RNAs, que interferem nos processos biológicos na célula receptora e podem mudar seu comportamento 9,10. No entanto, a composição da membrana limitante de EV é crucial para a interação com a membrana celular receptora.
As fontes de EVs são fluidos corporais e mídia cultural condicionada. Para isolar uma população de EV, deve-se utilizar uma técnica de isolamento adequada. Por exemplo, a centrifugação a 10.000 × g produz uma fração enriquecida em MVs, enquanto as forças centrífugas de ≥ 100.000 × g produzem uma fração enriquecida em exosóis11,12. A fração isolada de EVs deve ser validada em termos de pureza, tamanho e forma. Para isso, a Sociedade Internacional de Vesículas Extracelulares 2018 recomendou três classes de técnicas de imagem de alta resolução: microscopia eletrônica, microscopia de força atômica e microscopia de super-resolução à base de microscopialeve 13. Nenhuma dessas técnicas pode fornecer informações sobre o interior da membrana EV.
Microscopia eletrônica de fratura congelada é uma técnica de quebrar espécimes congelados para revelar suas estruturas internas, particularmente dando uma visão do interior da membrana. As etapas de preparação da amostra são (1) congelamento rápido, (2) fratura, (3) fazer a réplica e (4) limpar a réplica14. Na etapa 1, a amostra é (opcionalmente) quimicamente fixa, crioprotegida com glicerol e congelada em freon líquido. Na etapa 2, a amostra congelada é fraturada em uma unidade de fratura congelante, que expõe o interior da bicamadas de membrana. Na etapa 3, os rostos fraturados expostos são sombreados com platina (Pt) e carbono (C) para produzir réplicas. Na etapa 4, o material orgânico é removido. A réplica é analisada no microscópio eletrônico de transmissão (TEM). Para uma interpretação precisa dos micrografos, deve-se seguir as diretrizes para sua orientação adequada14,15. Resumidamente, a direção das sombras no micrografo é uma referência para orientar o micrografo (ou seja, determinar a direção da sombra do Pt) e, consequentemente, determinar formas convexas e côncavas (Figura 1). Duas visões interiores chamadas de rostos fraturados da bicamada de membrana podem ser vistas como resultado da divisão da membrana por fraturacongelante: a face protoplasmática (P-face) e a face exoplasmática (Face E). A face P representa o folheto de membrana adjacente ao protoplasma celular, enquanto o E-face representa o folheto de membrana adjacente ao espaço extracelular. Proteínas de membrana integral e suas associações são vistas como partículas intramembranassalientes 14,15.
Aqui, o objetivo é aplicar a técnica de fratura congelante para caracterizar MVs em termos de tamanho, forma e estrutura de sua membrana limitante. Aqui, apresentamos um protocolo para o isolamento e fratura de MVs originários de células cancerígenas de bexiga invasivas humanas.
A caracterização de MVs, ou qualquer outra população de EVs isolados, é de grande importância para começar antes de iniciar análises a jusante como estudos de “omics” ou estudos funcionais11,18. Nesse meio, os EVs das células T24 de câncer de bexiga invasivas humanas foram isolados por centrifugação, e seguindo o protocolo fornecido para análise por microscopia eletrônica de fratura congelante, demonstramos que a fração isolada foi enriquecida em MVs11,13. O isolado de MVs foi desprovido de detritos celulares ou organelas, confirmando um protocolo de isolamento e purificação bem sucedido.
A combinação de fixação química e congelamento, que são passos críticos do protocolo, manteve a forma esférica dos EVs12. No entanto, são necessárias precauções ao avaliar o diâmetro do EV por fraturamento congelado17. Uma vez que a fratura passa pela amostra aleatoriamente, as membranas MV são divididas em seus planos equatoriais e não-equatoriais. Para fornecer um método rigoroso para analisar as imagens de espécimes congelados e sombreados, Hallett et al. mostraram que o diâmetro médio da vesícula é de 4/π vezes o tamanho real do diâmetro vesicular na imagem17. Contabilizando isso, os EVs das células T24 foram calculados com um diâmetro de 304 nm, o que se encaixa na faixa de distribuição de tamanho teórico do MV de 100-1000 nm19.
A fratura por congelamento pode complementar a coloração negativa, a técnica TEM mais utilizada para visualizar EVs. Por coloração negativa, a amostra é comumente quimicamente fixa, seca e anexada a uma grade TEM, e contrasta com a solução de urânio. Sem suportar a mídia, os EVs tendem a entrar em colapso, o que lhes dá uma aparência em forma de copo. Por meio da fratura congelante, mostramos que os MVs são esferas, o que reflete sua forma em espaços extracelulares e fluidos corporais12. Com isso, nossos resultados também estão de acordo com observações de EVs nas seções crio-ultrathin20.
