Bu protokolde, kas kök hücreleri için endojen nişleriyle etkileşimlerinin çoğunu koruyan bir in vitro kültleme ve fonksiyonel analiz yöntemi tanımlanmıştır.
Erişkin iskelet kas dokusu, yenilenme yeteneğinin vazgeçilmezi olan bir kök hücre popülasyonunu barındırır. Kas hasarı üzerine, kas kök hücreleri sessiz hallerini terk eder ve miyojenik programı aktive eder ve sonuçta kas kök hücre havuzunun yenilenmesi ile birlikte hasarlı dokunun onarılmasına yol açtı. Çeşitli faktörler kas kök hücre aktivitesini etkiler, bunlar arasında içsel uyaranlar, aynı zamanda doğrudan kas kök hücre ortamından, kök hücre nişinden gelen sinyaller. Tek miyofiberlerin ilişkili kas kök hücreleri ile izolasyonu ve kültürü, kök hücrenin nişi ile etkileşiminin çoğunu korur ve bu nedenle kas kök hücre işlevselliğini incelemek için en yakın olasılıktır ex vivo. Burada fare EDL(ekstansör digitorum longus)kaslarından kas kök hücrelerinin kendi miyofiberlerinde izolasyon, kültür, siRNA transfeksiyonu ve immünostaining için bir protokol sağlanmaktadır. Burada özetlenen deneysel koşullar, in vivo hayvan deneylerine ihtiyaç duymadan miyojenik aktivitenin araştırılması da dahil olmak üzere kas kök hücrelerinin incelenmesine ve manipülasyon edilmesine izin verir.
Erişkinteki iskelet kası, esas olarak gönüllü hareketler için efektör hücreler olan çok iklüzlenmiş miyofiberlerden oluşan postmitotik bir dokudur. Embriyonik miyogenez’e benzeyen ve yaş ve hastalıkta bozukluklar geçiren bir süreç olan olağanüstü bir yenilenme yeteneğine sahiptir1. İskelet kasının bu çarpıcı rejeneratif kapasitesi, sarkolemma ve miyofiberlerin bazal laminası arasındaki konumları nedeniyle uydu hücreleri olarak da adlandırılan kas kök hücrelerine (MÜSC) bağlıdır2,3. Dinlenme koşulları altında MÜSC’ler sessizdir ve transkripsiyon faktörü Pax7 ve Sprouty1 4 , 5,6,7,8gibi sessizlik işaretleyicilerinin ifadesi ile karakterize edilir. Etkinleştirme üzerine, örneğin, yaralanmadan sonra, MUSC’ler sessiz durumdan ayrılır ve miyojenik düzenleyici faktör MyoD9’uyükseltir. Pax7/MyoD çift pozitif MuSC’ler çoğalır ve farklılaşır, böylece genellikle miyoblastlar olarak da adlandırılan miyojenik öncül hücreler üretir. Bu mioblastlar daha sonra uzun miyositlere, moleküler ve morfolojik değişikliklere denk gelen bir sürece, örneğin Pax7 kaybına ve Myogenin ifadesinin yukarı doğru kontrol edilebilirliğine daha da farklılaşır10. Miyositler daha sonra birbirlerine veya mevcut miyoberlere kaynaşır ve böylece hasarlı dokuyu onarırlar. Daha da önemlisi, kas kök hücrelerinin küçük bir kısmı MyoD’un yukarı yönlülasyonunu geri döndürür ve kendi kendini yenileyebilir11. MuSC farklılaşması ve miyojenik ilerleme durumu Pax7, MyoD ve Myogenin10gibi miyojenik belirteçlerin araştırılmasıyla kolayca gözlemlenebilir.
