פרוטוקול המתאר את היווצרותם של בלסטואידים אנושיים היוצרים ביעילות, בזמן וברצף תאים דמויי בלסטוציסט.
מודל של הבלסטוציסט האנושי שנוצר מתאי גזע (בלסטואיד) יתמוך בהתקדמות מדעית ורפואית. עם זאת, כוח החיזוי שלו יהיה תלוי ביכולתו לשחזר ביעילות, בזמן ובנאמנות את רצפי התפתחות הבלסטוציסטים (מורפוגנזה, מפרט, דפוס), וליצור תאים המשקפים את שלב הבלסטוציסט. כאן אנו מראים שתאי גזע פלוריפוטנטיים אנושיים תמימים בתרבית בתנאי PXGL ולאחר מכן מעוכבים באופן משולש עבור ההיפו, משנים את גורם הגדילה β, ומסלולי קינאז חוץ-תאיים המווסתים על ידי אותות עוברים ביעילות מורפוגנזה ליצירת בלסטואידים (>70%). בהתאם לתזמון ההתפתחותי (כ-4 ימים), הבלסטואידים פותחים את רצף המפרט הבלסטוציסטי על ידי יצירת אנלוגים של הטרופולסט והאפיבלסט, ולאחר מכן היווצרות אנלוגים של האנדודרם הפרימיטיבי והטרופולסטים הקוטביים. התוצאה היא היווצרות של תאים הדומים לשעתוק לבלסטוציסט (>96%) ומיעוט של אנלוגים לאחר ההשתלה. בלסטואידים מעוצבים ביעילות על ידי יצירת הציר העוברי-אבמבריוני המסומן על ידי הבשלת אזור הקוטב (NR2F2+), אשר רוכש את הפוטנציאל הספציפי להיצמד בכיוון לתאי רירית הרחם מגורה הורמונלית, כמו ברחם. בלסטואיד אנושי כזה הוא מודל מדרגי, רב-תכליתי ואתי לחקר ההתפתחות וההשתלה האנושית במבחנה.
מחסור במודלים ניסיוניים הגביל את ההבנה של עובריות אנושיות מוקדמות. הידע הנוכחי על היבטים ספציפיים לבני אדם בהתפתחות העוברית נגזר מעודפי עוברים להפריה חוץ גופית (IVF) שנתרמו למחקר. עם זאת, הזמינות המוגבלת, הקשיים של מניפולציות ניסיוניות ואיכות משתנה של העוברים מעכבים את החקירות המדעיות. להיפך, מודל נאמן במבחנה של עוברים אנושיים יאפשר מניפולציות ניסיוניות מורכבות, ובכך יספק הזדמנות אתית להשלים את המחקר על עוברים אנושיים 1,2,3,4. מודל שפותח בעבר של בלסטוציסטים של עכברים משלב תאי גזע עובריים של עכברים ותאי גזע טרופובלסטים5. בפרוטוקול מפורט זה, שיטה ליצירת מודל של הבלסטוציסט האנושי מתאי גזע פלוריפוטנטיים נאיביים הנאמנים לקריטריונים של בלסטוציסט יסודי מתוארת6.
