Een stroomanalysesysteem voor op kralen gebaseerde multiplexed-assays dat een twee-reporter-uitlezing biedt, werd gebruikt voor de ontwikkeling van multiplex serologische en antilichaamneutralisatietests die tegelijkertijd neutraliserende IgG- en IgM-antilichamen voor SARS-CoV-2 kunnen meten.
De COVID-19-pandemie heeft de noodzaak onderstreept van snelle high-throughput-methoden voor gevoelige en specifieke serologische detectie van infecties met nieuwe pathogenen, zoals SARS-CoV-2. Multiplex serologische testen kunnen bijzonder nuttig zijn omdat het tegelijkertijd antilichamen tegen meerdere antigenen kan analyseren die de dekking van pathogenen optimaliseren en controles op variabiliteit in het organisme en de individuele gastheerrespons. Hier beschrijven we een SARS-CoV-2 IgG 3-plex fluorescerende microsfeergebaseerde test die zowel IgM- als IgG-antilichamen kan detecteren tegen drie belangrijke SARS-CoV-2-antigenen- het spike (S) -eiwit, spike angiotensine-converting enzyme-2 (ACE2) receptor-bindend domein (RBD) en nucleocarpsid (Nc). De test bleek vergelijkbare prestaties te hebben als een SARS-CoV-2-referentietest voor IgG in serum verkregen na ≥21 dagen na het begin van de symptomen, maar had een hogere gevoeligheid met monsters verzameld op ≤5 dagen na het begin van de symptomen. Verder werd met behulp van oplosbare ACE2 in een neutralisatietestformaat remming van antilichaambinding aangetoond voor S en RBD.
De COVID-19-pandemie heeft het belang benadrukt van het snel kunnen ontwikkelen en implementeren van snelle, high-throughput, hoogwaardige serologische tests die kunnen worden gebruikt voor de diagnose en surveillance van nieuwe pathogenen zoals SARS-CoV-2. Multiplex serologische testen kunnen uiterst nuttig zijn in een pandemie, omdat het tegelijkertijd antilichamen tegen meerdere antigenen kan analyseren, wat zorgt voor een brede pathogeendekking en controles voor variabiliteit in het organisme en de reactie van de gastheer op infectie. De ontwikkeling van een multiplex fluorescerende op kralen gebaseerde test, het SARS-CoV-2 IgG 3Flex (3Flex), dat antilichamen kan detecteren tegen het spike (S) -eiwit, het spike angiotensine-converting enzyme-2 (ACE2) receptor-binding domain (RBD) en nucleocapsid (Nc) van SARS-CoV-2 werd onlangs gemeld1. 3Flex bleek vergelijkbare prestaties te hebben als een referentie SARS-CoV-2 IgG-test voor serum verkregen op ≥21 dagen na het begin van de symptomen, maar had een hogere gevoeligheid met monsters verzameld op ≤5 dagen na het begin van de symptomen. Bovendien werd remming van antilichaambinding aangetoond voor S- en RBD-antigenen met behulp van oplosbare ACE2 in een neutralisatietestformaat. Multiplex-op kralen gebaseerde technologie is op grote schaal toegepast als een bewezen technologie voor multiplex serologische testen en heeft duidelijke voordelen voor grootschalige screening, waaronder een korte tijd tot resultaten, kleine monstervereisten en verminderde arbeid2,3,4.
