דילוג על אקסונים הוא כרגע אופציה טיפולית מבטיחה ביותר בניוון שרירים דושן (DMD). כדי להרחיב את תחולת לחולים DMD וכדי לייעל את יציבות / פונקציה של חלבונים בדיסטרופין מקוצץ וכתוצאה מכך, גישה-אקסון רב דילוג באמצעות מולקולות אנטיסנס קוקטייל פותחה הראינו הצלה בדיסטרופין מערכתית במודל הכלב.
ניוון שרירים דושנו (DMD) הוא אחת המחלות הגנטיות הקטלנות הנפוצות ביותר בעולם, נגרמים על ידי מוטציות בגן בדיסטרופין (DMD). דילוג על אקסונים מעסיק דנ"א קצר / מולקולות דמויות RNA שנקראים מולקולות אנטיסנס (AONs) כי לשחזר את מסגרת הקריאה ולייצר חלבונים קצרים אך פונקציונליים. עם זאת, טיפול דילוג אקסון ניצבת בפני שני מכשולים עיקריים: תחולה מוגבלת (עד רק 13% מהחולים יכול להיות מטופלים עם תרופה אחת AON), ותפקוד ודאית של חלבונים קטועים. טופלו נושאים אלו עם גישה AON קוקטייל. בעוד כ 70% מחולי DMD יכולים להיות מטופלים על ידי דילוג אקסון בודד (כל אקסונים המשולבים), אפשר לטפל פוטנציאל ליותר מ -90% מחולי DMD אם אקסון המרובה דילוג באמצעות תרופות antisense קוקטייל יכול להתממש. הכלב X-linked ניוון שרירים מודל כלב (CXMD), פנוטיפ אשר דומה יותר בחולים אנושיים DMD, שימש כדי לבדוק את effic מערכתיתחרדה ובטיחות של דילוג רב אקסון של אקסונים 6 ו -8 מודל הכלב CXMD נמלי מוטצית אתר שחבור ב אינטרון 6, מוביל חוסר אקסון 7 ב mRNA בדיסטרופין. כדי לשחזר את מסגרת הקריאה CXMD דורש דילוג אקסון-רב של אקסונים 6 ו -8; ולכן, CXMD הוא מודל חיה בגודל בינוני טוב לבדיקת היעילות והבטיחות של דילוג רב אקסון. במחקר הנוכחי, קוקטייל של morpholinos antisense מיקוד אקסון 6 ו אקסון 8 תוכנן וזה החזיר ביטוי בדיסטרופין בשרירי שלד-רחב גוף. שיטות transfection / הזרקה של oligos קוקטייל והערכה של היעילות והבטיחות של דילוג רב אקסון במודל כלב CXMD מוצגים.
ניוון שרירים דושן (DMD) היא מחלה שרירים רצסיבי צמודי X שמתאפיין בחולשת שרירים מתקדמת, תוארה לראשונה על ידי ד"ר גיום-בנימין-אמאנד דושן (בולון) 1. DMD היא מחלה גנטית נפוצה המשפיעה על 1 ב -3,500 נערים ברחבי העולם, עם כ -20,000 ילדים מושפעים הנולדים בכל שנה 2,3. התפתחות מוטורית מתעכבת והפרעות בהליכה נראות בתחילת ילדות 4, ואחריו תלות גלגלים בערך העשרה המוקדמים. המוות מתרחש בדרך כלל בין הגילאים 20 ו -30 בשל כשל נשימתי או לבבי 5-8. אין כרגע תרופה DMD. טיפול עם גלוקוקורטיקואידים יכול להאט את התקדמות ניוון שרירים מסוים אך קשור לתופעות לוואי משמעותיות, כגון: השמנת יתר וסוכרת 2,7,8. DMD הנובעת מוטציות בגן בדיסטרופין (DMD), שמוביל לאובדן של protei בדיסטרופין פונקציונליn. DMD הוא גן גדול מאוד עם יותר מ -2 מיליון זוגות בסיסים ו -79 אקסונים 9,10. מחיקה, שטויות, ומוטציות שכפולות המוביל מוטציות מחוץ למסגרת הן הסיבה השכיחה