ארבעה קריטריונים לבלסטואידים אנושיים. כאן, בניסיון לקבוע הגדרה סטנדרטית של בלסטואידים אנושיים, אנו מציעים ארבעה קריטריונים מינימליים. אף על פי שאינם ממצים, קריטריונים אלה עשויים לשמש בסיס להערכת הפרמטרים המאפשרים היווצרות של בלסטואידים אנושיים (איור 1A). (1) בלסטואידים צריכים להיווצר ביעילות במונחים של מורפולוגיה ושל יצירת האנלוגיות של שלוש השושלות כלומר, אפיבלסט (Epi), trophectoderm (TE) ואנדודרם פרימיטיבי (PrE). חוסר יעילות עשוי להצביע על מצב תא התחלתי לקוי או על מצב תרבית (למשל, מדיום בלסטואידי). (2) בלסטואידים צריכים ליצור אנלוגים של שלוש השושלות בהתאם לרצף ההתפתחותי (Epi/TE first, PrE/polarTE אחרון)7,8 והתזמון (אינדוקציה ~ 3 ימים; ימים עובריים 5-7)7,9. (3) בלסטואידים צריכים ליצור אנלוגים של שלב הבלסטוציסט, אך לא של שלבים לאחר ההשתלה (למשל, אפיבלסט לאחר ההשתלה, טרופובלסט או תאי אמניון). (4) לבסוף, בלסטואידים צריכים להיות מסוגלים לשחזר תכונות פונקציונליות של השתלה והתפתחות בלסטוציסט. באמצעות פרוטוקול זה, בלסטואידים אנושיים נוצרים ביעילות באמצעות קווי תאים מרובים (>70%), מסוגלים ליצור את האנלוגיות התאיות הבלסטוציסטיות ברצף ובתוך 4 ימים, והאנלוגיות דומות מבחינה שעתוק לשלב הבלסטוציסט (>96% בהתבסס על מספר ניתוחים)6,10,11. לבסוף, בלסטואידים מייצרים בחוזקה את הציר העוברי-אבמבריוני, המאפשר להם לקיים אינטראקציה עם תאי רירית הרחם מגורה הורמונלית דרך אזור הקוטב, ולהרחיב בחוזקה את השושלות על תרבית מורחבת (שווה זמן: יום עוברי 13).
החשיבות של מצב התא ההתחלתי. תאי גזע פלוריפוטנטיים אנושיים (hPSCs) ניתנים לייצוב במצבים שונים המנסים ללכוד שלבי התפתחות מדויקים. מצבים אלה סובלים על ידי תנאי תרבית אשר, למרות שהם עדיין לא אופטימליים, מגבילים את התאים בשלב טרום ההשתלה ( ~ ימים עובריים 5-7) או לאחר ההשתלה (~ ימים עובריים 8-14) אפיבלסט שלב12. ניתוח תעתיק הראה כי hPSCs בתרבית PD0325901, XAV939, Gö6983, וגורם מעכב לוקמיה (LIF; המכונה PXGL hPSCs נאיביים)13,14 דומים יותר לאפיבלסט הבלסטוציסט בהשוואה ל- hPSCs בתרבית בגורם גדילה פיברובלסט (FGF) 2 ו- activin15 (המכונה hPSCsראשוניים 12) ולתאי גזע פלוריפוטנטיים מורחבים אנושיים (hEPSCs)16 (ראה ניתוח בהפניות17, 18,19). בהתאם לכך, התמלול של hPSCs ראשוניים מתאים בצורה הטובה ביותר עם אפיבלסט קוף צינומולגוס לאחר השתלה/טרום-גסטרולציה20. קריטריונים מולקולריים נוספים, כמו ביטוי טרנספוזון, מתילציה של דנ”א ומצב כרומוזום X, אישרו כי וריאציות של המצב הנאיבי דומות יותר לאפילסט הבלסטוציסט בהשוואה למצב הראשוני17,21. לבסוף, שורות של hPSCs תמימים נגזרו בהצלחה ישירות מבלסטוציסטים באמצעות תנאי תרבית PXGL22.
