Summary

Tüberküloz için Ev Sahibi Tarafından Yönlendirilen Tedavilerin Preklinik Testlerinde Kullanılmak Üzere Otomatik Bir Kültür Sistemi

Published: August 16, 2021
doi:

Summary

Hücre içi M. tuberculosis büyümesinin hızlı ve etkili bir şekilde ölçülmesi, tüberküloza (TB) karşı gelişmiş tedavilerin sürdürülmesi için çok önemlidir. Bu protokol, aday konakçı tarafından yönlendirilen tedavilerle tedavi edilen makrofajlarda Mtb büyümesini ölçmek için otomatik bir sıvı kültür sistemi kullanan et suyu bazlı bir kolorimetrik tespit testini tanımlar.

Abstract

Tüberkülozun (TB) etken maddesi olan Mycobacterium tuberculosis (Mtb), COVID-19’un ortaya çıkışına kadar dünya çapında en önemli bulaşıcı hastalık katiliydi. Mtb, hücre içi ortamında devam etmek, konakçı savunmasından kaçınmak ve birçok anti-tüberküler ilaca karşı direnç geliştirmek için evrimleşmiştir. Direnci çözmeye yönelik bir yaklaşım, Mtb’ye karşı konakçı bağışıklık tepkisini artıracak mevcut onaylanmış ilaçları tanımlamaktır. Bu ilaçlar daha sonra tedavi süresini kısaltmak ve antibiyotik direncinin üstesinden gelmeye yardımcı olmak için yardımcı konakçı yönelimli tedaviler (HDT) olarak yeniden kullanılabilir.

Makrofajlarda hücre içi Mtb büyümesinin ölçülmesi, potansiyel HDT’nin değerlendirilmesinde çok önemli bir husustur. Mtb büyümesini ölçmek için altın standart, agar plakaları üzerindeki koloni oluşturan birimleri (CFU) saymaktır. Bu, ilaçların hızlı bir şekilde taranmasına kendini ödünç vermeyen yavaş, emek yoğun bir tahlildir. Bu protokolde, klinik örneklerde Mtb’yi tespit etmek için daha yaygın olarak kullanılan otomatik, et suyu bazlı bir kültür sistemi, konakçıya yönelik tedavilerin klinik öncesi taraması için uyarlanmıştır. HDT ile tedavi edilen makrofajlarda sıvı kültür tahlil sisteminin hücre içi Mtb büyümesini araştırma kapasitesi değerlendirildi. Mtb büyümesini inhibe etme yetenekleri açısından test edilen HDT’ler, hem çözelti içinde hem de poli(laktik-ko-glikolik asit) (PLGA) mikropartiküllerinde ve interferon-gama ve linezolid kombinasyonunda kapsüllenmiş all-trans Retinoik asit (AtRA) idi. Bu otomatik sıvı kültür bazlı tekniğin CFU yöntemine göre avantajları, kurulumun basitliğini, daha az emek yoğun hazırlığı ve sonuçlara daha hızlı ulaşma süresini içerir (agar plakaları için 21 gün veya daha fazlasına kıyasla 5-12 gün).

Introduction

TB’nin etken maddesi olan Mycobacterium tuberculosis (Mtb), 2019 yılında dünya çapında en önemli bulaşıcı hastalık öldürücüolmuştur 1. Konakçı savunmasından kaçınmak için Mtb, makrofajlar ve dendritik hücreler (DC’ler) gibi doğuştan gelen bağışıklık hücrelerinin mikobakterisidal aktivitesini bozar ve hücre içinde devam etmesine ve2’yi çoğaltmasına izin verir. Erişkin akciğer tüberkülozunu önlemek için etkili bir aşının bulunmaması ve ilaca dirençli suşların giderek daha fazla ortaya çıkması, yeni tedavilere olan acil ihtiyacı vurgulamaktadır.