Onlangs is een nieuw stroomanalyse-instrument beschikbaar gekomen dat dezelfde high-plex, high-throughput-capaciteit biedt als het systeem dat in eerder werk1werd gedemonstreerd, maar met het extra voordeel van twee reporterkanalen. De mogelijkheid om twee fluorescerende reportersignalen in een enkele reactie te meten, maakt de beoordeling van twee resultaten per analyt voor elk monster mogelijk en is ideaal voor isotyperingstoepassingen, die meestal in afzonderlijke reactieputten moeten worden uitgevoerd5. De dubbele reportercapaciteit biedt twee keer de gegevens voor elk monster in half zoveel reactieputten met de helft van de vereisten voor het monstervolume, en heeft dus een duidelijk voordeel ten opzichte van systemen met één verslaggever. Deze studie beschrijft het standaard serologische assay protocol en beschrijft de aanpassing aan een neutralisatie assay. Daarnaast beschrijft dit rapport de conversie van de single reporter assay naar een dual reporter serologische assay, en vervolgens een dual reporter neutralisatie assay, om tegelijkertijd neutraliserende antilichamen van zowel IgG- als IgM-isotypen tegen de SARS-CoV-2 S, RBD en Nc-antigenen te meten. Een visueel overzicht van het testprotocol is te vinden in figuur 1.
Deze studie breidde de functionaliteit uit van een multiplex fluorescerende microsfeertest, 3Flex, die kwalitatief de IgG-respons op infectie door SARS-CoV-2beoordeelt 1. Hoewel veel serologische testen voor COVID-19 een enkel antigeen detecteren, evalueert deze test tegelijkertijd S-, RBD- en Nc-antigenen en bevat een interne antilichaamisotypecontrole7. Daarnaast wordt ACE2 gebruikt als indicator om neutraliserende antilichaamtiters tegen SARS-CoV-2 te detecteren.
Multi-antigeentests kunnen in de toekomst bijzonder nuttig zijn voor het onderscheiden van immuunresponsen tussen geïnfecteerde en gevaccineerde personen. Met SARS-CoV-2, als alleen S- en RBD-antilichamen worden geëvalueerd, zou het onmogelijk zijn om te onderscheiden of dit te wijten was aan een eerdere infectie of aan een vaccinatie-antilichaamrespons. Geen van de vaccins die momenteel in gebruik zijn, is gericht op het Nc-antigeen, dus door S / RBD- en Nc-antigenen te evalueren, is het mogelijk om eerdere virale infectie (Nc- en S / RBD-positief) te onderscheiden van een vaccinatierespons (alleen S / RBD-positief; Nc-negatief).
In de huidige studie werden de 3Flex serologische en neutralisatie assays (secties 5 en 6) overgebracht naar een nieuw dual reporter flow analyse-instrument (secties 7 en 8). Typische immunoassayprotocollen voor op kralen gebaseerde multiplextests zijn vergelijkbaar met standaard ELISA-protocollen, volgens vergelijkbare stappen voor monsterincubatie, detectie van antilichaam / reporter-incubatie en analyse van resultaten8. Eerdere studies hebben ook aangetoond hoe standaard ELISA-assays kunnen worden overgebracht naar een op kralen gebaseerd multiplexingplatform9.
De testprotocollen konden naadloos worden overgezet van het vorige single reporter-instrument naar het nieuwe dual reporter-systeem, zoals blijkt uit de resultaten die zijn verkregen voor de testmonsters en -controles(figuur 4 en figuur 5). In de serologische test vertoonden alle positieve serummonsters een karakteristieke dosisresponsieve afname van het signaal die overeenkomt met zowel een hogere monsterverdunning als een lagere detectieantilichaamconcentratie, terwijl de signalen voor de negatieve monsters op achtergrondniveaus bleven. Evenzo kwamen voor de neutralisatietest afnemende signalen voor S en RBD, maar niet voor Nc, overeen met toenemende concentraties van de ACE2-concurrent, terwijl het IgG-gestripte serum veel minder werd beïnvloed door de toevoeging van ACE2. Het vooraf incuberen van de kralen met ACE2 gedurende 2 minuten voorafgaand aan de toevoeging van het serummonster (zoals beschreven in rubrieken 6 en 8), werd ook vergeleken met het tegelijkertijd combineren van de kralen met ACE2 en serum en produceerde weinig verschil in de resultaten (gegevens niet getoond). Omdat de resultaten verkregen met de kralen plus ACE2 pre-incubatiestap echter consistenter waren, was dit de definitieve procedure die werd gevolgd voor het neutralisatietestprotocol (secties 6 en 8).
