La omisión de exón es actualmente una opción terapéutica más prometedora para la distrofia muscular de Duchenne (DMD). Para ampliar la aplicabilidad de los pacientes con DMD y para optimizar la estabilidad / función de las proteínas de distrofina truncados resultantes, un multi-exón enfoque saltar utilizando oligonucleótidos antisentido de cóctel fue desarrollado y hemos demostrado rescate distrofina sistémica en un modelo de perro.
Distrofia muscular de Duchenne (DMD) es una de las enfermedades genéticas letales más comunes en todo el mundo, causadas por mutaciones en el gen de la distrofina (DMD). La omisión de exón emplea moléculas cortas de ADN / ARN, llamadas oligonucleótidos antisentido (AONs) que restauran el marco de lectura y producen proteínas más cortas, pero funcionales. Sin embargo, la terapia de omisión de exón se enfrenta a dos obstáculos principales: la aplicabilidad limitada (hasta sólo el 13% de los pacientes pueden ser tratados con un solo fármaco AON), y la función de las proteínas truncadas incierta. Estas cuestiones fueron tratadas con un método cocktail AON. Mientras que aproximadamente 70% de los pacientes con DMD puede ser tratada por solo la omisión de exón (todos los exones combinados), se podría potencialmente tratar a más de 90% de los pacientes con DMD si exón múltiple omitiendo el uso de drogas antisentido de cóctel puede ser realizado. Se utilizó el canino ligada al X distrofia muscular (CXMD) modelo de perro, cuyo fenotipo es más similar a los pacientes con DMD humanos, para probar la effic sistémicoACY y la seguridad de multi-omisión de exón de exones 6 y 8. El modelo de perro CXMD alberga una mutación del sitio de empalme en el intrón 6, que conduce a la falta del exón 7 en el ARNm de la distrofina. Para restaurar el marco de lectura en CXMD requiere multi-omisión de exón de exones 6 y 8; Por lo tanto, CXMD es un buen modelo animal de tamaño medio para probar la eficacia y seguridad de multi-omisión de exón. En el estudio actual, un cóctel de morfolinos antisentido dirigidos exón 6 y el exón 8 se diseñó y se restauró la expresión de distrofina en los músculos esqueléticos en todo el cuerpo. se presentan métodos para la transfección / inyección de oligos de cóctel y evaluación de la eficacia y seguridad de multi-omisión de exón en el modelo de perro CXMD.
La distrofia muscular de Duchenne (DMD) es una enfermedad muscular recesiva ligada al cromosoma X se caracteriza por debilidad muscular progresiva, descrito por primera vez por el Dr. Guillaume-Benjamin-Amand Duchenne (de Boulogne) 1. La DMD es una enfermedad genética común que afecta a aproximadamente 1 de cada 3.500 niños en todo el mundo, con aproximadamente 20.000 niños afectados nacen cada año 2,3. El desarrollo motor se retrasa y alteraciones de la marcha se ve en la primera infancia 4, seguido de la dependencia sobre silla de ruedas en los primeros años de adolescencia. La muerte se produce normalmente entre las edades de 20 y 30 debido a la insuficiencia respiratoria o cardiaca 5-8. Actualmente no existe cura para la DMD. El tratamiento con glucocorticoides puede ralentizar la progresión de la degeneración muscular en cierto grado, pero se asocia con efectos secundarios significativos, incluyendo la obesidad y la diabetes mellitus 2,7,8. DMD resulta de mutaciones en el gen de la distrofina (DMD), lo que lleva a una pérdida de distrofina funcional protein. La DMD es un gen muy grande, con más de 2 millones de pares de bases y 79 exones 9,10. Deleción, sin sentido, y duplicación mutaciones que conducen a mutaciones fuera de la trama son la causa más común del fenotipo DMD. Las regiones de los exones 3 – 9 y los exones 45 – 55 se denominan "puntos calientes de mutación" como la mayoría de los pacientes tienen mutaciones de deleción dentro de estas porciones del gen, lo que lleva a la distrofina no funcional en pacientes con DMD 3,9,11-16. funciones de distrofina dentro del complejo distrofina-glicoproteína (DGC), que tiene un papel importante en la estabilización de la membrana muscular. La N- y C-terminales son los dominios más importantes para la función, mientras que el dominio de varilla central juega un papel menos importante 3,9,17. La observancia de un fenotipo leve asociado con distrofia muscular de Becker (BMD), lo que se traduce en su mayoría de las mutaciones en marco en el gen DMD, inspiró la aplicación de la omisión de exón para el tratamiento de la DMD. pacientes DMO han acortado una, pero functional, la proteína distrofina que mantiene ambos extremos 3,6,18. La omisión de exón, en teoría, puede restaurar el marco de lectura, lo que resulta en proteínas acortadas de distrofina funcional, pero-similares a los observados en la DMO 3,19.