Yardımcı konak yönelimli tedaviler (HDT) tedavi süresini kısaltabilir ve direncin üstesinden gelmeye yardımcı olabilir3. Makrofajlar içindeki mikobakterisidal aktiviteyi belirlemek için HDT adaylarının in vitro preklinik değerlendirmesi, genellikle katı agar plakaları üzerinde koloni oluşturan birimler (CFU) tarafından Mtb büyümesinin miktarına dayanır. Bu, ilaçların hızlı bir şekilde taranmasına kendini ödünç vermeyen yavaş, emek yoğun bir tahlildir. Ticari olarak temin edilebilen otomatik, et suyu bazlı mikrobiyal tespit sistemleri, klinik mikrobiyoloji laboratuvarlarında, klinik örneklerde Mtb ve diğer mikobakteriyel türlerin tespiti ve ilaca duyarlılık testi için daha yaygın olarak kullanılmaktadır4. Bu araçlar, zamanla izlenen kültür ortamındaki fiziksel değişikliklere (CO2 veya O2 seviyelerindeki veya basıncındaki değişiklik) yol açan bakteriyel metabolik aktiviteye dayanarak dolaylı olarak büyümeyi ölçer5. Okuma, daha önce 6,7 tedavisine yanıt olarak TB hastalarının balgam örneklerinde ve enfekte murin akciğer ve dalak8 lizatlarında Mtb CFU ile ilişkili olduğu gösterilen pozitiflik zamanıdır (TPP). Ek olarak, geleneksel patojene yönelik tedavilerin aksenik kültürde ve kültürlenmiş makrofajlarda mikobakterilerin büyümesi üzerindeki etkisini ölçmek için sıvı kültür tespit sistemleri kullanılmıştır 9,10. Cihaz ayrıca dendritik hücrelerin ve alveolar makrofajların Mtb 11,12’nin hücre içi büyümesini kontrol etme konusundaki doğuştan gelen yeteneğini araştırmak için kullanılmıştır. Bu deneysel protokol, kültürlü makrofajlarda TB için HDT’nin klinik öncesi taramasını gerçekleştirmek için bir sıvı kültür tanı sisteminin uyarlanabileceğini göstermektedir. CFU sayımı ile karşılaştırıldığında, bu tekniğin temel avantajı, hücre içi mikobakteriyel büyümeyi / sağkalımı ölçmek için gereken deneysel emeği ve zamanı önemli ölçüde azaltmasıdır. Bu teknik, konakçı bağışıklığını artırmak için hücresel fonksiyonları hedefleyen çok çeşitli farmakolojik reaktiflerle tedavi edilen bağışıklık hücrelerinde hücre içi mikobakteriyel sağkalımı değerlendirmek için kullanılabilecek otomatik bir kültür cihazına erişime dayanır.

Protocol

Bu protokolde özetlenen deneyler, bir Muhafaza Seviyesi 2 laboratuvarında ele alınabilen Mtb’nin zayıflatılmış H37Ra suşu kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Canlı mikobakterilerin tüm manipülasyonları Sınıf II biyolojik güvenlik kabininde (BSC) gerçekleştirildi. Aerosol oluşumunu en aza indirmek için deneysel prosedürler tasarlanmıştır. Ökaryotik hücre kültürü (THP-1 hücreleri) de Sınıf II BSC’de gerçekleştirildi. Laboratuvar, bir risk değerlendirmesi gerçekleştirmiş ve tüm prose…

Representative Results

Bu çalışmada kullanılan otomatik sıvı kültür cihazı, her 10 dakikada bir CO2 seviyelerini izler. Cihaz şişesinin altındaki sensördeki renk değişikliği kolorimetrik olarak ölçülür ve yansıtma birimleri olarak ifade edilir. Cihaz yazılımı daha sonra pozitifliğe kadar geçen süreyi (TTP), yani aşılamadan kültürlerin pozitif olarak işaretlenmesine kadar geçen gün sayısını hesaplamak için algılama algoritmaları uygular (Şekil 1A). Başlangıç in…