תאי בלסטוציסט מוקדמים אנושיים עדיין אינם מבוצעים. מפרט שושלת מורין מתרחש משלב המורולה המקדים את שלב הבלסטוציסט23. להיפך, ניסויי דיסוציאציה וצבירה מחדש הראו כי תאי הטרופיקטודרם האנושיים של בלסטוציסטים מוקדמים עדיין אינם מבוצעים24. בהתאם לכך, ניתוח התאים של בלסטוציסטים אנושיים על ידי ריצוף RNA חד-תאי (scRNAseq) הראה כי מפרט השושלת הראשונה (trophoblast/epiblast) מתרחש לאחר היווצרות חלל הבלסטוציסט7. המפרט האנושי הנדחה הזה תואם תצפיות שלפיהן hPSCs חזקים ליצירת טרופולסטים 25,26,27 כאשר PSCs של עכברים מחויבים במידה רבה לשושלת האפיבלסטים. תצפיות משולבות אלה הובילו לאפשרות ש-hPSCs תמימים משקפים שלב בלסטוציסטי ושומרים על הפוטנציאל ליצור את שלוש השושלות הבלסטוציסטיות. לאחרונה, העוצמה של hPSCs לציין אנלוגים חוץ-אמבריוניים הוצעה לעבור מ trophectoderm לאמניון במהלך ההתקדמות ממצב נאיבי למצב ראשוני27. לפיכך, hPSCs נאיביים דומים יותר לשלב טרום ההשתלה 17,18,21 ויש להם יכולת משופרת ליצור טרופובלסטים בהשוואה ל- hPSCsראשוניים 27, hEPSCs 16, או מצבי תכנות מחדש ביניים28, אשר נוטים ליצור אנלוגים לאחרההשתלה 10 (איור 1B ). מצב התא ההתחלתי הוא אפוא חיוני ליצירת האנלוגיות החוץ-ממבריוניות המתאימות. אף על פי שעדיין נותר לבצע ניתוח יסודי זה לצד זה של אנלוגים טרופיקטודרמים שהומרו, נראה כי מצב נאיבי של PXGL המשקף את הבלסטוציסט המוקדם חשוב ליצירת בלסטואידים בעלי נאמנות גבוהה.
הנחיית אפיון ומורפוגנזה על ידי איתות עיכוב מסלולים. העיכוב של מסלול האיתות של ההיפו הוא מנגנון שמור המניע את מפרט הטרופולסטים בעכברים, פרות ובני אדם 9,29,30. כמו כן, מאז 2013, ידוע כי עיכוב של NODAL (A83-01) ואת קינאז מווסת אותות חוץ תאיים (ERK; PD0325901 או שווה ערך) והפעלת מסלולי האיתות של החלבון המורפוגנטי של העצם (BMP) מפעילה hPSCs ראשוניים כדי להפעיל את רשת השעתוק הקשורה לשושלת הטרופולסט 25,31,32,33,34. יתר על כן, לאחרונה מספר דיווחים אישרו גם כי עיכוב של מסלול NODAL ו- ERK והפעלה של BMP להקל על ההבחנה trophoblast מ hPSCsנאיביים 25,31,32,33,34. לבסוף, אם מפרט הטרופוגובלסט מופעל ממצב נאיבי, התאים משחזרים היבטים של ההתקדמות ההתפתחותית של הטרופיקטודרם26. עם זאת, קווים המתחדשים בעצמם המשקפים את הגביע הבלסטוציסטי לא יוצבו במבחנה. לאחר אפיון טרופולסט, אינדוקציה של מקדם הגדילה האפידרמלי (EGF) ומסלולי האיתות Wnt יחד עם עיכוב HDAC עשויים להקל על התקדמות התפתחותית של טרופובלסטים34,35 ולייצב תאים לקווים של תאי גזע טרופובלסטים אנושיים (hTSCs) המשקפים ציטוטרופיובלסטים לאחר ההשתלה 18,35. קווים כאלה יכולים להיגזר הן מבלסטוציסטים והן מרקמות שליה35.
השושלת החוץ-אמבריונית השנייה, המכונה PrE, מוגדרת על שם טרופולסטים ומקורה באפיבלסט 7,9. בניגוד ל-murine PrE36, המקבילה האנושית נחשבת כבלתי תלויה ב-FGF המאותת 37,38. קווים המשקפים את האנדודרם החוץ-אמבריוני (המכונה nEnd) נוצרו מ-hPSCs נאיביים על ידי אינדוקציה של מסלולי איתות באמצעות activin A, Wnt ו-LIF39. לא עולה בקנה אחד עם ניסויים בעיכוב עוברים, עיכוב ERK הוכח כמונע היווצרות של תאי nEND כאלה במבחנה39. עד כה, קווים כאלה לא נגזרו ישירות מבלסטוציסטים.