ביותר של פנוטיפ DMD. האזורים של אקסונים 3 – 9 וגם אקסונים 45 – 55 מכונים "נקודות חמות מוטציה" כמו שיש רוב החולים מוטציות מחיקות בתוך חלקים אלה של הגן, מה שמוביל בדיסטרופין שאינו פונקציונלי בחולי DMD 3,9,11-16. בדיסטרופין פונקציות במתחם גליקופרוטאין-בדיסטרופין (DGC), אשר יש תפקיד מרכזי בייצוב קרום השריר. N- ו- C-Termini הם התחומים החשובים ביותר לתפקוד, בעוד תחום המוט המרכזי ממלא 3,9,17 תפקיד חשוב פחות. השמירה על פנוטיפ קל הקשורים בניוון שרירי בקר (BMD), שתוצאתה בעיקר מוטציות בתוך המסגרת בתוך גן DMD, בהשראת היישום של אקסון דילוג לטיפול DMD. חולי BMD שיהיו לך מקוצר, אבל functional, חלבון בדיסטרופין מקיים הוא טרמיני 3,6,18. אקסון מדלג, בתאוריה, ניתן לשחזר את מסגרת הקריאה, וכתוצאה מכך חלבונים בדיסטרופין מקוצרים-אבל-תפקודיים דומים לזו של BMD 3,19.
סוגים שונים של מולקולות אנטיסנס (AONs) נבדקו במחקרים קליניים, כולל phosphorothioates-מפוגל 2'O (2'OMePS) ו oligomers morpholino phosphorodiamidate (PMOS). אקסונים דילוג 51 ו -53 באמצעות AONs אלה נבדקים תוך ותוצאות מבטיחות, דילוג חד אקסון יש תחולה מוגבלת, כפי שהוא מוטציה ספציפית 3, 19, 20,21, 22-26. שאלות גם להישאר על היציבות של חלבונים בדיסטרופין מקוצר וכתוצאה המופק-אקסון בודד דילוג 22,23. בנוסף, חולים מסוימים דורשים יותר מאשר אקסון בודד שברצונכם לדלג עליו כדי להחזיר את מסגרת הקריאה 3. למרות שמבחינה טכנית קשה יותר, מדלגים-אקסון רב היא אחת השיטות כייכול לטפל בבעיות אלה 3,19. דילוג רב-אקסון הודגם בעבר כלב דיסטרופי ואת שורות תאים אנושיות במבחנה. בנוסף, ניוון שרירים צמוד X העכבר כלבי mdx52 (CXMD) מודלי כלב שמשו במשך במחקרים vivo 22, 24-27. X-linked כלבים ניוון שרירים יפן (CXMD J) כלבי ציד שימשו כאן, כמו את מסגרת הקריאה של CXMD J ניתן לשחזר על ידי דילוג רב אקסון של אקסונים 6 ו -8, או אקסונים נוספים (למשל, אקסונים 3 – 9) (איור 1). ביגל המבוסס CXMD חולקת אותו דפוס המוטציה כמו ניוון שרירי גולדן רטריבר (GRMD) המודל, אבל כלבי ציד קטנים וזולים יותר כדי לשמור על עקב גודל גופם, ובכך לספק מודל שימושי DMD 28,29. כלבי CXMD לחקות באופן הדוק יותר את הפנוטיפ DMD האנושי מאשר במודלים של בעלי חיים קטנים, כמו מכרסמים, והם אמינים יותר להערכות טוקסיקולוגית 3,22,30,31 </sעד> (איור 2). כלבי CXMD להציג ריקבון שרירים מתקדם, הפרעות בהליכה, ובעיות לב ונשימה דומה לאלה שראו DMD. לעומת דילוג חד אקסון, מדלגים-אקסון רב ישימים חלק הרבה יותר גדולה של חולים. בין שלושת סוגי המוטציה הנפוצה ביותר (מחיקות, שטויות, כפילויות), 80 – 98% מהחולים יכולים להיות מטופלים באמצעות רב אקסון דילוג 14,32,33, בעוד 45% מכלל חולי DMD יכול להפיק תועלת אקסונים דילוג במיוחד 45 – 55 3,19,22,34.