Discussion

Yazarlar, monosit kaynaklı makrofajlarda ve alveoler makrofajlarda vePMA 11,16,17 ile farklılaşmış THP-1 hücrelerinde Mtb büyümesini izlemek için bu protokolde açıklanan sıvı kültür yöntemini kullanmışlardır. Bu teknik, yapışkan olmayan hücrelerle kullanım için de değiştirilebilir12. Daha yakın zamanlarda, cihaz ayrıca inhale all-trans retinoik asidi (AtRA) TB

Divulgazioni

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Bu çalışma İrlanda Bilim Vakfı (SFI 08 / RFP / BMT1689), İrlanda’daki Sağlık Araştırma Kurulu [HRA-POR / 2012/4 ve HRA-POR-2015-1145] ve Dublin Kraliyet Şehri Hastanesi Vakfı tarafından finanse edilmiştir.

Materials

IX51 Fluorescent Microscope Olympus, Japan N/A AFB detection and imaging
2 mL microtube, flat bottom, screw cap, sterile Sarstedt, North Carolina, USA 72.694.006 Mtb infection of macropahges
5 mL syringe, Luer lock BD Biosciences, San Jose, CA, USA SZR-150-031K Mtb infection of macropahges/CFU
50 mL tube, sterile Sarstedt, North Carolina, USA 62.547.254 Mtb infection of macropahges
all-trans-Retinoic Acid (ATRA) ≥98% (HPLC) Sigma Aldrich, Missouri, USA R2625 Host directed therapy candidate
BacT/ALERT 3D Microbial Detection System Biomerieux ( Hampshire, UK) 247001 Broth-based colormetric detection system
BACT/ALERT MP  BACT/ALERT MP Nutrient Supplement Biomerieux ( Hampshire, UK) 414997 Broth-based colormetric detection assay
BACT/ALERT MP culture bottles Biomerieux ( Hampshire, UK) 419744 Broth-based colormetric detection assay
BD BBL Middlebrook ADC Enrichment, 20 mL BD Biosciences, San Jose, CA, USA M0553 Mycobacterium liquid culture
BD BBL Middlebrook OADC Enrichment, 20mL BD Biosciences, San Jose, CA, USA M0678 Colony Forming Units
Cell scraper, 25 cm Sarstedt, North Carolina, USA 83.1830 Harvest of lmacrophage lysates
Corning Syringe Filter, 0.2 µm Corning Incorporated, Germany 431219 Sterilization of lysis buffer
Cover glass (borosilicate), 24 x 50 mm, #1.5 thickness VWR International Limited 631 – 0147
Cycloheximide, from microbial Sigma Aldrich, Missouri, USA C7698 Colony Forming Units
Dako Fluorescent Mounting Medium Agilent Technologies Ireland Limited S3023 Antifade mounting medium
Dulbecco’s Phosphate Buffered Saline Sigma Aldrich, Missouri, USA D8537 Mtb infection of macropahges
Fetal Bovine Serum, Gibco Thermo Fisher, Massachusetts, USA 10270106 Macrophage cell culture
Glycerol, Difco BD Biosciences, San Jose, CA, USA 228220 Colony Forming Units
Hoescht 33342 (bisBenzimide H 33342 trihydrochloride) Sigma Aldrich, Missouri, USA B2261 Nuclear stain
IFNγ, recombinant human R&D Systems Inc, Minnesota, USA 285-IF Host directed therapy candidate
Labtek 2-well chamber slide, sterile, Nunc Thermo Fisher, Massachusetts, USA TKT-210-150R Mtb infection of macropahges
L-Asparagine, anhydrous Sigma Aldrich, Missouri, USA A4159 Colony Forming Units
Linezolid Sigma Aldrich, Missouri, USA PZ0014 Antibiotic
Microlance Hypodermic Needle 25 G BD Biosciences, San Jose, CA, USA 300400 Mtb infection of macropahges/CFU
Middlebrook 7H10 Agar Base BD Biosciences, San Jose, CA, USA M0303 Colony Forming Units
Middlebrook 7H9 Broth Base BD Biosciences, San Jose, CA, USA M0178 Mycobacterium liquid culture
Modified Auramine O Stain and Decolourizer Scientific Device Laboratory, IL, USA 345-250 AFB stain
Paraformaldehyde Sigma Aldrich, Missouri, USA 158127 Mtb infection of macropahges
Petri dishes, 92 x 16mm (20/bag) Sarstedt, North Carolina, USA 82.1473.001 Colony Forming Units
Phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) Sigma Aldrich, Missouri, USA P8139 Macrophage cell culture
Polysorbate 80, Difco BD Biosciences, San Jose, CA, USA 231181 Mycobacterium liquid culture
RPMI-1640, Gibco Thermo Fisher, Massachusetts, USA 52400025 Macrophage cell culture
Sterile Cell Spreader, L-Shaped Fisherbrand, Thermo Fisher, MA, USA RB-44103 Colony Forming Units
T25 TC flask, angled neck, filter cap, sterile, Nunc Thermo Fisher, Massachusetts, USA 156367 Mycobacterium liquid culture
THP-1 cell line ATCC, Virginia, USA ATCC TIB-202 Macrophage cell culture