Bitişik MuSC’leri ile tek miofiber kültürü, MuSC’ler endojen nişlerinde kaldıklarından, bir ex vivo ayarında MuSC işlevselliğini araştırmak için mükemmel bir yöntemdir12,13. MuSC’lerin davranışı, içsel sinyallerin yanı sıra, MüSC’leri ve miofiberin kendisini çevreleyen hücre dışı matrisin (ECM) bileşenlerini içeren özel bir anatomik konum olan niş tarafından sağlanan dışsal sinyallerle düzenlenir. Örneğin, MüSC sessizliğinin dışsal düzenleyicilerinden biri Notch sinyalidir. Burada, sinyal ipuçları hem myofiber hem de ECM14 , 15,16’dan MUSC’ler tarafından alınır. Dahası, MuSC niş, MüSC’lerin bölünme eksenini kontrol etmek için önemlidir, böylece MuSC kız hücrelerinin hücre kaderini düzenler17,18. Makul bir şekilde, asimetrik MuSC bölümleri, miyojenik ilerleme ve kendini yenileme gibi parametreler bu deneysel kurulumda benzersiz bir şekilde değerlendirilebilir. Örneğin, 72 saatlik bir kültür döneminden sonra bir MüSC’den kaynaklanan çok hücreli bir küme oluşabilir, bu da kendini yenileme, çoğalma ve daha da farklılaştırılmış MüSC 8 ,19,20,21gibi farklı miyojenik popülasyonların oluşumu ve yüzdesi için araştırılabilir. MüSC’lerin farklılaşma durumu Pax7, MyoD ve Myogenin’in ekspresyonu/birlikte ifadesi araştırılarak belirlenebilir. 72 saatlik kültürden sonra bir kümedeki hücreler aşağıdaki parametrelerle ayırt edilebilir: Pax7 yalnızca hücreler kendi kendini yenileyen MuSC’ler iken Pax7 / MyoD çift pozitif hücreler çoğalır / aktive olur MuSC’ler ve daha da farklılaştırılmış miyojenik hücreler Myogenin pozitif22. Ayrıca, MuSC numaraları veya hücre döngüsüne/aktivasyonuna yeniden giriş, miyojenik ilerlemeye ek olarak, örneğin yukarıda açıklanan parametrelere dayalı immünofluoresans bazlı analizler yoluyla araştırılabilir.
Burada, miofiber izolasyon ve kültür protokolünün benzersiz özellikleri, örneğin MüSC’nin nişi ile etkileşiminin korunması anlatılıyor. Fare bütün EDL (ekstansor digitorum longus) kasları dikkatlice parçalara ayırılır, kollajenaz tarafından sindirilir ve daha fazla kültür için ilişkili MuSC’leri ile tek miyofiber elde etmek için fiziksel olarak üçe katlanır. Ayrıca protokol, transgenik hayvanlara gerek kalmadan aday genlerin fonksiyonel analizleri ve ardışık immünofluoresans bazlı analizler için MüSC’leri siRNA ile dönüştürme adımlarını tanımlamamaktadır.
Burada, in vitro bir yaklaşım kullanarak belirli bir genin MuSC’lerdeki rolünü işlevsel olarak araştırmak için bir yöntem sunulmuştur. Daha da önemlisi, burada açıklanan sistemde, MUSC’lerin nişleriyle etkileşimlerinin çoğunu koruyarak mümkün olduğunca in vivo duruma benzeyen koşullarda MuSC’ler kültürlenir. Bu, izole edilmiş miofiberlerin yüzen koşullar ve ardışık siRNA transfeksiyonları altında bitişik MuSC’leri ile kült ederek gerçekleştirilir. İmmünofluoresans analizleri ile 72 saat kültür sırasında miyofiber izolasyon, siRNA transfeksiyonu ve MuSC popülasyonlarının araştırılması prosedürleri açıklanmaktadır. Ayrıca, tüm MuSC’lerin yaklaşık% 74’ünün 30 saat kültürden sonra floresan etiketli bir kontrol siRNA ile transkred olduğu gösterilmiştir.
