엑손 스키핑은 현재 뒤 시엔 느 근이영양증 (DMD)에 대한 가장 유망한 치료 옵션입니다. DMD 환자의 적용 가능성을 확장하고, 생성 된 절단 디스트로핀 단백질의 안정성 / 기능을 최적화하기 위해, 칵테일 안티센스 올리고 뉴클레오티드를 사용하는 방식을 스킵 멀티 엑손이 개발되어 우리 개 모델에서 전신 디스트로핀 구조를 입증 하였다.
뒤 시엔 느 근이영양증 (DMD)는 전세계 디스트로핀 (DMD) 유전자의 돌연변이에 의해 야기되는 가장 흔한 유전 치명적인 질환이다. 엑손 스키핑은 독서 프레임을 복원하고 짧은하지만 기능적인 단백질을 생산 안티센스 올리고 뉴클레오티드 (AONs)라는 짧은 DNA / RNA와 같은 분자를 사용한다. (하나의 AON 약물로 치료 될 수있는 환자의 13 %까지) 제한 적용하고, 절단 된 단백질의 불확실 기능 : 그러나, 엑손 건너 뛰는 치료는 두 가지 주요 장애물에 직면 해있다. 이러한 문제는 칵테일 AON 방식으로 해결했다. DMD 환자의 약 70 %가 단일 엑손 스킵하여 (결합 모두 엑손)로 처리 할 수 있지만 칵테일 안티센스 약물을 이용하여 스킵 여러 엑손이 실현 될 수 있다면, 하나의 잠재적 DMD 환자의 90 % 이상을 치료할 수있다. 송곳니의 X-연결 근이영양증 (CXMD) 개 모델, 그 표현형 인간의 DMD 환자에 더 유사하다는 전신 effic을 테스트하는 데 사용 된ACY과 엑손 6, 8 CXMD 개 모델의 멀티 엑손 스키핑의 안전 디스트로핀의 mRNA의 엑손 7의 부족으로 이어지는, 인트론 6 스플 라이스 사이트 변이를 항구. CXMD에서 독서 프레임을 복원하려면 엑손 6, 8의 멀티 엑손 스키핑이 필요합니다; 따라서, CXMD 멀티 엑손 스키핑의 효능과 안전성을 테스트하기위한 좋은 중간 크기의 동물 모델이다. 현재의 연구에서, 엑손 6 엑손 (8)을 대상으로 안티센스 morpholinos의 칵테일 설계되었으며 그것은 몸 전체의 골격 근육 디스트로핀 식을 복원. 형질 전환 / 칵테일 올리고 주입과 효능 및 CXMD 개 모델에서 멀티 엑손 스키핑의 안전성 평가를위한 방법을 제시한다.
뒤 시엔 느 근이영양증 (DMD) 먼저 박사 기욤 – 벤자민 – AMAND 뒤 시엔 느 (드 불로뉴 1)에 의해 설명 진보적 인 근육 약화 특징으로하는 X 연결된 열성 근육 질환이다. DMD는 매년 2,3 태어난 약 2 만 영향을받는 아이들과 함께, 전 세계적으로 약 1 3,500에서 소년에 영향을 미치는 일반적인 유전 질환이다. 모터 개발이 지연되고, 보행 장애는 초기 청소년에 대한에 휠체어 의존성 다음에, 유아 (4)에서 볼 수 있습니다. 죽음은 일반적으로 인한 호흡이나 심장 장애 5-8 20 30 세 사이에 발생합니다. DMD에 대한 치료법은 없습니다. 글루코 코르티코이드로 처리하고 어느 정도의 근육 퇴행의 진행을 느리게 할 수 있지만, 비만 및 당뇨병 2,7,8 포함한 심각한 부작용과 관련된다. DMD는 기능 디스트로핀의 PROTEI의 손실로 이어지는은 디스트로핀 (DMD) 유전자에 돌연변이의 결과n은. DMD는 2 백만 염기쌍 79 엑손 9, 10으로 매우 큰 유전자이다. 