The assembly and positioning of the mitotic spindle depend on the combined forces generated by microtubule dynamics, motor proteins and cross-linkers. Here we present our recently developed methods in which the geometrical confinement of spherical emulsion droplets is used for the bottom-up reconstitution of basic mitotic spindles.
Mitotic spindle assembly, positioning and orientation depend on the combined forces generated by microtubule dynamics, microtubule motor proteins and cross-linkers. Growing microtubules can generate pushing forces, while depolymerizing microtubules can convert the energy from microtubule shrinkage into pulling forces, when attached, for example, to cortical dynein or chromosomes. In addition, motor proteins and diffusible cross-linkers within the spindle contribute to spindle architecture by connecting and sliding anti-parallel microtubules. In vivo, it has proven difficult to unravel the relative contribution of individual players to the overall balance of forces. Here we present the methods that we recently developed in our efforts to reconstitute basic mitotic spindles bottom-up in vitro. Using microfluidic techniques, centrosomes and tubulin are encapsulated in water-in-oil emulsion droplets, leading to the formation of geometrically confined (double) microtubule asters. By additionally introducing cortically anchored dynein, plus-end directed microtubule motors and diffusible cross-linkers, this system is used to reconstitute spindle-like structures. The methods presented here provide a starting point for reconstitution of more complete mitotic spindles, allowing for a detailed study of the contribution of each individual component, and for obtaining an integrated quantitative view of the force-balance within the mitotic spindle.
Durante la mitosi, i cromosomi del genoma replicato sono organizzati all'equatore cella per garantire la parità di distribuzione di cromatidi fratelli negli cellule figlie di nuova formazione. il posizionamento e la segregazione dei cromosomi è mediato da loro attaccamento ai microtubuli del fuso provenienti da due centrosomi opposte. Oltre a garantire la distribuzione cromosomica fedeli, l'orientamento del fuso mitotico detta anche il piano divisione cellulare 1. Orientamento coordinato di divisione cellulare è essenziale durante molte fasi di sviluppo e per il tessuto omeostasi 2. In particolare, regolata posizionamento fuso mitotico può comportare la distribuzione asimmetrica del contenuto cellulare o anche produrre cellule figlie di diverse dimensioni 2. Assemblaggio del fuso mitotico e l'orientamento inizia in profase e è orchestrato da una complessa interazione tra cooperazione e inimicarsi forza-generatori 3,4. Le forze generate consistono btirando e spingendo le forze di OTH. Queste forze provengono sia dai contatti mandrino con la corteccia cellule così come all'interno del mandrino, e possono essere generati da dinamica dei microtubuli e da motori molecolari e reticolanti (Figura 1).
spinte possono essere generati quando microtubuli crescono contro strutture rigide come la corteccia cellulare. A seconda della forza resistente totale generato all'interno del sistema, questo può portare a riposizionamento del fuso mitotico (forze inferiori) o innescare instabilità microtubuli o catastrofi (elevate forze) 5-8. La quantità di forza che può essere generato premendo dipende dalla lunghezza dei microtubuli, poiché la lunghezza è un forte determinante di microtubuli buckling 9. Inoltre, microtubuli che hanno origine da uno dei centrosomi possono spingere contro l'altro centrosoma, un meccanismo che è stato suggerito di guidare la separazione centrosome nei primi mesi del profase 3,10.
in annunciocondizione per spingere le forze generate da microtubuli in crescita, microtubuli che tocca la corteccia cellula può anche mediare forze di trazione 11. Studi di molteplici laboratori hanno mostrato che l'attività controllata di generatori di forza corticali è necessaria per il posizionamento asimmetrico dei fusi mitotici in vivo 1. Essenziale per queste forze di trazione è Cortex-localizzato dynein citoplasmatica (di seguito denominato 'dynein'), un meno-end microtubuli diretto proteine motore 8,12,13. Ad esempio, in il lievito, interazioni laterali di dynein corticale con il risultato lattice microtubuli in microtubuli base al motore scorrevole lungo la corteccia 14. Tuttavia, le forze di trazione corticali possono essere generati anche dalla capacità di dynein di formare raccordi di estremità-a depolimerizzante microtubuli 8. L'energia generata dal restringimento microtubuli può portare a forze che sono generalmente di un ordine di grandezza superiore (~ 50 pN (riferimento 15 </sup>)) che le forze generate dai singoli proteine motrici (~ 7-8 pN (rif. 16)). Attaccamento Fine-in di dynein corticale ai microtubuli depolimerizzante promuove posizionamento del mandrino in erba lievito 17 e C. elegans 13. Sia che sia in base al motore scorrevole e microtubuli depolimerizzazione guidato forze di trazione corticali possono cooperare o si escludono a vicenda in vivo è attualmente sconosciuto.
