אנו מציגים פרוטוקול לבצע מדידות דינמיות של pH נוזלי משטח האוויר בתנאי סרט דק באמצעות קורא צלחת.
בשנים האחרונות, את החשיבות של משטח המים של רירית בדרכי הנשימה כבר הודגש על ידי יכולתה להסדיר את משטח הנשימה נוזלי (asl) לחות, צמיגות ריר ופעילות של פפטידים מיקרוביאלית, פרמטרים מפתח מעורב הגנה מולדת של ריאות. זה של הרלוונטיות העיקרית בתחום של מחלות הנשימה כרונית כגון סיסטיק פיברוזיס (CF) שבו פרמטרים אלה אינם מוסדרים. בעוד קבוצות שונות למדו ASL pH הן בvivo והן בתחום החוץ, השיטות שלהם לדווח על מגוון רחב יחסית של ערכי ה-pH ASL ואפילו ממצאים סותרים לגבי כל הבדלים ב-pH בין תאים שאינם CF ו-CF. יתר על כן, הפרוטוקולים שלהם לא תמיד לספק מספיק פרטים כדי להבטיח את הנתונים, רוב התפוקה נמוכה דורשים ציוד יקר או ידע מיוחד כדי ליישם, מה שהופך אותם קשה להקים ברוב המעבדות. כאן אנו מתארים למחצה אוטומטי הקורא לוחית הניאון האפשרות המאפשרת מדידה בזמן אמת של ASL pH תחת תנאי הסרט דק כי דומה יותר במצב vivo. טכניקה זו מאפשרת מדידות יציבה במשך שעות רבות מתרבויות דרכי הנשימה מרובים בו זמנית, וחשוב, שינויים דינאמיים ב ASL pH בתגובה אגוניסטים ומעכבי ניתן לפקח. כדי להשיג זאת, ASL של הבדיל במלואו תאים האפיתל דרכי הנשימה האנושית (hAECs) הם מוכתם לילה עם צבע pH-רגיש כדי לאפשר את ספיגת הנוזלים העודפים כדי להבטיח את המצב הסרט הדק. לאחר הזריחה הוא מפוקח בנוכחות או העדר של אגוניסטים, כיול pH מבוצע באתרו כדי לתקן את הנפח ואת הריכוז לצבוע. השיטה המתוארת מספקת את הפקדים הנדרשים כדי להפוך יציבה מדידות ASL pH, אשר בסופו של דבר יכול לשמש כפלטפורמה גילוי התרופה עבור רפואה אישית, כמו גם מותאם רקמות אפיתל אחרות וניסיוני תנאים, כגון מודלים דלקתיים ו/או פתוגן-מארח.
האפיתל של דרכי הנשימה מכוסה על ידי דק (~ 10 μm) שכבת הנוזלים כינה את משטח הנשימה נוזלי (ASL). הרכב ועומק (לחות) של asl זה מוסדר היטב ושולט ביעילות של פינוי דרכי הנשימה על ידי הדרגנוע mucociliary1,2,3,4. בשנים האחרונות, את החשיבות של asl H+/hco3– תוכן הוכח על ידי קבוצות שונות בשל יכולתה לווסת asl לחות5, דלקת דרכי הנשימה6 ו זיהום7, 8 וכן צמיגות של ריר8,9. חשוב, למרות שקיים מחלוקות מסוימות, מחקרים רבים דיווחו על דיסרגולציה של pH של דרכי הנשימה במחלות דרכי הנשימה כרונית כגון אסטמה10,11,12, copd11, ברונכיאקטזיס11, כרוניתrhinosinusitis 13,14 ו סיסטיק פיברוזיס (CF)5,9,15,16,17, אשר מציע כי טיפולים השחזור ASL pH יכול להיות שימושי כדי לטפל בסוגים מרובים של מחלות דרכי הנשימה כרונית. CF הוא המחלה השכיחה ביותר אוטוזומלית רצסיבי באוכלוסיות קווקזיות והוא בשל מוטציות ב-מוליכות החשמלית CF הרגולטור (CFTR) גן. זה קודים גן אניון (hco3– ו-Cl–) ערוץ המשחק תפקיד מכריע של הובלה יון ונוזלים הומאוסטזיס על פני epithelia18. למרות CF הוא מחלה רב איברים, פתולוגיה של ריאות היא הגורם העיקרי של תחלואה ותמותה19,20 בהתחשב הפגם העיקרי ב-CF הוא הובלה לקויה של קלרנית-ו- hco3–, אחד יכול לההשערה pH נוזלי מסחטות באנשים עם CF יהיה בלתי מוסדר לעומת אנשים שאין להם CF. Thus, המדידה של ASL pH כבר אזור אקטואלי של מחקר CF וקבוצות שונות פיתחו טכניקות למדוד ASL pH ב CF איירווייז.
