В этом протоколе описан метод культивирования и функционального анализа мышечных стволовых клеток in vitro, который сохраняет большую часть их взаимодействий с их эндогенной нишей.
Взрослая скелетная мышечная ткань содержит популяцию стволовых клеток, которая необходима для ее способности к регенерации. При повреждении мышц мышечные стволовые клетки выходят из состояния покоя и активируют миогенную программу, что в конечном итоге приводит к восстановлению поврежденных тканей, сопутствующему пополнению пула мышечных стволовых клеток. Различные факторы влияют на активность мышечных стволовых клеток, среди них внутренние стимулы, а также сигналы из прямой среды мышечных стволовых клеток, ниши стволовых клеток. Выделение и культивирование одиночных миофиберов с связанными с ними мышечными стволовыми клетками сохраняет большую часть взаимодействия стволовой клетки с ее нишей и, следовательно, является ближайшей возможностью для изучения функциональности мышечных стволовых клеток ex vivo. Здесь представлен протокол выделения, культивирования, трансфекции siRNA и иммуноокрашивания мышечных стволовых клеток на их соответствующих миофибрах из мышц мыши EDL(extensor digitorum longus). Экспериментальные условия, изложенные здесь, позволяют изучать и манипулировать мышечными стволовыми клетками ex vivo, включая исследование миогенной активности без врожденной необходимости в экспериментах in vivo на животных.
Скелетные мышцы у взрослых представляют собой постмитотическую ткань, в основном состоящую из многоядерных миофиберов, которые являются эффекторными клетками для произвольных движений. Он обладает замечательной способностью к регенерации, процесс, который напоминает эмбриональный миогенез и подвергается нарушениям в возрасте и болезни1. Эта поразительная регенеративная способность скелетных мышц зависит от мышечных стволовых клеток (MuSCs), которые также называются сателлитными клетками из-за их расположения между сарколеммой и базальной пластинкой миофиберов2,3. В условиях покоя MUSC находятся в состоянии покоя и характеризуются экспрессией транскрипционного фактора Pax7 и маркерами покоя, такими как Sprouty14,5,6,7,8. При активации, например, после травмы, MuSC покидают состояние покоя и повышают миогенный регуляторный фактор MyoD9. Двойные положительные MuSC Pax7/MyoD пролиферируют и дифференцируются, тем самым генерируя миогенные клетки-предшественники, которые также часто называют миобластами. Затем эти миобласты далее дифференцируются в удлиненные миоциты, процесс, совпадающий с молекулярными и морфологическими изменениями, например, потерей Pax7 и повышением регуляции экспрессии миогенина10. Затем миоциты в конечном итоге сливаются друг с другом или с существующими миофибрами, тем самым восстанавливая поврежденную ткань. Важно отметить, что небольшая часть мышечных стволовых клеток возвращает повышение регуляции MyoD и способна самообновляться11. Состояние дифференцировки MuSC и миогенной прогрессии можно легко наблюдать при исследовании миогенных маркеров, таких как Pax7, MyoD и Миогенин10.
Культура одиночных миофиберов с их смежными MuSC является отличным методом для исследования функциональности MuSC в условиях ex vivo, поскольку MuSC остаются в своей эндогенной нише12,13. Поведение MuSC регулируется внутренними сигналами, а также внешними сигналами, предоставляемыми нишей, специализированным анатомическим местом, включающим компоненты внеклеточного матрикса (ECM), окружающего MuSC, и само миофибра. Например, одним из внешних регуляторов покоя MuSC является сигнализация Notch. Здесь сигнальные сигналы принимаются MuSC как от миофибра, так и от ECM14,15,16. Кроме того, ниша MuSC важна для управления осью деления MuSC, тем самым регулируя судьбу дочерних клеток MuSC17,18. Разумно, что такие параметры, как асимметричные деления MuSC, миогенная прогрессия и самообновление, могут быть однозначно оценены в этой экспериментальной установке. Например, многоклеточный кластер может образовываться из одного MuSC после 72-часового периода культивирования, который может быть исследован на предмет возникновения и процента различных миогенных популяций, таких как самообновляющиеся, пролиферирующие и далее дифференцированные MuSC8,19,20,21. Состояние дифференцировки MuSC может быть определено путем исследования экспрессии/коэкспрессии Pax7, MyoD и миогенина. После 72 ч культуры клетки в кластере могут быть дискриминированы по следующим параметрам: только клетки Pax7 являются самообновляющимися MuSC, в то время как Pax7 / MyoD двойные положительные клетки пролиферируют / активируют MuSC, а дальнейшие дифференцированные миогенные клетки являютсямиогенин-положительными 22. Кроме того, числа MuSC или повторное вхождение в клеточный цикл/активация могут быть исследованы в дополнение к миогенной прогрессии, например, с помощью иммунофлуоресцентного анализа на основе параметров, описанных выше.