Özellikle dikkat, EDL kasının dikkatli bir şekilde diseksiyonu üzerine odaklanmalıdır, çünkü geniş germe, sıkışma veya sıkma miyofiberlerin kasılmasına ve ardışık ölümüne yol açacaktır. Ayrıca, her koşul için çoğaltma başına en az 20 farklı miyofiberden MuSC kümelerini araştırmak önemlidir. MuSC sayıları ve özellikleri, MuSC alt nüfuslarının varlığı nedeniyle değiştiğinden, bu gereklidir. Yüzen miyofiber kültür yöntemini kullanarak belirli bir siRNA’nın MuSC’ler üzerindeki etkisi araştırılırken, durumun hedefleme siRNA ile hedefleme olmayan kontrol ile karşılaştırılması aynı fare ve kas içinde yapılmalıdır. Bu, siRNA’nın etkilerini kapsayabilecek veya güçlendirebilecek fareye özgü farklılıkları önlemek için önerilir. Nakavt verimliliği, bitişik MuSC’leri ile tek miyofiberler kullanılarak hedef genlere karşı yönlendirilen antikorlarla immünofluoresans analizleri ile belirlenebilir. Bu bir seçenek değilse, birincil mioblastlarda siRNA devirme verimliliğini ve ardından nicel RT-PCR veya immünoblot analizlerini test edebilirsiniz. SiRNA’nın MüSC’ler üzerindeki etkisini tek miyofiberler üzerinde analiz etmeden önce siRNA’nın verimliliği belirlenmelidir. Tek bir sineye karşı 4 farklı siRNA’dan oluşan akıllı havuzun kullanılması, nakavt verimliliğini artırırken, belirsiz hedefleme riskini de artırır. Hedeflemeyen bir siRNA kontrol olarak kullanılmalıdır. Transfection verimliliğini doğrudan izlemek için, burada gerçekleştirilen gibi floresan etiketli hedefsiz siRNA kullanılabilir. SiRNA ile transfection için zaman noktası, izolasyondan yaklaşık 4 saat sonra, MuSC’leri çevreleyen bazal laminanın siRNA için zaten geçirgen olduğu bir zaman noktasıdır. Belirli bir siRNA’nın 72 veya 96 saat sonra MuSC’ler üzerindeki etkisi araştırılırsa, yüksek nakavt verimliliğini korumak için 24 saat veya 48 saat sonra ikinci bir siRNA transfeksiyonu yapılması önerilir.
Myofiber kültür tahlilleri, geleneksel hücre kültürü yöntemleriyle MuSC’lerin araştırılmasına kıyasla çeşitli avantajlar sergiler. MüSC’ler tüm izolasyon sürecinde miofiberlere bağlı kalır, böylece MuSC’ninniş 19,23 ,24,25ile önemli etkileşimini korur. MuSC’lerin miofiber ile korunmuş etkileşimi, geleneksel 2D mioblast kültürlerinde yeniden ele alınamayan MuSC işlevselliği üzerindeki niş bağımlı etkileri incelemek için bir ön koşuldur. Örneğin, yaşlanma sırasında MUSC’ler bozuk miyojenik kapasiteyi gösterir ve hasar20,26’dansonra kas dokusunu yenilemek için daha az verimlilik sağlar. Bu bozukluk en azından kısmen MuSC nişindeki değişikliklere, özellikle ECM bileşimindeki değişikliklere atfedilebilir27,28. Miyofiber kültür protokolü, çalışmanın ve bu sapkın niş değişikliklere müdahaleye izin verir.