아웃 오브 프레임 돌연변이로 이어지는 삭제, 넌센스, 및 중복 돌연변이는 DMD 표현형의 가장 흔한 원인이다. 9 엑손 (45) – – 엑손 3의 지역 대부분의 환자는 유전자의 이러한 부분에서 삭제 돌연변이를 가지고 55 DMD 환자 3,9,11-16에 비 기능 디스트로핀을 선도, "돌연변이 핫스팟"이라고한다. 근육 세포막의 안정화에서 중요한 역할을 갖는 디스트로핀 당단백 복합체 (DGC) 내의 디스트로핀 기능한다. 중앙로드 도메인이 덜 중요한 역할을한다 3,9,17하면서 N- 말단 및 C는 함수의 가장 중요한 영역이다. 주로 DMD 유전자 내의 프레임 내 돌연변이의 결과 베커 근이영양증 (BMD)과 연관된 경증 표현형의 준수는 DMD의 치료 스킵 엑손의 적용을 고무. BMD 환자는 단축하지만 functiona 한말단 3,6,18 모두를 유지 리터, 디스트로핀 단백질. 엑손 스킵 이론적 BMD 3,19에서 보이는 것과 유사한 단축-하지만 관능 디스트로핀 단백질의 결과로, 판독 프레임을 복원 할 수있다.
안티센스 올리고 뉴클레오티드 (AONs)의 여러 유형 2'O – 메틸화 포스 포로 (2'OMePS) 및 phosphorodiamidate의 모르 폴리 노 올리고머 (PMOS)를 포함하여 임상 시험에서 테스트되었습니다. 이 AONs를 사용하여 건너 뛰기 엑손 (51) 및 (53)는 조사 된 결과가 유망한 동안 돌연변이 별 3, 19, 20, 21, 22 ~ 26대로, 단일 엑손 스키핑은 적용이 제한되어 있습니다. 질문은 하나의 엑손이 22, 23 스킵로부터 생성 된 결과적인 단축 디스트로핀 단백질의 안정성에 대해 남아있다. 또한, 일부 환자는 하나의 엑손보다가 독서 프레임 (3)을 복원하기 위해 제외 될 필요합니다. 기술적으로 더 어려운 반면, 멀티 엑손 스키핑은 하나의 방법입니다이러한 문제 3,19를 해결할 수 있습니다. 멀티 엑손 스키핑 이전 이영 개, 시험관에서 인간 세포주에서 입증되었다. 또한, mdx52 마우스와 개 X-연결 근이영양증 (CXMD) 개 모델에서 생체에 사용 된 22, 24 ~ 27을 연구. 송곳니 X 결합 근이영양증 (일본 CXMD J) CXMD J의 판독 프레임은 엑손 (6, 8) 또는 추가 엑손 (즉, 엑손은 3-9)의 멀티 엑손 스킵에 의해 복원 될 수있는 비글 여기에 사용 하였다 (도 1). 비글 기반 CXMD는 골든 리트리버 근이영양증 (GRMD) 모델과 동일한 변이 패턴을 공유하지만 비글 견 따라서 DMD (28, 29)에 유용한 모델을 제공하기 때문에 자신의 신체 크기에 작은 및 유지 관리를 저렴합니다. CXMD 개는 더 밀접하게 설치류 같은 작은 동물 모델보다 인간의 DMD 표현형을 모방, 및 독성 학적 평가 3,22,30,31을 더 신뢰할 수있는 </s(그림 2)>입니다. CXMD 개는 DMD에서 본 것과 유사한 진보적 인 근육의 붕괴, 보행 장애, 심장 및 호흡기 문제를 표시합니다. 단일 엑손 스킵과 비교하여 멀티 – 엑손 스키핑 환자의 더 큰 비율에 적용 가능하다. 가장 일반적인 세 돌연변이 유형 (삭제, 넌센스, 및 중복) 중 80 – 모든 DMD 환자의 45 %가 이익을 얻을 수있는 동안 환자의 98 %는 구체적으로 건너 뛰는 엑손 (45), 멀티 엑손은 14,32,33를 건너 뛰는를 통해 처리 될 수있다 – 55 3,19,22,34.
