Bu sinyalleme yolunda yer alan protein ve gen ekspresyonlarını inceleyerek TGF-β sinyallerini ve TGF-β kaynaklı EMT’yi araştırmak için sistematik bir iş akışı tanımlıyoruz. Yöntemler arasında Batı şişkinliği, luciferaz muhabiri tahlili, qPCR ve immünoresans lekeleme saydır.
Büyüme faktörü β (TGF-β) dönüştürmek, hücreler arası iletişimde kilit rol oynayan gizli çok işlevli bir faktördür. TGF-β sinyallerinin pertürbasyonları meme kanserine yol açabilir. TGF-β, spesifik hücre yüzeyi TGF-β tip I ve tip II reseptörleri (tβRI ve TβRII) ile içsel serine/threonine kinaz etki alanı içeren çoğalma ve farklılaşma üzerindeki etkilerini ortaya çıkarır. TGF-β kaynaklı heteromerik kompleks oluşumu üzerine, aktif TβRI fosforilasyon SMAD2 ve SMAD3 ile hücre içi sinyal ortaya çıkarır. Bu aktif SMAD’ler, plazminojen aktivasyon inhibitörü 1 (SERPINE1 geni tarafından kodlanan PAI-1) dahil olmak üzere belirli hedef genleri düzenlemek için SMAD4 ile heteromerik kompleksler oluşturur. Epitelden mezenkimal geçişe (EMT) indüksiyon, epitel kanseri hücrelerinin birincil bölgede veya uzak bölgelerde kolonizasyon sırasında invaziv bir fenotip kazanmasını ve tümörün ilerlemesini sağlamasını sağlar. TGF-β EMT kullanarak meme kanseri invazyonunun güçlü bir indükleyicisi olarak hareket eder. Burada, TGF-β sinyallerini ve EMT yanıtlarını premalign insan MCF10A-RAS (M2) hücrelerini ve fare NMuMG epitel hücrelerini kullanarak araştırmak için sistematik yöntemleri örnek olarak açıklıyoruz. Batı şişkinliği ile TGF-β kaynaklı SMAD2 fosforilasyonunu, luciferaz muhabir aktivitesini kullanarak SMAD3/SMAD4 bağımlı transkripsiyon aktivitesini ve serpine1 hedef gen ekspresyonunu nicel gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (qRT-PCR) ile belirleme yöntemlerini açıklıyoruz. Ayrıca morfoloji, epitel ve mezenkimal belirteç ekspresyişi, filamentli aksin lekelenmesi ve E-cadherin immünoresans lekelenmesindeki değişiklikler ölçülerek TGF-β kaynaklı EMT’nin incelenmesi için yöntemler açıklanmaktadır. TGF-β kaynaklı SMAD2 fosforilasyon, hedef genler ve EMT belirteç ifadesindeki değişiklikleri engellemek için GW788388 ve SB431542 olmak üzere iki seçici küçük molekül TGF-β reseptör kinaz inhibitörü kullanıldı. Ayrıca mezenkimal meme Py2T murine epitel tümör hücrelerinin adipositlere transdifferentiasyonunu tarif ediyoruz. Meme kanserinde TGF-β kaynaklı sinyalizasyon ve EMT’yi inceleme yöntemleri meme kanseri için yeni terapötik yaklaşımlara katkıda bulunabilir.
Sitokin dönüşüm büyüme faktörü-β (TGF-β), TGF-βs (örneğin, TGF-β1, -β2 ve -β3), kemik morfojenik proteinler (BMP’ler) ve aktivinler1,2dahil olmak üzere yapısal ve işlevsel olarak ilgili düzenleyici polipeptidlerden oluşan geniş bir grubun prototipidir. Bu sitokinlerin hepsi embriyonik gelişimde ve doku ve organ homeostazlarının korunmasında önemli roller oynar3. TGF-β yanlış yönlendirilebilirliği, kanser4,5dahil olmak üzere çok çeşitlihastalıklarayol açabilir. TGF-β kanserin ilerlemesinde karmaşık, ikili bir rol oynar: normal ve premalign epitel hücrelerinde, TGF-β çoğalma inhibe ederek ve apoptoz6,7’yiindükleerek tümör baskılayıcı olarak davranır; bununla birlikte, tümör ilerlemesinin geç evresinde, onkogenlerin aktivasyonu veya tümör baskılayıcı genlerin kaybı ile sitostatik yanıtlar engellendiğinde, TGF-β kanser hücrelerinde epitelden mezenkimal geçişi (EMT) teşvik ederek tümör arttırıcı görevi görür, böylece kanser hücre invazyonunu ve metastazını mümkün kılar, tümör mikroçevreslerindeki hücrelere etki eder ve anjiogenez ve immün kaçamak8,9,10’uuyarır.