Burada açıklanan yöntemin aksine, MUSC’lerin immünoplabeling ve -sorti teknikleri ile saflaştırılması FACS (floresan aktif hücre sıralama) veya MACS (manyetik hücre sıralama) gibi MUSC’lerin nişlerinden uzaklaştırılmasını içerir. İlginçtir ki, yaşlı kaslardan izole edilmiş MüSC’lerin 2D kültürleri dışsal ipuçlarını kaybeder ve genç kaslardan izole edilen MuSC’lere benzer davranır, böylece in vivo durumu uygun şekilde yeniden yakalamaz29. Ayrıca, kas dokusunun tamamen ayrışması ve MuSC’lerin yüzey belirteçleri ile etiketlenmesi transkriptomik değişikliklere ve hücrelerin aktivasyonuna neden olur30,31,32. Miyofiber kültür sisteminin bir diğer avantajı, çeşitli seviyelerde MuSC işlevselliğine müdahale etme imkanıdır. MuSC’lerin kültürlü miyofiberler üzerindeki manipülasyonu, burada ayrıntılı olarak açıklandığı gibi siRNA aracılı gen devrilmesi ile etkili bir şekilde elde edilebilir. Aynı şekilde, kimyasal bileşiklerin uygulanması veya rekombinant proteinlerin teslimi kök hücre yollarına müdahale etmek için çok etkilidir20,28. Ayrıca, retro veya lentiviral ekspresyon vektörleri eksojen genlerin, yani konsitatif aktif mutantların tanıtılmasına izin eder33. Ek olarak, dışsal faktörlerin MuSC işlevselliği üzerindeki etkisi burada açıklanan sistemde araştırılabilir, örneğin, kültür koşulları kanser cachexia34 , 35gibi farklı durumları modellemek için farklı fizyolojik veya patolojik kaynaklardan gelen üstünlüklerle desteklenebilir.
Burada açıklanan yöntemin bir sınırlaması, tek miyofiber kültür sisteminin tüm sistemik faktörlerin veya diğer hücre türlerinin MuSC’ler üzerindeki etkisini tamamen nüksedemeyeceği gerçeğidir. Ayrıca, miyoberlerin kültürde canlı tutulabileceği süre sınırlıdır ve bu nedenle MuSC ile ilgili süreçlerin incelenmesi aktivasyon ve miyojenik bağlılık gibi erken olaylara odaklanmaktadır. Ayrıca, bağışıklık hücreleri veya fibro-adipojenik progenitör hücreler gibi diğer niş hücrelerle MuSC etkileşiminin araştırılması mümkün değildir. MuSC işlevselliği üzerindeki sistemik etkileri araştırmak için, kas yaralanması deneylerini ve ardından kas yenilenmesinin analizini in vivo yapabilir veya transplantasyon deneyleriyapabilirsiniz 36,37.
Birlikte ele alındığında, miyofiber izolasyon ve kültür protokolü, transgenik fare modellerine ihtiyaç kalmadan yetişkin MüSC’ler üzerinde genetik veya mekanistik çalışmalar için büyük bir fırsat sağlar ve potansiyel olarak hayvan deneylerini azaltabilir.
The authors have nothing to disclose.
Christine Poser ve Christina Picker’a mükemmel teknik yardım ve makalenin eleştirel okuması için teşekkür ederiz. Bu çalışma Deutsche Forschungsgemeinschaft’tan JvM’ye (MA-3975/2-1), Carl Zeiss vakfına ve Deutsche Krebshilfe’ye (DKH-JvM-861005) verilen bir hibe ile desteklendi.
Alexa Fluor 488 goat anti-rabbit IgG 2b | ThermoScientific | A-21141 | use 1:1000 for IF |
Alexa Fluor 546 goat anti-mouse IgG1 | ThermoScientific | A-21123 | use 1:1000 for IF |
chicken embryo extract | Seralab | CE-650-J | chicken embryo extract containing growth factors etc. |
collagenase type 1 | Sigma | C0130 | |
DMEM (Dulbecco’s modified Eagle’s medium with 4.5 g/l glucose and sodium pyruvate) | GibCo | 41966029 | cell culture medium |
fetal bovine serum | Gibco | 10270-106 | fetal bovine serum |
horse serum | Gibco | 26050-088 | |
Lipofectamine RNAiMax | ThermoScientific | 13778150 | transfection reagent |
MyoD antibody clone G-1 | Santa Cruz | sc-377460 | dilute 1:200 for IF |
Pax7 antibody | DSHB | PAX7 | use undiluted |
siGLO Red Transfection Indicator | horizon discovery | D-001630-02-05 | non targeting siRNA |