לאחרונה, מודלים של העובר המוקדם נוצרו על ידי שילוב וריאציות של המדיה שפותחה בעבר עבור תאי hTSCs35 ו- nEND39 ובכך באמצעות מפעילים של גורם הגדילה המשתנה – β (TGF-β), EGF ומסלולי איתות Wnt 28,40. מודלים עובריים אלה נוצרים ביעילות נמוכה (10%-20%) ויוצרים תאים הדומים לשלב10 שלאחר ההשתלה ולא לפני ההשתלה, כולל אנלוגים של אפיבלסט לאחר ההשתלה, טרופובלסט, אמניון, גסטרולה, רקמות מזודרמליות (~ יום עוברי 14), וציטוטרופיובלסטים10. להיפך, עיכוב משולש של מסלולי היפופו, ERK ו-TGF-β מנחה ביעילות את היווצרותם של בלסטואידים הכוללים תאים דמויי בלסטוציסט41. יחד עם מצב התא ההתחלתי, אנו מציעים שעיכוב מסלולים משולשים (היפו, ERK, TGF-β) הוא הפרמטר החיוני השני ליצירת בלסטואידים בעלי נאמנות גבוהה (איור 1B).
הערכת מצב התא והשלב המשתקף באמצעות scRNAseq. ניתן להעריך את מצבם של תאים המרכיבים בלסטואידים באמצעות ניתוח scRNAseq. ניתן למדוד את דמיון השעתוק שלהם לשלבים עובריים ספציפיים באמצעות תאים בלסטואידים בלבד ובהשוואה עם hPSCs ראשוניים או hTSCs המשקפים שלבים לאחרההשתלה 20,35. ביצוע ניתוחי אשכולות תוך שימוש ברמות שונות של הגדרה חושף כיצד תת-אוכלוסיות מתמזגות בהדרגה כאשר ההגדרה פוחתת, ובכך חושפת את קווי הדמיון של האשכולות. למרות שניתן למדוד את האופטימיות במספר האשכולות42, אשכולות ברזולוציה גבוהה מודיעים גם על נוכחותם הסופית של תת-אוכלוסיות חריגות קטנות, למשל המשקפות את שלב10 שלאחר ההשתלה. הגנים המבוטאים באופן דיפרנציאלי בין אשכולות יכולים לספק מידע על האנלוגיות שלהם בתהליך הפיתוח על ידי הערכת רמות הביטוי של מערכות גנים ייחוס המגדירות שושלות ספציפיות לבמה. זה מאפשר למדוד את ההעשרה של תת-אוכלוסיות בלסטואידיות באמצעות מפות מרחק לא מפוקחות (למשל, באמצעות גנים מועשרים עליונים) או באמצעות ניתוח העשרת קבוצות גנים (GSEA)43. באמצעות פרוטוקול בלסטואיד זה, נוצרים רק שלושה אשכולות עיקריים המשקפים באופן שעתוק את שלוש השושלות הבלסטוציסטיות. אשכול אחד כולל גם את ה-hPSCs הנאיביים הראשוניים וגם את אנלוגיית האפיבלסט של הבלסטואידים. ניתוח תאים בנקודות זמן שונות הראה את האופי הרציף של מפרט השושלות (טרופובלסטים מתחילים לציין תוך 24 שעות, ותאי אנדודרם פרימיטיביים בתוך 60 שעות). אשכולות ברזולוציה גבוהה לכדו תת-אוכלוסייה של תאים (3.2%) המבטאים גנים ספציפיים לעוברים בשלב הגסטרולציה (אולי מזודרם או אמנון). יש לציין כי ה-hPSCs הנאיביים הראשוניים היוו גם 5% מהתאים דמויי ההשתלה לאחר ההשתלה, כפי שתואר קודם לכן44. בניתוח שני, ניתן למזג תאים בלסטואידים בסיליקו עם תאי ייחוס המבודדים מ-concepti בשלבים שונים 45,46,47 על מנת להסיק שקילות שלבים. כאן, תאים שבודדו מתפיסות טרום-השתלה45,46, בלסטוציסטים בתרבית במבחנה 45 ועוברים בשלב ההשתלה47 שימשו כנקודות ייחוס. באמצעות פרוטוקול זה, כומת כי התאים הבלסטואידיים הלא תואמים שנחשפו על ידי אשכולות ברזולוציה גבוהה אכן מתקבצים עם מזודרם ואמניון לאחר ההשתלה. בשלבים עתידיים, יש להשלים את מדידת השעתוק עם ניתוח ביטוי טרנספוזון, מתילציה של DNA ומצב כרומוזום X המספקים גם ציוני דרך של שלבים התפתחותיים21.