변성 morpholinos의 발달로, 엑손 스킵 촉진에 AON 칵테일의 효율이 개선되었다. 아르기닌이 풍부한 세포 침투 펩타이드 결합 된 PMOS (PPMOs), 및 생체-morpholinos (vPMOs)은 크게 세포 침투 능력과 안정성 3,35-38을 향상 AON 화학이다. 우려는 장기 AON 독성에 대한 유지; 그러나, 상당한 진전만들어졌다. morpholinos에 대한 화학 수정은 크게 오프 대상 효과를 감소 및 사전 임상 연구는 유의 한 독성 효과 3,22,39,40을보고있다. 멀티 엑손 스키핑을위한 남은 과제는 각각의 단일 AON의 현재 요구 사항 칵테일 3,19,22,41,42으로 대신 함께 하나의 약물로, 단독으로 독성 시험을하여야한다. 심장을 대상으로 스킵 핑 하나 모두 다 엑손을 포함하는 DMD의 연구에서, 이영 심장 조직에 약간의 개선이 있었다. 마음에 morpholinos의 효능 때문에 가난한 세포 침투 능력이 낮은 것으로 생각된다. 펩타이드 공액 PPMOs 심장 3,19,38에 기능성 구조 디스트로핀 단백질의 양을 증가, 심장 세포 침투 AONs의 능력을 개선하고있다.
여기서, 우리 AON 칵테일 접근법 ESEfinder 소프트웨어 (43)를 사용 AON 서열의 설계를 포함하여 길이로 논의된다. Protoc멀티 엑손 스키핑와 개 실험에 대한 OLS도 설명되어 있습니다. CXMD J의 비글 견은 엑손 6, 8 스킵 실험에 사용 하였다. CXMD 개 모델에서 건너 뛰는 멀티 엑손은 유망한 결과를 보여 주지만, 문제는 임상 적으로 적용 할 수 있습니다 전에 필요가 극복해야 할 남아있다.
엑손 스키핑은 DMD의 치료를위한 유망한 치료 기술이다. 모두 시험 관내 및 생체 내 실험에서 멀티 엑손 스킵이 가능한 것으로 나타났다. 여기서, CXMD 개 모델의 사용이 설명되어 있습니다. 2'OMePS AON 화학은 CXMD의 근원 세포의 형질 전환 및 모르 폴리 노의 AON 백본 화학 생체 실험을 위해 선택되었다에 사용 된 8 – 첫째, AONs는 디스트로핀의 엑손 (6)를 대상으로 구조-ESE 및 ESEfinder 프로그램을 사용하여 설계되었다. vPMOs는 수정되지 않은 PMOS보다 더 효율적이지만 그들의 높은 독성으로 인해 그들은 전신 주사에 적합하지 않습니다. RNA 추출, RT-PCR 및 cDNA의 염기 서열은 CXMD의 아세포상에서 수행 하였다. PMO 칵테일 주사 개는 임상 증상에 어떤 개선을 평가하는 임상 등급 화했다. 개는 인도적으로 안락사시킨 후, 근육 샘플 촬영 및 극저온 절편을 준비 하였다. A로 유도 디스트로핀 단백질의 반감기2개월 – 기능은 약 1로 여겨지고 있습니다. 이 실험은 신생아 개 (5 세>) 이전 개를 사용하여 수행 할 수 있지만 젊은 성인 개는이 연구에 사용되었다. 준비 근육 섹션은 조직 병리학을 평가하고 웨스턴 블롯 및 면역 조직 화학 (48)를 통해 디스트로핀 단백질 구조를 평가하기 위해 사용되었다.
