Bu protokol, insan kaynaklı pluripotent kök hücrelerden makrofajların sağlam nesil açıklar, ve sonraki karakterizasyonu için yöntemler. Hücre yüzeyi belirteç ekspresyonu, gen ekspresyonu ve fonksiyonel tahliller bu iPSC kaynaklı makrofajların fenotip ve fonksiyonunu değerlendirmek için kullanılır.
Makrofajlar çoğu omurgalı dokuda bulunur ve farklı fonksiyonlara sahip yaygın olarak dağılmış ve heterojen hücre popülasyonlarını kapsar. Onlar sağlık ve hastalık önemli oyuncular, bağışıklık savunma sırasında fagosit ler olarak hareket ve trofik aracılık, bakım, ve onarım fonksiyonları. İnsan makrofaj fonksiyonunda yer alan moleküler süreçlerin bazılarını incelemek mümkün olsa da, genetik mühendislik tekniklerini birincil insan makrofajlarına uygulamak zor olmuştur. Bu önemli ölçüde makrofaj biyolojisi dahil karmaşık genetik yolları sorgulamak ve belirli hastalık durumları için modeller oluşturmak için yeteneğimizi engelledi. Genetik manipülasyon teknikleri geniş cephanelik için münasip bir insan makrofajlar bir off-the-raf kaynak, bu nedenle, bu alanda değerli bir araç sağlayacaktır. Biz in vitro insan kaynaklı pluripotent kök hücrelerden makrofajlar üretimi için izin veren optimize edilmiş bir protokol salıyoruz. Bu iPSC kaynaklı makrofajlar (iPSC-DMs) CD45, 25F9, CD163 ve CD169 dahil olmak üzere insan makrofaj hücre yüzey işaretleri ifade ve canlı hücre görüntüleme fonksiyonel tsay sağlam fagositik aktivite gösterdiğini göstermektedir. Kültürlü iPSC-DM’ler, LPS ve IFNg, IL4 veya IL10 ekleyerek değiştirilmiş gen ekspresyonu ve fagositik aktiviteyi görüntüleyen farklı makrofaj durumlarına etkinleştirilebilir. Böylece, bu sistem belirli insan hastalığı modeli genetik değişiklikler taşıyan insan makrofajlar oluşturmak için bir platform ve ilaç tarama veya hücre tedavisi için bu hastalıkların tedavisi için hücre kaynağı sağlar.
Embriyonik kök hücreler (ESCs) ve indüklenen pluripotent kök hücreler (iPSCs) her üç mikrop tabakası lineages hücreleri üretmek için ayırt edilebilir kendini yenileyen bir hücre kaynağı temsil eder. Çinko Parmak Çekirdeği, TALENS ve CRISPR-Cas9 gibi insan pluripotent kök hücrelerinin (PSCs) genetik manipülasyon sağlayan teknolojiler, tıbbi araştırma1devrim var1 ,2,3,4. İnsan PsCs genetik manipülasyon özellikle çekici bir strateji zaman ilgi birincil hücre genişletmek ve / veya in vitro korumak zordur, ya da genetik olarak işlemek zordur, makrofajlar için olduğu gibi5,6,7,8,9. İnsan iPSC’leri herhangi bir somatik hücreden türetilebildiği için, ESC’lerle ilişkili etik sınırlamaları aşarak kişiselleştirilmiş ilaç sunmak için bir strateji sağlarlar. Bu hastaya özgü hastalık modelleme içerir, ilaç testi, ve immün ret ve enfeksiyon riski ile otolog hücre tedavisi6,8,10,11.
iPSC’lerden makrofaj ların neslini açıklayan protokoller: 1) Embriyoid cisim lerin üretimi; 2) Süspansiyon hematopoetik hücrelerin ortaya çıkması; 3) Terminal makrofaj olgunlaşması.
