Dit protocol biedt een methode om Mycobacterium tuberculosis infectie in menselijke M1- of M2-gepolariseerde macrofagen te bestuderen op basis van differentiatie van perifere bloed-monocyten naar macrofaag-achtige cellen die zijn geïnfecteerd met de GFP-gelabelde virulente stam H37Rv, en geanalyseerd met flowcytometrie met behulp van een 10-kleurenpaneel inclusief expressie van geselecteerde M1/M2 markers.
Menselijke macrofagen zijn primaire gastheercellen van intracellulaire Mycobacterium tuberculosis (Mtb) infectie en spelen dus een centrale rol in de immuuncontrole van tuberculose (TB). We hebben een experimenteel protocol opgesteld om immuunpolarisatie van myeloïde-afgeleide cellen in M1 (klassiek geactiveerd) of M2 (alternatief geactiveerd) macrofaag-achtige cellen te volgen door beoordeling met een cytometriepaneel met 10 kleurenstroom dat visualisatie en diepe karakterisering van groen-fluorescerend eiwit (GFP)-gelabelde Mtb in verschillende macrofagen subsets mogelijk maakt. Monocyten verkregen uit gezonde bloeddonoren werden gepolariseerd in M1- of M2-cellen met behulp van differentiatie met granulocyt macrofaag-kolonie-stimulerende factor (GM-CSF) of macrofaag-kolonie stimulerende factor (M-CSF) gevolgd door polarisatie met respectievelijk IFN-γ en lipopolysaccharide (LPS) of IL-4. Volledig gepolariseerde M1- en M2-cellen werden gedurende 4 uur geïnfecteerd met Mtb-GFP voordat losgemaakte Mtb-geïnfecteerde macrofagen werden gekleurd met flowcytometrie na 4 of 24 uur na infectie. Monsterverwerving werd uitgevoerd met flowcytometrie en de gegevens werden geanalyseerd met behulp van een flowcytometrieanalysesoftware. Handmatige gating en dimensionaliteitsreductie met Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP) en fenograafanalyse werden uitgevoerd. Dit protocol resulteerde in effectieve M1/M2 polarisatie gekenmerkt door verhoogde niveaus van CD64, CD86, TLR2, HLA-DR en CCR7 op niet-geïnfecteerde M1-cellen, terwijl niet-geïnfecteerde M2-cellen een sterke up-regulatie vertoonden van de M2 fenotype markers CD163, CD200R, CD206 en CD80. M1-gepolariseerde cellen bevatten doorgaans minder bacteriën in vergelijking met M2-gepolariseerde cellen. Verschillende M1/M2 markers werden gereguleerd na Mtb infectie, wat suggereert dat Mtb macrofaag polarisatie kan moduleren. Bovendien bleken 24 verschillende celclusters van verschillende grootte op unieke wijze te zijn verdeeld over de niet-geïnfecteerde M1- en M2-en Mtb-geïnfecteerde cellen na 24 uur na infectie. Dit M1/M2 flow cytometrie protocol kan worden gebruikt als ruggengraat in Mtb-macrofaag onderzoek en worden aangenomen voor speciale behoeften op verschillende gebieden van onderzoek.
Macrofagen zijn immuuncellen die aanzienlijk bijdragen aan de regulatie van weefselhomeostase, ontstekingen en ziektepathologieën. Omdat het een essentieel onderdeel is van aangeboren immuniteit, drukt de monocyt-macrofaaglijn van cellen heterogene fenotypen uit als reactie op veranderde omgevingssignalen, die hun plasticiteit en aanpassing aan verschillende anatomische en immunologische locaties weerspiegelen1. Afhankelijk van de groeifactoren, cytokinen en andere bemiddelaars in het micromilieu, zijn macrofagen gecategoriseerd in twee belangrijke omkeerbare populaties, elk met een andere rol in bacteriële controle en klaring2: de pro-inflammatoire, klassiek geactiveerde M1-gepolariseerde macrofagen en de ontstekingsremmende, alternatief geactiveerde M2-gepolariseerde macrofagen die oorspronkelijk werden genoemd om T-helper (Th) celnomenclatuur na te bootsen3. Deze groepering van immuungepolariseerde macrofagen wordt vaak als simplistisch beschouwd, aangezien macrofaagactivatie en differentiatie niet lineair is, maar nauwkeuriger wordt geïllustreerd als een continuüm waarbij elke populatie verschillende kenmerken en functionele rollen heeft in de uitkomst van ziekteontwikkeling en progressie4,5,6,7. Toch zijn er tal van experimentele voordelen met het M1/M2 macrofaagmodel dat in verschillende onderzoeksgebieden kan worden gebruikt.
Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is de veroorzaker van tuberculose (TBC) en infecteert naar schatting elke seconde één persoon en wordt beschouwd als het meest dodelijke infectieuze agens ter wereld (Global TB report 2019). Aangezien de luchtwegen de belangrijkste route van Mtb-infectie zijn, zijn alveolaire macrofagen de voorkeursgastcellen die met Mtb worden geïnfecteerd en vertegenwoordigen zowel de primaire barrières als het infectieuze reservoir voor Mtb in de longen. Macrofaagpolarisatie als reactie op verschillende stimuli is in de loop der jaren uitgebreid bestudeerd7 en in het grootste deel van het gepubliceerde werk wordt M1-polarisatie van monocytculturen in vitro geïnduceerd door Granulocyte-Macrophage Colony Stimulating Factor (GM-CSF) samen met IFN-γ en LPS8,9, terwijl M2-polarisatie wordt geïnduceerd met Macrophage Colony Stimulating Factor (M-CSF) en IL-410,11. De M1-macrofagen zijn krachtige effectorcellen die antimicrobiële reacties tegen intracellulaire pathogenen bemiddelen en een essentiële rol spelen bij antitumorimmuniteit12. M2-macrofagen daarentegen hebben een ontstekingsremmende functie, een hoge fagocytische capaciteit en zijn voornamelijk betrokken bij wondgenezing en weefselherstel, evenals bij parasietinfecties12. Dienovereenkomstig worden M1-macrofagen als effectiever beschouwd bij intracellulaire controle van Mtb in vergelijking met M2-macrofagen13. Mtb-bacteriën hebben echter ook het potentieel om macrofaagpolarisatie te moduleren om aangeboren immuniteit te ondermijnen14,15,16,17.
Hoewel het gebruikelijk is macrofagen te genereren uit differentiatie van monocyten verkregen uit perifeer bloed18, kunnen macrofagen ook worden gegenereerd uit geïnduceerde pluripotente stamcellen (iPSC ‘s)19 of uit van beenmerg afgeleide macrofagen van muizen20,21. Dit zijn haalbare technieken om primaire macrofaagcellen te bestuderen die zijn verkregen uit monocyt/macrofaagvoorlopers die zich zullen verspreiden en differentiëren in een homogene populatie van volwassen macrofaagachtige cellen. Deze protocollen bieden echter zelden verdiepte kennis over het fenotype en de functie van de verkregen cellen en houden geen rekening met de natuurlijke heterogeniteit die wordt waargenomen bij macrofagen die in vivo worden verkregen. Omdat Mtb een strikte menselijke ziekteverwekker is, is er ook een voordeel om Mtb te bestuderen in gemenselijkede modelsystemen. Flow cytometrie is een krachtige technologie die de mogelijkheid biedt om meerdere fenotypische en functionele kenmerken van afzonderlijke cellen in suspensie22te beoordelen , iets dat vrij uitdagend kan zijn met aanhangende cellen zoals macrofagen waarvan ook bekend is dat ze autofluorescent zijn23,24. Naast chemische ontkoppeling van stevig hechtende macrofagen, kan Mtb-infectie een significante stressfactor vormen voor de cellen die een ander niveau van complexiteit toevoegt in flowcytometrische analyses van Mtb-geïnfecteerde macrofagen.
In dit experimentele protocol hebben we een eerder vastgesteld humaan macrofaaginfectiemodel gebruikt op basis van immuunpolarisatie van primaire perifere-bloedmonocyten-afgeleide cellen die zijn geïnfecteerd met de virulente laboratorium Mtb-stam H37Rv, en geanalyseerd met flowcytometrie met behulp van een 10-kleurenpaneel inclusief expressie van geselecteerde M1- en M2-markers25. Dit protocol biedt een efficiënte en reproduceerbare methode om reacties op Mtb-infectie in M1- of M2-gepolariseerde monocyt-afgeleide macrofagen te bestuderen. Bovendien stelt het gebruik van flowcytometrie op aanhangende Mtb-geïnfecteerde macrofagen ons in staat om een verscheidenheid aan oppervlaktemarkers te bestuderen die verband houden met conventionele M1- en M2-macrofagen en hun longitudinale reactie op Mtb-infectie. Belangrijk is dat dit protocol gemakkelijk kan worden aangenomen voor onderzoek naar infecties met andere pathogenen, in antitumorstudies of in studies naar ontstekingsaandoeningen, voor geneesmiddelenscreening enz. en kan ook worden gebruikt voor de beoordeling van M1/M2 macrofaagpolarisatie in menselijke klinische monsters.