PMO 용액의 부피가 주입 전에 올바른지 확인하는 것이 중요하다; 그렇지 않을 경우 결과에 상당한 영향을 미칠 것입니다. 근육 주사 동안, 충분한 압력이 근육 섬유를 입력 할 필요가있다. 개 건강과 수술 부위의 검사 모니터링은 문제 해결을 위해 중요하다. 동물의 상태를 모니터링하기 위해, 매주 혈액 검사와 무게가 수행해야합니다. 동물 근육 샘플 준비 euthanization 후, 디스트로핀 단백질의 검출 감도를 확보하기위한 중요한 단계는 트리스 – 아세테이트 젤, 세미 드라이 블롯 방법 모두를 사용하는웨스턴 블로 팅 절차를 수행하는 동안.
대표적인 결과에 도시 된 바와 같이, 근육 아세포는 프레임 내 DMD 제품 제조 Ex6A, Ex6B, Ex8A 및 칵테일 (Ex6A, Ex6B, Ex8A 함유하고 Ex8B)로 처리 하였다. Ex8B 더 엑손 스킵 제품을 생성하지 않기 때문에, 이는 생체 내 실험에서 이후에 사용되지 않았다. 9 건너 뛰기 발생한 DYS-2 염색과 면역 세포 치료 샘플에서 디스트로핀 식을 복원 보였다 – cDNA의 염기 서열은 엑손 6 것으로 나타났다. AON 처리 된 개는 디스트로핀 양성 섬유의 상당한 증가를 나타내었다. 8 생략되고하고 단축 단백질이 생성되었다 -이 엑손 6가 있음을 나타냅니다. 디스트로핀 양성 섬유의 양은 AONs의 칵테일을 사용했을 때 증가 AON 투여 량에 비례 하였다. 면역 블롯은 전신 모르 폴리 노 처리 개에서 디스트로핀의 발현을 증가 보였다. 골격근은 디스트로핀 섬유의 가변 레벨을 가지고; 그러나, 모르 폴리 노 – 처리 된 심장 조직이 약간 보였다디스트로핀 발현의 향상. 디스트로핀은 높은 분자량 (427 kDa의)을 갖기 때문에, 디스트로핀 소량의 검출이 어려울 수있다. 최상의 결과를 위해, 트리스 – 아세테이트 겔 및 세미 드라이 전사 방법을 사용 하였다. 그는 모르 폴리 노 처리 강아지의 개선 조직 병리학을 보였다의 염색. 중앙 핵 섬유 (CNFs)는 건강에 해로운 근육의 표시이며, 근육의 변성과 재생의주기를 나타냅니다. 모르 폴리 노 – 처리 CXMD 개는 비 처리 CXMD 개 비교 CNFs의 비율의 감소를 보였다. 임상 등급은 모르 폴리 노 처리 된 동물에서 증가 산책과 실행 능력과 같은 증상의 개선을 밝혔다. 근육의 경도 따라서,이 등급 체계 (59)에 포함 된 근육 위축을 반영하는 것으로 생각된다. 대퇴부 (뒷다리) 근육의 경도를 평가 하였다; 그들은 CXMD에 비대보다는 위축을 나타내는 경향이 있기 때문에, 우리는 뇌 SARTORIUS 근육을 제외. 치료 개 표시낮은 등급의 점수를 에드와 15m 주행 시험에 빠른 시간을 가졌다. 15m 시험에 개선 된 시간은 개선 된 근육 기능 (40)을 나타내는입니다. 높은 전체 등급 점수는 건강이 좋지 증가 근육의 위축을 나타냅니다.