Embriyoid cisimler (EBs) olarak bilinen üç boyutlu agregaların oluşumu iPSC’lerin farklılaşmasını başlatır. Kemik morfogenetik protein (BMP4), kök hücre faktörü (SCF) ve vasküler endotelbüyüme faktörü (VEGF) mezoderm belirtimi sürücü ve gelişmekte olan hematopoetik hücreleri7destek eklenir7 ,8,9,11,12. EBs içinde ayırt edici hücreler de Wnt ve Activin gibi endojen sinyal yollarının aktivasyonunu başlatın. Bazı farklılaşma protokolleri EB oluşumu aşamasından geçmez. Bu gibi durumlarda, Wnt ve Activin sinyal düzenleyicileri, rekombinant insan Activin A ve / veya Chiron gibi tek katmanlı bir biçimde ayırt edici iPSCs eklenir13,14,15. Burada, EB oluşumunu kullanan bir protokole odaklanıyoruz. Farklılaşmanın ikinci adımı için, EB’ler yapışkan bir yüzeye kaplanır. Bu bağlı hücreler daha sonra hematopoetik ve miyeloid ataları içeren süspansiyon hücrelerinin ortaya çıkmasını teşvik sitokinler maruz kalmaktadır. Bu in vitro kültür koşullarında, interlökin-3 (IL3) büyük olasılıkla hematopoetik kök-atajen hücre oluşumu ve çoğalmasıdestekler 16,17, yanı sıra miyeloid öncüleri proliferasyon ve farklılaşma18. Makrofaj koloni uyarıcı faktör (BOS1) miyeloid hücrelerin üretimini ve makrofajlar19,,20onların farklılaşması nı destekler. Farklılaşmanın üçüncü aşamasında, bu süspansiyon hücreleri terminal makrofaj olgunlaşmasını desteklemek için BOS1 varlığında kültürlenir.
İnsan iPSC’lerinin in vitro makrofajlara farklılaşması, gelişim sırasında makrofaj üretiminin erken dalgasını taklit eder. Dokuda yerleşik makrofajlar embriyogenez sırasında kurulur ve erişkin monositlerden farklı gelişimsel soylara sahiptir. Çeşitli çalışmalar, iPSC-DM’lerin, kan kaynaklı monositlere göre fetal karaciğer kaynaklı makrofajlarla karşılaştırılabilir bir gen imzasına sahip olduğunu göstermiştir ve bu da iPSC-DM’lerin dokuda yerleşik makrofajlara daha çok benzer olduğunu düşündürmektedir. iPSC-DMs doku remodelling ve anjiyogenez dahil proteinlerin salgılanması için kodlama genlerin yüksek düzeyde ifade ve pro-inflamatuar sitokin salgılanması ve antijen sunum faaliyetleri için kodlama genlerin düşük seviyelerde ifade21,22. Buna ek olarak, iPSC-DMs doku yerleşik makrofajlar23,,24benzer bir transkripsiyon faktörü gereksinimi var. Transkripsiyon faktörleri RUNX1, SPI1 (PU.1) ve MYB’de eksik olan nakavt iPSC hücre çizgilerini kullanarak, Buchrieser ve diğerleri iPSC-DM’lerin neslinin SPI1 ve RUNX1’e bağlı olduğunu, ancak MYB’nin bağımsız olduğunu gösterdi. Bu, gelişim sırasında hematopoyonun ilk dalgası sırasında oluşan yolk-kese türemiş makrofajlara transkripsiyonel olarak benzer olduklarını gösterir23. Bu nedenle, yaygın olarak iPSC-DMs mikroglia14,,25 ve Kupffer hücreleri11gibi doku yerleşik makrofajlar çalışmak için daha uygun bir hücre modeli temsil ve potansiyel dokuları onarmak için tedavilerde kullanılabilecek hücrelerin daha arzu edilen bir kaynak olduğu kabul edilmektedir. Örneğin, fare ESC’lerinden in vitro olarak üretilen makrofajların, ccl4’e bağlı karaciğer hasarı modelinde in vivo11’defibrozisin iyileştirilmesinde etkili olduğu gösterilmiştir. Ayrıca, bu ESC kaynaklı makrofajlar farelerde lipozomal klodronat11 kullanarak makrofajlar tükenmiş Kupffer hücre kompartmanlarının yeniden doldurulma kemik iliği kaynaklı makrofajlar daha verimli idi.
