Vele experimentele systemen zijn gebruikt om de mechanismen reguleren T cel ontwikkeling en functie van een immuunrespons begrijpen. Hier een genetische benadering met behulp van retrovirale transductie wordt beschreven, dat is economisch, tijd efficiënt, en nog belangrijker, zeer informatieve bij het identificeren van de regelgeving paden.
Helper T cell development and function must be tightly regulated to induce an appropriate immune response that eliminates specific pathogens yet prevents autoimmunity. Many approaches involving different model organisms have been utilized to understand the mechanisms controlling helper T cell development and function. However, studies using mouse models have proven to be highly informative due to the availability of genetic, cellular, and biochemical systems. One genetic approach in mice used by many labs involves retroviral transduction of primary helper T cells. This is a powerful approach due to its relative ease, making it accessible to almost any laboratory with basic skills in molecular biology and immunology. Therefore, multiple genes in wild type or mutant forms can readily be tested for function in helper T cells to understand their importance and mechanisms of action. We have optimized this approach and describe here the protocols for production of high titer retroviruses, isolation of primary murine helper T cells, and their transduction by retroviruses and differentiation toward the different helper subsets. Finally, the use of this approach is described in uncovering mechanisms utilized by microRNAs (miRNAs) to regulate pathways controlling helper T cell development and function.
The immune response must be highly regulated to eliminate infections but prevent attacks on self-tissue that lead to autoimmunity. Helper T cells play an essential role in regulating the immune response, and a great deal of effort has been undertaken to understand their development and function (illustrated in several recent reviews 1-3). However, many questions remain, and many approaches have been utilized to study the mechanisms controlling helper T cell development and function. These have ranged from the use of in vitro cell culture systems to whole animals. Cell culture systems, especially those using cell lines, offer the benefit of ease of use and the ability to generate large amount of material to do sophisticated biochemical analyses. However, they suffer from their limited ability to reproduce the actual conditions occurring in an immune response. In contrast, whole animal experiments offer the benefit of relevance, but they can suffer from difficulties in manipulation and the ability to perform precise controls in addition to their large costs and ethical implications. Nevertheless, the vast majority of helper T cells studies today still require the use of whole animal experiments involving primary T cells because of the inability of cell lines to duplicate the exact steps occurring in the whole animal. Therefore, it is essential to utilize cost effective approaches that are highly informative.
Genetics is one powerful tool to study helper T cell development and function, yet traditional methods involving gene knockouts or transgenes are time consuming and expensive so they are often out of reach of small labs. However, retroviral transduction offers a powerful, rapid and, cost effective genetic approach to study the mechanisms of specific gene products. Therefore, it is commonly used in papers studying helper T cell development and function.
We have optimized a procedure for retroviral transduction of helper T cells. It utilizes the pMIG (Murine stem cell virus-Internal ribosomal entry site-Green fluorescent protein) retroviral expression vector, in which the gene of interest can be cloned and thereby expressed from the retrovirus long terminal repeat (LTR) 4. In addition, downstream of the inserted gene of interest is an internal ribosome entry sequence (IRES) followed by the green fluorescent protein (GFP) gene so transduced cells can easily be followed by their expression of GFP. The vector was originally derived from the Murine Stem Cell Virus (MSCV) vectors, which contain mutations in repressor binding sites in the LTRs making them resistant to silencing and thus, giving high expression in many cell types including helper T cells 5,6. Production of high titer retrovirus requires a simple transient transfection protocol of human embryonic kidney (HEK) 293T cells with the MIG vector and a helper virus vector that expresses the retroviral GAG, Pol, and Env genes. For this the pCL-Eco helper virus vector 7 works well in producing high titer replication incompetent retroviruses.
Here these protocols for retroviral production and transduction of primary murine T cells are described in addition to some of our results using this approach to study miRNA regulation of gene expression controlling helper T cell differentiation. miRNAs are small RNAs of approximately 22 nucleotides in length that post-transcriptionally regulate gene expression by targeting homologous sequences in protein encoding messenger RNAs and suppressing translation and inducing message instability 8,9. miRNAs play critical roles in developmental gene regulation. They are essential in the earliest stages of development, as embryos that cannot produce miRNAs die at a very early stage 10. In addition miRNAs are important later on in the development of many tissues. They are thought to function by fine-tuning the expression of genes required for developmental programs 1. In helper T cells miRNAs play multiple roles and are required for regulatory T cell (Treg) development 11-14. We used retroviral transduction as a means to dissect the mechanisms of miRNA regulation of Treg differentiation 15. Through such studies important individual miRNAs were determined by retroviral-mediated overexpression. Subsequently, relevant genes regulated by these miRNAs were identified in order to understand the molecular pathways regulated by miRNAs in helper T cell differentiation.