이러한 결과는 유망하지만, 멀티 – 엑손 스킵 여전히 임상 기술을 적용하기 전에 극복해야 할 많은 과제를 제시한다. 심장 조직은 여전히 인해 심장과 골격 조직 사이의 세포 인신 매매의 차이로 AONs, 가능성의 감소 흡수를 표시합니다. 독성 효과는 현재 투여 섭생하에 동물에서 관찰되지 않았다; AON 칵테일의 사용은 임상 시험으로 이동하기 전에 그러나, 많은 작업 장기 독성을 평가하기 위해 수행 할 필요가있다. 규제 기관 고유 약물 각 AON 순서를 정의하기 때문에 AON 칵테일 약물에 대한 승인을 얻기 어렵다. 이 칵테일의 각 시퀀스는 개별적으로 보안 시스템을 테스트 할 필요가 있음을 의미Y는 더 많은 시간과 더 많은 돈을 요구. 임상 환경에서 멀티 엑손 스킵를 사용하는 또 다른 장벽 미지 함수 생성 중간 단백질 제품의 많은 양이다. 이 단백질은 잠재적으로 개인 돌연변이 (22)에 따라 예측할 수없는 부작용을 초래할 수 있습니다. 또한, 현재의 이영 개 모델에서 사용 가능한 돌연변이 패턴이 제한됩니다. 이 몇 자연 발생적인 돌연변이가 있고, 모든 돌연변이는 멀티 엑손 스키핑을 연구하는 데 유용하지. 이영 돼지 모델은 미래의 DMD 엑손은 연구 33, 34을 건너 뛰는에 대한 좋은 대안이 될 것을 약속드립니다.
DMD 개 모델은 다른 DMD의 모델에 비해 몇 가지 장점이있다. 더 큰 동물 모델 임상 등급 인 및 MRI보다 자세한 분석을 위해 허용 가능하다. 개는 큰 동물이기 때문에 그들은 또한 독성 연구에 더 적합하고 더 밀접하게 마우스 모델에 비해 인간의 질병을 나타냅니다. 개 models 또한 인간 23, 34, 45에 더 유사하다 DMD 유전자 서열을 가지고있다.
기술적 도전이지만, 멀티 엑손 스킵 방식은 궁극적 DMD 환자 24> 90 % 유익 할 수있다. 단일 엑손 스키핑 환자의 작은 부분 집합에만 적용 이것은, 그것은 단일 엑손 스키핑에 더 나은 대안이 있습니다. 또한, 멀티 – 엑손 스키핑은 단축 디스트로핀 단백질의 기능을 최적화 삭제 패턴을 선택하기 위해 사용된다. (55) 매우 가벼운 증상 또는 무증상 개인 14,19,60-63와 관련된 – 예를 들어, DMD의 삭제는 45 엑손. 엑손 (45)의 멀티 – 엑손 스킵 – 55 이미 vPMOs 22,26 전신 주사를 사용하여 엑손 52 삭제 (mdx52)과 DMD의 마우스 모델에서 입증되었다. 칵테일 vPMOs의 사용은 또한 근이영양증 다른 형태의 예에서 설명 된후쿠야마 선천성 근이영양증 (FCMD) 등. FCMD은 비정상적인 mRNA의 접합이 레트로 트랜스포존의 삽입으로 인해 발생하는 엑손 트래핑에 의해 발생합니다. vPMOs는 둘 다 FCMD 마우스 모델과 인간 세포주 (64)의 접합 패턴을 구하기 위해 도시되었다. 높은 효능과 낮은 독성을 나타내는 차세대 AON 화학 임상 응용에 멀티 엑손 스킵 방식의 효과적인 번역을 용이하게한다. 또한, 멀티 – 엑손 스킵 잠재적 예 dysferlinopathies 24, 65 등의 다른 유전 질환에 적용 할 수있다.
The authors have nothing to disclose.
This work was supported by The University of Alberta Faculty of Medicine and Dentistry, The Friends of Garrett Cumming Research Chair Fund, HM Toupin Neurological Science Research Chair Fund, Muscular Dystrophy Canada, Canada Foundation for Innovation (CFI), Alberta Advanced Education and Technology (AET), Canadian Institutes of Health Research (CIHR), Jesse’s Journey – The Foundation for Gene and Cell Therapy, and the Women and Children’s Health Research Institute (WCHRI).
