Summary

Modification et fonctionnalisation du groupe Guanidine par Précurseurs sur mesure

Published: April 27, 2017
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Summary

Un protocole pour la synthèse de guanidines modification alkyle basés sur l'utilisation des précurseurs correspondants est présentée.

Abstract

Le groupe guanidino est l'un des plus importants groupes pharmacophores en chimie médicinale. Le seul acide aminé portant un groupe guanidine est l'arginine. Dans cet article, une méthode simple pour la modification du groupe de guanidine en ligands peptidiques est prévu, avec un exemple de ligands d'intégrine RGD liant. Il a été récemment démontré que la modification distincte du groupe guanidine dans ces ligands permet la modulation sélective du sous – type (par exemple, entre les sous – types aV et α5). De plus, une stratégie auparavant inconnue pour la fonctionnalisation par le groupe guanidino a été démontrée, et l'approche synthétique est examinée dans le présent document. Les modifications décrites ici impliquent terminale (N ω) des groupes guanidine alkylés et acétylés. Pour la synthèse, des molécules de précurseur sur mesure sont synthétisés, qui sont ensuite soumis à une réaction avec une amine déprotégée orthogonalement pour transférer le préguanidinique -Modified. Pour la synthèse de guanidines alkylées, les précurseurs à base de N, -di-Boc-1 H-pyrazole-1-carboxamidine N 'sont utilisés pour synthétiser des composés acylés, le précurseur de choix étant un dérivé acylé de façon correspondante de N – Boc – S – méthylisothiourée, qui peut être obtenu dans les réactions à une et à deux étapes.

Introduction

Parmi les groupements pharmacophores les plus abondants dans les ligands naturels est le groupe de guanidine, qui est impliquée dans de multiples interactions 1, 2. Par exemple, il sert de quatre fois le potentiel donneur d'hydrogène dans des interactions de liaison hydrogène et est impliqué dans des interactions électrostatiques, tels que les ponts salins ou des interactions π-cation. Dans la chimie médicinale, ce groupe est souvent trouvé dans les médicaments et les médicaments candidats 4, bien que très souvent mimétiques guanidines 5, 6. La raison du développement de mimétiques de guanidine est la suppression de l'omniprésent, un groupe guanidine chargé positivement, ainsi que l'ajustement de la lipophilie du ligand. Dans les ligands peptidiques, le seul groupe contenant de l'acide aminé est l'arginine guanidine, qui est donc souvent trouvé dans la région bioactive de ligands peptidiques.

Une très prominent exemple pour une famille de ligands contenant de l'arginine est la sous-famille des intégrines RGD liant. En général, les intégrines sont une classe de récepteurs d'adhésion cellulaire, qui prennent en charge des fonctions importantes dans tous les organismes supérieurs. Certaines de ces fonctions impliquent l'adhésion cellulaire, la migration et la survie des cellules. Ainsi, ils sont également impliqués dans des indications pathologiques, comme le cancer et la fibrose. Les intégrines sont des protéines transmembranaires hétérodimériques consistant en un α- et une sous-unité β qui forment les sous-types 24 d'intégrine connus; 8 d'entre eux reconnaissent la séquence tripeptidique Arg-Gly-Asp (RGD =) dans leurs ligands 7. La région de liaison est située à l'interface entre ces deux sous – types dans la partie extracellulaire, que l'on appelle groupe de tête de l' intégrine 8. RGD est reconnu par deux interactions communes: le site d'adhésion dépendant de l'ion métallique (MIDAS) région, qui est située dans la sous-unité bêta et qui se lie à l'acide carboxylique dans les ligands (côté chaen Asp); et le groupe guanidine des ligands, qui se trouve dans la sous-unité alpha. La plupart des sous – types d' intégrine sont promiscuité et partagent au moins une partie de leur matrice extracellulaire naturelle (ECM) des ligands 9. Ainsi, pour le développement de ligands artificiels intégrines, le principal objectif est, outre une affinité de liaison élevée, la sélectivité du sous-type. Récemment, nous avons pu dévoiler un élément clé pour la génération de ligands sous-type sélectif: le groupe guanidique. Grâce à des modifications distinctes, des ligands pour le biselective αv- et α5 intégrine contenant des sous – types peuvent être transformés en composés sélectifs par de simples modifications sur le groupe de guanidine, qui peut alors distinguer les différentes sous – unités α-10.

Dans la poche de aV, le groupe guanidine interagit côté via un pont de sel bidentate avec Asp218 11, 12. Cette interaction cun lieu d' observer également dans α5β1 (ici, avec Asp227 en α5), mais en outre, une extrémité sur l' interaction du groupe guanidine par un résidu Gln (Gln221) est observée là 13. Ainsi, nous avons modifié le groupe guanidine de deux manières opposées: dans un cas, en bloquant la partie en interaction avec la méthylation de la N δ du groupe de guanidine, et dans l'autre cas, avec la méthylation du N guanidine ω, bloquant l'interaction en bout. Étonnamment, cette petite modification a conduit à un changement de sélectivité complète dans les ligands. En plus de l'alkylation, une nouvelle méthode de fonctionnalisation a été introduit dans cette publication. Le procédé de fonctionnalisation classique pour ce type de ligand pentapeptidic est par la conjugaison de la chaîne latérale d'un acide aminé non impliqué dans la liaison (par exemple, K c (RGDfK)) 14, 15. Ici,nous montrons que fonctionnalisation est également possible en modifiant la guanidique – ce qui est crucial pour la liaison – avec un acyl ou agent de liaison alkylée. La charge positive qui est essentielle pour la liaison est maintenue, et les modèles suggèrent que les longs points de chaîne hors de la poche de liaison, fournissant ainsi une possibilité idéale pour la fixation d'autres groupes de liaison et des unités étiquetage (par exemple, un marqueur fluorescent ou un agent chélatant pour moléculaire imagerie).