הערכת היווצרות צירים ותפקודים אחרים של בלסטואידים אנושיים. בלסטוציסט בוגר מאופיין על ידי היווצרות של הציר העוברי-אבמבריוני דפוס trophoblasts עבור השתלה. באמצעות פרוטוקול בלסטואיד זה, נוצר ציר חזק המודגם על ידי הבשלה של הטרופובילסטים הפרוקסימליים (למשל, NR2F2+/CDX2-) הרוכשים את היכולת להיצמד לתאי האורגנואידים של רירית הרחם רק כאשר הם מגורה הורמונלית48,49. השוואה עם טרופוספרות שאינן יוצרות את האפיבלסט מראה כי תאים פנימיים אלה גורמים לטרופובלסטים קרובים להבשיל כדי לתווך את ההתקשרות הראשונית לאנדומטריום. כאשר הם מתורבתים במדיום תרבותי מורחב המיועד לבלסטוציסטים של קופי צינומולגוס50, כל שלוש השושלות מהבלסטואיד מתרחבות בעקביות במשך שישה ימים נוספים (זמן שווה ערך ליום 13) אם כי הארגון שלהן אינו משקף את השלב ההתפתחותי הזה.
ההשלכה של בלסטואידים אנושיים בעלי יעילות גבוהה ונאמנות גבוהה. שימור העקרונות ההתפתחותיים שהתגלו באורגניזמים מודליים קשה מטבעו לבחון בתפיסה האנושית בשל הגישה המוגבלת והקשיים הטכניים במניפולציה גנטית ופיזית שלה. מודל בלסטואידי בעל יעילות גבוהה ונאמנות גבוהה יאפשר בדיקות גנטיות ותרופות בתפוקה גבוהה, הנמצאות בבסיס תגליות מדעיות וביו-רפואיות. בנוסף, שילוב של שינויים גנטיים מורכבים כדי לשנות ולתעד תהליכים ביולוגיים ישלים מחקרים כאלה. בסך הכל, אנו מציעים כי העיכוב המשולש (היפו, TGF-β, ERK) של hPSCs PXGL נאיביים הוא מוליך להיווצרות יעילה של בלסטואידים אנושיים בעלי נאמנות גבוהה העומדים בארבעת הקריטריונים המינימליים. האופי הניתן להרחבה ורב-תכליתי של פרוטוקול זה הופך אותו למתאים ליצירת השערות ממוקדות שניתן לאמת לאחר מכן באמצעות בלסטוציסטים אנושיים. ככאלה, בלסטואידים אנושיים לא יחליפו את השימוש במושגים אנושיים למחקר במבחנה , אלא עשויים לשמש כדרך רבת עוצמה לתעל את המחקר באמצעות גישות ניסיוניות שלא היו נגישות בעבר בלב תהליך הגילוי המדעי והביו-רפואי. הפרוטוקול מראה כיצד ליצור בלסטואידים אנושיים וגם כיצד לנתח את התאים הכלולים בתוך הבלסטואיד.