2'OMePS Transfection of Dog Myoblasts | |||
3ml 6 welled plates | IWAKI | 5816-006 | |
Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM) | Gibco | 11965-092 | |
fetal bovine serum (FBS) | HyClone | SH30071.01 | |
Penicillin | Sigma-Aldrich | P4333 | 200 U/mL |
Lipofectin | Invitrogen | 18292-011 | Total volume of 100 mL in opti-MEM media at a ratio of 2:1 for lipofectin. 10 mL lipofectin for 5 mg RNA. |
2’OMePS | Eurogentec | Ex6A (GUU GAUUGUCGGACCCAGCUCAGG), Ex6B (ACCUAUGA CUGUGGAUGAGAGCGUU), and Ex8A (CUUCCUGG AUGGCUUCAAUGCUCAC). | |
Horse Serum | Gibco | 16050-114 | 2% |
streptomycin | Sigma-Aldrich | P4333 | 200 ug/mL |
Bovine serum albumin (BSA) | Sigma-Aldrich | A9418 | |
Insulin | |||
Morpholino transfection of dog myoblasts | |||
All material from MePS Transfection of Dog Myoblasts for culturing | |||
Antisense morpholinos | Gene-tools |
Ex6A(GTTGATTGTCGGACCCAGC |
|
Endo-Porter | Gene-tools | ||
guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform | Invitrogen | 15596-018 | 1mL/plate |
RNA Extraction and Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) | |||
guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform | Invitrogen | 15596-018 | 1mL/plate |
Chloroform | Sigma-Aldrich | P3803 | 200 uL |
1.5 ml Tubes | Eppendorf | 22363204 | |
Centrifudge | Beckman-Coulter | ||
75% Ethanol | Sigma-Aldrich | 34852 | |
UV Spectrometer | |||
Forward primer in exon 5 | Invitrogen | CTGACTCTTGGTTTGATTTGGA 1.5 mL 10 mM |
|
Reverse primer in exon 10 | Invitrogen | TGCTTCGGTCTCTGTCAATG 1.5 L 10 mM |
|
dNTPS | Clontech | 3040 | |
One-Step RT-PCR kit | Qiagen | 210210 | |
Thermo-cycler | Scinco | ||
Complementary DNA (cDNA) Sequencing | |||
Gel extraction kit | Qiagen | 28704 | |
Centrifudge | |||
Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit | Applied Biosystems | 4337454 | |
Intramuscular injections or open muscle biopsy | |||
Surgical Tools | Scissors, Scapal, needle, surgical thread | ||
Vet Ointment | |||
Iodophors | webtextiles | 12190-71-5 | |
chlorohexidine | Peridex | 12134 | |
Surgical Drapes | |||
Srubs | |||
Facial Mask | |||
Surgical Gloves | |||
Head Covering | |||
Thiopental sodium | Mitsubishi Tanabe Pharma | 20 mg/kg | |
Isoflurane | Abbott laboratories | 05260-05 | 2-3% |
Antisense morpholinos | Gene-tools | Ex6A(GTTGATTGTCGGACCCAGC TCAGG), Ex6B(ACCTATGACTGTGGATGAG AGCGTT), Ex8A(CTTCCTGGATGGCTTCAAT GCTCAC) Dilute to a final volume of 100 L in opti-MEM media. 120–200 mg/kg of morpholinos at 32 mg/mL in saline |
|
27G Needles | TERUMO | SG3-2325 | |
50 mL syringe | TERUMO | SG2-03L2225 | |
buprenorphine hydrochloride | |||
Tougne Depressor | |||
cephalexin | 15 to 30 mg/kg | ||
cefazolin | 15 to 30 mg/kg | ||
buprenorphine | 0.01 mg/kg | ||
