风土通过概念葡萄果实代谢组学和转录组解释的

根据植物的基因组，转录组，蛋白质组和代谢组大规模数据分析提供了前所未有的洞察复杂系统，如葡萄酒的风土特性反映葡萄植物及其环境之间的相互作用的行为。因为即使在相同的葡萄无性系在不同的葡萄园种植葡萄酒的风土可以是不同的，基因组学分析是没有多大用处，因为克隆的基因组是相同的。相反，它是必要看看基因表达和浆果，决定葡萄酒的品质性状的代谢特性之间的相关性。基因表达在所有转录物的化学性质相似，它通过在芯片开发通用的特点，如杂交固定的探针有利于定量分析转录福利水平的分析。与此相反，普遍在蛋白质组学分析方法第二代谢是由于个别蛋白质和代谢物的巨大的物理和化学多样性更具挑战性。在代谢组学的情况下，这种多样性是更为极端，因为个体代谢物的大小，极性，丰度和波动性大大不同，所以不存在单一的提取工艺或分析方法提供了一个全面的方法。

之间合适的非易失性代谢物的分析平台，那些基于高效液相色谱耦合质谱（HPLC-MS）比等替代性HPLC用紫外线或二极管阵列检测器（HPLC-UV，HPLC-DAD敏感得多）或核磁共振（NMR）谱，但是通过HPLC-MS定量分析可以通过的现象，如基质效应和离子抑制/增强^1-3的影响。这种影响通过HPLC-MS的科维纳葡萄果实的分析过程中使用电喷雾离子源（HPLC-E的调查SI-MS），表明糖和其他分子具有最低保留时间强烈低估，也可能反映在这一区域中的大数目的分子，而其它分子的丰度可能被低估，由基体效应高估或未受影响的的，但对基体效应的数据归一化似乎对总体结果^4,5-影响有限。本文所描述的方法是成熟期间积聚在高水平葡萄浆果中等极性代谢物的分析优化，这是由风土显著影响。它们包括花青素，黄酮醇，黄烷-3-醇，花青素，类黄酮等，白藜芦醇，二苯乙烯，羟基酸和羟基苯甲酸，它们共同决定了颜色，口味和葡萄酒的健康相关的属性。其它代谢物，如糖和脂族有机酸，是由于基质短跑运动员忽略，因为定量通过HPLC-MS是不可靠T和离子抑制现象^5。内通过该方法选择的极性范围，该方法是在它的目的是检测许多不同的代谢物尽可能⁶未定位。

转录方法，使成千上万的小道消息成绩单可以同时监控由完整的葡萄基因组序列^7,8的可用性提供便利。基于高通量测序的cDNA转录早期方法已经发展下一代测序的到来进入统称为RNA测序技术的过程的集合。这种方法正迅速成为首选转录研究方法。然而，基于芯片，这也让成千上万的成绩单并行通过杂交来量化大量文献，积累了葡萄。事实上，在此之前RNA测序成为一种主流技术，很多专门的商用微阵列平台已经开发允许小道消息转录，并详细检查。在广阔的各种平台，只有两个允许的全基因组转录组分析^9。最进化阵列允许在单个设备上多达12个独立样品的杂交，从而减少每个实验的成本。 12个子阵列的每个组成代表29549小道消息成绩单135000 60-mer的探针。该装置已在大量的研究^10-24被使用。现在这两个平台已经停产，但一个新的定制芯片最近已经设计并表示最近的发展，因为它包含代表附加新发现的基因葡萄树²⁵探头的更大的数字。

通过转录组和代谢组学分析产生的大数据集销售需要对数据进行分析合适的统计方法，包括多元技术来确定不同形式之间的相关性s的数据的。最广泛使用的多元技术是那些基于投影，并且这些可以是无监督，如主成分分析（PCA），或监督，如双向正交投影到潜结构判别分析^{（O2PLS-DA）26。}在这篇文章中介绍的协议采用PCA进行探索性数据分析和O2PLS-DA来确定样本的群体之间的差异。