עם התפתחותה של morpholinos השונה, את היעילות של קוקטיילי AON להקל דילוג אקסון השתפרה. ארגינין עשיר PMOS פפטיד מצומדות חודר תאים (PPMOs), ו vivo-morpholinos (vPMOs) הם כימיות AON ששיפרו משמעותית חודר תאים היכולת ויציבות 3,35-38. חששות להישאר על רעילות ארוכי טווח AON; עם זאת, התקדמות משמעותיתנעשה. שינויים כימיים שבוצעו morpholinos להקטין באופן משמעותי השפעות חוץ-היעד של סקרי טרום קליניים דיווחו ללא תופעות רעילות משמעותית 3,22,39,40. אתגר הנותרים עבור דילוג רב אקסון היא הדרישה הנוכחית עבור כל אחת AON להיבדק לרעילות לבד, כתרופה יחידה, במקום יחד כמו קוקטייל 3,19,22,41,42. במחקרי DMD המעורבים הוא-אקסון רב יחיד מדלגים ממוקדת בלב, חל שיפור קטן ברקמת לב דיסטרופי. יעילותה של morpholinos בלב הוא חשב להיות נמוך בגלל היכולת החודרת-תא עני. פפטיד מצומדות PPMOs שיפרו את היכולת של AONs לחדור תאי לב, הגדלת כמות החלבון בדיסטרופין פונקציונלי הצילה בלב 3,19,38.
הנה, גישת קוקטייל AON שלנו נדונה בהרחבה, לרבות עיצוב רצפי AON באמצעות ESEfinder תוכנה 43. ProtocOLS עבור ניסויים בכלבים עם דילוג רב אקסון מתואר גם. CXMD J כלבי ציד שימשו אקסונים 6 ו -8 ניסויים מדלגים. Multi-אקסון דילוג במודל כלב CXMD מראה תוצאות מבטיחות, אך אתגרים להישאר להיות להתגבר שהצורך לפני שהם קליניים ישימים.
דילוג על אקסונים הוא טכניקה טיפולית מבטיחה לטיפול DMD. הן במבחנה בניסויים vivo הראו כי דילוג רב אקסון אינו ריאלי. כאן, השימוש במודל כלב CXMD נדון. ראשית, AONs תוכננו באמצעות התוכנית Rescue-ESE ותוכניות ESEfinder למקד אקסונים בדיסטרופין 6 – 8. כימיה 2'OMePS AON שימש transfection myoblast CXMD והכימיה עמוד השדרה AON morpholino נבחר לניסויים in vivo. vPMOs הם יעיל יותר מאשר PMOS ללא שינוי אך בשל הרעילות הגבוהה שלהם הוא אינם מתאימים זריקות מערכתיות. מיצוי RNA, RT-PCR, וסדר cDNA בוצעו על myoblasts CXMD. הכלבים מוזרקים עם קוקטייל PMO דורגו קליני להעריך כל שיפור בתסמינים קליניים. לאחר שהכלבים היו מורדמים אנושיים, דגימות שריר נלקחו והוכנו-חתך cryo. זמן מחצית החיים של חלבון הדיסטרופין המושרה על ידיONS הוא האמין להיות כ 1 – 2 חודשים. כלבים בוגרים צעירים שימשו במחקר זה, אם כי ניסויים אלה ניתן לעשות עם כלבים ילודים כלבים מבוגרים (> בן 5 שנים). סעיפי שריר מוכנים שמשו להעריך histopathology ולהעריך חלבון הצלה בדיסטרופין באמצעות מערבי סופג אימונוהיסטוכימיה 48.