Oltre a spinta forze microtubuli e forze di trazione corticali dynein-mediata, posizionamento centrosoma è controllata all'interno del fuso mitotico da numerose altre proteine. Kinesin-5 motori, ad esempio, esistono come tetrameri che può reticolare antiparalleli microtubuli interpolari, con conseguente generazione di forze di scorrimento verso l'esterno 18-20. I membri della famiglia del motore chinesina-5 sono necessari per la separazione centrosome e montaggio fuso bipolare in tutti gli eucarioti studiati, con l'eccezione di C. elegans (recensito in riferimento 21).
Inoltre, sono anche noti diffusibili reticolanti della famiglia / PRC1 Ase1 localizzare per sovrapposizione delle regioni microtubuli di microtubuli interpolari in vivo e in vitro 22-27. Le forze generate dalla espansione Ase1-driven del microtubulo-regione di sovrapposizione sono grandi abbastanza per controbilanciare kinesin-14 delle forze di scorrimento in vitro mediata 28,29. Nelle cellule, Ase1 / PRC1 è necessario per la formazione stabile di sovrapposizione regioni microtubuli nella zona mediana del mandrino 25-27,30, il che suggerisce che le forze generate da diffusibili reticolanti possono contribuire in modo significativo alla organizzazione del mandrino. Infine, le forze della cromatina mitotico e cinetocori influenzano assemblaggio del fuso mitotico e il posizionamento attraverso vari percorsi 3. Dal momento che questi componenti non sono parte dei saggi ricostituzione qui descritte, non saranno discussi in dettaglio.
jove_content "> Diverse teorie esistono su come le diverse componenti molecolari e forze sopra descritte cooperano nel montaggio e posizionamento del mandrino, ma siamo ancora lontani da una comprensione quantitativa. Oltre a esperimenti nelle cellule viventi, gli esperimenti in vitro con componenti purificati forniscono un potente percorso per aiutare raggiungere questo obiettivo. presentiamo qui una guida visiva per una versione adattata ed estesa dei metodi pubblicati recentemente (Roth et al. 31), in cui mandrini base sono ricostituiti in acqua-in-olio di goccioline di emulsione, iniziando con un numero minimo di componenti. Utilizzando tecniche di microfluidica, goccioline sferiche vengono generati con i formati che sono paragonabili alle cellule in mitosi. All'interno di queste goccioline, centrosomi purificati e tubulina possono essere combinati al fine di studiare la dinamica aster microtubuli, forzare le interazioni generazione e Aster-Aster. di introducendo corticali (come dineina) e inter-polari (come ad esempio kinesin-5 / Ase1) forza-generatori, abbiamoricostituire strutture sempre più complesse mandrino-like che iniziano ad assomigliare alla situazione in vivo.I metodi descritti sforzi qui presenti recenti per ricostituire fusi mitotici di base in acqua-in-olio di goccioline di emulsione. Studiando l'assemblaggio del fuso all'interno dei confini geometrici offre numerosi vantaggi. meccanismi importanti di feedback esistono tra microtubuli del fuso mitotico ei vincoli geometrici in cui sono assemblati. I microtubuli possono generare forze di spinta quando crescono in confini geometrici, che può risultare in spostamento fuso mitotico. Inoltre, cresce in una barriera fisica può indurre catastrofi microtubuli. Inoltre, del fuso entro una geometria confinato può portare ad un progressivo esaurimento delle singole componenti, come tubulina, che a sua volta influisce direttamente sulla velocità di crescita dei microtubuli 36. Questi sono tutti fattori determinanti essenziali di assemblaggio del fuso, che possono essere studiati utilizzando i saggi descritti qui.