Здесь описаны уникальные особенности протокола выделения и культивирования миофибры, например, сохранение взаимодействия MuSC с его нишей. Мышиные целые мышцы EDL(extensor digitorum longus)тщательно рассекаются, перевариваются коллагеназой и физически тритурируются для получения одиночных миофиберов с их ассоциированными MuSC для дальнейшего культивирования. Кроме того, протокол разграничивает шаги по трансфекции MuSC с siRNA для функционального анализа генов-кандидатов и последовательных анализов на основе иммунофлуоресценции без необходимости трансгенных животных.
Здесь представлен метод функционального исследования роли конкретного гена в MuSC с использованием подхода in vitro. Важно отметить, что в описанной здесь системе MuSC культивируются в условиях, которые максимально напоминают ситуацию in vivo, сохраняя большую часть взаимодействий MuSC со своей нишей. Это достигается путем культивирования изолированных миофибров с прилегающими к ним MuSC в плавающих условиях и последовательной трансфекции siRNA. Описаны процедуры выделения миофибры, трансфекции siRNA и исследования популяций MuSC в течение 72 ч культуры с помощью иммунофлуоресцентного анализа. Кроме того, было продемонстрировано, что около 74% всех MuSC были трансфектированы флуоресцентно меченой контрольной siRNA после 30 ч культуры.
Особое внимание следует сосредоточить на тщательном рассечении мышцы EDL, так как обширное растяжение, защемление или сдавливание приведет к сокращению и последовательной гибели миофибров. Кроме того, важно исследовать кластеры MuSC по крайней мере из 20 различных миофиберов на реплику для каждого условия. Это необходимо, поскольку числа и свойства MuSC варьируются из-за существования субпопуляций MuSC. При исследовании влияния специфической siRNA на MuSC с использованием метода плавающей культуры миофибры сравнение состояния с нацеливающей siRNA на нецелевой контроль должно проводиться в пределах одной мыши и мышцы. Это рекомендуется, чтобы избежать специфических для мышей различий, которые могут покрывать или усиливать эффекты siRNA. Эффективность нокдауна может быть определена иммунофлуоресцентным анализом с антителами, направленными против гена-мишени, с использованием одиночных миофиберов с прилегающими к ним MuSC. Если это не вариант, можно проверить эффективность нокдауна siRNA в первичных миобластах с последующим количественным анализом ОТ-ПЦР или иммуноблота. Эффективность siRNA должна быть определена до анализа влияния siRNA на MuSC на одиночные миофибры. Использование интеллектуального пула, состоящего из 4 различных siRNAs по сравнению с одним, увеличивает эффективность нокдауна, но также увеличивает риск неспецифического таргетинга. В качестве контроля следует использовать нецелевую siRNA. Для непосредственного мониторинга эффективности трансфекции можно использовать флуоресцентно меченую нецелевую siRNA, как это выполнено здесь. Временная точка для трансфекции с siRNA составляет около 4 часов после выделения, точка времени, когда базальная пластина, окружающая MuSC, уже проницаема для siRNA. Если следует исследовать влияние специфической siRNA на MuSCs после 72 или 96 ч, рекомендуется выполнять вторую трансфекцию siRNA через 24 ч или 48 ч для поддержания высокой эффективности нокдауна.
Анализ культуры миофибры демонстрирует различные преимущества по сравнению с исследованием MuSC обычными методами культивирования клеток. MuSC остаются привязанными к миофибрам в течение всего процесса изоляции, тем самым сохраняя решающее взаимодействие MuSC с его нишей19,23,24,25. Сохраненное взаимодействие MuSC с миофиброй является предпосылкой для изучения нишевых зависимых эффектов на функциональность MuSC, которые не могут быть повторены в обычных 2D-культурах миобластов. Например, во время старения MuSCs проявляют нарушенную миогенную способность, что приводит к снижению эффективности регенерации мышечной ткани после повреждения20,26. Это обесценение, по меньшей мере, частично связано с изменениями в нише MuSC, в частности изменениями в составеECM 27,28. Протокол культивирования миофибр позволяет изучать и вмешиваться в эти аберрантные изменения ниши.