Dit experimentele protocol beschrijft effectieve polarisatie van myeloïde-afgeleide cellen in M1- of M2-fenotypen, inclusief beoordeling met een cytometriepaneel met 10 kleurenstroom dat visualisatie en diepe karakterisering van Mtb met GFP-label in verschillende macrofagensubgroepen mogelijk maakt. Hoewel TBC een oude menselijke ziekte is, is er momenteel geen gouden standaardmodel om Mtb-macrofaaginteracties te bestuderen, en multi-color flow cytometrie van macrofagen kan gecompliceerd zijn in vergelijking met analyses van lymfocytreacties. Weinig beschikbare protocollen voor in vitro differentiatie van menselijke monocyten naar macrofagen bieden diepgaande kennis van het type macrofagen dat wordt gegenereerd. Een basisprotocol voor macrofaagpolarisatie en flowcytometrische beoordeling van macrofaagactivering met behulp van een solide paneel van markers kan een dergelijke karakterisering waarschijnlijk vergemakkelijken en mogelijkheden bieden om aanvullende kenmerken van gepolariseerde cellen te verkennen die onder verschillende omstandigheden worden behandeld. Dit omvat analyses van cellen die in vitro zijn gekweekt, evenals analyses van cellen in vivo in klinische monsters, d.w.z. zowel PBMC- als eencellige suspensies uit lichaamsvloeistoffen (d.w.z. bronchoalveolaire lavage) of gehomogeniseerd weefsel. Dienovereenkomstig kan differentiatie en/of activeringsstatus van monocyten en macrofagen verkregen van patiënten verband houden met de uitkomst van de ziekte. Uitbreiding van CD16+CD163+ monocyten in perifeer bloed is gemeld bij pulmonale tbc-patiënten30. Een verhoogde frequentie van CD163+ cellen werd ook gedetecteerd in de ontstoken huid van atopische dermatitispatiënten31. Evenzo is aangetoond dat CD206+ M2-achtige macrofagen de proliferatie en differentiatie van cellen in het micromilieu van adipocytweefsel32 remmen en worden verrijkt in beenmergmonsters van patiënten met acute myeloïde leukemie (AML)29. Een verhoogde verhouding tussen CD64 (M1) en CD163 (M2) cellen in volbloed van patiënten met artrose bleek geassocieerd te zijn met de ernst van de ziekte33. Een andere studie gebruikte CD86 (M1) en CD163 (M2) om aan te tonen dat hoge M1-expressie in weefsel correleerde met een slechter resultaat in een subgroep van kwaadaardige hersentumoren34.
Er zijn verschillende belangrijke voordelen van dit experimentele M1/M2 flow cytometrie protocol. Dit model biedt de mogelijkheid om aangeboren immuunresponsen op virulente Mtb-infectie te bestuderen en kan worden ontwikkeld om studies van adaptieve immuunresponsen te bevatten door autologe T-cellen samen met M1- of M2-macrofagen toe te voegen in gemengde lymfocytreacties (MLR’s). Het protocol is ook geschikt voor het screenen en testen van verschillende immunomodulerende en antimicrobiële verbindingen. Hier hebben we eerder de effecten van vitamine D en de histondeacetylaseremmer fenylbutyraat op myeloïde-afgeleide cellen bestudeerd na Mtb-infectie25,35. M1/M2-flowcytometrie kan ook worden gebruikt om macrofaagactivatie te beoordelen na conditionering met celkweeksupernatanten of patiëntplasma. Hoewel in vivo studies naar tbc-co-infectie met HIV of helminten of tbc-diabetes co-morbiditeit een uitdaging kunnen zijn, kan het minder complexe M1/M2-model studies naar co-morbiditeiten in vitro vergemakkelijken. Evenzo zou het protocol kunnen worden gebruikt voor transmissiestudies om de Mtb-infectiviteit van cellen te onderzoeken of om fagocytische en antigeenpresentatiecapaciteit van individuele M1/M2-cellen te onderzoeken. M1/M2 flow cytometrie is ook aantrekkelijk voor gebruik in biomarker- en vaccinstudies, om de ziekteprognose tijdens de behandeling te volgen en om therapieën te testen die gericht zijn op myeloïde-afgeleide cellen. Belangrijk is dat een aantal verschillende methoden parallel aan flowcytometrie kunnen worden toegepast voor gelijktijdige beoordeling van macrofaagpolarisatiefenotypes en functionele reacties met behulp van confocale microscopie(figuur 3D),real-time PCR, western blot, multiplex-assays en ELISA van oplosbare factoren in het cultuursupernatant, evenals beoordeling van intracellulaire bacteriële infectiviteit en groei met behulp van GFP-expressie (flowcytometrie en confocale microscopie) en kolonievormende eenheden (CFU). Infectie van M1- of M2-cellen met Mtb-GFP-bacteriën maakt het ook mogelijk om de niet-geïnfecteerde en Mtb-geïnfecteerde cellen uit hetzelfde monster te sorteren voor analyse van single cell-RNA-sequencing.