במחקר הנוכחי, אנו מראים, צעד אחר צעד, כיצד לבסס בלסטואידים אנושיים עם יעילות גבוהה באמצעות פרוטוקול פשוט וחזק. עם צבירה של PXGL hPSCs נאיביים והעיכוב המשולש שלהם, בלסטואידים נוצרים ביעילות (> 70%) ויוצרים ברצף את 3 האנלוגיות הבלסטוציסטיות תוך 4 ימים. מגבלות ביעילות ובאיכות של הבלסטואידים (למשל, נוכחות של תאים מחוץ למטרה) יכולות להתרחש אם המצב ההתחלתי אינו אופטימלי. יש לציין כי מדדנו כי PXGL hPSCs מכילים כ-5% מהתאים המשקפים את שלבי ההשתלה שלאחר ההשתלה. תאים אלה עשויים להגביל את היווצרותם של בלסטואידים באיכות גבוהה. מעבר למצב PXGL הנאיבי הראשוני המשקף את אפיבלסט הבלסטוציסט, גורם מרכזי נוסף הוא המדיום המשמש להיווצרות בלסטואידים. על מנת ליצור במהירות תאים דמויי בלסטוציסט ולמנוע היווצרות של תאים מחוץ למטרה, דמויי השתלה לאחר ההשתלה, אנו מציעים כי עיכוב מסלולים משולשים (היפו, ERK, TGF-β) הוא חיוני. בעוד שקווי תאים שונים נותנים תפוקות שונות של בלסטואיד על עיכוב ERK/TGF-β (בדרך כלל בסביבות 10%-20%), חשיפה ל-LPA גורמת להיווצרות תפוקת בלסטואידים גבוהה באותה מידה בכל קווי התאים, תוך שימוש בקריטריונים מחמירים למפרט מורפומטרי ושושלת. LPA פועל ככל הנראה על עיכוב מסלול ההיפו, הממלא תפקיד קריטי בהפרדת השושלת הראשונה בין שושלות אפיבלסט וטרופקטודרם בעכבר ובאדם 8,51. השיפור המשמעותי ביעילות הבלסטואידים על ידי LPA מצביע על כך שמנגנוני אפיון התאים הפנימיים-חיצוניים בתיווך מסלול ההיפו הפועלים בבלסטוציסט נבחרים יחד במהלך היווצרות בלסטואידים. מגבלה נוכחית טמונה בעובדה שבשל תת-אופטימליות של הפרוטוקולים המשמשים לתרבית בלסטוציסט אנושי או בלסטואידים ביום המקביל בזמן 7-13 (לאחר היווצרות בלסטוציסט/בלסטואיד), איננו מסוגלים להעריך באיזו מידה אנו יכולים לדגום כראוי התפתחות לאחר ההשתלה.
ניתוח מצב השעתוק של תאי הבלסטואידים יכול להיות מושג בקלות באמצעות scRNAseq, מפות ייחוס נאותות ושיטות ביואינפורמטיות. בעבר, ניתוח התעתיק הראה כי hPSCs שעברו תרבית ב- PXGL דומים יותר לאפיבלסט הבלסטוציסט בהשוואה למצב הראשוני. מגבלות בניתוח הנתונים יכולות להתרחש אם מפת הייחוס כוללת רק תאים בשלב הבלסטוציסט. מפת הייחוס צריכה לכלול תאים שמקורם בעוברים לאחר ההשתלה על מנת להעריך את נוכחותם של תאים פוטנציאליים מחוץ למטרה. בעתיד, על מנת למדוד את תאי הבלסטואיד, מפת ייחוס הכוללת את כל הרקמות של התפיסה האנושית לפני ואחרי ההשתלה תהיה בעלת ערך רב. בנוסף, מפות ייחוס של תאים בודדים מרובי-אומיקה, למשל כולל תעתיק, נגישות כרומטין ומתילציה של דנ”א, יעזרו עוד יותר. לבסוף, שיטות ביואינפורמטיות סטנדרטיות להערכה כמותית של קווי הדמיון בין תאים ממודלים של עוברים ומתפיסות ייחוס, ולזיהוי חיובי של תאים מחוץ למטרה יסייעו עוד יותר לנתח ולהשוות תוצאות ללא משוא פנים.
