Denne protokol beskriver Sådan oprettes viral infektion i vivo i Drosophila melanogaster ved hjælp af nano-injektion metode og grundlæggende teknikker til at analysere virus-værts-samspillet.
Virus spredning er en væsentlig årsag til epidemiske sygdomme. Dermed, forståelse samspil mellem virus og værten er meget vigtigt at udvide vores viden om forebyggelse og behandling af virusinfektion. Frugtflue Drosophila melanogaster har vist sig for at være en af de mest effektive og produktive modelorganismer til at screene for antiviral faktorer og undersøge virus-vært interaktion, på grund af stærke genetiske værktøjer og meget velbevarede medfødte immun signalering veje. Proceduren beskrevet her viser en nano-injektion metode til at fastlægge viral infektion og fremkalde systemisk antiviral svar i voksne fluer. Den præcis kontrol af viral injektion dosis i denne metode giver høj eksperimentelle reproducerbarhed. Protokoller er beskrevet i denne undersøgelse omfatter forberedelse af fluer og virus, injektion metode, overlevelse sats analyse, virus belastning måling og antiviral pathway vurdering. Indflydelse virkningerne af viral infektion af fluer baggrund blev nævnt her. Denne infektion metode er nem at udføre og kvantitativt gentagelig; Det kan anvendes til at screene for host/viral faktorer involveret i virus-vært interaktion og at dissekere krydstale mellem medfødte immun signalering og andre biologiske veje som svar på viral infektion.
Nye virale infektioner, især af arboviruses, såsom den Chikungunya virus1, Dengue virus, gul feber virus2 og Zikavirus3, har været en stor trussel mod folkesundheden ved at forårsage pandemier 4. således en bedre forståelse af virus-vært interaktion er blevet stadig vigtigere for epidemiske kontrol og behandling af virale sygdomme hos mennesker. For dette mål, skal mere passende og effektive modeller oprettes til at efterforske de mekanismer, der ligger til grund for virusinfektion.
Frugtflue, Drosophilamelanogaster (D. melanogaster), sørger et kraftfuldt system for at undersøge virus-vært interaktion5,6 og har vist sig for at være en af de mest effektive modeller til at studere menneskets virussygdomme7 , 8 , 9. stærkt bevarede antiviral signalering veje og uforlignelige genetiske værktøjer gør flyver en stor model for at give betydelige resultater med reelle konsekvenser for menneskers antiviral undersøgelser. Derudover fluer er nemt og billigt at opretholde i laboratoriet og er bekvemt for omfattende screening af roman regulerende faktorer6,10 i virus og værten under infektion.
Fire store stærkt bevarede antiviral veje (fx., RNA interferens (RNAi) vej11, JAK-STAT vej12, NF-κB vej og autophagy vej13) er godt undersøgt i Drosophila i de seneste år6. RNAi-vej er en bred antiviral mekanisme, der kan undertrykke de fleste former for virus infektion6,14. Afbrydelse af denne vej af mutation i gener som Dicer-2 (Dcr-2) eller Argonaute 2 (AGO2) kan føre til øget virus titer og vært dødelighed15,16,17. JAK-STAT pathway har været impliceret i kontrol af infektion med en virus fra familien Dicistroviridae og familien Flaviviridae i insekter, fx., Drosophila C virus (DCV) i fluer16 og West Nile-virus (VNV) og Dengue Virus i myg18,19. Drosophila vejafgift (homologe til den menneskelige NF-κB vej) og immundefekt (IMD) veje (svarende til den menneskelige NF-κB og TNF pathway) er begge involveret i forsvaret virus invasionen20,21, 22. autophagy er en anden bevarede mekanisme, der er involveret i reguleringen af viral infektion, som er godt præget i Drosophila23,24. Således, identifikation af nye regulerende faktorer af disse veje og dissekere krydstale mellem disse antiviral signalering og andre biologiske veje som stofskifte, aldring, neurale reaktion og så videre, kan være nemt at sætte op i Drosophila system.
Selv om mest veletablerede viral smitsomme modeller i Drosophila er induceret af RNA-vira, infektion af hvirvelløse iriserende Virus 6I (IV-6) og Kallithea virus har vist potentiale for undersøgelse af DNA virus i fluer25, 26. Virussen kan desuden også ændres for at tillade infektion i Drosophila, såsom influenzavirus9. Dette har stærkt udvidet anvendelse af Drosophila screening platform. I denne procedure bruger vi DCV som et eksempel til at beskrive hvordan man kan udvikle en viral smitsomme system i Drosophila. DCV er en positiv følelse enkelt strandede RNA virus af ca 9300 nukleotider, kodning 9 proteiner27. Som en naturlig patogen af D. melanogasterbetragtes DCV som en egnet virus at studere vært fysiologiske, adfærdsmæssige og basal immunrespons i værten-virus interaktion og co-Evolution28. Derudover gør dens hurtige dødelighed efter infektion i vildtype fluer DCV nyttigt at screene for resistente eller modtagelige gener i vært29.