Riferimenti

  1. WHO. Global Tuberculosis Report. World Health Organization. , (2020).
  2. Russell, D. G. Mycobacterium tuberculosis and the intimate discourse of a chronic infection. Immunological Reviews. 240 (1), 252-268 (2011).
  3. Young, C., Walzl, G., Du Plessis, N. Therapeutic host-directed strategies to improve outcome in tuberculosis. Mucosal Immunology. 13 (2), 190-204 (2020).
  4. Angeby, K. A., et al. Evaluation of the BacT/ALERT 3D system for recovery and drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis. Clinical Microbiology and Infection. 9 (11), 1148-1152 (2003).
  5. Asmar, S., Drancourt, M. Rapid culture-based diagnosis of pulmonary tuberculosis in developed and developing countries. Frontiers in Microbiology. 6, 1184 (2015).
  6. Diacon, A. H., et al. Time to liquid culture positivity can substitute for colony counting on agar plates in early bactericidal activity studies of antituberculosis agents. Clinical Microbiology and Infection. 18 (7), 711-717 (2012).
  7. Diacon, A. H., et al. Time to positivity in liquid culture predicts colony forming unit counts of Mycobacterium tuberculosis in sputum specimens. Tuberculosis. 94 (2), 148-151 (2014).
  8. O’Sullivan, D. M., et al. Evaluation of liquid culture for quantitation of Mycobacterium tuberculosis in murine models. Vaccine. 25 (49), 8203-8205 (2007).
  9. Heinrichs, M., et al. Mycobacterium tuberculosis Strains H37ra and H37rv have equivalent minimum inhibitory concentrations to most antituberculosis drugs. International Journal of Mycobacteriology. 7 (2), 156-161 (2018).
  10. Sorrentino, F., et al. Development of an intracellular screen for new compounds able to inhibit mycobacterium tuberculosis growth in human macrophages. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 60 (1), 640-645 (2016).
  11. O’Leary, S. M., et al. Cigarette smoking impairs human pulmonary immunity to Mycobacterium tuberculosis. American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 190 (12), 1430-1436 (2014).
  12. Ryan, R. C., O’Sullivan, M. P., Keane, J. Mycobacterium tuberculosis infection induces non-apoptotic cell death of human dendritic cells. BMC Microbiology. 11, 237 (2011).
  13. Keane, J., Remold, H. G., Kornfeld, H. Virulent mycobacterium tuberculosis strains evade apoptosis of infected alveolar macrophages. The Journal of Immunology. 164 (4), 2016-2020 (2000).
  14. Gao, X. F., Yang, Z. W., Li, J. Adjunctive therapy with interferon-gamma for the treatment of pulmonary tuberculosis: a systematic review. International Journal of Infectious Diseases. 15 (9), 594-600 (2011).
  15. Thorpe, T. C., et al. BacT/Alert: an automated colorimetric microbial detection system. Journal of Clinical Microbiology. 28 (7), 1608-1612 (1990).
  16. Gleeson, L. E., et al. Cutting edge: Mycobacterium tuberculosis induces aerobic glycolysis in human alveolar macrophages that is required for control of intracellular bacillary replication. The Journal of Immunology. 196 (6), 2444-2449 (2016).