Múltiples tipos de oligonucleótidos antisentido (AONs) han sido probados en ensayos clínicos, incluyendo fosforotioatos metilados-2O (2'OMePS) y oligómeros de morfolino fosforodiamidada (PMO). Saltarse los exones 51 y 53 que utilizan estos AONs ha sido examinado y si bien los resultados son prometedores, la omisión de exón de un solo tiene aplicabilidad limitada, ya que es-mutación específica 3, 19, 20,21, 22-26. Las preguntas también sobre la estabilidad de las proteínas distrofina acortada resultantes producidos a partir de un solo salto de exón 22,23. Además, algunos pacientes requieren más de un solo exón a ser omitido con el fin de restaurar el marco de lectura 3. Aunque técnicamente más difícil, multi-omisión de exón es un método quepodría hacer frente a estos problemas 3,19. Multi-omisión de exón previamente se ha demostrado en perro distrófica y líneas celulares humanas in vitro. Además, mdx52 ligadas al cromosoma X modelos de ratón para perros y caninos de la distrofia muscular (CXMD) se han utilizado para los estudios in vivo 22, 24-27. Distrofia muscular ligada al cromosoma X Canine Japón (CXMD J) se utilizaron beagles aquí, ya que el marco de lectura de CXMD J puede ser restaurada por la omisión de multi-exón de exones 6 y 8, o exones adicionales (por ejemplo, los exones 3-9) (Figura 1). CXMD a base de Beagle comparte el mismo patrón de mutación como el modelo Golden Retriever distrofia muscular (GRMD), pero beagles son más pequeños y más baratos de mantener debido a su tamaño corporal, proporcionando así un modelo útil para la DMD 28,29. CXMD perros se asemejan más a la fenotipo DMD humana que los modelos animales más pequeños, como roedores, y son más fiables para las evaluaciones toxicológicas 3,22,30,31 </sarriba> (Figura 2). CXMD perros muestran la decadencia progresiva muscular, alteraciones de la marcha, y los problemas cardíacos y respiratorios similares a los observados en la DMD. En comparación con la omisión de un solo exón, multi-omisión de exón es aplicable a una proporción mucho mayor de pacientes. Entre los tres tipos de mutaciones más comunes (deleciones, duplicaciones, y sin sentido), el 80 – 98% de los pacientes podría ser tratada a través de múltiples salto de exón 14,32,33, mientras que el 45% de todos los pacientes con DMD podría beneficiarse de los exones 45 saltarse específicamente – 55 3,19,22,34.
Con el desarrollo de morfolinos modificados, la eficiencia de cócteles AON a facilitar la omisión de exón ha mejorado. Ricos en arginina PMO conjugado de péptido-penetran en las células (PPMOs), y vivo-morfolinos (vPMOs) son las químicas AON que han mejorado significativamente la capacidad y la estabilidad 3,35-38 penetrante en las células. Persiste la preocupación acerca de la toxicidad de AON a largo plazo; Sin embargo, el progreso significativofue hecho. Las modificaciones químicas introducidas en morfolinos disminuyen en gran medida fuera de objetivo efectos y los estudios preclínicos no han reportado efectos tóxicos significativos 3,22,39,40. Un desafío pendiente para multi-omisión de exón es el requisito actual para cada sola AON a ensayar para la toxicidad por sí solo, como un solo fármaco, en vez de juntos como un cóctel 3,19,22,41,42. En los estudios que implican DMD, monofásicos y multi-omisión de exón dirigida al corazón, ha habido pocas mejoras en el tejido del corazón distrófica. La eficacia de morfolinos en el corazón se piensa que es bajo debido a la mala capacidad de penetración celular. PPMOs péptido conjugado han mejorado la capacidad de AONs para penetrar en las células cardíacas, el aumento de la cantidad de proteína distrofina funcional rescatado en el corazón 3,19,38.