Het beschreven protocol heeft ook enkele beperkingen, waaronder zowel technische als wetenschappelijke nadelen. Het nadeel van monocyt-afgeleide macrofagen van menselijke bloeddonoren is dat de donorvariabiliteit vaak hoog is en het feit dat de cellen niet gepolariseerd zijn in de fysiologische omgeving van menselijke weefsels. Grote variabiliteit in M1/M2 polarisatie-werkzaamheid of Mtb-infectiviteit tussen donoren kan leiden tot problemen met zowel intra- als interexperimentale variaties, lage statistische kracht en de noodzaak om veel donoren op te nemen om betrouwbare resultaten te verkrijgen. Bovendien resulteren plastic hechting van monocyten uit PBMC’s in een donorafhankelijk aantal monocyten/put dat uiteindelijk een willekeurige MOI kan opleveren die de macrofaagpolarisatie en cel levensvatbaarheid na Mtb-infectie kan beïnvloeden. Kritieke stappen in het protocol omvatten goed wassen om te voorkomen dat andere celtypen de celculturen besmetten die ook macrofaagpolarisatie kunnen beïnvloeden. Hoewel een te lage MOI latente tbc-infectie kan nabootsen, zal een te hoge MOI de cellen doden, wat het belang benadrukt van het gebruik van een geschikte MOI. Bovendien kan het moeilijk zijn om stevig hechtende cellen op te halen bij onthechting, wat kan resulteren in een bevooroordeelde weergave van bepaalde macrofagen subsets die worden gebruikt voor flow cytometrie analyses. Een cruciale stap in flow cytometrie analyse omvat het juiste gebruik van kralen compensatie matrix en negatieve controles zoals niet-aangetaste cellen of FMO (Fluorescentie Minus One) controles om de juiste handmatige gating te garanderen.
Een andere beperking betreft polarisatie van monocyten afgeleid van bloed en niet van de lokale weefselomgeving. Het kenmerk van menselijke tbc is de vorming van granulomen in met Mtb geïnfecteerde weefsels en daarom moet immunopathologie bij tbc bij voorkeur worden bestudeerd op de lokale weefsellocatie. Monocyten worden echter gerekruteerd naar de long uit perifeer bloed bij ontsteking / infectie, waar cellen zich kunnen onderscheiden in macrofagen in aanwezigheid van inflammatoire cytokinen zoals GM-CSF12. Belangrijk is dat er in het fysiologische milieu van weefsel in vivo waarschijnlijk een grote heterogeniteit van macrofaagpolarisatie is, inclusief een mengsel en verschillende verhoudingen van diverse M1- en M2-achtige macrofaagpopulaties die bijdragen aan het lot van tbc-infectie36. We hebben eerder een menselijk organotypisch longweefselmodel ontwikkeld dat 3D-studies van macrofaaggemedieerde granuloomvorming in TB37mogelijk maakt. Het kan interessant zijn om het huidige M1/M2-polarisatieprotocol in combinatie met het longweefselmodel te gebruiken om de vorming van tbc-granuloom, effectorfuncties en M1/M2-verhouding in experimenteel weefsel verder te bestuderen.
Dit M1/M2 flowcytometrieprotocol kan gemakkelijk worden aangepast om een uitgebreid panel van myeloïde markers op te nemen die nuttig zijn voor de beoordeling van kenmerken die verband houden met remmende en inflammatoire reacties. Er is een grote onderzoeksinteresse in remmende immuuncontrolepuntmoleculen zoals PD-1, SIRP-α, IDO en arginases die macrofaagreacties kunnen moduleren38. In deze context kan polarisatie van myeloïde cellen ook andere stimuli omvatten die immunoregulerende macrofagen (Mreg) of myeloïde-afgeleide suppressorcellen (MDSC) bevorderen waarvan is aangetoond dat ze betrokken zijn bij verschillende ziekten, waaronder TB38. Meer geavanceerde flow cytometrie panelen van M1/M2/Mreg macrofaag subsets kunnen ook intracellulaire kleuring van cytokinen/chemokinen IL-1β, TNF-α, IL-10 en MCP-1 of andere oplosbare factoren of effector moleculen zoals inductief stikstofmonoxide (iNOS) en antimicrobiële peptiden omvatten. Dit zou de mogelijkheden kunnen vergroten om polyfunctionele macrofaagreacties te bestuderen, vergelijkbaar met wat uitgebreid is beschreven voor T-cellen39.