  17. O’Connor, G., et al. Inhalable poly(lactic-co-glycolic acid) (PLGA) microparticles encapsulating all-trans-Retinoic acid (ATRA) as a host-directed, adjunctive treatment for Mycobacterium tuberculosis infection. European Journal of Pharmaceutics and Biopharmaceutics. 134, 153-165 (2019).
  18. O’Connor, G., et al. Sharpening nature’s tools for efficient tuberculosis control: A review of the potential role and development of host-directed therapies and strategies for targeted respiratory delivery. Advanced Drug Delivery Reviews. 102, 33-54 (2016).
  19. Rodriguez, D. C., Ocampo, M., Salazar, L. M., Patarroyo, M. A. Quantifying intracellular Mycobacterium tuberculosis: An essential issue for in vitro assays. Microbiologyopen. 7 (2), 00588 (2018).
  20. Ortalo-Magne, A., et al. Molecular composition of the outermost capsular material of the tubercle bacillus. Microbiology. 141, 1609-1620 (1995).
  21. Stokes, R. W., et al. The glycan-rich outer layer of the cell wall of Mycobacterium tuberculosis acts as an antiphagocytic capsule limiting the association of the bacterium with macrophages. Infection and Immunity. 72 (10), 5676-5686 (2004).
  22. O’Sullivan, M. P., O’Leary, S., Kelly, D. M., Keane, J. A caspase-independent pathway mediates macrophage cell death in response to Mycobacterium tuberculosis infection. Infection and Immunity. 75 (4), 1984-1993 (2007).
  23. Cheon, S. H., et al. Bactericidal activity in whole blood as a potential surrogate marker of immunity after vaccination against tuberculosis. Clinical and Diagnostic Laboratory Immunology. 9 (4), 901-907 (2002).
  24. Nathan, C., Barry, C. E. TB drug development: immunology at the table. Immunological Reviews. 264 (1), 308-318 (2015).
  25. Bowness, R., et al. The relationship between Mycobacterium tuberculosis MGIT time to positivity and cfu in sputum samples demonstrates changing bacterial phenotypes potentially reflecting the impact of chemotherapy on critical sub-populations. Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 70 (2), 448-455 (2015).
  26. Basu Roy, R., et al. An auto-luminescent fluorescent BCG whole blood assay to enable evaluation of paediatric mycobacterial responses using minimal blood volumes. Frontiers in Pediatrics. 7, 151 (2019).
  27. Christophe, T., et al. High content screening identifies decaprenyl-phosphoribose 2′ epimerase as a target for intracellular antimycobacterial inhibitors. PLoS Pathogens. 5 (10), 1000645 (2009).
  28. Franzblau, S. G., et al. Comprehensive analysis of methods used for the evaluation of compounds against Mycobacterium tuberculosis. Tuberculosis. 92 (6), 453-488 (2012).

Play Video

Citazione di questo articolo
O’Leary, S., Bahlool, A. Z., O’Connor, G., Cryan, S., Keane, J. M., O’Sullivan, M. P. An Automated Culture System for Use in Preclinical Testing of Host-Directed Therapies for Tuberculosis. J. Vis. Exp. (174), e62838, doi:10.3791/62838 (2021).

View Video