בשנת vivo, pH בדרכי הנשימה נמדד באמצעות טכניקות שונות, מ מיקרו זונדים (סיבים אופטיים, זהב או מולודיום רגשים)5,21,22,23,24 מדידות pH של חומר מקוצר או מעובה נשימה נשפה (ebc)10,11,12,25,26,27. בתחום המחקר של CF, pH הוא למד נרחב בשל ההשלכות הקליניות הפוטנציאליות שלה. תיאורטית, הפיכת דרכי הנשימה לאלקליין יותר יכולות להגביר את ההרג החיידקי ולשפר את הסיווג המודלקת והומאוסטזיס בכללותה. עם זאת, במחקרים vivo/ex vivo לדווח על מגוון רחב של ערכי pH, ועד היום, התוצאות אינן מכרעת לגבי קיומו של הבדל ב-ph בין NON-cf ו-cf איירווייז. בשנות האלפיים המוקדמות, קבוצות שונות דיווחו על ה-pH של EBC. בקבוצות שאינן חולות, ערכי ה-ph נעו מ 4.6 אל 8.5 אך מעניין, ebc pH נמצא חומצי יותר במהלך השאיפה אצל אנשים עם CF12,27. לאחרונה, ב vivo מדידות של asl במודלים אנושיים ובעלי חיים של CF דיווחו על תוצאות סותרות16,17,21,22,23, 24 וזה עדיין לא ברור אם האיירווייז CF הם חומציים יותר מאשר non-CF איירווייז.
כמו במדידה vivo של ASL התחתון pH הוכיחה קשה בשל כמות קטנה מאוד של נוזל הבטנה את הנשימה ואת הנוכחות הפוטנציאלית של מאטמי ריר במחלה, קבוצות רבות הפכו בניסויים מבחנה כדי למדוד ASL pH, בעיקר באמצעות שלושה שונים תודולוגיות. הגישה הראשונה משתמשת dextran ביחד תא-ציוויים משמעותו הצבעים פלורסנט pH-רגישים שנוספו כאבקה יבשה, או ישירות asl או באמצעות נוזל אינרטי הנקרא perfluorocarbon (טוראי ראשון)5,8,16 , מיכל בן 17 , מיכל בן 28 , בן 29 , בן 30 , מיכל בן 31 , 32. עם זאת, טכניקה זו מספקת שליטה מועטה על כמות הצבע המדויקת הנוספת לתרבויות ומציגה סיכון לאגרגטים לצבען והבדלים גדולים בריכוז בין דוגמאות ו/או ניסויים ואף בתוך אותה דוגמית . בדרך כלל בוצע במיקרוסקופ קונפוקלית וקד, אשר מגביל את תחולתו ובמקרים רבים, מונע ניטור מפורט של דגימות ושינויים מרובים בתנאי הקלטה. השיטה השנייה המועסקים למדוד asl ph הוא השימוש של מיקרואלקטרודות רגישות ל-ph5,15. לפיכך, מדידות ASL pH אינן תלויות בריכוז לצבוע פלורסנט וצריך לתת תוצאות חזקות יותר ומאודלות. עם זאת, שיטה זו אינה מאפשרת מדידות דינמית בזמן אמת של ASL pH, וגם לא קל לבצע קריאות מרובות בתנאים שונים. זהו גם עבודה אינטנסיבית, מורכבת, תהליך הדורש ציוד מומחה (מיקרואלקטרודה ייצור/אלקטרופיזיולוגיה הקלטה התקנים) והדרכה עבור אוסף של דגימות עבור מדידה pH וכיול עוקבות. יתר על כן, שתי טכניקות אלה הראו גם כמה חוסר עקביות ביכולת לייצר תוצאות לאחר מכן: באמצעות השיטה pH-תלויית צבע פלורסנט, טאנג et al. דיווח ערכים של 7.35 עבור non-CF ASL ו 7.0 עבור CF ASL8 ואילו בעוד הנייר האחרון מאותה קבוצה, ASL pH היה 6.9 ו 6.4 עבור לא CF ו CF, בהתאמה17. באופן דומה, מדידות מיקרואלקטרודה נתן ערכים של 6.4 ב-CF ASL ו 6.1 ב CF ASL במחקר מ 200315 בעוד הקבוצה אותה דיווחו ערכים של 6.7 עבור NON-CF asl ו 6.45 עבור CF asl במחקר מ 