В отличие от метода, описанного здесь, очистка MuSC методами иммуномаркировки и сортировки, такими как FACS (флуоресцентная активированная сортировка клеток) или MACS (магнитная сортировка клеток), включает удаление MuSC из их ниши. Интересно, что 2D-культуры изолированных MuSC из старых мышц теряют свои внешние сигналы и ведут себя аналогично MuSC, изолированным от молодых мышц, тем самым не повторяя ситуацию in vivo соответствующим образом29. Кроме того, полная диссоциация мышечной ткани и маркировка MuSC поверхностными маркерами приводит к транскриптомным изменениям и активации клеток30,31,32. Еще одним преимуществом системы культивирования миофибры является возможность вмешательства в функциональность MuSC на различных уровнях. Манипуляции с MuSC на культивируемых миофибрах могут быть эффективно достигнуты путем нокдауна гена, опосредованного siRNA, как подробно описано здесь. Аналогичным образом, применение химических соединений или доставка рекомбинантных белков очень эффективны для вмешательства в пути стволовых клеток20,28. Кроме того, ретро- или лентивирусные векторы экспрессии позволяют вводить экзогенные гены, т.е. конститутивные активные мутанты33. Кроме того, влияние внешних факторов на функциональность MuSC может быть изучено в системе, описанной здесь, например, условия культивирования могут быть дополнены супернатантом из различных физиологических или патологических источников для моделирования различных состояний, таких какраковая кахексия 34,35.
Одним из ограничений метода, описанного здесь, является тот факт, что единая система культивирования миофибры не может полностью повторить влияние всех системных факторов или влияние других типов клеток на MuSC. Кроме того, время, в течение которого миофибры могут поддерживаться жизнеспособными в культуре, ограничено, и поэтому изучение процессов, связанных с MuSC, фокусируется на ранних событиях, таких как активация и миогенная приверженность. Кроме того, исследование взаимодействия MuSC с другими нишевыми клетками, такими как иммунные клетки или фибро-адипогенные клетки-предшественники, невозможно. Для исследования системного влияния на функциональность MuSC можно либо выполнить эксперименты по повреждению мышц с последующим анализом регенерации мышц in vivo, либо выполнить эксперименты по трансплантации36,37.
Взятый вместе, протокол выделения и культивирования миофибры предоставляет большие возможности для генетических или механистических исследований на взрослых MuSC без требования трансгенных моделей мышей и потенциально может уменьшить эксперименты на животных.
The authors have nothing to disclose.
Мы благодарим Кристину Позер и Кристину Пикер за отличную техническую помощь и критическое прочтение рукописи. Эта работа была поддержана грантом Deutsche Forschungsgemeinschaft JvM (MA-3975/2-1), фонда Carl Zeiss и Deutsche Krebshilfe (DKH-JvM-861005).
Alexa Fluor 488 goat anti-rabbit IgG 2b | ThermoScientific | A-21141 | use 1:1000 for IF |
Alexa Fluor 546 goat anti-mouse IgG1 | ThermoScientific | A-21123 | use 1:1000 for IF |
chicken embryo extract | Seralab | CE-650-J | chicken embryo extract containing growth factors etc. |
collagenase type 1 | Sigma | C0130 | |
DMEM (Dulbecco’s modified Eagle’s medium with 4.5 g/l glucose and sodium pyruvate) | GibCo | 41966029 | cell culture medium |
fetal bovine serum | Gibco | 10270-106 | fetal bovine serum |
horse serum | Gibco | 26050-088 | |
Lipofectamine RNAiMax | ThermoScientific | 13778150 | transfection reagent |
MyoD antibody clone G-1 | Santa Cruz | sc-377460 | dilute 1:200 for IF |
Pax7 antibody | DSHB | PAX7 | use undiluted |
siGLO Red Transfection Indicator | horizon discovery | D-001630-02-05 | non targeting siRNA |