I saggi descritti sono molto sensibili alla piccola differe concentrazioneNCEs dei componenti di una goccia. Questo è il caso per la tubulina, in cui le differenze di concentrazione minori possono risultare in crescita troppo lento o troppo rapido microtubuli. In questo caso, i tassi di crescita microtubuli spesso possono ancora essere corrette regolando la temperatura durante il primo ~ 30 min dell'esperimento. del fuso mitotico e posizionamento è anche molto sensibile alle variazioni della concentrazione di generatori (corticale) di forza. Questo è probabilmente dipende dalla concentrazione, la purezza e l'attività dei componenti purificati e deve essere titolato con attenzione per ogni nuova proteina purificata.
Inoltre, alcuni compromessi devono essere effettuate in ambienti di imaging, a seconda della natura del saggio. Inizialmente, alti livelli di dimeri di tubulina fluorescenti solubili rendono difficile immagine singoli microtubuli. Come microtubuli si allungano e tubulina solubile è esaurito lentamente, il rapporto segnale-rumore diventa gradualmente più elevata e permette l'imaging del individuAl microtubuli. In contrasto con configurazioni con sistemi aperti, il confinamento geometrico impedisce lo scambio di molecole fluorescenti e componenti di sistema assorbitore di ossigeno all'interno di un serbatoio di massa, con conseguente sbiancamento significativo. Soprattutto per monitorare assemblaggio del fuso e posizionamento nel tempo, si richiede di immagine con basse intensità di luce, anche in presenza di un potente sistema di ossigeno scavenger.
Questi metodi consentono la ricostituzione bottom-up di semplificate strutture mandrino simili in vitro. Oltre ai componenti introdotti qui, molti altri fattori sono stati descritti da influenzare la formazione bipolare mandrino, posizionamento, orientamento, sagomatura, ecc 3. Questo sistema può essere ulteriormente ampliato per studiare gli effetti individuali e combinati di generatori di forza aggiuntivi. contributori importanti per la formazione del fuso che sono attualmente assente da questo sistema sono i cromosomi mitotici. cromatina mitotico ha dimostrato diformazione diretta mandrino (1) chromokinesins che possono generare la cosiddetta 'forze polari-espulsione' 3, (2) la formazione di un gradiente RanGTP dalla cromatina-bound RanGEF RCC1 38, (3) cinetocori che possono interagire con (depolimerizzante ) microtubuli 39 e (4) la cromatina stessa, che può funzionare come una molla meccanica in-tra microtubuli opposte 40.
Infine, il sistema descritto fornisce attualmente limitato controllo temporale e spaziale sull'attività e localizzazione di forza generatori introdotte. Nelle cellule, molti fattori di assemblaggio del fuso localizzano a compartimenti specifici o sono attivi all'interno di una finestra temporale limitata. Un esempio lampante è l'attività di dineina, che è specificamente arricchito sul lato posteriore del C. elegans una cellula embrionale per promuovere il posizionamento del mandrino asimmetrica e la divisione cellulare. In questo sistema, stiamo esplorando la possibilità di imitare tale tattività utilizzando metodi emporal e asimmetrici presi in prestito dalle tecniche opto-genetiche. Inoltre, come è il caso per la C. elegans embrione e cellule con una parete cellulare rigida, molte cellule non completano in mitosi. La forma del confinamento geometrica avrà un impatto fondamentale sulle forze che agiscono sul mandrino 41. Sarà quindi importante ricostituire assemblaggio del mandrino e posizionamento nelle goccioline non sferiche e, potenzialmente utilizzando sistemi microfluidici più complessi che permettono di plasmare e la memorizzazione di emulsione di goccioline di 42,43. Infine, nei tessuti, cellula-cellula e cellula-segnalazione substrato e attaccamento forniscono stimoli esterni che possono essere tradotti in orientamento del mandrino diretto, come spesso osservato in cellule epiteliali e le cellule staminali. Tutti questi aspetti specialistici non sono stati presi in considerazione in questo studio e potrebbe fornire le sfide del futuro per costruire verso più in vivo -come ricostruzioni di mitotico assemb mandrinoly e posizionamento.