TGF-β olgun karboksi terminal TGF-β ve gecikme ile ilişkili peptit (LAP)11içeren inaktif bir öncü molekül olarak salgılanır. Bu küçük kompleks, gizli TGF-β bağlayıcı protein (LTBP)12ile birlikte bağlanabilir. Olgun TGF-β salınımı, LAP’yi ikiye ayıran spesifik proteazların etkisi veya LAP’nin integrin bağımlı bir işlemde mekanik olarak çekilmesi ile aracılık edilebilir13,14. LTBP’ye ek olarak, Glikoprotein A tekrarları baskın (GARP), düzenleyici T hücrelerinin (Tregs) yüzeyinde yüksek oranda ifade edilir ve TGF-β15,16aktivasyonunun düzenlenmesinde LTBP ile benzer bir rol oynar. GARP, disülfid bağlantı ve uyumsuz ilişki yoluyla doğrudan gizli TGF-β bağlanır. GARP/TGF-β kompleksinden TGF-β aktivasyonu17entegre gerektirir. Olgun TGF-β, sinyalizasyon başlatmak için TGF-β serine/threonine kinaz reseptörlerine, yani TGF-β tip I (TβRI) ve TGF-β tip II (TβRII) reseptörlerinebağlanır. TGF-β TβRII’ye bağlanması, TβRI’nin işe alınmasını ve heteromerik bir kompleksin oluşumunu teşvik eder. Daha sonra, TβRI kısa bir glisine ve serine bakımından zengin (GS) motifinde serine ve threonine kalıntıları üzerinde TβRII kinaz tarafından fosforillenir ve aktivasyonu19,20. Aktivasyondan sonra, aktif TβRI alt tabakalarını işe toplar ve fosforilasyonlar: SMAD2 ve SMAD3(Şekil 1)içeren iki reseptöre özgü SMAD (R-SMAD). R-SMAD’ler, proline bakımından zengin bir bağlayıcı bölgeyle ayrılan mad homology etki alanları MH1 ve MH2 ile benzer bir genel yapıyı paylaşırlar (Şekil 2). SMAD3’ün MH1 etki alanındaki DNA bağlama motifi SMAD2 ve SMAD3 arasında korunmuyor ve SMAD2, MH1 etki alanındaki iki ekleme nedeniyle (ekson 3 ve L1) DNA’yı doğrudan bağlayamıyor. SMAD2 ve SMAD3, C-terminilerinde SSXS motifinin fosforilasyonu ile aktive edilebilir (Şekil 2). Fosforilasyonlu SMAD2/3, hedef genlerin transkripsiyonunu modüle etmek için çekirdeğe geçen ortak bir SMAD aracı olan SMAD4 ile heteromerik kompleksler oluşturur (Şekil 1)7,21. Bu kurallı SMAD sinyal yolu hassas bir şekilde düzenlenir ve hücre kaderinin düzenlenmesi ve tümör hücre metastazı ve istilası22gibi spesifik hücresel ve doku yanıtları üretir. TGF-β-SMAD sinyaline ek olarak, SMAD olmayan sinyal yolları da aşağı akış hücresel yanıtlarını düzenlemek için reseptörler tarafından doğrudan etkinleştirilebilir23.