Omdat het dual reporter-systeem een tweede fluorescerend reporterkanaal bevat, werden beide assays omgezet in isotyping-assays om tegelijkertijd zowel IgG- als IgM-responsen te meten. De dual reporter-functionaliteit van de flow analyzer maakt het mogelijk om fluorescerende signalen te verzamelen van twee reporterdetectiereagentia voor elke analyt in de multiplex voor elk monster, waardoor de gegevens die per monster in een test worden gegenereerd, effectief worden verdubbeld. Voor de ontwikkeling en optimalisatie van de dual reporter assay protocollen werden verschillende commercieel beschikbare reporter kleurstoffen en detectie antilichamen geëvalueerd voor het nieuwe RP2 kanaal (Figuur 7 en Figuur 8) om de beste beschikbare optie(s) te bepalen. Het anti-IgM-antilichaam geconjugeerd met de DL 405 reporterkleurstof presteerde niet goed in het RP2-kanaal(figuur 7),dus biotine anti-IgG met SASB werd vervolgens geëvalueerd voor detectie in het RP2-kanaal(figuur 8). Drie combinaties van RP1- en RP2-detectiereagentia werden vergeleken in de dual reporter neutralisatietest (tabel 1 en figuur 9) om de best presterende combinaties te bepalen voor gelijktijdige detectie van IgG- en IgM-neutraliserende antilichamen. Hoewel er significante verschillen waren in de signaalintensiteit tussen het RP1-kanaal met PE-anti IgM en het RP2-kanaal met DL 549 anti-IgM, was er geen significant verschil in de meting van de procentuele bindingsremming door ACE2.
Verschillende beperkingen van de huidige methode en deze studie worden erkend. Ten eerste waren de monsters die werden getest en gebruikt bij de ontwikkeling en optimalisatie van de methode beperkt tot sets van 8-11 monsters. Meer monsters zullen worden getest in uitgebreide studies om te controleren of de methode volledig is geoptimaliseerd. Ten tweede werd een beperkt aantal reporter fluoroforen en reporterparen getest. Verder testen van alle beschikbare melders in alle mogelijke combinaties zal bepalen welke reagentia met succes kunnen worden gebruikt in deze methode. Het anti-IgG-antilichaam geconjugeerd aan biotine was anders dan het anti-IgG-antilichaam geconjugeerd aan de BV 421-verslaggever. Dus, hoewel variabiliteit in de signaalintensiteit voor de BV 421 anti-IgG bestond, kan dit te wijten zijn aan de specificiteit van het antilichaam en niet gerelateerd aan de reporterkleurstof. Het testen van andere beschikbare BV 421-geconjugeerde antilichamen kan een ander antilichaam identificeren dat goed zou presteren in het RP2-kanaal. Toekomstige studies zullen ook de combinatie van PE anti-IgM met BV 421 anti-humaan IgG evalueren voor detectie in respectievelijk RP1 en RP2. Ten slotte zijn assays, zelfs met de dual reporter-capaciteit van het instrument, beperkt tot twee isotypen (twee parameters) per reactie. Als extra isotypen moeten worden gemeten of volledige isotypering gewenst is, moeten extra reacties met dezelfde twee reporterkanalen in afzonderlijke putten worden uitgevoerd.