Burada, insan iPSC’lerinin bakımı, dondurulması ve çözülmesi ve bu iPSC’lerin fonksiyonel makrofajlara farklılaşması için serum ve besleyiciiçermeyen protokolleri tanımlıyoruz. Bu protokol van Wilgenburg ve ark.12tarafından açıklanan çok benzer , dahil küçük değişiklikler ile: 1) iPSC-bakım medya; 2) EB oluşum aşamasında KAYA inhibitörü kullanılmaz; 3) iPSC kolonilerinden tek tip EB’ler üretmek için enzimatik bir yaklaşım yerine mekanik bir yaklaşım kullanılır; 4) EB hasat ve kaplama yöntemi farklıdır; 5) Süspansiyon hücreleri haftada 2x değil, haftada 2x hasat edilir; ve 6) Hasat edilen süspansiyon hücreleri 7 gün yerine 9 gün makrofaj olgunlaşması için BOS1 altında kültürlenir. Ayrıca, gen ekspresyonu (qRT-PCR), hücre yüzey marker ekspresyonu (akış sitometrisi) analizleri ve fagositoz ve polarizasyonu değerlendirmek için fonksiyonel tahliller de dahil olmak üzere, iPSC kaynaklı makrofaj fenotip ve fonksiyonu karakterize etmek için kullanılan protokolleri de tanımlıyoruz.
Burada açıklanan iPSC-DM’lerin üretimi için protokol sağlamdır ve nispeten az sayıda iPSC’den çok sayıda homojen hücre nin üretilemesine olanak sağlar. Yaklaşık 1 x 106 iPSC’nin ilk farklılaşmasından sonra, sonraki kültürler 2-3 aya kadar her 4 günde bir hasat edilebilir ve bu da bu süre içinde en az 6,5 x 107 makrofaj üretimine yol açabilir. Bu in vitro-oluşturulan insan makrofajlar morfolojik birincil insan makrofajlar benzer, anahtar makrofaj hücre yüzey belirteçleri ifade, ve fagositik aktivite sergiler. Makrofaj farklılaşması için protokol tekrarlanabilir ve diğer hiPSC ve hESC hücre hatlarına uygulanabilir, ancak makrofaj öncülerinin ilk hasadının kesin zamanlaması ve oluşturulabilen hücrelerin mutlak sayıları iPSC çizgileri arasında değişir.
Genetik olarak manipüle edilmiş iPSC’lerden makrofajlar üretilebildiği gösterilmiştir. Örneğin, kurucu CAG organizatörü kontrolü altında floresan muhabiri ZsGreen oluşan bir transgen kaset SFCi55 iPSC hattının AAVS1 locus içine yerleştirildi, ve daha sonra bu iPSC hattı ZsGreen ifade makrofajlar8içine ayırt edilebilir gösterildi . Bu floresan makrofajlar ileride hastalık modellerinde terapötik makrofajların göçve stabilitesini izlemek için kullanılabilir. Başka bir çalışmada, makrofajlar genetik tamoksifen kaynaklı transkripsiyon faktörü ifade etmek için manipüle edilmiş bir iPSC hattı oluşturuldu, KLF1. IPSC kaynaklı makrofajlarda KLF1 aktivasyonu, eritroid adasının makrofajlarına benzer bir fenotip ile makrofajüretimi ile sonuçlandı9. Potansiyel olarak, bu strateji genetik olarak iPSC kaynaklı makrofajların karaciğerin Kupffer hücreleri veya cildin Langerhans hücreleri gibi dokuya özgü makrofaj popülasyonları ile ilişkili fenotiplere programedilmesi için kullanılabilir. Bu hücre türlerini tanımlayan anahtar transkripsiyon faktörleri tanımlandıktan sonra bu mümkün olacaktır.