Aquí, nuestro enfoque cóctel de AON se analiza en profundidad, incluyendo el diseño de secuencias utilizando el software de AON ESEfinder 43. protocTambién se describen oles para experimentos con perros multi-omisión de exón. CXMD J beagles se utilizaron para los exones 6 y 8 experimentos saltarse. Multi-omisión de exón en el modelo de perro CXMD muestra resultados prometedores, pero sigue habiendo dificultades que deben superarse antes de que sean clínicamente aplicable.
La omisión de exón es una técnica terapéutica prometedora para el tratamiento de la DMD. Tanto in vitro e in vivo han demostrado que la omisión de multi-exón es factible. A continuación, se discute el uso del modelo de perro CXMD. En primer lugar, AONs fueron diseñados utilizando los programas de rescate-ESE y ESEfinder para apuntar exones de la distrofina 6 – 8. Se utilizó la química 2'OMePS AON para CXMD transfección de mioblastos y la química de la columna vertebral AON morfolino fue elegido para los experimentos in vivo. vPMOs son más eficientes que PMOs no modificados, pero debido a su toxicidad más alta que no son adecuadas para inyecciones sistémicas. La extracción de RNA, la RT-PCR, y la secuencia de ADNc se realizaron en los mioblastos CXMD. Los perros inyectados con el cóctel PMO fueron clínicamente graduada para evaluar cualquier mejora en los síntomas clínicos. Después de que los perros se sacrificaron humanamente, se tomaron muestras de músculo y se prepararon para la crio-seccionamiento. La vida media de la proteína distrofina inducida por unaONs se cree que es aproximadamente 1 – 2 meses. perros adultos jóvenes se utilizaron en este estudio, aunque estos experimentos se pueden realizar con los perros neonatales y perros de edad avanzada (> 5 años de edad). Secciones de músculo preparados se utilizaron para evaluar la histopatología y evaluar rescate proteína distrofina a través de transferencia de Western e inmunohistoquímica 48.
Es importante asegurarse de que el volumen de la solución de PMO es correcta antes de las inyecciones; Al no hacerlo tendrá efectos significativos en los resultados. Durante las inyecciones intramusculares, se requiere una presión suficiente para entrar en las fibras musculares. El seguimiento de la salud del perro y la inspección del sitio de la cirugía son importantes para la solución de problemas. Para monitorear la salud de los animales, los análisis de sangre semanales y pesada se realizará. Después de la eutanasia del animal y preparación de muestras de músculo, un paso fundamental para garantizar una sensibilidad para detectar la proteína distrofina es utilizar tanto el gel de Tris-acetato y método de transferencia semisecadurante el procedimiento de transferencia Western.
Como se muestra en los resultados representativos, mioblastos tratados con Ex6A, Ex6B, Ex8A, y el cóctel (que contiene Ex6A, Ex6B, Ex8A, y Ex8B) producido en marco productos DMD. Desde Ex8B no produjo productos exón omitido, no se utilizó en posteriores experimentos in vivo. secuenciación de cDNA mostró que los exones 6 – 9 se produjo el salto e inmunocitoquímica con DYS-2 tinción mostró restauró la expresión de distrofina en las muestras tratadas. perros tratados con AON mostraron un aumento significativo de fibras positivas de distrofina. Esto indica que los exones 6 – 8 fueron saltadas y se produjo una proteína acortada. La cantidad de fibras positivas de distrofina aumentó cuando se utilizó un cóctel de AONs y fue proporcional a la dosis AON. Las inmunotransferencias mostraron un aumento de la expresión de distrofina en los perros tratados con morfolino sistémicos. El músculo esquelético tenían niveles variables de fibras distrofina; sin embargo, el tejido del corazón morfolino-tratado mostró pocomejora en la expresión de distrofina. Desde la distrofina tiene un alto peso molecular (427 kDa), la detección de bajas cantidades de distrofina puede ser difícil. Para los mejores resultados, se utilizaron gel de Tris-acetato y el método de transferencia semi-seco. Tinción HE mostraron histopatología mejorado en los perros tratados con morfolino. fibras nucleadas centralmente (CNFs) son una muestra de músculo poco saludable y representan ciclos de degeneración y regeneración muscular. perros CXMD tratados con morfolino mostraron una disminución en el porcentaje de CNFs en comparación con los perros CXMD no tratados. graduación clínica reveló una mejoría de los síntomas, tales como el aumento de la capacidad para caminar y correr, en los animales tratados con morfolino. La dureza de los músculos se cree que reflejan la atrofia muscular, por lo tanto, se incluye en el sistema de clasificación 59. Se evaluó la dureza de los músculos del muslo (de las extremidades posteriores); Sin embargo, se excluyeron músculo sartorio craneales, ya que tienden a exhibir una hipertrofia en lugar de la atrofia en CXMD. perros tratados muestraned puntajes más bajos de calificación y tenía veces más rápido en el test de carrera 15 m. Tiempos mejorados con respecto a la prueba de 15 m son indicativos de mejora de la función muscular 40. puntajes de calificación globales más altos indican una mala salud y una mayor atrofia muscular.