בסך הכל, בלסטואידים הנוצרים על ידי עיכוב משולש של מסלולי היפופו, TGF-β ו- ERK הם בעלי ארבע התכונות של 1) מורפוגנזה יעילה ביותר, 2) רצף נכון של מפרט שושלת, 3) טוהר גבוה של תאים דמויי בלסטוציסט ברמת השעתוק, 4) יכולת לדגום פיתוח פרי-השתלה. תכונות אלה של בלסטואידים יאפשרו היפותזות בנייה על התפתחות והשתלה של בלסטוציסט, אולם הן אינן משחזרות שלבים מוקדמים יותר של התפתחות עוברית. בניגוד לנגישות המוגבלת והרבגוניות של הבלסטוציסט האנושי, בלסטואידים מקובלים על בדיקות גנטיות ותרופות לצורך חקירות תפקודיות של התפתחות והשתלת בלסטוציסטים. בעתיד, ידע בסיסי כזה עשוי לתרום לשיפור נוסחת המדיה ההפריה החוץ גופית, לפיתוח אמצעי מניעה לאחר הפריה ולניהול טוב יותר של ההריון המוקדם.
The authors have nothing to disclose.
פרויקט זה קיבל מימון ממועצת המחקר האירופית (ERC) במסגרת תוכנית המחקר והחדשנות Horizon 2020 של האיחוד האירופי (הסכם מענק ERC-Co מס ‘101002317 ‘BLASTOID: פלטפורמת גילוי לאמבריוגנזה אנושית מוקדמת’). H.H.K. נתמך על ידי קרן המדע האוסטרית (FWF), תוכנית Lise Meitner M3131-B. אנו מודים ליאסוהירו טקשימה על שיתוף קווי התאים H9 ו-H9-GFP, ולאוסטין סמית’, פיטר אנדרוז וגה גואו על שיתוף קווי התאים HNES1, Shef6, niPSC 16.2b ו-cR-NCRM2. אנו מודים ל-Hossein Baharvand על שיתוף האורגנואידים של רירית הרחם. אנו מודים לג’ושוע מ. בריקמן על שיתוף הרנ”א שבודד מתאי התמיינות PrE ותאי nEND. אנו מודים לשנקר סריניווס על שיתוף נתוני ריצוף ה-RNA החד-תאיים של עובר הפרי-גסטרולציה. אנו מודים לאלכסנד ביקוב וללואיזה קוצ’לה על הסיוע הטכני בהכנת ספריית SMARTSeq2. אנו מודים למתקן ה-NGS, הביואופטיקה ותאי הגזע ב-IMBA על הסיוע הקריטי.
Neurobasal media | in house | ||
DMEM/F12 | in house | ||
100X N2 supplemen | Gibco | 17502048 | |
50X B27 supplement | Gibco | 17504044 | |
100X Glutamax | Gibco | 35050038 | |
100 mM Sodium Pyruvate | Gibco | 11360039 | |
MEM-Non-essential amino acids | Gibco | 11140050 | |
1 M Hepes | in house | ||
50 mM 2-Mercaptoethanol | Thermofisher | 31350010 | |
100X Penicillin-Streptomycin | Sigma-Aldrich | P0781 | |
Bovine Serum Albumin solution | Sigma-Aldrich | A7979 | |
PD0325901 | Medchem express | HY-10254 | |
XAV-939 | Medchem express | HY-15147 | |
Gö 6983 | Medchem express | HY-13689 | |
Human recombinant Leukemia Inhibitory Factor | in house | ||
A83-01 | Medchem express | HY-10432 | |
1-Oleoyl Lysophosphatidic acid (LPA) | Peprotech | 2256236 | |
Y-27632 | Medchem express | HY-10583 | |
CMRL medium | Gibco | 21530027 | |
Fetal Bovine Serum (FBS) | Sigma-Aldrich | F7524 | |
KnockOut Serum Replacement (KSR) | Thermofisher | 10-828-028 | |
Accutase | Biozym | B423201 | cell detachment solution |
Geltrex | Thermofisher | A1413302 | growth factor basement membrane extract |
TROP2 antibody | R&D systems | MAB650 | |
PDGFRα antibody | R&D systems | AF307 | |
SC-144 | Axon | 2324 | |
XMU-MP-1 | Med Chem Express | HY-100526 | |
Matrigel | basement membrane matrix | ||
Countess cell counting chamber slides | Thermo fisher | cell counting slides | |
DAPI Staining Solution | Miltenyi Biotec | 130-111-570 |