Protokol açısından, iPSC’lerin başlangıç popülasyonunun durumunun başarılı bir farklılaşma için kritik öneme sahip olduğunu belirtmek çok önemlidir. İnsan iPSC kültürleri çeşitli pasajlar üzerinde karyotipik anormal alt popülasyonları ile istila edilebilir, bu nedenle genom kalite kontrolüne tabi tutulan iPSC stoklarının ve büyük toplu ana stokların sağlam kürasyonu önerilir. Elimizde, burada açıklanan bakım protokolleri sürekli kültürde 2 aya kadar karyotipik normal iPSC’leri koruyabilir, ancak bu farklı hücre hatları ve farklı laboratuvarlarda değişebilir. Sorunlarla karşılaşılırsa, her farklılaşma denemesi için yeni bir farklılaşmamış iPSC şişesi kullanılması tavsiye edilir. Buna ek olarak, farklılaşmamış iPSC’lerin başlangıç kültürü en fazla% 80 eşzamanlı olmalıdır. EB kaplama aşamasında, sadece 10-15 EBs bir kuyu başına kaplanmış olmalıdır 6 iyi doku kültürü plaka, ve bu EBs kuyu boyunca eşit olarak yayılır önemlidir. Kuyunun merkezinde daha fazla sayıda EB ve/veya EB’nin kümelenmeleri, üretilen makrofaj ların sayısı üzerinde olumsuz bir etki yaratmıştı. Eb kültürlerinden monosit benzeri progenitor süspansiyon hücrelerinin toplanması ve eB’lerin kaplamalı kültür plakalarının yüzeyine yapışmasını rahatsız etmemek için ortam yenilenirken ve toplanırken dikkatli olunmalıdır. Üretilen hematopoetik süspansiyon hücrelerinin sayısı her hasatta kademeli olarak artar ve 40-72 gün arasında en iyi üretim le birlikte farklılaşma(Şekil 2). Üretim 68 gün sonra giderek azalır ve plakalar 2,5 ay sonra egzoz eğilimindedir, kesin zamanlama iPSC hattına bağlı olarak değişebilir rağmen.
Protokolümüzün bir sınırlaması, Evre 2’nin sonunda oluşan hematopoetik süspansiyon hücrelerinin kriyokorunmuş olmasıdır. WNT’nin eksojen aktivasyonuna dayanan protokoller kriyopreservation sonrası %40 iyileşme hızı rapor eder, ancak bu protokoller yalnızca bir hücre hasadını rapor eder, bu nedenle oluşturulan makrofajların mutlak sayısı30’dur. Burada açıklanan protokol, EB’lerin oluşumu yoluyla endojen sinyalizasyon indükleyen, çok daha yüksek bir toplam makrofaj verim üreten, iki haftada bir hasat edilebilir.
Özetle, fonksiyonel iPSC kaynaklı makrofajların üretimi için ayrıntılı bir protokol salıyoruz. Sağlık ve hastalıkta makrofaj biyolojisini incelemek için iPSC kaynaklı makrofajlarla in vitro deneylerin kurulması, monosit kaynaklı makrofajlar (MdM) ile yapılan deneylere göre birçok avantaja sahiptir. Bu avantajlar malzemeye erişilebilirlik kolaylığı (örneğin, hiçbir donör gereklidir), makrofajlar çok büyük miktarda üretilebilir ve uygulanabilir ve nispeten genetik olarak değiştirilmiş makrofajlar üretmek için basittir. Ayrıca, iPSC kaynaklı makrofajlar doku yerleşik makrofaj biyolojisi çalışması için daha iyi bir kaynak olabilir.
The authors have nothing to disclose.
Biz akış sitometri, Eoghan O’Duibhir ve Bertrand Vernay mikroskopi ile yardım için Fiona Rossi ve Claire Cryer teşekkür ederiz. Bu çalışma CONACYT (M.L.-Y.), Wellcome Trust (102610) ve Innovate UK (L.M.F), Wellcome Trust Doktora öğrencisiliği (A.M), MRC Hassas Tıp Öğrenciliği (T.V) tarafından finanse edilmiştir. L.C. ve J.W.P. Wellcome Trust (101067/Z/13/Z), Medical Research Council (MR/N022556/1) ve COST Action BM1404 Mye-EUNITER (http://www.mye-euniter.eu) tarafından desteklendi.