buprenorphine hydrochloride | 0.02 mg/kg | ||
Systemic Injections | |||
Syringe infusion pump | Muromachi | ||
22G Indwelling needles | TERUMO | SG3-2225 | |
27G Needles | TERUMO | SG3-2325 | |
50 mL syringe | TERUMO | SG2-03L2225 | |
Saline | Ohtsuka-Pharmaceutical | 28372 | |
Clinical Grading of Dogs | |||
Video Camera | |||
Stop watch | |||
Magnetic resonance imaging (MRI) | |||
3 Tesla MRI l | |||
18 cm diameter/18 cm length human extremity coi | |||
Muscle sampling and preparation (necropsy) | |||
Thiopental sodium | Mitsubishi Tanabe Pharma | 20 mg/kg | |
Isoflurane | Abbott laboratories | 05260-05 | 2-3% |
Tragacanth gum | 10-20 mL | ||
Liqoud Nitrogrn | |||
Cork Discs | Iwai-kagaku | 101412-806 | |
Dry Ice | |||
Tweezers | |||
Poly-l-lysine–coated slides | Fisher | 22-037-216 | |
Cryostat Microsystem | Leica | cm1900 | |
Immunohistochemistry | |||
DYS1 | Novocastra | NCL-DYS1 | 1:150 dilutions |
DYS2 | Novocastra | NCL-DYS2 | 1:150 dilutions |
Alexa 594 goat antimouse IgG1 | Invitrogen | A-21125 | 1:2,500 dilutions |
Alexa 594 goat antimouse IgG2 | Invitrogen | A-11005 | 1:2,500 dilutions |
DAPI | Invitrogen | D1306 | Contans mounting agent |
Goat Serum | Invitrogen | 10000C | 15% |
PBS | |||
Moisture chamber | Scientific Devise Laboratory | 197-BL | |
Chamber slide | Lab-tek | 154453 | |
Cover Glasses | Fisher | 12-540A | |
Hydrophobic barrier pen | |||
Flpurescent microcope | 594 nm at 20X magnification. | ||
Western Blotting | |||
Distillied Water | |||
Hand Homogenizer | |||
2× Laemmli SDS-loading buffer | 0.1 M Tris–HCl (pH 6.6), 2% (w/v) SDS, 2% (0.28 M) beta-mercaptoethanol, 20% glycerol, 0.01% bromophenol blue | ||
SDS gels | Bio-Rad | 161-1210 | 5% resolving |
SDS gels | Invitrogen | Invitrogen, WG1601BOX | 3-8% |
PVDF membrane | GE | 10600021 | |
Methanol | |||
Transfer buffer (10×) | 250 mM of Tris-Base, 1,920 mM of Glycine | ||
Transfer buffer (1×) | 10% 10× buffer, 20% methanol | ||
0.05% PBS/Tween 20 (PBST) | 2,000 mL 3× 200 mL for washing |
||
PBST/5% milk powder | 100 mL | ||
Protein Assay Kit | BCA | T9650 | |
Tween 20 | Sigma | P5927 | |
Urea | Sigma | U5378 | |
Beta Mercaptoethanol | Millipore | ES-007-E | |
SDS | Sigma | L3771 | |
Tris-Acetate | Sigma | ||
Tris HCL | Sigma | T3253 | |
Glycerol | Sigma | G8773 | |
Loading/sample buffer for Western blotting | NuPage Invitrogen | NP007 | |
NaCl | Sigma | S3014 | |
PMSF | Sigma | P7626 | |
Protease cocktail inhibitor | Roche | 11836153001 | |
Cathode Buffer | .025 M Tris base + 40 mM 6-aminocaproic acid + 20% Methanol | ||
Anode Buffer | 0.03 M Tris Base + 20% Methanol | ||
Concentred Anode Buffer | 0.3 M Tris base + 20 % Methanol | ||
desmin antibody | Abcam | ab8592 | |
DYS1 | Novocastra | NCL-DYS1 | 1:150 dilutions |
Image J Software |