20135. בסופו של דבר, בגישה השלישית, החוקרים להוסיף נפח גדול יחסית של פתרון באגירה חלש על המשטח (mucosal) של התרבויות, ובכך להרוס את תנאי הסרט דק ושינוי הרכב ASL, פוטנציאל הרגולציה שלה. ph הוא נמדד אז באמצעות ph-תלויית צבעי פלורסנט33, על ידי שיטת ph-stat השיטה בחדר ussing13,14, או דורש asl מדולל להיות מוסר מן התרבויות ו-ph נמדד באמצעות pH אלקטרודה, מנתח או רצועות לקמוס34. קושי נוסף במדידה המדויקת של ASL pH הוא הקמת עיקול סטנדרטי שהוא מדויק ככל האפשר. ואכן, האם הקריאות מבוצעות באמצעות אלקטרודה שתמדוד את ההפרש בפוטנציאל החשמלי באמצעות שרף או שימוש בצבעי פלורסנט הרגישים ל-pH, הן הגישות הללו יושפעו על ידי המיקרו-סביבה המקומית של הדגימות נמדד. באופן ספציפי יותר, קבוע הדיסוציאציה (Kd) של הצבעים עשוי להשתנות באופן משמעותי בהתאם לטמפרטורה, כוח יוניים, צמיגות, כמו גם אינטראקציה פוטנציאלית של הצבע עם המרכיבים הסלולריים כגון חלבונים וכלי פוטנציאל.
כדי לנסות להתגבר על רבים מהנושאים הטכניים הללו, כמו גם לפתח שיטת תפוקה דינמית יותר, פשוטה וגבוהה יותר, הקמנו טכניקת חוץ-גופית הרושמת את ASL pH בתרבויות הראשיות hAEC באמצעות תא-הכוונה ל-pH רגיש צבע פלורסנט בקורא לוחית מסחרי רגיל. השיטה מייצרת מדידות של שדרוג, דינמי, חצי אוטומטי, בזמן אמת של ה-ASL pH של הבדיל באופן מלא תרבויות התא תלת-ממדי תחת תנאי סרט דק. באמצעות שימוש בקורא צלחת מרובת היטב, זו שיטת חצי אוטומטי יכול לעשות ליד מדידות סימולטני של pH עד 24 מצבים מעל 12 h והוא יכול לפקח על ההשפעה של הוספת אגוניסטים שונים או מעכבי. במאמר זה אנו מתארים את המתודולוגיה בפירוט התוצאות נציג דוחות תחת תנאי שליטה חיוביים ושליליים המאמת את הטכניקה.
כאן אנו מספקים פרוטוקול מפורט עבור המדידה הדינמית של ASL pH בתאי האפיתל דרכי הנשימה האנושית הראשית. צעדים קריטיים כוללים לשטוף את הריר את פני השטח הרשמי של התאים, מדידת וחיסור הרקע באמצעות אותם פרמטרים כמו בניסוי, אופטימיזציה של z-מיקום ולהרוויח וביצוע של כיול pH באתרו.
הצעד הראשון של כביסה התאים הוא קריטי כמו שכבה עבה של ריר יכול (i) למנוע את הצבעים מלהגיע שכבת לקרום הלב (PCL) ו (ii) עיכוב או למנוע את האיתור של שינויים באור הזריחה בתגובה אגוניסטים/מעכבי. השיטה שלנו פותחה כדי ללמוד כיצד haecs העיקרי מאופנן את הפעילות של hco3– ו-H+ מובילים בתגובה לאגוניסטים. למרות שיהיה מעניין לחקור כיצד שינויים ב-PCL ph מתייחסים לשינויים ב-ph ריר, פיתוח נוסף של פרוטוקול זה נדרש, כולל שימוש במשקל מולקולרי שונים למקד את המטרה 2 שכבות ו-z סריקות דרך ה כל מארג
מדידת רקע היא שלב חשוב נוסף של פרוטוקול זה. משטח פסגה של באופן מלא הבדיל בצורה העיקרית epithelia הוא לעתים נדירות שטוח לחלוטין אשר ישפיע על הנתיב האור ולכן את הרקע. הבטחת שקריאות הרקע יבוצעו באותן נקודות מקומיות של הבארות, כמו במהלך הניסוי, באופן קריטי לצורך שמירה ויציבות של ההקלטות.