2-Mercaptoethanol (50 mM) | Invitrogen | 31350010 | |
Abtibody CD64-APC -CY7 | Biolegend | 305026 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody 25F9-EFLUOR 660 | Ebioscience | 15599866 | Dilution factor: 1:20 |
Antibody CCR2-PE-Cy7 | Biolegend | 357212 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CCR5 PE | Biolegend | 313707 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CCR8 PE | Biolegend | 360603 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CD11b-PE | Biolegend | 301305 | Dilution factor: 1:50 |
Antibody CD14-APC | Ebioscience | 10669167 | Dilution factor: 1:20 |
Antibody CD163-PE-CY7 | BIolegend | 333614 | Dilution factor: 1:25 |
Antibody CD169-APC | Biolegend | 346007 | Dilution factor: 1:25 |
Antibody CD206-PE | Biolegend | 321106 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CD209-PE-CY7 | Biolegend | 3310114 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CD274-PE-CY7 | Biolegend | 329718 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CD43-PE | Ebioscience | 10854419 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CD45-APC | Ebioscience | 15577936 | Dilution factor: 1:20 |
Antibody CD86-APC | Biolegend | 305412 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CD93-PE | Ebioscience | 10804637 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody CX3CR1-PE | Biolegend | 307650 | Dilution factor: 1:100 |
Antibody HLA-DR-BV650 | Biolegend | 307650 | Dilution factor: 1:100 |
Antiboy CD115-PE | Biolegend | 347308 | Dilution factor: 1:40 |
Cell Dissociation Buffer, enzyme free | Thermofisher | 13151014 | |
Cell Dissociation Buffer, enzyme-free, PBS | Gibco | 13151014 | |
CellCarrier-96 Ultra Microplates, tissue culture treated, black, 96-well | PerkinElmer | 6055302 | |
CellMask Deep Red Plasma Membrane Stain | Thermofisher | C10046 | Cryopreservation media |
Cryostor CS10 | Sigma | C2874 | |
CTS CELLstart Substrate | Invitrogen | A1014201 | Stem cell substrate |
DAPI | Merck | D9542-1MG | Final concentration 1 μg/mL |
DPBS, calcium, magnesium (500ml) | Thermofisher | 14040091 | |
FcR Blocking Reagent, human | MACS Miltenyi Biotec | 130-059-901 | |
FGF-Basic (AA 10-155) Recombinant Human Protein | Thermofisher | PHG0021 | |
GlutaMAX Supplement | Thermofisher | 35050061 | |
Human Recombinant IFNY | Thermofisher | 14-8319-80 | |
Human Serum Albuminum | Irvine Scientific | 9988 | |
Lipopolysaccharide (LPS) from E. Coli | Sigma | L2630 | |
NucBlue (Hoechst33342) | Thermofisher | R37605 | |
pHrodo Green Zymosan Bioparticles Conjugate for Phagocytosis | Thermofisher | P35365 | |
Porcine Skin Gelatin | Sigma | G9136 | |
Recombinant Human BMP4 Protein | R&D | 314-BP-010 | |
Recombinant Human IL10 | Preprotech | 200-10 | |
Recombinant Human IL3 | Preprotech | 200-03-10 | |
Recombinant Human IL4 | Preprotech | 200-04 | |
Recombinant Human MCSF (carrier-free) 100ug | Biolegend | 574806 | |
Recombinant Human VEGF Protein | R&D | 293-VE-010 | |
Rock Inhibitor Y-27632 | Merck | SCM075 | |
SCF (C-Kit Ligand) Recombinant Human Protein | Thermofisher | PHC2111 | |
StemPro hESC SFM | Thermofisher | A1000701 | |
StemPro EZPassage Disposable Stem Cell Passaging Tool | Thermofisher | 23181010 | |
Ultralow attachment plates: Cell culture multi-well plate, 6 well, cell star cell repellent surface | Greiner | 657970 | |
UltraPure 0.5 M EDTA, pH 8.0 | Invitrogen | 15575020 | |
X-Vivo 15 500 mL bottle | Lonza | BE02-060F |