Momenteel kunnen flowcytometriekleuringspanelen tot 30-40 kleuren bevatten, wat de mogelijkheid biedt om meerdere celsubgroepen en moleculen tegelijkertijd te immunofenotyperen. De basis experimentele opzet van dit M1/M2 flow cytometrie protocol kan worden gebruikt als een ruggengraat die compatibel is met de meeste oude en nieuwe flow cytometers en kan worden gebouwd en aangepast aan individuele behoeften, inclusief de uitdagingen die het werken met virulente Mtb in een BSL-3 omgeving met zich meebrengt. Tegenwoordig zijn dimensionaliteitsreductietechnieken zoals UMAP beschikbaar in de nieuwe versies van flowcytometriesoftware, die analyse van een groot aantal parameters mogelijk maakt die worden gegenereerd in eencellige studies die essentieel zijn voor een betere visualisatie en interpretatie van hoogdimensionale gegevens40. De constante technologische verbeteringen in flowcytometrie zullen waarschijnlijk de komende jaren worden voortgezet, waaronder de combinatie van multiparametrische fenotypering in combinatie met moderne celsorteermogelijkheden, waar dit protocol nuttig zou kunnen zijn in verschillende op macrofaag gebaseerde Mtb-infectietesten.
The authors have nothing to disclose.
Wij danken onze collega’s van het Zweedse Agentschap voor volksgezondheid, Matilda Svensson en Solomon Ghebremichael voor hun hulp in het BSL-3-laboratorium.
Dit werk werd ondersteund door subsidies van de Swedish Heart and Lung Foundation (HLF) (2019-0299 en 2019-0302 aan SB), de Swedish Research Council (VR) (2014-02592, 2019-01744 en 2019-04720 aan SB), de Foundation to Prevent Antibiotic Resistance (Resist), Karolinska Institutet Foundations ML werd ondersteund door de Swedish Children’s Cancer Foundation (TJ2018-0128 en PR2019-0100).
8-well chamber slides | Lab-Tek | 154534 | |
BD Comp bead plus | BD | 560497 | |
Bovine Serum Albumin | Sigma-Aldrich | A7906 | |
DAPI Mounting media | Vector Laboratories | H-1200-10 | |
EDTA (0.5 M) | Karolinska University hospital, Huddinge | N/A | |
Falcon 6-well Flat Bottom plates | Corning Life Sciences | 353046 | |
Fetal bovine serum (FBS) | Sigma-Aldrich | F7524 | |
Formaldehyde | Sigma-Aldrich | F8775 | |
Glycerol (70%) | Karolinska University hospital, Huddinge | N/A | |
GM-CSF | Peprotech | 300-03 | |
Goat anti-mouse IgG Alexa Fluor 594 secondary antibody | Invitrogen | R37121 | Secondary antibody for CD64 |
Goat anti-Rabbit IgG Alexa Fluor 594 secondary antibody | Invitrogen | A-11037 | Secondary antibody for CD163 |
HEPES | GE Healthcare Life Sciences | SH30237.01 | |
IFN-γ | Peprotech | 300-02 | |
IL-4 | Peprotech | 200-04 | |
L-Glutamine | GE Healthcare Life Sciences | SH30034.01 | |
LPS (Escherichia coli O55:B5) | Sigma-Aldrich | L6529 | |
Lymphoprep | Alere Technologies AS | 11508545 | |
M-CSF | Peprotech | 300-25 | |
Middle Brook 7H10 agar plates | Karolinska University hospital, Huddinge | N/A | |
Middle Brook 7H9 media | Karolinska University hospital, Huddinge | N/A | |
Mouse anti-human CD64 primary antibody | Bio-Rad | MCA756G | Clone: 10.1 |
Na-pyruvate | GE Healthcare Life Sciences | SH300239.01 | |
Normal goat serum | Jackson ImmunoResearch | 005-000-121 | |
Rabbit anti-human CD163 primary antibody | GeneTex | GTX81526 | Polyclonal |
RPMI 1640 | Life Technologies Corporation | SH30096.01 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | X-100 | |
TubeSpin bioreactor tubes | TPP Techno Plastic Products AG | 87050 | |
Tween-20 | Sigma-Aldrich | P9416 | |
Tween-80 | Sigma-Aldrich | P4780 |