אופטימיזציה של z-מיקום ולהרוויח הם הצעדים הנחוצים שצריך להיות מוגדר עבור כל ריכוז שונה של צבע פלורסנט אשר ישמש. פעולה זו תמנע השתנות גבוהה בין ניסויים. לאחר ההגדרה, הגישה שלנו מספקת תוצאות יציבות ומשוב. אחת הסיבות לכך היא כי הצבעים מתווספים על פני השטח פסגה על התאים בנפח קטן של נוזל כי הוא נספג בקלות על ידי האפיתל, השארת asl באופן מאוד מתויג הומוקול. שיטה נוספת להכתים את ASL, זה יכול להיות מוצלח באותה מידה, השתמשו באבקה יבשה או “השעיה” בטוראי ראשון. למרות שזה עשוי להיות החיסכון בזמן (כמו הניסויים מבוצעים בדרך כלל בתוך 2 h), לא סביר כי הצבעים היבשים מסיסות באופן מלא ב ASL ולכן יכול גושים אחידים. כך ריכוזים שונים של צבע ה-pH רגיש יימצא על פני השטח של תאים אפיתל.
כיול ה-pH באתרו הוא צעד חשוב כדי להשיג תוצאות מדויקות ומושמעות. כפי שמוצג והוסבר בסעיף התוצאות, הבדלים באמצעי אחסון ASL ישפיעו על ספירות הזריחה ולכן ערכי ה-pH שעברו אינטרפולציה (איור 2 ואיור 3). בעוד קבוצות שונות שפורסמו בעבר asl pH מדידות, מגוון רחב של ערכים הושגו גם בין מחקרים שונים שפורסמו על ידי אותה קבוצה8,17. אנו מאמינים כי על ידי ביצוע באתרו כיול, התוצאות יהפכו יותר להיות מיותר. לעומת טכניקות כיול אחרות של pH, אשר להשתמש בשיטה גבוהה K+/nigericin (או מספר ionophores) כדי ליצור את עקומת רגיל28,29,30, את הבקשה המוצגת כאן יש את היתרון כי , כל עוד כל צעד מבוצע בארון בטיחות, התאים המשמשים ASL pH ניתן לשטוף, נשמר ולעשות שימוש חוזר עבור ניסויים אחרים בתנאי כי הטיפולים ביצעו לא בלתי הפיך להשפיע על התאים האפיתל.
הפיתוח והאופטימיזציה של השיטה סיפקה תוצאות הניתנות לכימות ואנו מאמינים כי שיטה זו תסייע לקבוצות אחרות עם מדידת pH-ASL שלהם. עם זאת, טכניקה זו יש גם כמה מגבלות בשל הגדרת סוג התאים הנמצאים בשימוש. ניטור ASL pH על פרק זמן ארוך יותר מאשר הציג כאן (> 8-10 h) עשוי להתברר קשה כמו סביבה ארוכת טווח לחות גבוהה עלול לגרום נזק לציוד והעובדה כי רוב קוראי הצלחת רק להציע את האפשרות להקליט קריאות קינטי על פרק זמן מסוים (בדרך כלל 24 שעות). השימוש במלואו haecs העיקרי הוא קריטי באופן שלבים שונים של בידול ישפיע על הביטוי של hco3– ו-H+ מובילים. עם זאת, אין כמעט כל אפשרות לשלוט במדויק את עוצמת הקול של ASL בתאים גדל תחת תנאי הסרט דק. כפי שצוין בפרוטוקול ואת סעיפים התוצאות, שינויים באמצעי האחסון ישפיע על יחס הזריחה, ולמרבה הצער יש צורך להניח כי בתאים גדלו מאדם אחד, שנזרע באותו יום על תמיכה שונים למחצה חדירות, כרכים ASL יהיה אותו הדבר הנובע ממגבלה זו, כל אגוניסט או מעכבי שישפיעו על הפרשת הנוזלים או על הספיגה ישפיעו על אמצעי האחסון ASL וכנראה את יחסי הזריחה. עם זאת, במסגרת שלנו, עקומת הכיול מבוצעת בסוף הניסוי, כך שאנו יכולים להניח ששינויים אלה באמצעי האחסון ישפיעו על יחסי הכיול באותו אופן כמו במהלך הניסוי הקינטי. מסיבה זו אנו מייעצים לקבוצות שיהיו מעוניינות לפתח בדיקה זו, להשתמש ב-2-3 לפחות משכפל לכל תנאי שנבדק, כך שיאפשר הקמת עקומה סטנדרטית לכל תנאי.