חשוב להבטיח כי היקף פתרון PMO נכון לפני זריקות; אי לעשות זאת תהיה השפעה משמעותית על תוצאות. במהלך זריקה תוך שרירית, לחץ מספיק נדרש להזין סיבי השריר. ניטור של כלב בריאות ובדיקה של אתר הניתוח חשוב לפתרון בעיות. כדי לפקח על בריאות בעלי חיים, בדיקות דם שבועיות ומשקל צריכות להתבצע. לאחר euthanization של החיה והכנה דגימות שריר, צעד חיוני להבטחת רגישות באיתור חלבון בדיסטרופין הוא להשתמש בשני הג'ל טריס-יצטט ושיטה סופג חצי יבשהבמהלך ההליך המערבי סופג.
כפי שניתן לראות בתוצאות הנציג, myoblasts שטופל Ex6A, Ex6B, Ex8A, ואת הקוקטייל (המכיל Ex6A, Ex6B, Ex8A, ו Ex8B) מיוצר מסגרת מוצרי DMD. מאז Ex8B הניבה שום מוצרים אקסון-דלג, זה לא היה בשימוש לאחר בניסויי vivo. רצף cDNA הראה כי אקסונים 6 – דילוג 9 התרחשה immunocytochemistry עם מכתים פרע-2 הראה משוחזר ביטוי בדיסטרופין בדגימות מטופל. AON שטופלו כלבים הראו עלייה משמעותית בסיבים בדיסטרופין חיובי. זה מצביע על כך אקסונים 6 – 8 היו מדלגים עליו לבין חלבון מקוצר הופק. כמות הסיבים בדיסטרופין החיובי מוגברת כאשר קוקטייל של AONs שמש והייתה פרופורציונאלי מינון AON. Immunoblots והראה גדילת ביטוי בדיסטרופין בכלבים מערכתיים שטופל morpholino. שרירי שלד היו רמות משתנות של סיבים בדיסטרופין; עם זאת, רקמת לב שטופלו morpholino הראה מעטשיפור הביטוי בדיסטרופין. מאז בדיסטרופין יש משקל מולקולרי גבוה (427 KDA), זיהוי של כמויות נמוכות בדיסטרופין יכול להיות קשה. לקבלת התוצאות הטובות ביותר, ג'ל טריס-יצטט ואת שיטת ההעברה-יבש למחצה היו בשימוש. HE מכתים הראה histopathology השתפר כלבים שטופלו morpholino. מרכזי-גרעיני סיבים (CNFs) הם סימן של שריר בריא ולייצג מחזורים של ניוון שרירים והתחדשות. Morpholino שטופלו כלבים CXMD נרשמה ירידה באחוז CNFs בהשוואה לכלבים CXMD שאינם מטופלים. לדירוג קליני גילה שיפור בתסמינים, כגון הליכה מוגברת ויכולת לרוץ, בחיות שטופלו morpholino. הקשיות של השרירים הוא האמין כדי לשקף ניוון שרירים, ובכך, הוא נכלל בתכנית לדירוג 59. הקשיות של ירך (אחורי-איבר) שרירים הוערכה; עם זאת, לא כללנו שרירים גולגולתי סארטוריוס כי הן נוטות להציג היפרטרופיה ולא ניוון ב CXMD. המטופלים כלבים להראותאד ציונים לדירוג נמוכים והיו פעמים מהר על מבחן הריצה 15 מ '. פעמים משופרות במבחן 15 מ 'מעידות על תפקוד שרירים משופר 40. עשרות לדירוג כוללים גבוהים מצביעים בריאות לקויה וניוון שרירים מוגבר.