Men der er flere aspekter af bekymring når man studerer virale infektioner i Drosophila. For eksempel, har symbiotisk bakterier Wolbachia en evne til at hæmme et bredt spektre af RNA-virus spredning i Drosophila og myg30,31,32. Seneste beviser viser en mulig mekanisme i hvilke Wolbachia blokke Sindbis virus (SINV) infektion gennem opregulering af methyltransferase Mt2 udtryk i vært33. Den genetiske baggrund for insekter er desuden også afgørende for virusinfektion. For eksempel, den naturlige polymorfi i gen, pastrel (pst), bestemmer modtagelighed for DCV infektion i Drosophila34,35, mens loci Ubc-E2H og CG8492 er involveret i Cricket lammelse virus (CrPV) og Flock hus virus (FHV) infektion, henholdsvis36.
De særlige måder at etablere virus-værts-samspillet i fluer, skal vælges efter forskningsformål som en høj overførselshastighed skærmen til værten cellulære komponenter i Drosophila celle linjer37,38, mundtlige infektion at studere gut-specifikke antivirale svar22,39,40, nål pricking41,42 eller nano-injektion ved at passere epitelial barrierer for at stimulere systemisk immun svar. Nano-injektion kan netop kontrollere viral dosis for at fremkalde en kontrolleret antiviral reaktion og en fysiologisk læsion43, dermed garantere høj eksperimentelle reproducerbarhed44. I denne undersøgelse beskriver vi en nano-injektion metode for at studere virus-værtssammenspil i Drosophila, fremhæver betydningen af fluer baggrundseffekter.
I denne artikel præsenterer vi en detaljeret procedure om, hvordan at skabe en viral smitsomme system i voksen Drosophila melanogaster ved hjælp af nano-injektion. Protokollerne omfatter udarbejdelsen af passende flyve linjer og virus lager, infektion teknikker, evaluering af smitsomme indikatorer og måling af de antivirale svar. Selvom DCV bruges som et eksempel på en viral patogen, har snesevis af forskellige slags virus været anvendt med succes til undersøgelse i Drosophila system. Derudover er hundredv…
The authors have nothing to disclose.
Vi vil gerne takke hele Pan laboratoriet i IPS. CAS. Vi takker Dr. Lanfeng Wang (IPS, CAS) for eksperimenterende bistand og Dr. Gonalo Cordova Steger (Springer natur), Dr. Jessica VARGAS (IPS, Paris) og Dr. Seng Zhu (IPS, Paris) for kommentarer. Dette arbejde blev støttet af tilskud fra den strategiske prioritet Research Program af kinesiske Academy of Sciences Larsen (XDA13010500) og Vivi Hansen (XDB29030300), National Natural Science Foundation of China Larsen (31870887 og 31570897) og J.Y (31670909). Larsen er en fellow af CAS ungdom Innovation fremme Association (2012083).
0.22um filter | Millipore | SLGP033RS | |
1.5 ml Microcentrifuge tubes | Brand | 352070 | |
1.5 ml RNase free Microcentrifuge tubes | Axygen | MCT-150-C | |
10 cm cell culture dish | Sigma | CLS430167 | Cell culture |
100 Replacement tubes | Drummond Scientific | 3-000-203-G/X | |
15 ml tube | Corning | 352096 | |
ABI 7500 qPCR system | ABI | 7500 | qPCR |
Cell Incubator | Sanyo | MIR-553 | |
Centriguge | Eppendof | 5810R | |
Centriguge | Eppendof | 5424R | |
Chloroform | Sigma | 151858 | RNA extraction |
DEPC water | Sigma | 95284-100ML | RNA extraction |
Drosophila Incubator | Percival | I-41NL | Rearing Drosophila |
FBS | Invitrogen | 12657-029 | Cell culture |
flat bottom 96-well-plate | Sigma | CLS3922 | Cell culture |
Fluorescence microscope | Olympus | DP73 | |
Isopropyl alcohol | Sigma | I9516 | RNA extraction |
Lysis buffer (RNA extraction) | Thermo Fisher | 15596026 | TRIzol Reagent |
Lysis buffer (liquid sample RNA extraction) | Thermo Fisher | 10296028 | TRIzol LS Reagent |
Microscope | Olympus | CKX41 | |
Nanoject II Auto-Nanoliter Injector | Drummond Scientific | 3-000-204 | Nanoject II Variable Volume (2.3 to 69 nL) Automatic Injector with Glass Capillaries (110V) |
Optical Adhesive Film | ABI | 4360954 | qPCR |
Penicillin-Streptomycin, Liquid | Invitrogen | 15140-122 | Cell culture |
qPCR plate | ABI | A32811 | qPCR |
Schneider’s Insect Medium | Sigma | S9895 | Cell culture |
statistical software | GraphPad Prism 7 | ||
TransScript Fly First-Strand cDNA Synthesis SuperMix | TransScript | AT301 | RNA extraction |
Vortex | IKA | VORTEX 3 | RNA extraction |