Tümör ilerlemesi sırasında EMT’nin indüksiyonu için TGF-β kaynaklı SMAD’ye bağımlı ve SMAD’den bağımsız yolların aktivasyonuna ihtiyaç vardır. EMT, tümör hücrelerinin hücre-hücre kontaktlarının kaybı ve apik-bazal polaritenin azalmasıyla ilişkili bir epitel fenotipten, gelişmiş hareketlilik ve istila yeteneğine sahip mezenkimal fenotipe adanmış geri dönüşümlü bir süreçtir24. EMT, N-cadherin, vimentin, Zeb2 ve Salyangoz1/2 dahil olmak üzere mezenkimal belirteç proteinlerinin artan ekspresyasyonu ve E-cadherin ve β-catenin (Şekil 3)25gibi epitel belirteçlerinin eşlik eden downregülasyonu ile karakterizedir. Bununla birlikte, bir epitelden mezenkimal duruma geçiş genellikle eksiktir ve hücreler karışık epitel ve mezenkimal (E/M) özellikler kazanır. Uluslararası EMT derneğinin yakın tarihli bir makalesi, ara E/M fenotipik durumlara maruz kalan hücrelerin sürecini epitel-mezenkimal plastisite (EMP)26olarak tanımlamayı önermektedir. Bu plastisite kısmi EMT, hibrit E/ M durumu, metastable EMT durumu, EMT sürekliliği ve EMT spektrumu26anlamına gelir. EMT sırasında tümör hücreleri kanser kök hücre (CSC) özellikleri kazanır ve dekupsiyon kaynaklı apoptoz27’yekarşı daha dirençli hale gelir. EMT primer tümör hücrelerinde invaziv bir fenotipin kazanılmasından sorumlu olmakla birlikte ve kanserin ilerlemesini sağlarken, buna karşılık mezenkimal-epitel geçişinin (MET) uzak metastatik bölgelerde yayılan tümör hücrelerinin büyümesinde önemli bir rol oynadığı gösterilmiştir28,29. Yeni bir çalışma, EMT türevi meme kanseri hücrelerinin adipozitlere dönüştürülebileceğini göstermiştir, bu da metastazı inhibe etme ve tümör hücrelerinde tedavi direncinin üstesinden gelme fırsatı sunabilir ve kanserin nüksetme30. Meme karsinogenezinde EMT’nin aktivasyonunda TGF-β sinyalinin önemli rolü nedeniyle, Batı şişkinliği için ayrıntılı protokoller sunuyoruz, luciferaz transkripsiyonel muhabir tahlili, nicel gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (qRT-PCR) ve TGF-β sinyalizasyonunun araştırılması için immünofluoresans, TGF-β kaynaklı EMT ve EMT türevi murin meme epitel tümör hücrelerinin adipositlere transdifferentiasyonu. Bu teknikler hücre biyolojisi alanında en sık kullanılan analitik araçlardır. qRT-PCR, mRNA ifade düzeylerini nicel bir şekilde tespit etmek, karakterize etmek ve ölçmek için kullanılır. Alternatif bir teknik olan nicel PCR (qPCR) ile karşılaştırıldığında, mRNA ekspresyonunu yarı nicel bir şekilde belirlemek için ters transkripsiyon (RT)-PCR kullanılabilir31,32. Batı şişkinliği, belirli bir hücre lisat örneğindeki belirli protein seviyelerini duyarlılık ve özgüllük avantajlarıyla yarı nicel bir şekilde incelemek için kullanılır. Bu nedenle, diğer sinyal yollarına da uygulanabilecek TGF-β sinyallerini araştırmaya yardımcı olmak için gen ekspresyonundan protein ekspresyona kadar değişiklikleri analiz etmek için sistematik bir iş akışı sunuyoruz.
TGF-β/SMAD sinyalizasyonu meme kanserinin ilerlemesinde önemli bir rol oynar, çünkü EMT7’yiindükleerek meme kanseri hücre invazivliğini ve metastazını teşvik edebilir. Burada, reseptör kaynaklı SMAD aktivasyonundan SMAD aracılı transkripsiyonal ve biyolojik yanıtlara kadar TGF-β başlatılan sinyali araştırmak için mantıklı bir iş akışı tanımladık. SMAD2 fosforilasyon analizini tanımlayarak başladık, TGF-β/SMAD sinyal yanıtını analiz etmek için hem gen hem de protein seviyelerinde TGF-β kaynaklı SMAD3 bağımlı transkripsiyonal yanıtlar ve EMT işaretleyici ekspresyonu ile devam ettik ve son olarak TGF-β kaynaklı EMT’yi inceledik. TGF-β/SMAD sinyal yolu35’inaktivitesini izlemek için PAI-1 promotöründen türetilen CAGA kutularını içeren CAGA 12 -luciferase transkripsiyon muhabirini kullandık. Bu muhabir yapısı etkinleştirme için SMAD3 ve SMAD4 gerektirir. Önceki çalışmalar, SMAD4’ün devrilmesinin TGF-β kaynaklı CAGA12-luciferaz aktivitesini zayıfladığını göstermiştir37. Muhabir testine ek olarak, SMAD2 ve SMAD3 de dahil olmak üzere endojen SMAD’lerin fosforilasyon durumunu belirlemek, TGF-β sinyal yanıtını araştırmanın bir başka yoludur. Gerçekten de, büyüme ve farklılaşma faktörü (GDF)-8/myostatin ve GDF-9 gibi TGF-β ailesinin diğer üyeleri de TβRI 42,43,44’ü devreye alarak SMAD2/3 proteinleri aracılığıyla sinyalleriaktarır. CAGA12-luciferase muhabirine ek olarak, TGF-β sinyalinin aktivasyonunu tespit etmek için benzer birkaç muhabir kullanılmıştır. Örneğin, JunB promotöründen türetilen yanıt öğelerine sahip transkripsiyonal (SBE)4-Lux muhabiri, TGF-β, aktivatörler ve BMP’ler45tarafından verimli bir şekilde indüklenebilir.