Aunque estos resultados son prometedores, multi-omisión de exón todavía presenta muchos desafíos que hay que superar antes de que la técnica tiene aplicabilidad clínica. tejido cardíaco todavía muestra reducida absorción de AONs, probablemente debido a la diferencia en el tráfico celular entre el tejido cardíaco y esquelético. No se observaron efectos tóxicos se han observado en animales bajo los regímenes de dosificación actuales; Sin embargo, aún queda trabajo por hacer para evaluar la toxicidad a largo plazo antes de que el uso de cócteles AON puede pasar a los ensayos clínicos. Es difícil lograr la aprobación de drogas cóctel AON porque las agencias reguladoras definen cada secuencia AON como fármaco único. Esto significa que tendría que ser probado de forma individual para cada uno de segur secuencia en un cóctelY, lo que requiere más tiempo y más dinero. Otra barrera para el uso de multi-omisión de exón en un entorno clínico es una gran cantidad de productos de proteína de intermedios producidos con funciones desconocidas. Estas proteínas pueden potencialmente conducir a efectos secundarios impredecibles, dependiendo de la mutación individuo 22. Además, los patrones de mutación disponibles dentro de los modelos actuales de perros distróficos son limitadas. Hay pocas mutaciones naturales, y no todas las mutaciones son útiles para el estudio de multi-omisión de exón. El modelo de cerdo distrófica promete ser una buena alternativa para el futuro DMD omisión de exón 33, 34 estudios.
Los modelos de perros con DMD tienen algunas ventajas sobre otros modelos de DMD. Al ser un modelo animal más grande, la clasificación clínica y la resonancia magnética son posibles, lo que permite un análisis más detallado. Dado que los perros son los animales grandes también son más adecuados para los estudios de toxicología y representan más de cerca la enfermedad humana en comparación con el modelo de ratón. perro modelos también tienen secuencias de genes de DMD que son más similares a los humanos 23, 34, 45.
Aunque técnicamente difícil, el enfoque multi-omisión de exón podría beneficiarse en última instancia,> 90% de los pacientes con DMD 24. Esto hace que sea una alternativa mucho mejor que la omisión de un solo exón, como la omisión de exón de un solo es aplicable únicamente a un pequeño subgrupo de pacientes. Además, multi-omisión de exón nos permitirá seleccionar los patrones de deleción que optimizan la funcionalidad de las proteínas distrofina acortada. Por ejemplo, la supresión de la DMD exones 45 – 55 se asocia con síntomas leves o excepcionalmente individuos asintomáticos 14,19,60-63. La omisión multi-exón de exones 45 – 55 ya se ha demostrado en un modelo murino de DMD con una deleción del exón 52 (mdx52) usando inyecciones sistémicas de vPMOs 22,26. El uso de vPMOs cóctel se ha demostrado también en otras formas de distrofia muscular, talesFukuyama como la distrofia muscular congénita (FCMD). FCMD es causada por atrapamiento de exones, en el que el empalme de mRNA aberrante es causada por la inserción retrotransposón. vPMOs se han demostrado para rescatar el patrón de empalme tanto en un modelo de ratón FCMD y en líneas celulares humanas 64. La próxima generación de AON químicas que presentan una mayor eficacia y baja toxicidad, podría facilitar la traducción eficaz del enfoque multi-omisión de exón en la aplicación clínica. Además, la omisión de multi-exón potencialmente se podría aplicar a otros trastornos genéticos, tales como la dysferlinopathies 24, 65.