Retroviraal gemedieerde overexpressie van genen is een krachtige manier te functioneren in helper T-cellen te analyseren, omdat de ontwikkeling en functie vaak wordt bepaald door het expressieniveau van sleutelregulatoren. Echter voorzichtige interpretatie van de resultaten vereist omdat expressieniveaus aanzienlijk boven het endogene gen veel artefacten kunnen introduceren. Daarom moet deze techniek worden gecombineerd met anderen om de relevantie van werking gecontroleerd. Bijvoorbeeld, overexpressie moet worden aangevuld met een verminderde expressie via siRNA of gen knockouts indien beschikbaar. Met miRNAs, we aangevuld overexpressie experimenten met die van het blokkeren door het gebruik van virussen die kunstmatige miRNA richten op sites die als competitieve remmers fungeerde voor een miRNA 15 overexpressie. Retrovirale getransduceerde cellen kunnen ook worden gebruikt bij biochemische assays met RNA- en eiwitanalyse. Echter een belangrijke beperking van deze experimenten is de efficiëntie van transductie resUlting in een gemengde populatie van getransduceerde en getransduceerde cellen. Daarom zullen deze assays waarschijnlijk vereisen sorteren van de GFP + populatie. Tenslotte moet in vitro differentiatie assays worden gecombineerd met in vivo experimenten, en een manier waarop dit kan worden bereikt is door adoptief overbrengen van de getransduceerde T-cellen in muizen en na hun differentiatie en hun effect op de immuunrespons.
Een van de belangrijkste beperkingen van dit systeem is de grootte van het RNA genoom die kan worden verpakt in het capside retrovirale. In onze ervaring, de maximale grootte inzetstuk voor MIG retrovirale systeem dat goed virus productie geeft is 3-3,5 kb. Daarom kan groter genen niet worden geanalyseerd met het systeem omdat zij geven slechte virustiters. De meeste genen zijn kleiner dan deze grootte zodat dit systeem is bruikbaar voor een groot aantal genen studies.
Met retrovirale transductie, verschillende alternatieven binnen deze protocols zijn gebruikt. Veel onderzoekers hebben verpakkende cellijnen die stabiel de retrovirale genen (bijvoorbeeld referentie 16) drukken toegepast. Echter, hebben we de hoogste titers middels standaard HEK 293T cellen met co-transfectie van de PCL-Eco helpervirus vector verkregen. Isolatie van naïeve helper-T-cellen kunnen ook worden bereikt door celsortering plaats van de magnetische bolletje en celscheiding kolom protocol, maar dit vereist toegang tot een cel sorteerder en de kosten voor soort tijd zijn meestal hoger dan de kraal reagentia. Tenslotte zijn er variaties op activeringsomstandigheden gebruikt voor helper T-cellen differentiëren tot de verschillende subgroepen. Bijvoorbeeld, TCR stimulatie van de cellen te lang voor de blootstelling aan Treg inducerende omstandigheden kunnen hun inductie 16 remmen. Dit kan een probleem zijn omdat retrovirale expressie celdeling geïnduceerd door stimulatie van cellen vereist. Toch hebben we een efficiënte Treg inductie gebruik van dit protocol met O / N activ gevondenatie voorafgaand aan retrovirale transductie.
Binnen deze protocollen, succesvolle toepassing vereist verschillende factoren. Hoge titer retrovirus voorbereidingen nodig efficiënte transfectie van de HEK 293T cellen, zodat een hoge kwaliteit van DNA en nauwkeurig voorbereid 2x HBS zijn belangrijk. Bovendien, de celdichtheid van de HEK 293T cellen moet ongeveer 50% op het punt van transfectie zijn omdat goede expressie van het getransfecteerde DNA vereist dat de cellen actief groeien, en dit zal worden stopgezet indien de cellen te dun of dik. Cellen op het optimale dichtheid tijdens transfectie moet samenloop bereiken op enig moment tijdens het virus verzameling stappen, maar ze zullen blijven produceren van hoge titer virus voorraden helemaal door tot de laatste collectie. Efficiënte differentiatie van de helper T-cellen vereist goede kwaliteit cel zodat ervoor dat geïsoleerde cellen om de zuiverheid in figuur 1. Ook de kwaliteit van de cellen is afhankelijk van de muizen frOM waarin ze werden geïsoleerd. Voor deze studies hebben we gebruik 6-8 weken oude C57BL / 6 muizen. Oudere muizen minder naïeve cellen, en andere stammen kunnen verschillen in hun differentiatie. Bijvoorbeeld BALB / c muizen gevoeliger voor Th2 responsen dan C57BL / 6-muizen 17 zoals hierboven vermeld, C57BL / 6 T-cellen kan moeilijk zijn om een Th2 respons induceren. Bovendien kan elk van de differentiatie weer licht verschillen van lab tot lab, en het effect van overexpressie kan alleen zichtbaar in sub-optimale condities worden zo cytokine concentraties in de diverse polarisatieomstandigheden moet worden getitreerd. Tenslotte effecten van de tot overexpressie gebrachte gen of polarisatieomstandigheden op celproliferatie kan het transductierendement zodat het effect meten van het gen van belang kan vereisen optimalisatie van de timing en de concentratie van polariserende reagentia beïnvloeden. Het optimaliseren van al deze factoren moet leiden tot informatieve resultaten met dit systeem.
