Este protocolo apresenta duas técnicas para isolar os compartimentos subcelulares de fotorreceptores de haste murina para análise de proteínas. O primeiro método utiliza papel filtro de retina viva e celulose para separar segmentos externos da haste, enquanto o segundo emprega retina liofilizada e fita adesiva para descascar camadas internas e externas do segmento.
Os fotorreceptores de rod são neurônios sensoriais altamente polarizados com compartimentos distintos. As hastes do mouse são longas (~80 μm) e finas (~2 μm) e são embaladas lateralmente na camada mais externa da retina, a camada fotorreceptora, resultando no alinhamento de compartimentos subcelulares análogos. Tradicionalmente, a seção tangencial da retina congelada montada plana tem sido usada para estudar o movimento e a localização de proteínas dentro de diferentes compartimentos de vara. No entanto, a alta curvatura da retina do rato dominante da haste torna a seção tangencial desafiadora. Motivados pelo estudo do transporte de proteínas entre compartimentos, desenvolvemos dois métodos de descascamento que isolam de forma confiável o segmento externo da haste (ROS) e outros compartimentos subcelulares para manchas ocidentais. Nossas técnicas relativamente rápidas e simples fornecem frações enriquecidas e subcelulares específicas para medir quantitativamente a distribuição e redistribuição de importantes proteínas fotorreceptoras em hastes normais. Além disso, essas técnicas de isolamento também podem ser facilmente adaptadas para isolar e investigar quantitativamente a composição proteica de outras camadas celulares dentro da retina saudável e degenerada.
As células fotorreceptoras de rod, bem embaladas na camada mais externa da retina neural, são parte integrante da visão de luz fraca. Para funcionar como contadores de fótons fiéis, as hastes utilizam uma via de sinalização baseada em proteína G, denominada fototransdução, para gerar respostas rápidas, amplificadas e reprodutíveis à captura de fótons únicos. Esta resposta à luz finalmente desencadeia uma mudança na correnteza na membrana plasmática e é posteriormente sinalizada para o resto do sistema visual1. Como o nome indica, cada célula de haste tem uma forma distinta semelhante a uma haste e exibe uma morfologia celular altamente polarizada, consistindo de um segmento externo (OS), segmento interno (IS), corpo celular (CB) e terminal sináptico (ST). Cada compartimento subcelular possui máquinas proteicas específicas (ligadas à membrana e solúveis), características biomoleculares e complexos proteicos que desempenham papéis cruciais, como fototransdução visual, limpeza geral e síntese de proteínas, e transmissão sináptica2,3.
Há mais de 30 anos, o movimento recíproco dependente da luz de proteínas subcelulares, especificamente transdutina (longe do SO) e preso (em direção ao SO), foi observado pela primeira vez4,5,6,7. No início, esse fenômeno observado foi recebido com ceticismo, devido, em parte, à vulnerabilidade da imunohistoquímica ao mascaramento de epítope8. No início dos anos 2000, a translocação de proteínas dependentes de estímulos foi confirmada por meio de uma rigorosa e árdua técnica de secção física9. A seção tangencial serial da retina de roedores congelados, seguida de imunoblotting, revelou que transducin9,10, prende em 11,12, e recupera em 13 todos passam por redistribuição subcelular em resposta à luz. Acredita-se que a translocação leve dessas proteínas de sinalização chave não só regula a sensibilidade da cascata de fototransdução9,14,15, mas também pode ser neuroprotetora contra danos leves16,17,18. Como o transporte de proteínas leve em hastes parece ser muito significativo para a biologia celular e fisiologia, técnicas que permitem o isolamento de diferentes compartimentos subcelulares para determinar a distribuição de proteínas são ferramentas valiosas de pesquisa.
Atualmente, existem alguns métodos que visam isolar os compartimentos subcelulares da haste. No entanto, esses métodos podem ser longos e difíceis de reproduzir, ou requerem uma quantidade considerável de isolamento da retina. As preparações do segmento externo de rod (ROS) através da centrifugação gradiente de densidade19, por exemplo, é comumente usada para separar o ROS do homogeneato da retina. Este método é amplamente utilizado para a mancha ocidental, mas o procedimento é muito demorado e requer um mínimo de 8-12 retinas murinas20. Por outro lado, a secção tangencial serial da retina congelada de murina e rato foi implementada com sucesso na isolação do SO, IS, CB e ST9,11,13. No entanto, este método é tecnicamente desafiador devido à necessidade de achatar totalmente a pequena e altamente curvada retina murina para alinhar as camadas de retina antes da seção tangencial. Como há uma infinidade de modelos de camundongos e camundongos transgênicos recapitulando doenças do sistema visual, a criação de uma técnica que separa de forma confiável, rápida e fácil os compartimentos individuais de hastes é promissora na revelação dos processos fisiológicos que ocorrem em cada compartimento especializado e dos mecanismos que fundamentam os processos visuais em saúde e doença.