למרות שתוצאות אלה אינן מבטיחות, מדלגים-אקסון רב עדיין מציבה בפנינו אתגרים רבים כי יהיה צורך להתגבר לפני יש את הטכניקה ישימות קלינית. ברקמת לב עדיין מציגה ספיגה מופחתת של AONs, ככל הנראה בשל ההבדל בסחר הסלולר בין רקמת לב שלד. אין השפעות רעילות נצפו בבעלי חיים תחת משטרי מינון נוכחיים; עם זאת, יותר עבודה שצריך לעשות על מנת להעריך רעילות ארוכי טווח לפני והשלכת בקבוקי AON יכול לעבור ניסויים קליניים. קשה לקבל אישור לתרופות קוקטייל AON כי רשויות רגולטוריות להגדיר כל רצף AON כתרופה ייחודית. משמעות הדבר היא כי כל רצף קוקטייל היה צריך להיבדק בנפרד עבור Safety, הדורשים יותר זמן ויותר כסף. מחסום נוסף על שימוש דילוג רב אקסון בסביבה קלינית הוא כמות גדולה של מוצרי חלבון הביניים מיוצרים עם פונקציות ידועות. חלבונים אלה עלולים לגרור פעולות תופעות לוואי בלתי צפוי, תלוי מוטצית פרט 22. בנוסף, דפוסי המוטציה הזמינים בתוך מודלי כלב דיסטרופי הנוכחיים מוגבלים. ישנם כמה מוטציות טבעיות המתחוללות, ולא כל המוטציות הן שימושיות לחקר דילוג אקסון-רב. מודל חזיר דיסטרופי מבטיח להיות אלטרנטיבה טובה עבור אקסון בעתיד DMD דילוג מחקרים 33, 34.
המודלים כלב DMD יש כמה יתרונות על פני מודלים DMD אחרים. להיות לדירוג קליני, במודל חיה גדול ו- MRI אפשרי, המאפשר ניתוח מפורט יותר. מאז כלבים הם בעלי חיים גדולים הם גם יותר מתאימים מחקרי רעלים ועוד מקרוב מייצגי המחלה האנושית בהשוואה למודל העכבר. כלב מodels גם יש רצפי גנים DMD, כי הם יותר דומים לבני אדם 23, 34, 45.
למרות שטכנית מאתגר, גישת הדילוג הרב אקסון יכולה בסופו של דבר ליהנות> 90% מחולי DMD 24. זה עושה את זה אלטרנטיבה הרבה יותר טובה כדי דילוג חד אקסון, כמו דילוג חד אקסון הוא חל רק על קבוצה קטנה של חולים. בנוסף, דילוג רב אקסון יאפשר לנו לבחור את דפוסי המחיקה המביאות למרב את הפונקציונליות של חלבונים בדיסטרופין מקוצר. לדוגמא, מחיקת DMD אקסונים 45 – 55 קשורים לסימפטומים קלים במיוחד או אנשים ללא תסמינים 14,19,60-63. את מדלגת רב אקסון של אקסונים 45 – 55 כבר הודגמה במודל של עכברים של DMD עם המחיקה 52 אקסון (mdx52) באמצעות זריקות מערכתית של 22,26 vPMOs. שימוש קוקטייל vPMOs גם הודגם צורות אחרות של ניוון שרירים, כגוןניוון שרירים מולד פוקויאמה (FCMD). FCMD נגרמת על ידי לכידת אקסון, שבו שחבור mRNA סוטה נגרם על ידי החדרת retrotransposon. vPMOs הוכח להציל את דפוס השחבור בשני מודל עכבר FCMD וב שורות תאים אנושיים 64. כימיות AON הדור הבא מציגות יעילות גבוהה רעילות נמוכה תקלנה על התרגום היעיל של גישת דילוג הרב אקסון לתוך יישום קליני. בנוסף, דילוג רב אקסון שעלול להיות מיושם על הפרעות גנטיות אחרות, כגון dysferlinopathies 24, 65.
The authors have nothing to disclose.
This work was supported by The University of Alberta Faculty of Medicine and Dentistry, The Friends of Garrett Cumming Research Chair Fund, HM Toupin Neurological Science Research Chair Fund, Muscular Dystrophy Canada, Canada Foundation for Innovation (CFI), Alberta Advanced Education and Technology (AET), Canadian Institutes of Health Research (CIHR), Jesse’s Journey – The Foundation for Gene and Cell Therapy, and the Women and Children’s Health Research Institute (WCHRI).