The authors have nothing to disclose.
This work was supported by a Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) grant (BB/H018573/1) and a BD Biosciences grant.
RPMI | Sigma | R8758 | |
DMEM | Sigma | D5671 | |
Penicillin Streptomycin solution | Sigma | P4333 | |
L-Glutamine | Sigma | G7513 | |
β-mercaptoethanol | Sigma | M3148 | |
DPBS | Sigma | D8537 | |
MIG vector | Addgene | Plasmid 9094 | |
pCL-Eco vector | Addgene | Plasmid 12371 | |
Cell strainer | BD Falcon | 352350 | |
Magnetic beads mouse CD4 cell kit | Invitrogen (Dynabeads) | 11415D | |
Streptavidin Beads | Miltenyi Biotech | 130-048-102 | |
MS cell separation columns | Miltenyi Biotech | 130-042-201 | |
LS cell separation columns | Miltenyi Biotech | 130-042-401 | |
CD25 Biotenylated MAb | BD Biosciences | 85059 | clone 7D4 |
CD62L Biotenylated MAb | BD Biosciences | 553149 | clone MEL-14 |
Polybrene (Hexadimethrine Bromide) | Sigma | 107689 | |
Anti-CD3 | eBiosciences | 16-0031-85 | clone 145-2C11 |
Anti-CD28 | eBiosciences | 16-0281-85 | clone 37.51 |
Anti-IL-4 | BD Biosciences | 559062 | clone 11B11 |
Anti-IFN-gamma | BD Biosciences | 559065 | clone XMG1.2 |
Anti-IL-2 | BD Biosciences | 554425 | cloneJES6-5H4 |
Recombinant IL-12 p70 | eBiosciences | 14-8121 | |
Recombinant IL-4 | BD Biosciences | 550067 | |
Recombinant TGF-beta | eBiosciences | 14-8342-62 | |
Recombinant IL-6 | eBiosciences | 14-8061 | |
Recombinant IL-2 | eBiosciences | 14-8021 | |
PMA | Sigma | P8139 | |
Ionomycin | Sigma | I0634 | |
Brefeldin A | eBiosciences | 00-4506 | |
Paraformaldehyde | Sigma | 16005 | Paraformaldehyde is toxic so use appropriate caution when handling |
Foxp3 staining buffer set | eBiosciences | 00-5523 | |
Anti-CD4 FITC | eBiosciences | 11-0041 | clone GK1.5 |
Anti-CD8a perCP-cy5.5 | eBiosciences | 45-0081-80 | clone 53-6.7 |
Anti-MHCII PE | eBiosciences | 12-0920 | clone HIS19 |
Anti-CD25 PE | eBiosciences | 12-0251-82 | clone PC61.5 |
Anti-CD62L PE | eBiosciences | 12-0621-82 | clone MEL-14 |
Anti-CD44 APC | eBiosciences | 17-0441 | clone IM7 |
Anti-IFN-gamma FITC | eBiosciences | 11-7311-81 | clone XMG1.2 |
Anti-IL-4 PE | BD Biosciences | 554435 | clone 11B11 |
Anti-IL-9 PE or APC | eBiosciences/Biolegend | 50-8091-82/514104 | clone RM9A4 |
Anti-IL-17a PE | BD Biosciences | 559502 | clone TC11-18H10 |
Anti-Foxp3 APC or PE | eBiosciences | 17-5773-82/12-5773-80 | clone FJK-16s |
NaCl | Sigma | S7653 | |
KCl | Sigma | P9333 | |
Na2HPO4-2H2O | Sigma | 71643 | |
Dextrose/Glucose | Sigma | G7021 | |
HEPES, free acid | Sigma | H3375 | |
NH4Cl | Sigma | A9434 | |
Disodium EDTA | Sigma | D2900000 | |
KHCO3 | Sigma | 237205 | |
CaCl2 | Sigma | C5670 |