Para facilitar essas investigações, descrevemos dois métodos de descascamento que isolam compartimentos subcelulares de haste mais facilmente do que os protocolos atuais. O primeiro método de peeling, adaptado de uma técnica para expor células bipolares fluorescentes rotuladas para gravação de grampo de remendo21, emprega papel filtro de celulose para remover sequencialmente o ROS de uma retina murina viva e isolada (Figura 1). O segundo método, adaptado de um procedimento que isola as três camadas primárias das células da retina de uma retina de 22 e sapo, utiliza fita adesiva para remover o segmento interno de ROS e haste (RIS) de uma retina liofilizada (Figura 2). Ambos os procedimentos podem ser concluídos em 1h e são consideravelmente fáceis de usar. Fornecemos validação da eficácia desses dois protocolos de separação para a mancha ocidental utilizando retinas adaptadas à escuridão e expostas à luz de camundongos C57BL/6J para demonstrar translocação induzida pela luz de transduína de haste (GNAT1) e arrestin (ARR1). Além disso, usando o método de descascamento de fita, fornecemos evidências adicionais de que nossa técnica pode ser usada para examinar e abordar inconsistências entre dados de localização de proteínas adquiridos pela imunocitoquímica (ICC) e manchas ocidentais. Especificamente, nossa técnica mostrou que: 1) a isoforma proteína quinase C-alfa (PKCα) está presente não apenas em células bipolares, mas também em murine ROS e RIS, embora em baixas concentrações24,25, e 2) rhodopsin quinase (GRK1) está presente predominantemente na amostra isolada do SO. Esses dados demonstram a eficácia de nossas duas técnicas de descascamento para separar e quantificar proteínas específicas de vara e retina.
Muitas doenças da retina afetam as células fotorreceptoras da haste, levando à morte da haste e, em última instância, à perda completa da visão37. Uma parte significativa das origens genéticas e mecanicistas da degeneração da retina humana foram recapituladas com sucesso em inúmeros modelos de camundongos ao longo dos anos. Nesse contexto, a capacidade de separar facilmente e seletivamente compartimentos subcelulares individuais da pequena retina do rato aumentaria muito nossa compreens…
The authors have nothing to disclose.
Este trabalho foi apoiado pelo NIH Grant EY12155, EY027193 e EY027387 para JC. Somos gratos ao Dr. Spyridon Michalakis (Caltech, Pasadena, EUA) e Natalie Chen (USC, Los Angeles, EUA) por revisar o manuscrito. Também gostaríamos de agradecer ao Dr. Seth Ruffins (USC, Los Angeles, EUA) e ao Dr. Janos Peti-Peterdi (USC, Los Angeles, EUA) por fornecerem os equipamentos necessários para coletar as imagens fornecidas pelo autor. Material de: Kasey Rose et al, Separação de compartimentos celulares fotorreceptor na retina do rato para análise de proteínas, Neurodegeneração Molecular, publicado [2017], [Springer Nature].
100 mL laboratory or media bottle equipped with a tubing cap adapter | N/A | N/A | |
100% O2 tank | N/A | N/A | |
1000mL Bottle Top Filter, PES Filter Material, 0.22 μm | Genesee Scientific | 25-235 | |
4X SDS Sample Buffer | Millipore Sigma | 70607-3 | |
50 mL Falcon tube | Fisher Scientific | 14-432-22 | |
95% O2 and 5% CO2 tank | N/A | N/A | |
Ames’ Medium with L-glutamine, without bicarbonate | Sigma-Aldrich | A1420 | |
CaCl2 (99%, dihydrate) | Sigma | C-3881 | |
Drierite (Anhydrous calcium sulfate, >98% CaSO4, >2% CoCl2) | WA Hammond Drierite Co LTD | 21005 | |
Falcon Easy-Grip Petri Dish (polystyrene, 35 x 10 mm) | Falcon-Corning | 08-757-100A | |
Falcon Easy-Grip Tissue Culture Dish (60 x 15 mm) | Falcon-Corning | 08-772F | |
Feather Scalpel (No. 10, 40 mm) | VWR | 100499-578 | |
Feather Scalpel (No. 11, 40 mm) | VWT | 100499-580 | |
KCl (99%) | Sigma | P-4504 | |
Kimble Kontes pellet pestle | Sigma | z359971 | |
Labconco Fast-Freeze Flasks | Labconco | N/A | |
LN2 (liquid nitrogen) + Dewar flask or similar vacuum flask | N/A | N/A | |
MgCl2 | Sigma | M-9272 | |
Milli-Q/de-ionized water | EMD Millipore | N/A | |
Na2HPO4 (powder) | J.T. Baker | 4062-01 | |
NaCl (crystal) | EMD Millipore | Sx0420-3 | |
NaHCO3 | Amresco | 0865 | |
OmniPur EDTA | EMD | 4005 | |
OmniPur HEPES, Free Acid | EMD | 5320 | |
Parafilm M | Sigma-Aldrich | P7793 | |
Reynolds Wrap Aluminum Foil | Reynolds Brands | N/A | |
Scotch Magic Tape (12.7 mm x 32.9 m) | Scotch-3M | N/A | |
Sodium deoxycholate | Sigma-Aldrich | D67501 | |
Spectrafuge mini centrifuge | Labnet International, Inc | C1301 | |
Tissue incubation chamber (purchased or custom made) | N/A | N/A | |
Tris-HCl | J.T.Baker | 4103-02 | |
Triton X-100 | Signma-Aldrich | T8787 | |
VirTis Benchtop 2K Lyophilizer or equivalent machine | SP Scientific | N/A | |
VWR Grade 413 Filer Paper (diameter 5.5 cm, pore size 5 μm) | VWR | 28310-015 | |
Whatman Grade 1 Qualitative Filter Paper (diameter 9 cm, pore size 11 μm) | Whatman/GE Healthcare | 1001-090 | |
Wide bore transfer pipet, Global Scientific | VWR | 76285-362 |