Uma vantagem crucial da técnica de fratura congelante é seu poder para resolver a organização interna da membrana limitante, que é um fator-chave para entender como os EVs são direcionados e interagir com as membranas receptoras. Aqui, analisamos as membranas dos MVs, mas a fratura congelante poderia revelar a organização da membrana de qualquer outra população de EVs. Os MVs são formados por membrana de plasma brotando; portanto, espera-se que proteínas de membrana plasmática e aglomerados de proteínas sejam encontrados na membrana MV. Nossos resultados apoiaram que os MVs das células T24 continham partículas intramembranas, apresentando proteínas de membrana integral. Com base na distribuição de partículas entre o E-face e o P-face, é razoável esperar que as partículas observadas em MVs sejam proteínas transmembranas uroplakins, que são células uroteliais específicas21,24. As partículas observadas foram esparsas, o que está de acordo com estudos anteriores relatando uma redução de uroplacinas durante a carcinogênese urotelial 21,22,23. No entanto, para investigar melhor a composição proteica das membranas MV, recomenda-se o uso da técnica de rotulagem imunológica (FRIL) da réplica de fratura congelante (FRIL). O FRIL é um upgrade da técnica de fratura congelante apresentada e dedica-se a revelar a identidade das proteínas em réplicas por reconhecimento de anticorpos24,25. Resumindo, a técnica de fratura congelante é uma técnica de microscopia eletrônica adequada para a caracterização da membrana limitante de EV, bem como a forma, tamanho e pureza das frações isoladas de EV. O protocolo apresentado pode ser utilizado também para avaliação de outras populações de EVs isolados; portanto, a técnica de congelamento-fraturando merece a inclusão nas diretrizes da Sociedade Internacional para Vesículas Extracelulares para estudos que exploram a organização das membranas limitantes de EV.
The authors have nothing to disclose.
Esta pesquisa foi financiada pela Agência de Pesquisa eslovena (pesquisa core funding no. P3-0108 e projeto J7-2594) e o programa de infraestrutura MRIC UL IP-0510. Este trabalho contribui para a COST Action CA17116 International Network for Transling Research on Perinatal Derivatives into Therapeutic Approaches (SPRINT), apoiada pela COST (European Cooperation in Science and Technology). Os autores gostariam de agradecer a Linda Štrus, Sanja Čabraja, Nada Pavlica Dubarič e Sabina Železnik por ajuda técnica com a cultura celular e preparação das amostras e Marko Vogrinc, Ota Širca Roš e Nejc Debevec por ajuda técnica na preparação do vídeo.
A-DMEM | ThermoFisher Scientific, USA | 12491015 | |
Balzers freeze-fracture device | Balzers AG, Liechtenstein | Balzers BAF 200 | |
Centrifuge | Eppendorf, Germany | model 5810R | |
CO2 incubator HeraCell | Heraues, Germany | ||
Copper carriers | Balzers | BB 113 142-2 | 100+ mesh |
Copper grids | SPI, United States | 2010C | |
Culture flask T75 | TPP, Switzerland | growing surface 75 cm2 | |
F12 (HAM) | Sigma-Aldrich, Germany | 21765029 | |
FBS | Gibco, Life Technologies, USA | 10500064 | |
Glazed Porcelain Plate 6 Well | Fischer Sientific, United States | 50-949-072 | |
Glycerol | Kemika, Croatia | 711901 | final concentration 30 % (v/v) |
Glutaradehyde | Serva, Germany | 23114.01 | final concentration 2.5 % (v/v) |
GlutaMAX | Gibco, Life Technologies | 35050-079 | final concentration 4 mM |
Penicillin | Gibco, Life Technologies | 15140163 | final concentration 100 U/ml |
Phase-contast inverted microscope | Nikon, Japan | model Eclipse | |
Rotor | Eppendorf, Germany | A 4-44 | |
Rotor | Eppendorf, Germany | F-34-6-38 | |
Serological pipetts | TPP, Switzerland | 50mL volume | |
Sodium hypochloride solution in water | Carlo Erba, Italy | 481181 | |
Stereomicroscope | Leica, Germany | ||
Streptomycin | Gibco, Life Technologies | 35050038 | final concentration 100 mg/mL |
Transmission electron microscope | Philips, The Netherlands | model CM100 | working at 80 kV |
Tweezers | SPI, United States |