The authors have nothing to disclose.
This work was supported by The University of Alberta Faculty of Medicine and Dentistry, The Friends of Garrett Cumming Research Chair Fund, HM Toupin Neurological Science Research Chair Fund, Muscular Dystrophy Canada, Canada Foundation for Innovation (CFI), Alberta Advanced Education and Technology (AET), Canadian Institutes of Health Research (CIHR), Jesse’s Journey – The Foundation for Gene and Cell Therapy, and the Women and Children’s Health Research Institute (WCHRI).
2'OMePS Transfection of Dog Myoblasts | |||
3ml 6 welled plates | IWAKI | 5816-006 | |
Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM) | Gibco | 11965-092 | |
fetal bovine serum (FBS) | HyClone | SH30071.01 | |
Penicillin | Sigma-Aldrich | P4333 | 200 U/mL |
Lipofectin | Invitrogen | 18292-011 | Total volume of 100 mL in opti-MEM media at a ratio of 2:1 for lipofectin. 10 mL lipofectin for 5 mg RNA. |
2’OMePS | Eurogentec | Ex6A (GUU GAUUGUCGGACCCAGCUCAGG), Ex6B (ACCUAUGA CUGUGGAUGAGAGCGUU), and Ex8A (CUUCCUGG AUGGCUUCAAUGCUCAC). | |
Horse Serum | Gibco | 16050-114 | 2% |
streptomycin | Sigma-Aldrich | P4333 | 200 ug/mL |
Bovine serum albumin (BSA) | Sigma-Aldrich | A9418 | |
Insulin | |||
Morpholino transfection of dog myoblasts | |||
All material from MePS Transfection of Dog Myoblasts for culturing | |||
Antisense morpholinos | Gene-tools |
Ex6A(GTTGATTGTCGGACCCAGC |
|
Endo-Porter | Gene-tools | ||
guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform | Invitrogen | 15596-018 | 1mL/plate |
RNA Extraction and Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) | |||
guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform | Invitrogen | 15596-018 | 1mL/plate |
Chloroform | Sigma-Aldrich | P3803 | 200 uL |
1.5 ml Tubes | Eppendorf | 22363204 | |
Centrifudge | Beckman-Coulter | ||
75% Ethanol | Sigma-Aldrich | 34852 | |
UV Spectrometer | |||
Forward primer in exon 5 | Invitrogen | CTGACTCTTGGTTTGATTTGGA 1.5 mL 10 mM |
|
Reverse primer in exon 10 | Invitrogen | TGCTTCGGTCTCTGTCAATG 1.5 L 10 mM |
|
dNTPS | Clontech | 3040 | |
One-Step RT-PCR kit | Qiagen | 210210 | |
Thermo-cycler | Scinco | ||
Complementary DNA (cDNA) Sequencing | |||
Gel extraction kit | Qiagen | 28704 | |
Centrifudge | |||
Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit | Applied Biosystems | 4337454 | |
Intramuscular injections or open muscle biopsy | |||
Surgical Tools | Scissors, Scapal, needle, surgical thread | ||
Vet Ointment | |||
Iodophors | webtextiles | 12190-71-5 | |
chlorohexidine | Peridex | 12134 | |
Surgical Drapes | |||
Srubs | |||
Facial Mask | |||
Surgical Gloves | |||
Head Covering | |||
Thiopental sodium | Mitsubishi Tanabe Pharma | 20 mg/kg | |
Isoflurane | Abbott laboratories | 05260-05 | 2-3% |
Antisense morpholinos | Gene-tools | Ex6A(GTTGATTGTCGGACCCAGC TCAGG), Ex6B(ACCTATGACTGTGGATGAG AGCGTT), Ex8A(CTTCCTGGATGGCTTCAAT GCTCAC) Dilute to a final volume of 100 L in opti-MEM media. 120–200 mg/kg of morpholinos at 32 mg/mL in saline |