Op kralen gebaseerde multiplexingtechnologie maakt een snel en flexibel testontwerp mogelijk met eenvoudige implementatie in routinematige laboratoriumworkflows3,4,10. Deze studie toonde het gemak aan bij het overbrengen van de eerder beschreven 3Flex serologische en neutralisatietests voor SARS-CoV-2 naar een stroomanalysesysteem voor het meten van IgG met een enkele reporter, of met lichte modificatie, waarbij tegelijkertijd zowel IgG- als IgM-responsen worden gemeten met behulp van twee reporters. De dual reporter-optie heeft duidelijke voordelen ten opzichte van single reporter-platforms omdat het twee keer zoveel gegevens per monster kan leveren, met behulp van de helft van het steekproefvolume en in de helft van het aantal reactieputten. Met de juiste reporterkleurstoffen en detectieantistoffen kunnen isotyping-assays eenvoudig worden ontwikkeld en uitgevoerd op het dual reporter flow analysis-instrument.
The authors have nothing to disclose.
Dit rapport werd gefinancierd door Luminex Corporation (Austin, TX). De auteurs bedanken Matthew Silverman PhD (Biomedical Publishing Solutions, Delray Beach, FL) voor wetenschappelijke redactiehulp.
ACE2 (human) (rec.) | AdipoGen Life Sciences | AG-40B-0192-3050 | |
Biotin-SP (long spacer) AffiniPure Goat Anti-Human IgG, Fcγ fragment specific | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 109-065-098 | |
Bovine Serum Albumin | MilliporeSigma | A7888 | Sigma-Aldrich |
Branson 1800 Cleaner/water bath sonicator | Various | ||
Brilliant Violet 421 AffiniPure Donkey Anti-Human IgG (H+L) | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 709-675-149 | |
Corning 96-well Black Flat Bottom Polystyrene NBS Microplate | Corning | 3650 | |
Corning 96-well Microplate Aluminum Sealing Tape, Nonsterile | Corning | 6570 | |
DyLight 405 AffiniPure Goat Anti-Human IgM, Fc5μ fragment specific | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 109-475-043 | |
DyLight 549 AffiniPure F(ab')2 Goat Anti-Human IgM Fc5μ specific | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 109-506-129 | Discontinued but available from multiple vendors |
eBioscience Streptavidin Super Bright 436 Conjugate | ThermoFisher Scientific | 62-4317-82 | |
Fisherbrand Incubating Microplate Shaker | ThermoFisher Scientific | 02-217-757 | Fisher Scientific |
Goat anti-Rabbit IgG (H+L) Cross-Adsorbed Secondary Antibody, PE | ThermoFisher Scientific | P-2771MP | |
Luminex Magnetic Plate Separator | Luminex Corporation | CN-0269-01 | |
MagPlex beads | Luminex Corporation | MC100XX-ID | |
PE AffiniPure F(ab')2 Goat Anti-Human IgM Fc5μ specific | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 109-116-129 | |
Phosphate Buffered Saline | MilliporeSigma | P3813 | Sigma-Aldrich |
SARS Nucleocapsid Protein Antibody | Novos Biologicals | NB100-56683 | Unconjugated, rabbit, polyclonal, Protein G purified |
SARS Nucleocapsid Protein Antibody | Novos Biologicals | NB100-56049 | Unconjugated, rabbit, polyclonal, Protein A purified |
SARS Spike Protein Antibody | Novos Biologicals | NB100-56047 | Unconjugated, rabbit, polyclonal, Protein G purified |
SARS Spike Protein Antibody | Novos Biologicals | NB100-56048 | Unconjugated, rabbit, polyclonal, Protein G purified |
SARS-CoV-2 (2019-nCoV) Spike S1 Antibody, Rabbit MAb | SinoBiological | 40150-R007 | |
Sodium Azide | MilliporeSigma | S2002 | Sigma-Aldrich |
Streptavidin, R-Phycoerythrin Conjugate (SAPE) | ThermoFisher Scientific | S21388 | premium grade |
Tube Revolver/ Rotator | ThermoFisher Scientific | 88881001 | |
TWEEN 20 | MilliporeSigma | P9416 | Sigma-Aldrich |
xMAP Antibody Couplng Kit | Luminex Corporation | 40-50016 | |
xMAP INTELLIFLEX DR-SE | Luminex Corporation | INTELLIFLEX-DRSE-RUO |