2'OMePS Transfection of Dog Myoblasts | |||
3ml 6 welled plates | IWAKI | 5816-006 | |
Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM) | Gibco | 11965-092 | |
fetal bovine serum (FBS) | HyClone | SH30071.01 | |
Penicillin | Sigma-Aldrich | P4333 | 200 U/mL |
Lipofectin | Invitrogen | 18292-011 | Total volume of 100 mL in opti-MEM media at a ratio of 2:1 for lipofectin. 10 mL lipofectin for 5 mg RNA. |
2’OMePS | Eurogentec | Ex6A (GUU GAUUGUCGGACCCAGCUCAGG), Ex6B (ACCUAUGA CUGUGGAUGAGAGCGUU), and Ex8A (CUUCCUGG AUGGCUUCAAUGCUCAC). | |
Horse Serum | Gibco | 16050-114 | 2% |
streptomycin | Sigma-Aldrich | P4333 | 200 ug/mL |
Bovine serum albumin (BSA) | Sigma-Aldrich | A9418 | |
Insulin | |||
Morpholino transfection of dog myoblasts | |||
All material from MePS Transfection of Dog Myoblasts for culturing | |||
Antisense morpholinos | Gene-tools |
Ex6A(GTTGATTGTCGGACCCAGC |
|
Endo-Porter | Gene-tools | ||
guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform | Invitrogen | 15596-018 | 1mL/plate |
RNA Extraction and Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) | |||
guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform | Invitrogen | 15596-018 | 1mL/plate |
Chloroform | Sigma-Aldrich | P3803 | 200 uL |
1.5 ml Tubes | Eppendorf | 22363204 | |
Centrifudge | Beckman-Coulter | ||
75% Ethanol | Sigma-Aldrich | 34852 | |
UV Spectrometer | |||
Forward primer in exon 5 | Invitrogen | CTGACTCTTGGTTTGATTTGGA 1.5 mL 10 mM |
|
Reverse primer in exon 10 | Invitrogen | TGCTTCGGTCTCTGTCAATG 1.5 L 10 mM |
|
dNTPS | Clontech | 3040 | |
One-Step RT-PCR kit | Qiagen | 210210 | |
Thermo-cycler | Scinco | ||
Complementary DNA (cDNA) Sequencing | |||
Gel extraction kit | Qiagen | 28704 | |
Centrifudge | |||
Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit | Applied Biosystems | 4337454 | |
Intramuscular injections or open muscle biopsy | |||
Surgical Tools | Scissors, Scapal, needle, surgical thread | ||
Vet Ointment | |||
Iodophors | webtextiles | 12190-71-5 | |
chlorohexidine | Peridex | 12134 | |
Surgical Drapes | |||
Srubs | |||
Facial Mask | |||
Surgical Gloves | |||
Head Covering | |||
Thiopental sodium | Mitsubishi Tanabe Pharma | 20 mg/kg | |
Isoflurane | Abbott laboratories | 05260-05 | 2-3% |
Antisense morpholinos | Gene-tools | Ex6A(GTTGATTGTCGGACCCAGC TCAGG), Ex6B(ACCTATGACTGTGGATGAG AGCGTT), Ex8A(CTTCCTGGATGGCTTCAAT GCTCAC) Dilute to a final volume of 100 L in opti-MEM media. 120–200 mg/kg of morpholinos at 32 mg/mL in saline |
|
27G Needles | TERUMO | SG3-2325 | |
50 mL syringe | TERUMO | SG2-03L2225 | |
buprenorphine hydrochloride | |||
Tougne Depressor | |||
cephalexin | 15 to 30 mg/kg | ||
cefazolin | 15 to 30 mg/kg | ||
buprenorphine | 0.01 mg/kg | ||