|
27G Needles | TERUMO | SG3-2325 | |
50 mL syringe | TERUMO | SG2-03L2225 | |
buprenorphine hydrochloride | |||
Tougne Depressor | |||
cephalexin | 15 to 30 mg/kg | ||
cefazolin | 15 to 30 mg/kg | ||
buprenorphine | 0.01 mg/kg | ||
buprenorphine hydrochloride | 0.02 mg/kg | ||
Systemic Injections | |||
Syringe infusion pump | Muromachi | ||
22G Indwelling needles | TERUMO | SG3-2225 | |
27G Needles | TERUMO | SG3-2325 | |
50 mL syringe | TERUMO | SG2-03L2225 | |
Saline | Ohtsuka-Pharmaceutical | 28372 | |
Clinical Grading of Dogs | |||
Video Camera | |||
Stop watch | |||
Magnetic resonance imaging (MRI) | |||
3 Tesla MRI l | |||
18 cm diameter/18 cm length human extremity coi | |||
Muscle sampling and preparation (necropsy) | |||
Thiopental sodium | Mitsubishi Tanabe Pharma | 20 mg/kg | |
Isoflurane | Abbott laboratories | 05260-05 | 2-3% |
Tragacanth gum | 10-20 mL | ||
Liqoud Nitrogrn | |||
Cork Discs | Iwai-kagaku | 101412-806 | |
Dry Ice | |||
Tweezers | |||
Poly-l-lysine–coated slides | Fisher | 22-037-216 | |
Cryostat Microsystem | Leica | cm1900 | |
Immunohistochemistry | |||
DYS1 | Novocastra | NCL-DYS1 | 1:150 dilutions |
DYS2 | Novocastra | NCL-DYS2 | 1:150 dilutions |
Alexa 594 goat antimouse IgG1 | Invitrogen | A-21125 | 1:2,500 dilutions |
Alexa 594 goat antimouse IgG2 | Invitrogen | A-11005 | 1:2,500 dilutions |
DAPI | Invitrogen | D1306 | Contans mounting agent |
Goat Serum | Invitrogen | 10000C | 15% |
PBS | |||
Moisture chamber | Scientific Devise Laboratory | 197-BL | |
Chamber slide | Lab-tek | 154453 | |
Cover Glasses | Fisher | 12-540A | |
Hydrophobic barrier pen | |||
Flpurescent microcope | 594 nm at 20X magnification. | ||
Western Blotting | |||
Distillied Water | |||
Hand Homogenizer | |||
2× Laemmli SDS-loading buffer | 0.1 M Tris–HCl (pH 6.6), 2% (w/v) SDS, 2% (0.28 M) beta-mercaptoethanol, 20% glycerol, 0.01% bromophenol blue | ||
SDS gels | Bio-Rad | 161-1210 | 5% resolving |
SDS gels | Invitrogen | Invitrogen, WG1601BOX | 3-8% |
PVDF membrane | GE | 10600021 | |
Methanol | |||
Transfer buffer (10×) | 250 mM of Tris-Base, 1,920 mM of Glycine | ||
Transfer buffer (1×) | 10% 10× buffer, 20% methanol | ||
0.05% PBS/Tween 20 (PBST) | 2,000 mL 3× 200 mL for washing |
||
PBST/5% milk powder | 100 mL | ||
Protein Assay Kit | BCA | T9650 | |
Tween 20 | Sigma | P5927 | |
Urea | Sigma | U5378 | |
Beta Mercaptoethanol | Millipore | ES-007-E | |
SDS | Sigma | L3771 | |
Tris-Acetate | Sigma | ||
Tris HCL | Sigma | T3253 | |
Glycerol | Sigma | G8773 | |
Loading/sample buffer for Western blotting | NuPage Invitrogen | NP007 | |
NaCl | Sigma | S3014 | |
PMSF | Sigma | P7626 | |
Protease cocktail inhibitor | Roche | 11836153001 | |
Cathode Buffer | .025 M Tris base + 40 mM 6-aminocaproic acid + 20% Methanol | ||
Anode Buffer | 0.03 M Tris Base + 20% Methanol | ||
Concentred Anode Buffer | 0.3 M Tris base + 20 % Methanol | ||
desmin antibody | Abcam | ab8592 | |
DYS1 | Novocastra | NCL-DYS1 | 1:150 dilutions |
Image J Software |