כאן אנו מציגים פשוטה, חצי אוטומטי, שיטת המאפשר מדידה בזמן אמת של pH משטח מתחת לתנאים הסרט דק. יש לו את היכולת לחקור תגובות ה-pH דינאמי בתרבויות רבות באופן כמעט סימולטני המאפשר השוואות בין הפנים והתורמים. הפיכה של שיטה זו לתבנית צלחת 96 היטב באמצעות מערכת מקוטב (HTS 96 לוחות הבאר)38 יספק תפוקה גבוהה אף יותר כמו שיטת גילוי התרופה. יתר על כן, הצגנו כיצד טכניקה זו יכולה לשמש כדי ללמוד את ההשפעה החריפה של אגוניסטים ב-asl pH ואנחנו כבר פרסמו כי שיטה זו יכולה לשמש כדי ללמוד את ההשפעה ארוכת טווח של מעכבי משאבת פרוטון פסגה ב-CF haecs asl39. כמו ph הוכח לווסת זיהום, דלקת, צמיגות של ריר והובלת יונים, זיהוי מטרות מולקולריות שיכולות להגדיל את ה-ph יהיה בעל ערך בתחומי המחקר של מחלות ריאה כרוניות וטכניקה זו עשויה להקל על ה פיתוח הקרנת סמים בגישות לרפואה אישית. בסופו של דבר, מאז דיסתקנה ב-חומצה בסיס הומאוסטזיס משחק תפקיד מרכזי במחלות אחרות, פרוטוקול זה יכול להיות מותאם, עם שלבי אופטימיזציה, ציוד שונים (הקוראים לוחית) וסוגי תאים, כגון תאים אפיתל אחרים. חומציות מסחטות הוא מאפיין של סרטן40,41,42 ושיטת זה יכול לעזור לקבוע כיצד גידולים מוצקים לייצר pH נמוך או יכול לשמש בתור התפוקה נמוכה ההקרנה התרופה שיטת הסינון עבור שחזור של הומאוסטזיס pH. באופן דומה, באשר למחלות דרכי הנשימה כרוניות, היא יכולה גם לספק פלטפורמה לפיתוח גישה רפואית אישית.
The authors have nothing to disclose.
עבודה זו נתמכת על ידי שני מענקים CF Trust מרכז מחקר אסטרטגי (SRC003 ו SRC013) ו מועצת מחקר רפואי (MRC) ביטחון במענק המושג (MC_PC_15030). JG היה נתמך על ידי מענק מתוך הקרן למחקר רפואי (MRF-091-0001-RG-גרנט). מגה-בתים נתמך על ידי מועצת המחקר הרפואי האגודה הקלינית מדען (MR/M008797/1). IH נתמכת על ידי מלגת אימון קליני ברוך הבא (203520/Z/16/Z). המחקר נתמך על ידי המכון הלאומי לחקר בריאות ניוקאסל מרכז המחקר ביורפואי מבוסס בבית החולים ניוקאסל אמון ואוניברסיטת ניוקאסל. ההשקפות המובעות הן אלה של המחברים ולא בהכרח של משרד הבריאות, ה-NIHR או מחלקת בריאות. התאים הראשוניים של ד ר רנדל היו נתמכים על ידי מענק סיסטיק פיברוזיס קרן (BOUCHE15R0) ו-NIH מענק (P30DK065988).
0.2 µm syringe filter | Starlab | E4780-1226 | |
6.5 mm Transwell with 0.4 µm Pore Polyester Membrane Insert | Corning | 3470 | |
CaCl2 | Sigma Aldrich | 21115 | |
CFTRInh172 | RnD Systems (Tocris) | 3430 | Stock Concentration: 50 mM; Final Concentration: 20 µM |
Costar 24-well Clear TC-treated Multiple Well Plates | Corning | 3524 | |
dextran-coupled pH-insensitive fluorescent dye: AlexaFluor488-dextran | ThermoFisher | D22910 | Stock Concentration: 1 mg/mL; Final Concentration: 0.67 mg/mL |
dextran-coupled pH-sensitive fluorescent dye: pHrodo-dextran | ThermoFisher | P10361 | Stock Concentration: 1 mg/mL; Final Concentration: 0.67 mg/mL |
D-glucose | Sigma Aldrich | G5767 | |
Forskolin | RnD Systems (Tocris) | 1099 | Stock Concentration: 50 mM; Final Concentration: 10 µM |
Greiner CELLSTAR 96 well plates | Cellstar | 655180 | |
Humidity cassette | TECAN | 30090495 | |
KCl | Sigma Aldrich | P9541 | |
MES | Sigma Aldrich | M3885 | |
MgCl2 | Sigma Aldrich | M1028 | |
NaCl | Sigma Aldrich | S9888 | |
NaHCO3 | Sigma Aldrich | S5761 | |
NaHepes | Sigma Aldrich | H3784 | |
Plate reader: TECAN SPARK 10M | TECAN | 30086375 | |
Tris | Sigma Aldrich | T1503 | |
Universal pH electrodes DJ 113 | VWR | 662-1385 |