buprenorphine hydrochloride | 0.02 mg/kg | ||
Systemic Injections | |||
Syringe infusion pump | Muromachi | ||
22G Indwelling needles | TERUMO | SG3-2225 | |
27G Needles | TERUMO | SG3-2325 | |
50 mL syringe | TERUMO | SG2-03L2225 | |
Saline | Ohtsuka-Pharmaceutical | 28372 | |
Clinical Grading of Dogs | |||
Video Camera | |||
Stop watch | |||
Magnetic resonance imaging (MRI) | |||
3 Tesla MRI l | |||
18 cm diameter/18 cm length human extremity coi | |||
Muscle sampling and preparation (necropsy) | |||
Thiopental sodium | Mitsubishi Tanabe Pharma | 20 mg/kg | |
Isoflurane | Abbott laboratories | 05260-05 | 2-3% |
Tragacanth gum | 10-20 mL | ||
Liqoud Nitrogrn | |||
Cork Discs | Iwai-kagaku | 101412-806 | |
Dry Ice | |||
Tweezers | |||
Poly-l-lysine–coated slides | Fisher | 22-037-216 | |
Cryostat Microsystem | Leica | cm1900 | |
Immunohistochemistry | |||
DYS1 | Novocastra | NCL-DYS1 | 1:150 dilutions |
DYS2 | Novocastra | NCL-DYS2 | 1:150 dilutions |
Alexa 594 goat antimouse IgG1 | Invitrogen | A-21125 | 1:2,500 dilutions |
Alexa 594 goat antimouse IgG2 | Invitrogen | A-11005 | 1:2,500 dilutions |
DAPI | Invitrogen | D1306 | Contans mounting agent |
Goat Serum | Invitrogen | 10000C | 15% |
PBS | |||
Moisture chamber | Scientific Devise Laboratory | 197-BL | |
Chamber slide | Lab-tek | 154453 | |
Cover Glasses | Fisher | 12-540A | |
Hydrophobic barrier pen | |||
Flpurescent microcope | 594 nm at 20X magnification. | ||
Western Blotting | |||
Distillied Water | |||
Hand Homogenizer | |||
2× Laemmli SDS-loading buffer | 0.1 M Tris–HCl (pH 6.6), 2% (w/v) SDS, 2% (0.28 M) beta-mercaptoethanol, 20% glycerol, 0.01% bromophenol blue | ||
SDS gels | Bio-Rad | 161-1210 | 5% resolving |
SDS gels | Invitrogen | Invitrogen, WG1601BOX | 3-8% |
PVDF membrane | GE | 10600021 | |
Methanol | |||
Transfer buffer (10×) | 250 mM of Tris-Base, 1,920 mM of Glycine | ||
Transfer buffer (1×) | 10% 10× buffer, 20% methanol | ||
0.05% PBS/Tween 20 (PBST) | 2,000 mL 3× 200 mL for washing |
||
PBST/5% milk powder | 100 mL | ||
Protein Assay Kit | BCA | T9650 | |
Tween 20 | Sigma | P5927 | |
Urea | Sigma | U5378 | |
Beta Mercaptoethanol | Millipore | ES-007-E | |
SDS | Sigma | L3771 | |
Tris-Acetate | Sigma | ||
Tris HCL | Sigma | T3253 | |
Glycerol | Sigma | G8773 | |
Loading/sample buffer for Western blotting | NuPage Invitrogen | NP007 | |
NaCl | Sigma | S3014 | |
PMSF | Sigma | P7626 | |
Protease cocktail inhibitor | Roche | 11836153001 | |
Cathode Buffer | .025 M Tris base + 40 mM 6-aminocaproic acid + 20% Methanol | ||
Anode Buffer | 0.03 M Tris Base + 20% Methanol | ||
Concentred Anode Buffer | 0.3 M Tris base + 20 % Methanol | ||
desmin antibody | Abcam | ab8592 | |
DYS1 | Novocastra | NCL-DYS1 | 1:150 dilutions |
Image J Software |