Dans ce travail, nous nous concentrons sur les étapes de préparation pour la modification du groupe guanidique ligands contenant de l'arginine. Cela implique la synthèse de N d'espèces -methylated, ainsi que guanidines avec des unités de liaison plus. Les différentes modifications comprennent des groupes acyle et alkyle.

Protocol

Remarque: Tous les réactifs et les solvants ont été obtenus auprès de fournisseurs commerciaux et ont été utilisés sans autre purification. Attention: S'il vous plaît consulter toutes les fiches de sécurité des matières pertinentes (FS) avant utilisation. S'il vous plaît utiliser tous les équipements de sécurité appropriés lors de l' exécution des synthèses chimiques (par exemple, hotte, lunettes de sécurité, gants, blouse de laboratoire, pantalons pleine lon…

Representative Results

Le précurseur de peptide cyclique a été synthétisé comme un peptide linéaire, cyclisé, et orthogonalement Dde-déprotégé. Après la précipitation, on a analysé la pureté du composé par HPLC-MS (Figure 1). Pour surveiller la progression de la réaction, une analyse par HPLC a été réalisée après que le temps de réaction de 2 h (figure 2). Pour les résidus plus importants sur …

Discussion

Le précurseur de guanidinylation est un dérivé de peptide cyclique orthogonalement déprotégé, (c (OrnD (Ot Bu) Gf (N Me) V)), qui est synthétisé par un protocole Fmoc standard de synthèse peptidique en phase solide (SPPS). L'ornithine est utilisé en tant que dérivé protégé orthogonalement, (-OH Fmoc-Orn (Dde)), qui peut être déprotégé avec de l'hydrazine dans du DMF après la cyclisation du squelette peptidique. Le précurseur de peptide est purifié par précipitatio…

Divulgazioni

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

TGK reconnaît la Graduate School international pour la science et du génie (IGGSE) de la Technische Universität München pour leur soutien financier. HK reconnaît le Centre pour la science des protéines intégrées Munich (CIPSM) pour leur soutien.

Materials

N,N′-Di-Boc-1H-pyrazole-1-carboxamidine, 98%  Sigma Aldrich 434167 ALDRICH
Triphenylphosphine, 99% Sigma Aldrich T84409 SIGMA-ALDRICH
Tetrahydrofuran, >99.5% Carl Roth 4745
Tetrahydrofuran anhydrous, 99.8% Carl Roth 5182
Methanol anhydrous, 99.8% Sigma Aldrich 322415 SIGMA-ALDRICH
Diisopropyl azodicarboxylate, 98% Sigma Aldrich 225541 ALDRICH
Dichlormethan, for synthesis, 99.5% Carl Roth 8424
Silica gel for flash chromtaography Sigma Aldrich 60738 SIGMA-ALDRICH
n-Pentane, 99% Carl Roth 8720
n-Hexane, 99% Carl Roth CP47
Ethylacetate, 99.5% Carl Roth 7338
Aminohexanol, 95% Sigma Aldrich A56353 ALDRICH
S-Methylisothiourea hemisulfate, 98% Sigma Aldrich M84445 ALDRICH
Di-tert-butyl dicarbonate, 99% Sigma Aldrich 205249 ALDRICH
N,N-Dimethylformamid, 99.8% Carl Roth A529
N,N-Diisopropylethylamin, 99.5% Carl Roth 2474
Acetic anhydrid, 99% Carl Roth 4483
Chlortrityl resin Carbolution CC11006
Fmoc-Gly-OH, 98% Carbolution CC05014
Piperidin, 99% Sigma Aldrich 104094 SIGMA-ALDRICH
Fmoc-Orn(Dde)-OH Iris-Biotech FAA1502
HATU, 99% Carbolution CC01011
HOAt, 99% Carbolution CC01004
Fmoc-Val-OH Carbolution CC05028
2-Nitrobenzenesulfonyl chloride, 97% Sigma Aldrich N11507 ALDRICH
2,4,6-Collidine, 99% Sigma Aldrich 27690 SIGMA-ALDRICH
Mercaptoethanol, 99%  Sigma Aldrich M6250 ALDRICH
Diazabicycloundecen, 98% Sigma Aldrich 139009 ALDRICH
Fmoc-D-Phe-OH, 98% Sigma Aldrich 47378 ALDRICH
Fmoc-Asp(OtBu)-OH, 98% Carbolution CC05008
Hexafluoroisopropanol Carbolution CC03056
Diphenylphosphoryl azide, 97% Sigma Aldrich 178756 ALDRICH
TFA, 99.9% Carl Roth P088
Triisopropylsilan, 98% Sigma Aldrich 233781 ALDRICH
Acetonitrile, HPLC grade Carl Roth HN44

Riferimenti

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Citazione di questo articolo
Kapp, T. G., Fottner, M., Kessler, H. Modification and Functionalization of the Guanidine Group by Tailor-made Precursors. J. Vis. Exp. (122), e54873, doi:10.3791/54873 (2017).

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