Epitel belirteçlerinin (yani E-cadherin) ve mezenkimal belirteçlerin (örneğin, N-cadherin, Salyangoz, Sümüklüböcek ve Zeb2) ekspresyonunu araştırmak için klasik yöntemler olan TGF-β kaynaklı EMT’yi analiz etmek için Batı şişkinliği ve qPCR kullanılmıştır. Ayrıca E-cadherin dolaylı immünofluoresans boyama ve F-actin doğrudan floresan boyama gerçekleştirdik. Bu tahliller TGF-β tedavisinden sonra hücrelerin mezenkimal fenotipini daha da doğrulamıştır. İmmünofluoresans lekelemenin sınırlaması, hücrelerin antikorlar ve görüntüleme ile inkübasyondan önce düzeltilmesi gerektiğidir ve canlı hücrelerde EMT belirteç ifadesindeki değişiklikleri araştırmak zordur. Son zamanlarda, A549 akciğer adenokarsinom-vimentin-RFP gibi EMT muhabir hücre hatlarının tasarımı, kırmızı floresan protein (RFP) etiketli vimentin ifadesiyle epitel hücrelerinin mezenkimal hücrelere dönüşümünü gerçek zamanlı olarak izlemeyi mümkün klas hale getirmiştir. Bu platform ilaç taraması ve yeni ilaç geliştirme için kullanılabilir46. Canlı hücrelerde F-actin yapılarını lekeleyebilen 17 amino asitli bir peptit olan LifeAct boyası, hücresel işlemlere müdahale etmeden aktin sitoskeleton’u gerçek zamanlı olarak görselleştirmek için değerli bir araç haline geliyor47. Bu çalışmada, TGF-β sinyalizasyon ve TGF-β kaynaklı EMT üzerindeki inhibitör etkilerini doğrulamak için SB431542 ve GW788388 olmak üzere iki küçük molekül inhibitörü kullandık. Özellikle GW788388, TβRI ve TβRII aktivitesini güçlü bir şekilde inhibe ederken, SB431542 sadece TβRI (ve ALK4 ve ALK7) üzerinde inhibitör bir etkiye sahiptir. Önceki çalışmalar GW788388’in SB43154240’tandaha güçlü olduğunu ortaya koydu. EMT inhibisyona ek olarak, GW788388 böbrekte fibrozis belirteçlerinin ekspresyonunu azalttı ve diyabetik farelerde GW788388’in oral olarak verilmesi glomerülopatiyi belirgin şekilde azalttı25,48.
EMT, kanser hücre plastisitesini teşvik etmede önemli bir rol oynar ve ilaç direnci ve metastaz ile sonuçlanır 49. Bu nedenle, EMT türevi hücrelerin spesifik sitotoksik ilaçlar50 ile hedeflenmesi veya mezenkimal-epitel geçişi (MET)51 yoluyla redifferentiation indüklenmesi kanser hücre metastazı ve tedavi direncinin üstesinden gelmek için bir yaklaşım olarak önerilmiştir. Bununla birlikte, MET uzak organlarda yayılan kanser hücrelerinin çoğalmasına katkıda bulunur52EMT’nin terapötik geri dönüşümlerini kullanırken ters tepebilir. Son zamanlarda, yeni bir çalışma emt türevli meme kanseri hücrelerini doğrudan adipositlere farklılaşmak için hedef alarak terapötik bir transdifferentiation yaklaşımı bildirdi30. Ishay-Ronen et tarafından yapılan çalışma. al.30, TGF-β ile uzun süreli tedaviye yanıt olarak mezenkimal hücrelere geçiş geçiren Py2T murine epitel kanser hücrelerini kullandı. Rosiglitazone’un MEK inhibitörleri ile birlikte epitel farklılaşması ve adipogenezini geliştirdiğini gösterdiler. Bununla birlikte, rosiglitazone’un tek başına mezenkimal Py2T murine hücrelerinin adipositlere transdifferentiasyonunu teşvik etmek için yeterli olduğunu bulduk.