The authors have nothing to disclose.
We like to thank the members of the Dogterom lab for valuable discussions. We acknowledge Stefan Diez and Marcel Janson for reagents, and Samara Reck-Peterson for help with the purification of dynein. This work was supported by funding from the European Research Council (ERC Synergy grant: MODEL-CELL).
1. Preparation of microfluidic chips | |||
Photomask (Photomask on film substrate) | Selba S.A. Switzerland | ||
SU-8 3025 | MicroChem | ||
Silicon wafer (4 inch silicon wafer p/Boron <1-0-0> 10-20 Ω-cm, 500-550μm, SSP, w/2 flats) | WRS Materials | 4P0SSP-005 | |
Spin coater | Polos | SPIN150I | |
PDMS pre-polymer RVT615 A+B | Lubribond | 9481 | |
Corona treater | Electro-technic products | BD-20ACV | |
2. Microfluidic setup | |||
Name | Company | Catalog Number | Comments |
DOPS (1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine) | Avanti Polar Lipids | 840035 | |
Biotinyl PE (1,2-Dipalmitoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-(biotinyl)) | Avanti Polar Lipids | 870285 | |
Chloroform | Sigma-Aldrich | 650498 | |
Glass pipets | |||
Glass tubes | |||
Vacuum pump | Laboport | KNF | |
Vacuum chamber | Kartell | Polypropylene Vacuum Desiccator | |
Mineral oil | Sigma-Aldrich | M5904 | |
Surfactant (Span80) | Sigma-Aldrich | 85548 | |
Sonicator | Branson | M2800H | |
Coverslips | 24x60mm, thickness 1.5 | ||
Glass-slides | 26x76mm | ||
Puncher | Harris Uni-Core | 135840/135841/135843 | |
Laboratory sealing film | Parafilm | ||
Valap (Vaseline, lanolin, paraffin wax melted at equal concentrations) | Home made | ||
Brightfield Microscope | Leica | PMIRB | Any inverted brightfield would suffice |
Pressure controler | Fluigent | MFCS-FLEX-4C-1000 | |
PEEK Tubing | Cluzeau Info. Labo, France | ||
Microfluidics vials (Tubes Micrew 0.5 ml and 1 ml) | VWR, The Netherlands | ||
3. Reconstituting spindle formation and positioning | |||
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Dextran-647nm (Dextran, Alexa Fluor 647, 10,000 MW, Anionic, Fixable) | Life Technologies | ||
Tween-20 | Sigma-Aldrich | ||
BSA – Bovine serum albumin | Sigma-Aldrich | ||
Glucose (D-(+)-Glucose) | Sigma-Aldrich | G8270 | |
Glucose-oxidase (Glucose oxidase from Aspergillus niger) | Sigma-Aldrich | G6125 | |
DTT (DL-dithioltheitol) | Sigma-Aldrich | 646563 | |
Catalase (Catalase form bovine liver) | Sigma-Aldrich | C9322 | |
Tubulin (Tubulin from bovine brain) | Cytoskeleton Inc. | ||
Tubulin-488/561 (HiLyte-488/Rhodamine-labeled tubulin from porcine brain) | Cytoskeleton Inc. | ||
GTP (Guanosine-'5-triphosphate, sodium salt hydrate) | Sigma-Aldrich | 51120 | |
κ-casein (κ-casein from bovine serum milk) | Sigma-Aldrich | C0406 | |
Airfuge (Air-driven ultracentrifuge) | Beckman-Coulter | CLS | |
4. Introducing spindle-assembly factors | |||
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Neutravidin | Sigma-Aldrich | A2666 | |
ATP (Adenosine-'5-triphosphate, disodium salt hydrate) | Sigma-Aldrich | A9187 | |
PEP (Phospho(enol)pyruvic acid monosodium salt hydrate ≥ 97% (enzymatic)) | Sigma-Aldrich | P0564 | |
PK/LDH -(Pyruvate kinase/lactic dehydrogenase enzymes from rabbit muscle) | Sigma-Aldrich | P0294 |