Özetle, bu çalışmada kullanılan yöntemler TGF-β sinyalizasyon ve TGF-β kaynaklı EMT’yi araştırmak için mantıklı bir iş akışı sağlamıştır. İki inhibitör, SB431542 ve GW788388, TGF-β kaynaklı yanıtları ve EMT’yi engelleyebilir. Ek olarak, rosiglitazone’un tek başına bazı TGF-β kaynaklı mezenkimal meme kanseri hücrelerinde adipogenez indüklese neden olduğunu da gösterdik. TGF-β yanıtlarını araştırmak için sadece birkaç meme kanseri hücre hattı kullanmamıza rağmen, burada açıklanan yöntemler diğer (kanser) hücrelere tahmin edilebilir. Burada, hücresel yanıtları teşvik etmek için çeşitli TGF-β konsantrasyonları kullandık. Çoğu hücre tipinde, TGF-β biyolojik aktivitesini 0.01-10 ng/mL53 konsantrasyon aralığında uygular ve bir doz-yanıt deseninde sinyalizasyona neden olur. Sığır aort endotel hücreleri de dahil olmak üzere birincil endotel hücrelerinde, TGF-β fosforillenmiş SMAD2’nin önemli ekspresyonunun 0.025 ng/mL’de indüklendiğini, maksimum 0.25 ng/mL’ye ulaştığını ve daha yüksek konsantrasyonlara yanıt olarak bu seviyede kaldığını53. Çalışmamızda, güçlü yanıtlar elde etmek için transkripsiyonal muhabir tahlili için MCF10A-Ras hücrelerinde yüksek konsantrasyonda TGF-β (5 ng/mL) kullandık. SMAD2 fosforilasyon ve hedef gen ekspresyasyonu TGF-β tarafından düşük dozda indüklenebilir; böylece hücreleri tedavi etmek için 2,5 ng/mL TGF-β kullandık. Bununla birlikte, en uygun çalışma konsantrasyonu hücre tipine ve tahmini etkilere bağlıdır. TGF-β en iyi konsantrasyonunu belirlemek için, hücrelerin farklı dozlarda (düşükten yükseğe) tedavi etmesi önerilir.
The authors have nothing to disclose.
Çin Burs Konseyi’nin (CSC) J.Z. ve Kanser Genomik Merkezi Hollanda’ya (CGC) desteğini kabul ediyoruz. NL) P.t.D.’ye.
Reagent | |||
18 mm-side square glass coverslips | Menzel Gläser | 631-1331 | |
4′,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) | Vector Laboratories | H-1200 | |
Alexa Fluor 488 Phalloidin | Thermo Fisher Scientific | A12379 | |
Alexa Fluor 555 secondary antibody | Thermo Fisher Scientific | A-21422 | |
Anti-E-cadherin antibody | BD Biosciences | 610181 | |
anti-glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase(GAPDH) antibody | Merck Millipore | MAB374 | |
Anti-N-cadherin antibody | BD Biosciences | 610920 | |
Anti-Slug antibody | Cell Signaling Technology | 9585 | |
anti-SMAD2/3 antibody | Becton Dickinson | 610842 | |
Anti-Snail antibody | Cell Signaling Technology | 3879 | |
Anti-Tubulin antibody | Cell Signaling Technology | 2148 | |
Bovine Serum Albumin | Sigma-Aldrich | A2058 | |
Cholera enterotoxin | Sigma-Aldrich | C8052 | |
Clarity Western ECL Substrate | Bio-Rad | 1705060 | |
DC protein assay kit | Bio-Rad | 5000111 | |
DMEM-high glucose | Thermo Fisher Scientific | 11965092 | |
DMEM-high glucose medium | Thermo Fisher Scientific | 11965092 | |
Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM)/F12 | Thermo Fisher Scientific | 11039047 | |
epidermal growth factor (EGF) | Merck Millipore | 01-107 | |
Fetal bovine serum (FBS) | BioWest | S1860-500 | |
GoTaq qPCR Master Mix | PROMEGA | A600X | |
Horse serum | Thermo Fisher Scientific | 26050088 | |
Hydrocortisone | Sigma-Aldrich | H0135 | |
Insulin | Sigma-Aldrich | 91077C | |
Mini Protease Inhibitor Cocktail | Roche | 11836153001 | |
NucleoSpin RNA II kit | BIOKE´ | 740955 | |
Penicillin-streptomycin (Pen-Strep) | Thermo Fisher Scientific | 15140148 | |
Polyethylenimine (PEI) | Polyscience | 23966 | |
Polyvinylidene difluoride (PVDF) membrane | Merck Millipore | IPVH00010 | |
Ponceau S solution | Sigma-Aldrich | P7170 | |
RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit | Thermo Fisher Scientific | K1621 | |
Skimmed milk | Campina: Elk | ||
Equipment | |||
ChemiDoc Imaging System | Bio-Rad | 17001402 | |
CFX Connect Detection System | Bio-Rad | 1855201 | |
Luminometer | Perkin Elmer | 2030-0050 | |
NanoDrop 2000/2000c Spectrophotometers | Thermo Fisher Scientific | ND-2000 |